These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7391#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 999 fasta sequence [GTATGAATGTTGCACTAGTTGTGGTCTAAGCCAACGATCCTATCCTTTTAACACCTTACTCAGTCTAATGTTGGCATCTCTGTCAATCATCGGATCATGCTTTCATGAACTAAAAATTAATGGCTATCTTCTGCGAACTATCTAGACATTAGTAAGCTAATTATTAACTTACGTATAGCTTTATCTGATATGGACCAACCACCTATCCGAATATTGAGACGACCATGTCCAGTTCCATCTGACGTTCCTAATACGCCACAGAGGCCACCAGTAGTCACAAAAACACTTGAACAAAGGGAAGCAGACTATGCTGCTGCTCGAAAAAGGATAATGGGGTCCGCTACTCCGGAGTCACTTAAGGTAGAGACGAAAGAATTAACAGAGTCTAATCCAGTGAAAATGACAGACGATACCAACAAGGTCATTACAAAACAGGATCCATCAACTGCGTCCACCATTCCCACGACTCAGAACATGGAGGTTAGTGGTCAAAGTAACTCTTCGGAAATGACAACCAATCACTTGTTCACTAACCACAGTGGAGTCCAACTTTCCATGCCCCAGAGTAACAAACAGCCTCTGGATATCAATGTTGGTCGAAAGCCTCAACAACACTCACATTCTACATCAAACGGCGTTCGGCAGAATTTACAACAGCGCAGTGCAACAAAATAGGATGCCTCGACGAACGAACACGGACCAAAATCGACAACCTCTGTGTACGAACTCACTACATAATTGGCGACCGCAACGAGCGAACACAAATCAAAAATGGAACCGCCAACGACATATTTCGTTATGATCCGAATAATCATCATATGCTCATTATTACAATAATGTCATATCATCATCTAACGTGGAGTTATTATTTTTGTTCGTATTAACATTAAACTATGACATATACGTAGTCATATCACTAATCGAACAAATTATAATGATATGGGCATTACACGTTATGATATTCCAAAACTCCCCGGATTATTTTTATTTTCCAATGGA] [+] EMBL CD182005 [GTATGAATGTTGCACTAGTTGTGGTCTAAGCCAACGATCCTATCCTTTTAACACCTTACTCAGTCTAATGTTGGCATCTCTGTCAATCATCGGATCATGCTTTCATGAACTAAAAATTAATGGCTATCTTCTGCGAACTATCTAGACATTAGTAAGCTAATTATTAACTTACGTATAGCTTTATCTGATATGGACCAACCACCTATCCGAATATTGAGACGACCATGTCCAGTCCCATCTGACGTTCCTAATACGCCACAGAGGCCACCAGTAGTCACAAAAACACTTGAACAAAGGGAAGCAGACTATGCTGCTG ] [-] EMBL CD187339 [ GATCATGCTTTCATGAACTAAAAATTAATGGCTATCTTCTGCGAACTATCTAGACATTAGTAAGCTAATTATTAACTTACGTATAGCTTTATCTGATATGGACCAACCACCTATCCGAATATTGAGACGACCATGTCCAGTTCCATCTGACGTTCCTAATACGCCACAGAGGCCACCAGTAGTCACAAAAACACTTGAACAAAGGGAAGCAGACTATGCTGCTGCTCGAAAAAGGATAATGGGGTCCGCTACTCCGGAGTCACTTAAGGTAGAGACGAAAGAATTAACAGAGTCTAATCCAGTGAAAATGACAGACGATACCAACAAGGTCATTACAAAACAGGATCCATCAACTGCGTCCACCATTCCCACGACTCAGAACATGGAGGTTAGTGGTCAAAGTAACTCTTCGGAAATGACAACCAATCACTTGTT ] [-] EMBL CD187569 [ ATCATGCTTTCACGAACTAAAAATTAATGGCTATCTTCTGCGAACTATCTAGACATTAGTAAGCTAATTATTAACTTACGTATAGCTTTATCTGATATGGACCAACCACCTATCCGAATATTGAGACGACCATGTCCAGTTCCATCTGACGTTCCTAATACGCCACAGAGGCCACCAGTAGTCACAAAAACACTTGAACAAAGGGAAGCCGACTATGCTGCTGCTCGAAAAAGGATAATGGGGTCCGCTACTCCGGAGTCACTTAAGGTAGAGACGAAAGAATTAACAGAGTCTAATCCAGTGAAAATGACAGACGATACCAACAAGGTCATTACAAAACAGGATCCATCAACTGCGTCCACCATTCCCACGACTCAGAACATGGAGGTTAGTGGTCAAAGTAACTCTTCGGAAATGACAACCAATCACTTGTT ] [+] EMBL CD096953 [ AAGCTAATTATTAACTTACGTATAGCTTTATCTGATATGGACCAACCACCTATCCGAATATTGAGACGACCATGTCCAGTTCCATCTGACGTTCCTAATACGCCACAGAGGCCACCAGTAGTCACAAAAACACTTGAACAAAGGGAAGCAGACTATGCTGCTGCTCGAAAAAGGATAATGGGGTCCGCTACTCCGGAGTCACTTAAGGTAGAGACGAAAGAATTAACAGAGTCTAATCCAGTGAAA ] [+] EMBL CD168233 [ TGCGTCCACCATTCCCACGACTCAGAACATGGAGGTTAGTGGTCAAAGTAACTCTTCGGAAATGACAACCAATCACTTGTTCACTAACCACAGTGGAGTCCAACTTTCCATGCCCCAGAGTAACAAACAGCCTCTGGATATCAATGTTGGTCGAAAGCCTCAACAACACTCACATTCTACATCAAACGGCGTTCGGCAGAATTTACAACAGCGCAGTGCAACAAAATAGGATGCCTCGACGAACGAACACGGACCAAAATCGACAACCTCTGTGTACGAACTCACTACATAATTGGCGACCGCAACGAGCGAACACAAATCAAAAATGGAACCGCCAACGACATATTTCGTTATGATCCGAATAATCATCATATGCTCATTATTACAATAATGTCATATCATCATCTAACGTGGAGTTATTATTTTTGTTCGTATTAACATTAAACTATGACATATACGTAGTCATATCACTAATCGAACAAATTATAATGATATGGGCATTACACGTTATGATATTCCAAAACTCCCCGGATTATTTTTATTTTCCAATGGA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||