These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7368#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 412 fasta sequence [GTTCA-TAAA-TAAGAATAACCACTTACGGAAG-ATATTAATAAG-CGAATGAATATATTGGACTTATTTGTCTCTCAATTTATTGATGTTATTTTCTTCGGGTTATTTGGAAATTATATGTATGTTTAA-GCGAGATAAGACATGTGTTCATGAATTTGTAACTTGTCCATTTCTCAAAATCTTCAGTACGTAAGCGGATCTTGAAGTATTTTTCCGTTCATTATTTGGTAAGTGTGTACTGCATACAAGAGCATAATTTCCACTGAGGATTTTATTTCAAGTTTTAACTTCCACTTTGTTTTTCTTCTTTTATCCGGCAAGTTGGAATGCGCTACAGTAGCATTTTCATGAAAGACATTTGTCAA-TTGTTTCGGATGATTAAAATGAAATCCTTAGTAAAAATTACACTTT-TATA] [+] EMBL CD111064 [GTTCAGTAAAGTCAGAATAACCACTTACGGAAGAATATTAATAAGCCGAATGAATATATTGGACTTATTTGTCTCTCAATTTATTGATGTTATTTTCTTCGGGTTATTTGGAAATTATATGTATGTGTAATGCGAGATAAGACATGTGTACATGAATTTGTAACTTGTGCATTTCTCAAAATCTTCAGTACGTAAGC ] [+] EMBL CD111038 [ TTCA TAAA TAAGAATAACCACTTACGGAAG ATATTAATAAG CGAATGAATATATTGGACTTATTTGTCTCTCAATTTATTGATGTTATTTTCTTCGGGTTATTTGGAAATTATATGTATGTTTAA GCGAGATAAGACATGTGTTCATGAATTTGTAACTTGTCCATTTCTCAAAATCTTCAGTACGTAAGCGGATCTTGAAGCATTTTTCCGTTCATTATTTGGTAAGTGTGTACTGCATACAAGAGCATAATTTCCACTGAGGATTTTATTTCAAGTTTTAACTTCCACTTTGTTTTTCTTCTTTTATCCGGCAAGTTGGAATGCGCTACAGTAGCATTTTCATGAAAGACATTTGTCAA TTGTTTCGGATGATTAAAATGAAATCCTTAGTAAAAATTACACTTT TATA] [+] EMBL CD110836 [ TTCA TAAA TAAGAATAACCACTTACGGAAG ATATTAATAAG CGAATGAATATATTGGACTTATTTGTCTCTCAATTTATTGATGTTATTTTCTTCGGGTTATTTGGAAATTATATGTATGTTTAA GCGAGATAAGACATGTGTCCATGAATTTGTAACTTGTCCATTTCTCAAAATCTTCAGTACGTAAGCGGATCTTGAAGTATTTTTCCGTTCATTATTTGGTAAGTGTGTACTGCATACAAGAGCATAATTTCCACTGAGGATTTTATTTCAAGTTTTAACTTCCACTTTGTTTTTCTTCTTTTATCCGGCAAGTTGGAATGCGCTACAGTAGCATTTTCATGAAAGACATTTGTCAA TTGTTTCGGATGATTAAAA GAAATCCTTAGTAAAAATTACACTTT TATA] [+] EMBL CD110902 [ TTCA TAAA TAAGAATAACCACTTACGGAAG ATATTAATAAG CGAATGAATATATTGGACTTATTTGTCTCTCAATTTATTGATGTTATTTTCTTCGGGTTATTTGGAAATTATATGTATGTTTAA GCGAGATAAGACATGTGTTCATGAATTTGTAACTTGTCCATTTCTCAAAATCTTCAGTACGTAAGCGGATCTTGAAGTATTTTTCCGTTCATTATTTGGTAAGTGTGTACTGCATACAAGAGCATAATTTCCACTGAGGATTGTATTTCAAGTTTTAACTTCCACTTCGTTTTTCTTCTTTTATCCGGCAAGTTGGAATGCGCTACAGTAGCATTTTCATGAAAGACATTTGTCAAGTTGTTTCGGATGATTAATATGAAATCCTTAGTAAAAA ] [-] EMBL CD111555 [ AAA TAAGAATAACCACTTACGGAAG ATATTAATAAG CGAATGAATATATTGGACTTATTTGTCTCTCAATTNATTGATGTTATTTTCTTCGGGTTATTTGGAAATTATATGTATGTTTAA GCGAGATAAGACATGTGTTCATGAATTTGTAACTTGTCCATTTCTCAAAATCTTCAGTACGTAAGCGGATCTTGAAGTATTTTTCCGTTCATTATTTGGTAAGTGTGTGCTGCATACAAGAGCATAATTTCCACTGAGGATTTTATTTCAAGTTTTAACTTCCACTTTGTTTTTCTTCTTTTATCCGGCAAGTTGGAATGCGCTACAGTAGCATTTTCATGAAAGACATTTGTCAA TTGTTTCGGATGATTAAAATGAAATCCTTAGTAAAAA TACACTTTATAT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||