These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7386#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 902 fasta sequence [CTGTTGGTGATAATATGGCTAGTGTTGATGGTGATTTTGTTCATCGAGATGAAGTTAATTGGCAAAATGATGCTAAAGCTGTTGCACGTATCTGTGAACAATTACAACAGGGCCTAGTTACGGAGAAATTGCCAGTCACATCATCAAATAATGATAGTAATAACGGTGCTGTAACAGAATTTTCTGGGTATTCTGTAAAAATCAATGATCATAATAATAGTAGTACTCCTGCACTATCCAGTAATACTCCTGACTACTCAATTCCGCGGAATGATATAATAGTGTCATTGAAGCATGTTTCTCCAGTGCAAGATCCGGCAATGACTAATTTAATGACTACAACTTGTACAACATGGTCAAGTTATTCACCTCAGACAACAAGTGGTATTGGGCATACTGTACTACGACGTCATAATAGTGGAAACAATAGTATTAGTGGTAGTAGTAGTAGTGTTATTACTACTACTACTAATACTACTACTACCATTACGAATGTTGTGAATAAAGCTGCTGTCGCTGCCGCGTTAGCTAGTCAACAAGCTGCAGCAAGTCAACGTAATCAATTGACTAATCAACGTCTTTTAGCCGAACAACGTAAACGTCTTATCCAACATCAATTATATAATCAAGTTGCTGTGTATTCACTGAATTCATCCGTGAATAGTCGGAATCCTATGTCGAATTCAGATTCGAATCCTCCAGTCAATACATTTTTTGTCAATGAAAATACGTATGGTATACAAAATTTACCTTCTTTTAATATTTCTTCTACTACTACTAATAATACTATCATTTCAACAACAACAACAACAACAACCAGTCATAATGATCATAATCCAACTTATCATTTATTACATGTAATTCCTAATAAGTCAATANATCGGNAAATCTTATCATTAGAT] [-] EMBL CD154805 [CTGTTGGTGATAATATGGCTAGTGTTGATGGTGATTTTGTTCATCGAGATGAAGTTAATTGGCAAAATGATGCTAAAGCTGTTGCACGTATCTGTGAACAATTACAACAGGGCCTAGTTACGGAGAAATTGCCAGTCACATCATCAAATAATGATAGTAATAACGGTGCTGTAACAGAATTTTCTGGGTATTCTGTAAAAATCAATGATCATAATAATAGT ] [+] EMBL CD113160 [ GTCACATCATCAAATAATGATAGTAATAACGGTGCTGTAACAGAATTTTCTGGGTATTCTGTAAAAATCAATGATCATAATAATAGTAGTACTCCTGCACTATCCAGTAATACTCCTGACTACTCAATTCCGCGGAATGATATAATAGTGTCATTGAAGCATGTTTCTCCAGTGCAAGATCCGGCAATGACTAATTTAATGACTACAACCTGTACAACATGGTCAAGTTACTCACCTCAGACAACGAGTGGTATTGGGCATACTGTACTACGACGTCATAATAGTGGAAACAATAGTATTAGTGGTAGTAGTAGTAGTGTTATTACTACTACTACTATTACTACTACTATCATTACGAATGTTGTGAATAAAGCTGCTGTCGCTGCCGCGTTAGCTAGTCAACAAGCTGCAGCAAGTCAACGTAATCAATTGACTAATCAACGTCTTTTAGCCGAACAACGTAAACGTCTTATCCAACATCAATTATATAATCAAGTTGCTGTGTATTCACTGAATTCATCCGTGAATAGTCGGAATCCTATGTCGAATTCA ] [-] EMBL CD113193 [ TTCTGGGTATTCTGTAAAAATCAATGATCATAATAATAGTAGTACTCCTGCACTATCCAGTAATACTCCTGACTACTCAATTCCGCGGAATGATATAATAGTGTCATTGAAGCGTGTTTCTCCAGTGCAAGATCCGGCAATGACTAATTTAATGACTACAACTTGTACAACATGGTCAAGTTATTCACCTCAGACAACAAGTGGTATTGGGCATACTGTACTACGACGTCATAATAGTGGAAACAATAGTATTAGTGGTAGTAGTAGTAGTGTTATTACTACTACTACTAATACTACTACTACCATTACG ATGTTGTGAATAAAGCTGCTGTCGCTGCCGCGTTAGCTAGTCAACAAGCTGCAGCAAGTCAACGTAATCAATTGACTAATCAACGTCTTTTAGCCGAACAACGTAAACGTCTTATCCAACATCAATTATATAATCAAGTTGCTGTGTATTCACTGAATTCATCCGTGAATAGTCGGAATCCTATGTCGGATTCAG ] [-] EMBL CD113143 [ ATAGTAGTACTCCTGCACTATCCAGTAATACTCCTGACTACTCAATTCCGCGGAATGATATAATAGTGTCATTGAAGCATGTTTCTCCAGTGCAAGATCCGGCAATGACTAATTTAATGACTACAACTTGTACGACATGGTCAAGTTATTCACCTCAGACAACAAGTGGTATTGGGCATACTGTACTACGACGTCATAATAGTGGAAACAATAGTATTAGTGGTAGTAGTAGTAGTGTTATTACTACTACTACTAATACTACTACTACCATTACGAATGTTGTGAATAAAGCTGCTGTCGCTGCCGCGTTAGCTAGTCAACAAGCTGCAGCAAGTCAACGTAATCAATTGACTAATCAACGTCTTTTAGCCGAACAACGTAAACGTCTTATCCAACATCAGTTATATAATCAAGTTGCTGTGTATTCACTGAATTCATCCGTGAATAGTCGGAATCCTATGTCGAATTCAG ] [+] EMBL CD159252 [ TGACTAATTTAATGACTACAACTTGTACAACATGGTCAAGTTATTCACCTCAGACAACAAGTGGTATTGGGCATACTGTACTACGACGTCATAATAGTGGAAACAATAGTATTAGTGGTAGTAGTAGTAGTGTTATTACTACTACTACTAATACTACTACTACCATTACGAATGTTGTGAATAAAGCTGCTGTCGCTGCCGCGTTAGCTAGTCAACAAGCTGCAGCAAGTCAACGTAATCAATTGACTAATCAACGTCTTTTAGCCGAACAACGTAAACGTCTTATCCAACATCAATTATATAATCAAGTTGCTGTGTATTCACTGAATTCATCCGTGAATAGTCGGAATCCTATGTCGAATTCAGATTCGAATCCTCCAGTCAATACATTTTTTGTCAATGAAAATACGTATGGTATACAAAATTTACCTTCTTTTAATATTTCTTCTACTACTACTAATAATACTATCATTTCAACAACAACAACAACAACAACCAGTCATAATGATCATAATCCAACTTATCATTTATTACATGTAATTCCTAATAAGTCAATANATCGGNAAATCTTATCATTAGAT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||