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Schistosoma mansoni
cluster # 7362 cluster # 7362       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7362#0 length = 1197 sequences # 5  
consensusID : consensus_7362#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1197
fasta sequence 
                              [ACTTTTGGTCCGTTGTTTCCAATAAATGCTAACTGAGGACAACATTAATGCTGTAGTTTCCTAAATCCAAAGAAAATTTCAAGTTTCAATAGATAAAAAAATTCTCAGCCTCTATTTGGTAAAGATTGCTTTGAATTTCGATGGGCAAAACGTGTAGTCACTCTCAAATGACACAGTGAAAGCTCAAAAATATCGCTTGGTATCTACTAGCTTGTAAAAAAATAAATCTGAAGAGTTTGCTTCAAGTGTACGCTAAATAACTGGCTTCTATGACCCAATGGAGAAACAGAAAAGTAATTATTTTAACAAAAAAGTGTATAGACGACATTTTTCAAGAAAAAGAACTTTGCATTTTATGTTTTTCTTTACGTTATCTGTAATTTTTGTTATGACAACTTCATATTTAGTTTATAATAATCAAGGCCTAAGTTTAAACTCTTTTGAACATTTGCTTGATGTGGATTTGTACATGATATATGAAAATGAATTCAAATCGTTAAATAACAAGCCATCAATTAAACCTATAAATCCCGTTAAATTTAACGCTGTTCTCCAACCAATAAACTCTTGTAAATTGTCCAATCAATCTGATGCGTCACCAGATCTAGTTATTTTTGTCAAATCAGCGTTGTTACACTTTGAATTACGTAATAATATACGTCAGTCTTGGGGTAATTCAAACTGTTTCCGTCATTTTGGAGTGCGTACTCGAATTCTTTTCATTCTTGGTAGACCGGGTTCCACCGATTGGAAACATTCCAGTACTCAAAGTATGGTGTTACAAGAACATATGAAGTATAA-CGACACAGTTCAGTTTGATTTTATT-GAAGACTATCATAATGTTACGTATAAACTGATAGCGACATTAGACTTTGCTATTAATGAATGTTCTACTCCTCGATTTCTCACTTTGATTGATGATGATTTCATGTTGCACCCATCTAATTTACTCCGGACACTTGCCAAAGTTACTGAAACTCAGTATTTGACTTATATAGCTGGTAATGTGATGCGTGTCTCCAAACCAATGAGGTTCCTATTCAGTAAATGGTATATTTCCTATTCAGACTATCCATACAGTCTATATCCAGCCTTCCCTTCTGGCGGAACTATTATTCTCAGCATGCCTGTCGCCCAGCTTCTTTCTGTTGGTCTGAGGTATATCAAATTGCTTCCTTTTGAAGATGTTGTAATTGG]

[+] EMBL CD122949             [ACTTTTGGTCCGTTGTTTCCAATAAATGCTAACTGAGGACAACATTAATGCTGTAGTTTCCTAAATCCAAAGAAAATTTCAAGTTTCAATAGATAAAAAAATTCTCAGCCTCTATTTGGTAAAGATTGCTTTGAATTTCGATGGGCAAAACGTGTAGTCACTCTCAAATGACACAGTGAAAGCTCAAAAATATCGCTTGGTATCTACTAGCTTGTAAAAAAATAAATCTGAAGAGTTTGCTTCAAGTGTACGCTAAATAACTGGCTTCTATGACCCAATGGAGAAACAGAAAAGTAATTATTTTAACAAAAAAGTGTATAGACGACATTTTTCAAGAAAAAGAACTTTGCATTTTATGTTTTTCTTTACGTTATCTGTAATTTTTGTTATGACAACTTCATATTTAGTTTATAATAATCAAGGCCTAAGTTTAAACTCTTTTGAACATTTGCTTGATGTGGATTTGTACATGATATATGAAAATGAATTCAAATTGTTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD081911             [                                                                                                                                                                                                                                                           cgggcagAACTGGCTTCTATGACCCAATGGAGAAACAGAAAAGTAATTATTTTAACAAAAAAGTGTATAGACGACATTTTTCAAGAAAAAGAACTTTGCATTTTATGTTTTTCTTTACGTTATCTGTAATTTTTGTTATGACAACTTCATATTTAGTTTATAATAATCAAGGCCTAAGTTTAAACTCTTTTGAACATTTGCTTGATGTGGATTTGTACATGATATATGAAAATGAATTCAAATCGTTAAATAACAAGCCATCAATTAAACCTATAAATCCCGTTAAATTTAACGCTGTTCTCCAACCAATAAACTCTTGTAAATTGTCCAATCAATCTGATGCGTCACCAGATCTAGTTATTTTTGTCAAATCAGCGTTGTTACACTTTGAATTACGTAATAATATACGTCAGTCTTGGGGTAATTCAAACTGTTTCCGTCATTTTGGAGTGCGTACTCGAATTCTTTTCATTCTTGGTAGACCGGGTTCCACCGATTGGAAACATTCCAGTACTCAAAGTATGGTGTTACAAGAACATATGAAGTATAA CGACACAGTTCAGTTTGATTTTATT GAAGACTATCATAATGTTACGTATAAACTGATAGCGACATTAGACTTTGCTATTAATGAATGTTCTACTCCTCGATTTCTCACTTTGATTGATGATGATTTCATGTTGCACCCATCTAATTTACTCCGGACACTTGCCAAAGTTACTGAAACTCAGTATTTGACT                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD166182             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AATGAATTCAAATCGTTAAATAACAAGCCATCAATTAAACCTATAAATCCCGTTAAATTTAACGCTGTTCTCCAACCAATAAACTCTTGTAAATTGTCCAATCAATCTGATGCGTCACCAGATCTAGTTATTTTTGTCAAATCAGCGTTGTTACACTTTGAATTACGTAATAATATACGTCAGTCTTGGGGTAATTCAAACTGTTTCCGTCATTTTGGAGTGCGTACTCGAATTCTTTTCATTCTTGGTAGACCGGGTTCCACCGATTGGAAACATTCCAGTACTCAAAGTATGGTGTTACAAGAACATATGAAGTATAA CGACACAGTTCAGTTTGATTTTATT GAAGACTATCATAATGTTACGTATAAACTGATAGCGACATTAGACTTTGCTATTAATGAATGTTCTACTCCTCGATTTCTCACTTTGATTGATGATGATTTCATGTTGCACCCATCTAA TTACTCC GTCACTTGtcta                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL SMAA69226            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTATTTTTGTCAAATCAGCGTTGTTACACTTTGAATTACGTAATAATATACGTCAGTCTTGGGGTAATTCAAACTGTTTCCGTCATTTTGGAGTGCGTACTCGAATTCTTTTCATTCTTGGTAGACCGGGTTCCACCGATTGGAAACATTCCAGTACTCAAAGTATGGTGTTAC AGAACATATGAAGTATAAGCCACACAGTTCAGTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD083879             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  cacgaggGTTACATGAACATATGAAGTATAA CGACACAGTTCAGTTTGATTTTATTAGAAGACTATCATAATGTTACGTATAAACTGATAGCGACATTAGACTTTGCTATTAATGAATGTTCTACTCCTCGATTTCTCACTTTGATTGATGATGATTTCATGTTGCACCCATCTAATTTACTCCGGACACTTGCCAAAGTTACTGAAACTCAGTATTTGAACTATATAGCTGGTAATGTGATGCGTGTCTCCAAACCAATGAGGTTCCTATTCAGTAAATGGTATATTTCCTATTCAGACTATCCATACAGTCTATATCCAGCCTTCCCTTCTGGCGGAACTATTATTCTCAGCATGCCTGTCGCCCAGCTTCTTTCTGTTGGTCTGAGGTATATCAAATTGCTTCCTTTTGAAGATGTTGTAATTGG]




>consensus_7362#0
ACTTTTGGTCCGTTGTTTCCAATAAATGCTAACTGAGGACAACATTAATGCTGTAGTTTC
CTAAATCCAAAGAAAATTTCAAGTTTCAATAGATAAAAAAATTCTCAGCCTCTATTTGGT
AAAGATTGCTTTGAATTTCGATGGGCAAAACGTGTAGTCACTCTCAAATGACACAGTGAA
AGCTCAAAAATATCGCTTGGTATCTACTAGCTTGTAAAAAAATAAATCTGAAGAGTTTGC
TTCAAGTGTACGCTAAATAACTGGCTTCTATGACCCAATGGAGAAACAGAAAAGTAATTA
TTTTAACAAAAAAGTGTATAGACGACATTTTTCAAGAAAAAGAACTTTGCATTTTATGTT
TTTCTTTACGTTATCTGTAATTTTTGTTATGACAACTTCATATTTAGTTTATAATAATCA
AGGCCTAAGTTTAAACTCTTTTGAACATTTGCTTGATGTGGATTTGTACATGATATATGA
AAATGAATTCAAATCGTTAAATAACAAGCCATCAATTAAACCTATAAATCCCGTTAAATT
TAACGCTGTTCTCCAACCAATAAACTCTTGTAAATTGTCCAATCAATCTGATGCGTCACC
AGATCTAGTTATTTTTGTCAAATCAGCGTTGTTACACTTTGAATTACGTAATAATATACG
TCAGTCTTGGGGTAATTCAAACTGTTTCCGTCATTTTGGAGTGCGTACTCGAATTCTTTT
CATTCTTGGTAGACCGGGTTCCACCGATTGGAAACATTCCAGTACTCAAAGTATGGTGTT
ACAAGAACATATGAAGTATAACGACACAGTTCAGTTTGATTTTATTGAAGACTATCATAA
TGTTACGTATAAACTGATAGCGACATTAGACTTTGCTATTAATGAATGTTCTACTCCTCG
ATTTCTCACTTTGATTGATGATGATTTCATGTTGCACCCATCTAATTTACTCCGGACACT
TGCCAAAGTTACTGAAACTCAGTATTTGACTTATATAGCTGGTAATGTGATGCGTGTCTC
CAAACCAATGAGGTTCCTATTCAGTAAATGGTATATTTCCTATTCAGACTATCCATACAG
TCTATATCCAGCCTTCCCTTCTGGCGGAACTATTATTCTCAGCATGCCTGTCGCCCAGCT
TCTTTCTGTTGGTCTGAGGTATATCAAATTGCTTCCTTTTGAAGATGTTGTAATTGG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)