These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7408#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 291 fasta sequence [TGGATTTATTCTCAAAAATCGTCTATGTTGTCAAGCGATTTGGGTCAAAAGGAGCATAAATTAACAACTTGCGCAATGCAAAGGTTTTGGTAATTCATTATTTTAAAAGTGAGTTGTGTACAGAAGTGGCACTTAAGAGCTCTAATTTTACCGTGACCGTAACTTATTTTTTTC-ACTCAAGGTAAATTCGTCAGTATTCCCTCCAAGTGGTTTCGTCCTTATATTTTCGTAGATATCACCGTCACTTCCTANATTCATTTTTCACCTNTCTCCTATNTGTCGAATGAACAG] [+] EMBL CD199346 [TGGATTTATTCCCAAAAATCGTCTATGTTGTCAAGCGATTTGGGTCAAAAGGAGCATAAATTAACAACTTGCGCAATGCAAAGGTTTTGGTAATTCATTATTTTAAAAGTGAGTTGTGTACAGAAGTGGCACTTAAGAGCTCTAATTTTACCGTGACCGTAACTTATTTTTTTC ACTCAAGGTAAATTCGTCAGTATTCCCTCCAAGTGGTTTCGTCCTTATATTTTCGTAGATATCACCGTCACTTCCTANATTCATTTTTCACCTNTCTCCTATNTGTCGAATGAACAG] [+] EMBL CD199345 [TGGATTTATTCTCAAAAATCGTCTATGTTGTCAAGCGATTTGGGTCAAAAGGAGCATAAATTAACAACTTGCGCAATGCAAAGGTTTTGGTAATTCATTATTTTAAAAGTGAGTTGTGTACAGAAGTGGCACTTAAGAGCTCTAATTTTACCGTGACCGTAACTTATTTTTTTCNACTC AGGTAAATTCGTCAGTATTCCCTCCAAGTGGATTCGTCCTTATATATTCGTAGATATCACCGTCACTTCCT GAATCATTTTTCACCTTTCTCCTATNTGTCGAATGAACAG] [+] EMBL CD199385 [TGGATTTATTCTCAAAAATCGTCTATGTTGTCAAGCGATTTGGGTCAAAAGGAGCATAAATTAACAACTTGCGCAATGCAAAGGTTTTGGTAATTCATTATTTTAAAAGTGAGTTGTGTACAGAAGTGGCACTTAAGAGCTCTAATTTTACCGTGACCGTAACTTATTTTTTTC ACTCAAGGTAAATTCGTCAGTATTCCCTCCAAGTGGTTTCGTCCTTATATTTTCGTAGATATCACCGTCACTTCCTA ATTCA TTTTCACCT TCTCCTAT TGTCG ATG ACAG] [+] EMBL CD199429 [TGGATTTATCCTCAAAAATCGTCTATGTTGTCAAGCGATTTGGGTCAAAAGGAGCATAAATTAACAACTTGCGCAATGCAAAGGTTTTGGTAATTCATTATTTTAAAAGTGAGTTGTGTACAGAAGTGGCACTTAAGAGCTCTAATTTTACCGTGACCGTAACTTATTTTTTTC ACTCAAGGTAAATTCGTCAGTATTCCCTCCAAGTGGTTTCGTCCTTATATTTTCGTAGATATCACCGTCACTTCCTAAATTCATTTTTCACCTNTCTCCTATNTGTCGA ] [+] EMBL CD199410 [TGGATTTATTCTCAAAAATCGTCTATGTTGTCAAGCGATTTGGGTCAAAAGGAGCATAAATTAACAACTTGCGCAATGCANAGGTTTTGGTAATTCATTATTTTAAAAGTGAGTTGTGTACAGAAGTGGCACTTAAGAGCTCTAATTTTACCGTGACCGTAACTTATTTTTTTC ACTCAAGGCAAATTCGTCAGTATTCCCTC ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||