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Schistosoma mansoni
cluster # 7391 cluster # 7391       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7391#0 length = 999 sequences # 5  

consensusID : consensus_7391#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 999
fasta sequence
                              [GTATGAATGTTGCACTAGTTGTGGTCTAAGCCAACGATCCTATCCTTTTAACACCTTACTCAGTCTAATGTTGGCATCTCTGTCAATCATCGGATCATGCTTTCATGAACTAAAAATTAATGGCTATCTTCTGCGAACTATCTAGACATTAGTAAGCTAATTATTAACTTACGTATAGCTTTATCTGATATGGACCAACCACCTATCCGAATATTGAGACGACCATGTCCAGTTCCATCTGACGTTCCTAATACGCCACAGAGGCCACCAGTAGTCACAAAAACACTTGAACAAAGGGAAGCAGACTATGCTGCTGCTCGAAAAAGGATAATGGGGTCCGCTACTCCGGAGTCACTTAAGGTAGAGACGAAAGAATTAACAGAGTCTAATCCAGTGAAAATGACAGACGATACCAACAAGGTCATTACAAAACAGGATCCATCAACTGCGTCCACCATTCCCACGACTCAGAACATGGAGGTTAGTGGTCAAAGTAACTCTTCGGAAATGACAACCAATCACTTGTTCACTAACCACAGTGGAGTCCAACTTTCCATGCCCCAGAGTAACAAACAGCCTCTGGATATCAATGTTGGTCGAAAGCCTCAACAACACTCACATTCTACATCAAACGGCGTTCGGCAGAATTTACAACAGCGCAGTGCAACAAAATAGGATGCCTCGACGAACGAACACGGACCAAAATCGACAACCTCTGTGTACGAACTCACTACATAATTGGCGACCGCAACGAGCGAACACAAATCAAAAATGGAACCGCCAACGACATATTTCGTTATGATCCGAATAATCATCATATGCTCATTATTACAATAATGTCATATCATCATCTAACGTGGAGTTATTATTTTTGTTCGTATTAACATTAAACTATGACATATACGTAGTCATATCACTAATCGAACAAATTATAATGATATGGGCATTACACGTTATGATATTCCAAAACTCCCCGGATTATTTTTATTTTCCAATGGA]

[+] EMBL CD182005             [GTATGAATGTTGCACTAGTTGTGGTCTAAGCCAACGATCCTATCCTTTTAACACCTTACTCAGTCTAATGTTGGCATCTCTGTCAATCATCGGATCATGCTTTCATGAACTAAAAATTAATGGCTATCTTCTGCGAACTATCTAGACATTAGTAAGCTAATTATTAACTTACGTATAGCTTTATCTGATATGGACCAACCACCTATCCGAATATTGAGACGACCATGTCCAGTCCCATCTGACGTTCCTAATACGCCACAGAGGCCACCAGTAGTCACAAAAACACTTGAACAAAGGGAAGCAGACTATGCTGCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD187339             [                                                                                            GATCATGCTTTCATGAACTAAAAATTAATGGCTATCTTCTGCGAACTATCTAGACATTAGTAAGCTAATTATTAACTTACGTATAGCTTTATCTGATATGGACCAACCACCTATCCGAATATTGAGACGACCATGTCCAGTTCCATCTGACGTTCCTAATACGCCACAGAGGCCACCAGTAGTCACAAAAACACTTGAACAAAGGGAAGCAGACTATGCTGCTGCTCGAAAAAGGATAATGGGGTCCGCTACTCCGGAGTCACTTAAGGTAGAGACGAAAGAATTAACAGAGTCTAATCCAGTGAAAATGACAGACGATACCAACAAGGTCATTACAAAACAGGATCCATCAACTGCGTCCACCATTCCCACGACTCAGAACATGGAGGTTAGTGGTCAAAGTAACTCTTCGGAAATGACAACCAATCACTTGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD187569             [                                                                                             ATCATGCTTTCACGAACTAAAAATTAATGGCTATCTTCTGCGAACTATCTAGACATTAGTAAGCTAATTATTAACTTACGTATAGCTTTATCTGATATGGACCAACCACCTATCCGAATATTGAGACGACCATGTCCAGTTCCATCTGACGTTCCTAATACGCCACAGAGGCCACCAGTAGTCACAAAAACACTTGAACAAAGGGAAGCCGACTATGCTGCTGCTCGAAAAAGGATAATGGGGTCCGCTACTCCGGAGTCACTTAAGGTAGAGACGAAAGAATTAACAGAGTCTAATCCAGTGAAAATGACAGACGATACCAACAAGGTCATTACAAAACAGGATCCATCAACTGCGTCCACCATTCCCACGACTCAGAACATGGAGGTTAGTGGTCAAAGTAACTCTTCGGAAATGACAACCAATCACTTGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD096953             [                                                                                                                                                         AAGCTAATTATTAACTTACGTATAGCTTTATCTGATATGGACCAACCACCTATCCGAATATTGAGACGACCATGTCCAGTTCCATCTGACGTTCCTAATACGCCACAGAGGCCACCAGTAGTCACAAAAACACTTGAACAAAGGGAAGCAGACTATGCTGCTGCTCGAAAAAGGATAATGGGGTCCGCTACTCCGGAGTCACTTAAGGTAGAGACGAAAGAATTAACAGAGTCTAATCCAGTGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD168233             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGCGTCCACCATTCCCACGACTCAGAACATGGAGGTTAGTGGTCAAAGTAACTCTTCGGAAATGACAACCAATCACTTGTTCACTAACCACAGTGGAGTCCAACTTTCCATGCCCCAGAGTAACAAACAGCCTCTGGATATCAATGTTGGTCGAAAGCCTCAACAACACTCACATTCTACATCAAACGGCGTTCGGCAGAATTTACAACAGCGCAGTGCAACAAAATAGGATGCCTCGACGAACGAACACGGACCAAAATCGACAACCTCTGTGTACGAACTCACTACATAATTGGCGACCGCAACGAGCGAACACAAATCAAAAATGGAACCGCCAACGACATATTTCGTTATGATCCGAATAATCATCATATGCTCATTATTACAATAATGTCATATCATCATCTAACGTGGAGTTATTATTTTTGTTCGTATTAACATTAAACTATGACATATACGTAGTCATATCACTAATCGAACAAATTATAATGATATGGGCATTACACGTTATGATATTCCAAAACTCCCCGGATTATTTTTATTTTCCAATGGA]


>consensus_7391#0 GTATGAATGTTGCACTAGTTGTGGTCTAAGCCAACGATCCTATCCTTTTAACACCTTACT CAGTCTAATGTTGGCATCTCTGTCAATCATCGGATCATGCTTTCATGAACTAAAAATTAA TGGCTATCTTCTGCGAACTATCTAGACATTAGTAAGCTAATTATTAACTTACGTATAGCT TTATCTGATATGGACCAACCACCTATCCGAATATTGAGACGACCATGTCCAGTTCCATCT GACGTTCCTAATACGCCACAGAGGCCACCAGTAGTCACAAAAACACTTGAACAAAGGGAA GCAGACTATGCTGCTGCTCGAAAAAGGATAATGGGGTCCGCTACTCCGGAGTCACTTAAG GTAGAGACGAAAGAATTAACAGAGTCTAATCCAGTGAAAATGACAGACGATACCAACAAG GTCATTACAAAACAGGATCCATCAACTGCGTCCACCATTCCCACGACTCAGAACATGGAG GTTAGTGGTCAAAGTAACTCTTCGGAAATGACAACCAATCACTTGTTCACTAACCACAGT GGAGTCCAACTTTCCATGCCCCAGAGTAACAAACAGCCTCTGGATATCAATGTTGGTCGA AAGCCTCAACAACACTCACATTCTACATCAAACGGCGTTCGGCAGAATTTACAACAGCGC AGTGCAACAAAATAGGATGCCTCGACGAACGAACACGGACCAAAATCGACAACCTCTGTG TACGAACTCACTACATAATTGGCGACCGCAACGAGCGAACACAAATCAAAAATGGAACCG CCAACGACATATTTCGTTATGATCCGAATAATCATCATATGCTCATTATTACAATAATGT CATATCATCATCTAACGTGGAGTTATTATTTTTGTTCGTATTAACATTAAACTATGACAT ATACGTAGTCATATCACTAATCGAACAAATTATAATGATATGGGCATTACACGTTATGAT ATTCCAAAACTCCCCGGATTATTTTTATTTTCCAATGGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)