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Schistosoma mansoni
cluster # 7354 cluster # 7354       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7354#0 length = 977 sequences # 5  
consensusID : consensus_7354#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 977
fasta sequence 
                              [GCTCGCCAGAATGGTTATCGCGTTTAGTATGAATTATGTGTTCAGTACGTCAATCGTATCAATGTTTGTGTATGGACAAATAATAAAACAATTGGCTGCATAAAAATGTACGCTGTAAATTGCTTATCTAACCCGAATTTGTATGGTTACGTTATATTTATTTTATATTCTTTTTTCCAAGTGTTAATTTCCTATGTATTTCCTTTTTAACTGTCTCCTCACAATTTTCTAAATCCCTTCCGTAGTGTTGTTGACTTTNTTATTTAACGGTTTGTCCTCTAATGAAAACTTTGGAAGGGTGGACTCCAGAAAATTCATTGATTTATGCACTATGAATTTCCAGTTTAGTGATATGGAGACCAGTGACTAACACATCTATGAATAGCAAGACTAATGCTAGATATATCAGTTCAGGGGACCTGTATTACCACCTG--ATATATATATATATATAACTATTGAATTTGTTGATGAAAGATAACAATACTGAAAAAAACGTTGCCTTAATTACTGCATTCCAGTCACATTGTGTTGATCCAAGATTGTTTTTTTCTTCCTGGCAATATGTATGTTACTGTAGTGAATATTGTTATTACCACTATTACTCATACATATAATCTACTCGTCTTTCTTTAATACAATCCTAATTAGACTTGATTGACAATTTAGTAAAATAAAACTATAAGCCCCGCATCGATCC-GAATTCTCTATTCAACTCAGGTTGATTTAATCAATTTTACGAATAAGACAAACACTTGACCCTAAGCCATTGAAAGTTGTCTTTTTTGTTGTTGAAAGGCCAGCTATGAAATTTCATTTGTACTGTTGTTTCTCTTTCTTTGTTTGTGTTTTTCCGACATATTTCTTTGTGTAATTTTGTTTACCATTGCTAATACACATTTTGAACTAGTATAATTCCCGTTACTGTTTCTATCCTAATGAATATGAATTAATCATTTGACAAAGCACACACACAAGTT]

[+] EMBL AI976527             [GCTCGCCAGAATGGTTATCGCGTTTAGTATGAATTATGTGTTCAGTACGTCAATCGTATCAATGTTTGTGTATGGACAAATAATAAAACAATTGGCTGCATAAAAATGTACGCTGTAAATTGCTTATCTAACCCGAATTTGTATGGTTACGTTATATTTATTTTATATTCTTTTTTCCAAGTGTTAATTTCCTATGTATTTCCTTTTTAACTGTCTCCTCACAATTTTCTAAATCCCTTCCGTAGTGTTGTTGACTTTNTTATTTAACGGTTTGTCCTCTAATGAAAACTTTGGAAGCTTCTTTTCCAGAAAATTCATTGATTTATGCACTATGAATTTCCAGTTTAGTGATATGGAGACCAGTGACTAACACATCTATGAATAGCAAGACTAATGCTAGATATATCAGTTCAGGGGACCTGTATTACCACCTGATATATATATATATATATAACTATTGAATTTGTTGATGAAAGATAACAATACTGAAAAAAACGTTGCCTTAATTACTGCATTCCAGTCACATTGTGTTGATCCAAGATTGTTTTTTTCTTCCTGGCAATATGTATGTTACTGTAGTGAATATTGNTATTACCACTATTACTCATACATATAATCTACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BG932042             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GGTGGACTCCAGAAAATTCATTGATTTATGCACTATGAATTTCCAGTTTAGTGATATGGAGACCAGTGACTAACACATCTATGAATAGCAAGACTAATGCTAGATATATCAGTTCAGGGGACCTGTATTACCACCTG  ATATATATATATATATAACTATTGAATTTGTTGATGAAAGATAACAATACTGAAAAAAACGTTGCCTTAATTACTGCATTCCAGTCACATTGTGTTGATCCAAGATTGTTTTTTTCTTCCTGGCAATATGTATGTTACTGTAGTGAATATTGTTATTACCACTATTACTCATACATATAATCTACTCGTCTTTCTTTAATACAATCCTAATTAGACTTGATTGACAATTTAGTAAAATAAAACTATAAGCCCCGCATCGATCCGGAATTC                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BG932038             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GGTGGACTCCAGAAAATTCATTGATTTATGCACTATGAATTTCCAGTTTAGTGATATGGAGACCAGTGACTAACACATCTATGAATAGCAAGACTAATGCTAGATATATCAGTTCAGGGGACCTGTATTACCACCTG  ATATATATATATATATAACTATTGAATTTGTTGATGAAAGATAACAATACTGAAAAAAACGTTGCCTTAATTACTGCATTCCAGTCACATTGTGTTGATCCAAGATTGTTTTTTTCTTCCTGGCAATATGTATGTTACTGTAGTGAATATTGTTATTACCACTATTACTCATACATATAATCTACTCGTCTTTCTTTAATACAATCCTAATTAGACTTGATTGACAATTTAGTAAAATAAAACTATAAGCCCCGCAT                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BG932047             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GGTGGACTCCACAAAATTCATTGATGGATGCACTATGAATTTCCAGTTCAGTGATATGGAGACCAGTGACTAACACATCTATGAATAGCAAGACTAATGCTAGATATATCAGTTCAGGGGACCTGTATTACCACCTG  ATATATATATATATATAACTATCGAATGGGTTGATGAAAGATAAGAATACTGAAAAAGACGTTGCCTTAATTACTGCATTCCAGTCACATAGTGTGGATCCAACATTGTTTGTTTCTTCCTGGCAATATGTATGTTACTGTACTGAATATTGTCATTACCACTATCACTCATACATATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD083656             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              gCGTTGCCTTAATTACTGCATTCCAGTCACATTGTGTTGATCCAAGATTGTTTTTTTCTTCCTGGCAATATGTATGTTACTGTAGTGAATATTGTTATTACCACTATTACTCATACATATAATCTACTCGTCTTTCTTTAATACAATCCTAATTAGACTTGATTGACAATTTAGTAAAATAAAACTATAAGAACTGGATCAATCC GAATAATCTATTCAACTCAGGTTGATTTAATCAATTTTACGAATAAGACAAACACTTGACCCTAAGCCATTGAAAGTTGTCTTTTTTGTTGTTGAAAGGCCAGCTATGAAATTTCATTTGTACTGTTGTTTCTCTTTCTTTGTTTGTGTTTTTCCGACATATTTCTTTGTGTAATTTTGTTTACCATTGCTAATACACATTTTGAACTAGTATAATTCCCGTTACTGTTTCTATCCTAATGAATATGAATTAATCATTTGACAAAGCACACACACAAGTT]




>consensus_7354#0
GCTCGCCAGAATGGTTATCGCGTTTAGTATGAATTATGTGTTCAGTACGTCAATCGTATC
AATGTTTGTGTATGGACAAATAATAAAACAATTGGCTGCATAAAAATGTACGCTGTAAAT
TGCTTATCTAACCCGAATTTGTATGGTTACGTTATATTTATTTTATATTCTTTTTTCCAA
GTGTTAATTTCCTATGTATTTCCTTTTTAACTGTCTCCTCACAATTTTCTAAATCCCTTC
CGTAGTGTTGTTGACTTTNTTATTTAACGGTTTGTCCTCTAATGAAAACTTTGGAAGGGT
GGACTCCAGAAAATTCATTGATTTATGCACTATGAATTTCCAGTTTAGTGATATGGAGAC
CAGTGACTAACACATCTATGAATAGCAAGACTAATGCTAGATATATCAGTTCAGGGGACC
TGTATTACCACCTGATATATATATATATATAACTATTGAATTTGTTGATGAAAGATAACA
ATACTGAAAAAAACGTTGCCTTAATTACTGCATTCCAGTCACATTGTGTTGATCCAAGAT
TGTTTTTTTCTTCCTGGCAATATGTATGTTACTGTAGTGAATATTGTTATTACCACTATT
ACTCATACATATAATCTACTCGTCTTTCTTTAATACAATCCTAATTAGACTTGATTGACA
ATTTAGTAAAATAAAACTATAAGCCCCGCATCGATCCGAATTCTCTATTCAACTCAGGTT
GATTTAATCAATTTTACGAATAAGACAAACACTTGACCCTAAGCCATTGAAAGTTGTCTT
TTTTGTTGTTGAAAGGCCAGCTATGAAATTTCATTTGTACTGTTGTTTCTCTTTCTTTGT
TTGTGTTTTTCCGACATATTTCTTTGTGTAATTTTGTTTACCATTGCTAATACACATTTT
GAACTAGTATAATTCCCGTTACTGTTTCTATCCTAATGAATATGAATTAATCATTTGACA
AAGCACACACACAAGTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)