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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7414#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 649 fasta sequence
[GGNTGTAAAGNCAGAAAAAGGTTCGAAAACATCTGACAAGTTTGNAAACTAAGTCAACAGTTCATAACATTAACTCACGCAATCGTAACACGCAAAGAATAATATGGACTGTCACTTATACGAAAGAATTCCTCAAATACTCTGCTTCTCTAGCTGCATTTGGCACCTTTTGCTGGTTTGCTAAGGGACACCCTTTCGCAATTATGTTTGCGTCACTACTAATCGGCTTATATGTATATTTTCAGAGTATTAACT-TTGATTTTGTATTTACTAACCAAAAATAGACACTATTCCCTACTG-AATTTTGTAATTTTTCCCTAC-AAAAAGTTTGAAGACTAGATGAGATATTAATTGAGACGATACTATGAAAACAGGGGGACTATACTCTAACCATTTTTCTAAAGAACTTTGACTTGAGACTAATATCTCATCTTTCTGTTCAAGAATTTTAAGCATGACTACCAAATGTATTCACTTTATAAACTTGGTGAATTTCATGTGTTTTTGATATTGTCTATCTTCTCAAGTTTTTATCATTATACCTCAGATACGGTTAAATGTTACCTTTTTGTACAGAATCTATTCTATATTTTCCAAATTCGTGTCTATGTTTTGCTAATCATCCTCAAGATATCTTAATTGGTCAACA]
[+] EMBL SM7091 [GGNTGTAAAGNCAGAAAAAGGTTCGAAAACATCTGACAAGTTTGNAAACTAAGTCAACAGTTCATAACATTAACTCACGCAATCGTAACACGCAAAGAATAATATGGACTGTCACTTATACGAAAGAATTCCTCAAATACTCTGCTTCTCTAGCTGCATTTGGCACCTTTTGNTGGTTTGCTAAGGGACACCCTTTCGCAATTATGTTTGCGTCACTACTAATCGGCTTATATGTATATTTNCAGAGTATTAACTCTGGATTTCGNATTTACTAACCAAAAATAGACACTATTCCNTACTG ]
[-] EMBL CD075084 [ CACGCAAAGAATAATATGGACTGTCCCTTATACGAAAGAATTCCTCAAATACTTTGGTTCTCTAGCTGCATTTGGCCCCTTTTGCTGGTTTGGTAAGGGACACCCTTTCGCAATTATGTTTGCGTCCCTACTAATCGGCTTATATGTATATTTTCAGAGTATTAACT TTGATTTTGTATTTACTAACCAAAAATAGACCCTATTCCCTACTG AATTTTGTAATTTTTCCCTAC AAAAAGTTTGAAGACTAGATGAGATATTAATTGAGACGATACTATGAAAACAGGGGGGCTATACTTTAACCCTTTTTTTAAAGAACTTTGAATTGAGACTAATATTTCATCTTTCTGTTCAAGAATTTTAAGCATGAGTACCAAATGTATTCCCTTTATA ]
[+] EMBL CD160781 [ GCATTTGGCACCTTTTGCTGGTTTGCTAAGGGACACCCTTTCGCAATTATGTTTGCGTCACTACTAATCGGCTTATATGTATATTTTCAGAGTATTAACT TTGATTTTGTATTTACTAACCAAAAATAGACACTATTCCCTACTG GATTTTGTAATTTTTCCCTAC AAAAAGTTTGAAGACTAGATGAGATATTAATTGAGACGATACTATGAAAACAGGGGGACTATACTCTAACCATTTTTCTAAAGAACTTTGACTTGAGACTAATATCTCATCTTTCTGTTCAAGAATTTTAAGCATGACTACCAAATGTATTCACTTTATAAACTTGGTGAATTTCATGTGTTTTTGATATTGTCTATCTTCTCAAGTTTTTATCATTACACCTCAGATACGGTTAAATGTTACCTTTTTGTACAGAATCTATTCTATATTTTCCAAATTCGTGTCTATGTTTTGCTAATCATCCTCAAGATATCTTAATTGGTCAACA]
[-] EMBL AI026169 [ ATTCCCTACCGCCCCGGGGAAATTTTTCCCTAC AAAAAGTTTGAAGACTAGATGAGATATTAATTGAGACGATACTATGAAAACAGGGGGACTATACTCTAACCATTTTTCTAAAGAACTTTGACTTGAGACTAATATCTCATCTTTCTGTTCAAGAATTTTAAGCATGACTACCAAATGTATTCACTTTATAAACTTGGTGAATTTCATGTGTTTTTGATATTGTCTATCTTCTCAAGTTTTTATCATTATACCTCA ]
[-] EMBL AI026168 [ TTCCCTACAAAAAAGTTTGAAGACTAGATGAGATATTAATTGAGACGATACTATGAAAACA GGGGACTATACTCTAACCATTTTTCTAAAGAACTTTGACTTGAGACTAATATCTCATCTTTCTGTTCAAGAATTTTAAGCATGACTACCAAATGTATTCACTTTATAAACTTGGTGAATTTCATGTGTTTTGGATATTGTCTATCTTCTCAAGTTTTTATCATTATACCTCAag ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||