These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7362#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1197 fasta sequence [ACTTTTGGTCCGTTGTTTCCAATAAATGCTAACTGAGGACAACATTAATGCTGTAGTTTCCTAAATCCAAAGAAAATTTCAAGTTTCAATAGATAAAAAAATTCTCAGCCTCTATTTGGTAAAGATTGCTTTGAATTTCGATGGGCAAAACGTGTAGTCACTCTCAAATGACACAGTGAAAGCTCAAAAATATCGCTTGGTATCTACTAGCTTGTAAAAAAATAAATCTGAAGAGTTTGCTTCAAGTGTACGCTAAATAACTGGCTTCTATGACCCAATGGAGAAACAGAAAAGTAATTATTTTAACAAAAAAGTGTATAGACGACATTTTTCAAGAAAAAGAACTTTGCATTTTATGTTTTTCTTTACGTTATCTGTAATTTTTGTTATGACAACTTCATATTTAGTTTATAATAATCAAGGCCTAAGTTTAAACTCTTTTGAACATTTGCTTGATGTGGATTTGTACATGATATATGAAAATGAATTCAAATCGTTAAATAACAAGCCATCAATTAAACCTATAAATCCCGTTAAATTTAACGCTGTTCTCCAACCAATAAACTCTTGTAAATTGTCCAATCAATCTGATGCGTCACCAGATCTAGTTATTTTTGTCAAATCAGCGTTGTTACACTTTGAATTACGTAATAATATACGTCAGTCTTGGGGTAATTCAAACTGTTTCCGTCATTTTGGAGTGCGTACTCGAATTCTTTTCATTCTTGGTAGACCGGGTTCCACCGATTGGAAACATTCCAGTACTCAAAGTATGGTGTTACAAGAACATATGAAGTATAA-CGACACAGTTCAGTTTGATTTTATT-GAAGACTATCATAATGTTACGTATAAACTGATAGCGACATTAGACTTTGCTATTAATGAATGTTCTACTCCTCGATTTCTCACTTTGATTGATGATGATTTCATGTTGCACCCATCTAATTTACTCCGGACACTTGCCAAAGTTACTGAAACTCAGTATTTGACTTATATAGCTGGTAATGTGATGCGTGTCTCCAAACCAATGAGGTTCCTATTCAGTAAATGGTATATTTCCTATTCAGACTATCCATACAGTCTATATCCAGCCTTCCCTTCTGGCGGAACTATTATTCTCAGCATGCCTGTCGCCCAGCTTCTTTCTGTTGGTCTGAGGTATATCAAATTGCTTCCTTTTGAAGATGTTGTAATTGG] [+] EMBL CD122949 [ACTTTTGGTCCGTTGTTTCCAATAAATGCTAACTGAGGACAACATTAATGCTGTAGTTTCCTAAATCCAAAGAAAATTTCAAGTTTCAATAGATAAAAAAATTCTCAGCCTCTATTTGGTAAAGATTGCTTTGAATTTCGATGGGCAAAACGTGTAGTCACTCTCAAATGACACAGTGAAAGCTCAAAAATATCGCTTGGTATCTACTAGCTTGTAAAAAAATAAATCTGAAGAGTTTGCTTCAAGTGTACGCTAAATAACTGGCTTCTATGACCCAATGGAGAAACAGAAAAGTAATTATTTTAACAAAAAAGTGTATAGACGACATTTTTCAAGAAAAAGAACTTTGCATTTTATGTTTTTCTTTACGTTATCTGTAATTTTTGTTATGACAACTTCATATTTAGTTTATAATAATCAAGGCCTAAGTTTAAACTCTTTTGAACATTTGCTTGATGTGGATTTGTACATGATATATGAAAATGAATTCAAATTGTTA ] [+] EMBL CD081911 [ cgggcagAACTGGCTTCTATGACCCAATGGAGAAACAGAAAAGTAATTATTTTAACAAAAAAGTGTATAGACGACATTTTTCAAGAAAAAGAACTTTGCATTTTATGTTTTTCTTTACGTTATCTGTAATTTTTGTTATGACAACTTCATATTTAGTTTATAATAATCAAGGCCTAAGTTTAAACTCTTTTGAACATTTGCTTGATGTGGATTTGTACATGATATATGAAAATGAATTCAAATCGTTAAATAACAAGCCATCAATTAAACCTATAAATCCCGTTAAATTTAACGCTGTTCTCCAACCAATAAACTCTTGTAAATTGTCCAATCAATCTGATGCGTCACCAGATCTAGTTATTTTTGTCAAATCAGCGTTGTTACACTTTGAATTACGTAATAATATACGTCAGTCTTGGGGTAATTCAAACTGTTTCCGTCATTTTGGAGTGCGTACTCGAATTCTTTTCATTCTTGGTAGACCGGGTTCCACCGATTGGAAACATTCCAGTACTCAAAGTATGGTGTTACAAGAACATATGAAGTATAA CGACACAGTTCAGTTTGATTTTATT GAAGACTATCATAATGTTACGTATAAACTGATAGCGACATTAGACTTTGCTATTAATGAATGTTCTACTCCTCGATTTCTCACTTTGATTGATGATGATTTCATGTTGCACCCATCTAATTTACTCCGGACACTTGCCAAAGTTACTGAAACTCAGTATTTGACT ] [-] EMBL CD166182 [ AATGAATTCAAATCGTTAAATAACAAGCCATCAATTAAACCTATAAATCCCGTTAAATTTAACGCTGTTCTCCAACCAATAAACTCTTGTAAATTGTCCAATCAATCTGATGCGTCACCAGATCTAGTTATTTTTGTCAAATCAGCGTTGTTACACTTTGAATTACGTAATAATATACGTCAGTCTTGGGGTAATTCAAACTGTTTCCGTCATTTTGGAGTGCGTACTCGAATTCTTTTCATTCTTGGTAGACCGGGTTCCACCGATTGGAAACATTCCAGTACTCAAAGTATGGTGTTACAAGAACATATGAAGTATAA CGACACAGTTCAGTTTGATTTTATT GAAGACTATCATAATGTTACGTATAAACTGATAGCGACATTAGACTTTGCTATTAATGAATGTTCTACTCCTCGATTTCTCACTTTGATTGATGATGATTTCATGTTGCACCCATCTAA TTACTCC GTCACTTGtcta ] [+] EMBL SMAA69226 [ TTATTTTTGTCAAATCAGCGTTGTTACACTTTGAATTACGTAATAATATACGTCAGTCTTGGGGTAATTCAAACTGTTTCCGTCATTTTGGAGTGCGTACTCGAATTCTTTTCATTCTTGGTAGACCGGGTTCCACCGATTGGAAACATTCCAGTACTCAAAGTATGGTGTTAC AGAACATATGAAGTATAAGCCACACAGTTCAGTTT ] [+] EMBL CD083879 [ cacgaggGTTACATGAACATATGAAGTATAA CGACACAGTTCAGTTTGATTTTATTAGAAGACTATCATAATGTTACGTATAAACTGATAGCGACATTAGACTTTGCTATTAATGAATGTTCTACTCCTCGATTTCTCACTTTGATTGATGATGATTTCATGTTGCACCCATCTAATTTACTCCGGACACTTGCCAAAGTTACTGAAACTCAGTATTTGAACTATATAGCTGGTAATGTGATGCGTGTCTCCAAACCAATGAGGTTCCTATTCAGTAAATGGTATATTTCCTATTCAGACTATCCATACAGTCTATATCCAGCCTTCCCTTCTGGCGGAACTATTATTCTCAGCATGCCTGTCGCCCAGCTTCTTTCTGTTGGTCTGAGGTATATCAAATTGCTTCCTTTTGAAGATGTTGTAATTGG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||