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Schistosoma mansoni
cluster # 7386 cluster # 7386       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7386#0 length = 902 sequences # 5  

consensusID : consensus_7386#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 902
fasta sequence
                              [CTGTTGGTGATAATATGGCTAGTGTTGATGGTGATTTTGTTCATCGAGATGAAGTTAATTGGCAAAATGATGCTAAAGCTGTTGCACGTATCTGTGAACAATTACAACAGGGCCTAGTTACGGAGAAATTGCCAGTCACATCATCAAATAATGATAGTAATAACGGTGCTGTAACAGAATTTTCTGGGTATTCTGTAAAAATCAATGATCATAATAATAGTAGTACTCCTGCACTATCCAGTAATACTCCTGACTACTCAATTCCGCGGAATGATATAATAGTGTCATTGAAGCATGTTTCTCCAGTGCAAGATCCGGCAATGACTAATTTAATGACTACAACTTGTACAACATGGTCAAGTTATTCACCTCAGACAACAAGTGGTATTGGGCATACTGTACTACGACGTCATAATAGTGGAAACAATAGTATTAGTGGTAGTAGTAGTAGTGTTATTACTACTACTACTAATACTACTACTACCATTACGAATGTTGTGAATAAAGCTGCTGTCGCTGCCGCGTTAGCTAGTCAACAAGCTGCAGCAAGTCAACGTAATCAATTGACTAATCAACGTCTTTTAGCCGAACAACGTAAACGTCTTATCCAACATCAATTATATAATCAAGTTGCTGTGTATTCACTGAATTCATCCGTGAATAGTCGGAATCCTATGTCGAATTCAGATTCGAATCCTCCAGTCAATACATTTTTTGTCAATGAAAATACGTATGGTATACAAAATTTACCTTCTTTTAATATTTCTTCTACTACTACTAATAATACTATCATTTCAACAACAACAACAACAACAACCAGTCATAATGATCATAATCCAACTTATCATTTATTACATGTAATTCCTAATAAGTCAATANATCGGNAAATCTTATCATTAGAT]

[-] EMBL CD154805             [CTGTTGGTGATAATATGGCTAGTGTTGATGGTGATTTTGTTCATCGAGATGAAGTTAATTGGCAAAATGATGCTAAAGCTGTTGCACGTATCTGTGAACAATTACAACAGGGCCTAGTTACGGAGAAATTGCCAGTCACATCATCAAATAATGATAGTAATAACGGTGCTGTAACAGAATTTTCTGGGTATTCTGTAAAAATCAATGATCATAATAATAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD113160             [                                                                                                                                      GTCACATCATCAAATAATGATAGTAATAACGGTGCTGTAACAGAATTTTCTGGGTATTCTGTAAAAATCAATGATCATAATAATAGTAGTACTCCTGCACTATCCAGTAATACTCCTGACTACTCAATTCCGCGGAATGATATAATAGTGTCATTGAAGCATGTTTCTCCAGTGCAAGATCCGGCAATGACTAATTTAATGACTACAACCTGTACAACATGGTCAAGTTACTCACCTCAGACAACGAGTGGTATTGGGCATACTGTACTACGACGTCATAATAGTGGAAACAATAGTATTAGTGGTAGTAGTAGTAGTGTTATTACTACTACTACTATTACTACTACTATCATTACGAATGTTGTGAATAAAGCTGCTGTCGCTGCCGCGTTAGCTAGTCAACAAGCTGCAGCAAGTCAACGTAATCAATTGACTAATCAACGTCTTTTAGCCGAACAACGTAAACGTCTTATCCAACATCAATTATATAATCAAGTTGCTGTGTATTCACTGAATTCATCCGTGAATAGTCGGAATCCTATGTCGAATTCA                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD113193             [                                                                                                                                                                                     TTCTGGGTATTCTGTAAAAATCAATGATCATAATAATAGTAGTACTCCTGCACTATCCAGTAATACTCCTGACTACTCAATTCCGCGGAATGATATAATAGTGTCATTGAAGCGTGTTTCTCCAGTGCAAGATCCGGCAATGACTAATTTAATGACTACAACTTGTACAACATGGTCAAGTTATTCACCTCAGACAACAAGTGGTATTGGGCATACTGTACTACGACGTCATAATAGTGGAAACAATAGTATTAGTGGTAGTAGTAGTAGTGTTATTACTACTACTACTAATACTACTACTACCATTACG ATGTTGTGAATAAAGCTGCTGTCGCTGCCGCGTTAGCTAGTCAACAAGCTGCAGCAAGTCAACGTAATCAATTGACTAATCAACGTCTTTTAGCCGAACAACGTAAACGTCTTATCCAACATCAATTATATAATCAAGTTGCTGTGTATTCACTGAATTCATCCGTGAATAGTCGGAATCCTATGTCGGATTCAG                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD113143             [                                                                                                                                                                                                                        ATAGTAGTACTCCTGCACTATCCAGTAATACTCCTGACTACTCAATTCCGCGGAATGATATAATAGTGTCATTGAAGCATGTTTCTCCAGTGCAAGATCCGGCAATGACTAATTTAATGACTACAACTTGTACGACATGGTCAAGTTATTCACCTCAGACAACAAGTGGTATTGGGCATACTGTACTACGACGTCATAATAGTGGAAACAATAGTATTAGTGGTAGTAGTAGTAGTGTTATTACTACTACTACTAATACTACTACTACCATTACGAATGTTGTGAATAAAGCTGCTGTCGCTGCCGCGTTAGCTAGTCAACAAGCTGCAGCAAGTCAACGTAATCAATTGACTAATCAACGTCTTTTAGCCGAACAACGTAAACGTCTTATCCAACATCAGTTATATAATCAAGTTGCTGTGTATTCACTGAATTCATCCGTGAATAGTCGGAATCCTATGTCGAATTCAG                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD159252             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGACTAATTTAATGACTACAACTTGTACAACATGGTCAAGTTATTCACCTCAGACAACAAGTGGTATTGGGCATACTGTACTACGACGTCATAATAGTGGAAACAATAGTATTAGTGGTAGTAGTAGTAGTGTTATTACTACTACTACTAATACTACTACTACCATTACGAATGTTGTGAATAAAGCTGCTGTCGCTGCCGCGTTAGCTAGTCAACAAGCTGCAGCAAGTCAACGTAATCAATTGACTAATCAACGTCTTTTAGCCGAACAACGTAAACGTCTTATCCAACATCAATTATATAATCAAGTTGCTGTGTATTCACTGAATTCATCCGTGAATAGTCGGAATCCTATGTCGAATTCAGATTCGAATCCTCCAGTCAATACATTTTTTGTCAATGAAAATACGTATGGTATACAAAATTTACCTTCTTTTAATATTTCTTCTACTACTACTAATAATACTATCATTTCAACAACAACAACAACAACAACCAGTCATAATGATCATAATCCAACTTATCATTTATTACATGTAATTCCTAATAAGTCAATANATCGGNAAATCTTATCATTAGAT]


>consensus_7386#0 CTGTTGGTGATAATATGGCTAGTGTTGATGGTGATTTTGTTCATCGAGATGAAGTTAATT GGCAAAATGATGCTAAAGCTGTTGCACGTATCTGTGAACAATTACAACAGGGCCTAGTTA CGGAGAAATTGCCAGTCACATCATCAAATAATGATAGTAATAACGGTGCTGTAACAGAAT TTTCTGGGTATTCTGTAAAAATCAATGATCATAATAATAGTAGTACTCCTGCACTATCCA GTAATACTCCTGACTACTCAATTCCGCGGAATGATATAATAGTGTCATTGAAGCATGTTT CTCCAGTGCAAGATCCGGCAATGACTAATTTAATGACTACAACTTGTACAACATGGTCAA GTTATTCACCTCAGACAACAAGTGGTATTGGGCATACTGTACTACGACGTCATAATAGTG GAAACAATAGTATTAGTGGTAGTAGTAGTAGTGTTATTACTACTACTACTAATACTACTA CTACCATTACGAATGTTGTGAATAAAGCTGCTGTCGCTGCCGCGTTAGCTAGTCAACAAG CTGCAGCAAGTCAACGTAATCAATTGACTAATCAACGTCTTTTAGCCGAACAACGTAAAC GTCTTATCCAACATCAATTATATAATCAAGTTGCTGTGTATTCACTGAATTCATCCGTGA ATAGTCGGAATCCTATGTCGAATTCAGATTCGAATCCTCCAGTCAATACATTTTTTGTCA ATGAAAATACGTATGGTATACAAAATTTACCTTCTTTTAATATTTCTTCTACTACTACTA ATAATACTATCATTTCAACAACAACAACAACAACAACCAGTCATAATGATCATAATCCAA CTTATCATTTATTACATGTAATTCCTAATAAGTCAATANATCGGNAAATCTTATCATTAG AT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)