These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7418#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1352 fasta sequence [GTAGCTTCATCTCCATATGATCCTACTGACCATGAGATTGACGATGCCCGAAGTATATAGCACAAATCTGATGATACAGAAATACATGATTCCAGCGGATGAAGAGCTTTTAACATGTGATATA---CTTGACTTTTTGTTGGTATAGTGATATGCACATTAGCACTTGACAAAGGACCAGTAGAAGGTATATACTCTTCACCTTTTGGTAATGAATTGATTAAGGAATGAAACAATGAAGAAGCAGTATTTACGTAATTTGAATAATTTTTAAATTTATCCCACCGGTTCATAGCCGATAAGCATAATGTCCAATCTGAACACGGTTTCAACTTGTCTACAGAACAATAATCATGCAAGGATAAAGATGAATAACGTTCCAAAAGAGTTGTGGATTGCTTAAAGTCATTTAATTGAGATGACAAAAGATTCCAAGTTACCGACTCGACTTCTTCCATTAAATAAGGTAAAATTGGTGCTAAAAGAGCTTTTAGACATTCAACAGTTAACCAAAATACTGTCTGTGTGTTTCGTCGGGATGAATCATCTGGACTATTGAAGTATAATCTGTCTTTAACTGAAGTTATATATACAGATGATAAATACGATAAAAATTGATCAATTTCAGATAGAATTGTATTATATCGAAATTGTGGATAGTAAGTATTCAATGAATTTGAAATATTAGTTGAAAGAGAATAGAGAACAGCTTTATCCAATGCAGTAAGACAAAGAGAATTGCACGTATCTTCACTAACATTGTTTGCCATATCCAAAATTAATTTAGACAGTGAGTAATTTGTTTTTTCATTGTAATTTAGCTGGGTAACTGGACAAAAATCGTATAAATTTCCAGTCATAAAGCGTAGACTGTTGCGTAGAGCTTTATAACTAGCAGCATTTTGACTGATTTCTTTAGAACCTAAATGACATACAGTATCTAAACCGGAATAACATGCCCACCGACGCATTATGTCAACACATCCATTTTGACTAGAAATTAATTCTTTTGGAGTAATACCATTTCCTANAGATTTCGACATTTTACGACCACACGAATCTGCAACAAAACCATGTATTACAAGATTTCTAAAATAAAATAAAATCTGAAAGTTAGAAAATCACAGAAGAATACAGAGAAAAGTAATATGTGATTTTAACTATAAAGTAATTGGTTTCCATAAAACTTTTAAACGACTAACACATTAATATTGATGATAATATACACATTCCAGTTCTAACGTTTCATTTACTGTTATATCTAGAGCTTTAAATTCTTGCTATGCCGCGTACTACGATGCTACTTGAACGATCAAACCTGCAACGTCTCAAGAGAAAAGACTAGTAAGTAGGAA] [+] EMBL CD086450 [GTAGCTTCATCTCCATATGATCCTACTGACCATGAGATTGACGATGCCCGAAGTATATAGCACAAATCTGATGATACAGAAATACATGATTCCAGCGGATGAAGAGCTTTTAACATGTGATATA CTTGACTTTTTGTTGGTATAGTGATATGCACATTAGCACTTGACAAAGGACCAGTAGAAGGTATATACTCTTCACCTTTTGGTAATGAATTGATTAAGGAATGAAACAATGAAGAAGCAGTATTTACGTAATTTGAATAATTTTTAAATTTATCCCACCGGTTCATAGCCGATAAGCATAATGTCCAATCTGAACACGGTTTCAACTTGTCTACAGAACAATAATCA ] [+] EMBL CD086451 [GTAGCTTCATCTCCATATGATCCTACTGACCATGAGATTGACGATGCCCGAAGTATATAGCACAAATCTGATGATACAGAAATACATGATTCCAGCGGATGAAGAGCTTTTAACATGTGATATA CTTGACTTTTTGTTGGTATAGTGATATGCACATTAGCACTTGACAAAGGACCAGTAGAAGGTATATACTCTTCACCTTTTGGTAATGAATTGATTAAGGAATGAAACAATGAAGAAGCAGTATTTACGTAATTTGAATAATTTTTAAATTTATCCCA ] [-] EMBL CD119275 [ ATGATACAGAAATACATGATTCCAGCGGATGAAGAGCTTTTAACATGTGATATACTTCTTGACTTTTTGTTGGTATAGTGATATGCACATTAGCACTTGACAAAGGACCAGTAGAAGGTATATACTCTTCACTTTTTGGTAATGAATTGATTAAGGAATGAAACAATGAAGAAGCAGTATTTACGTAATTTGAATAATTTTTAAATTTATCCCACCGGTTCATAGCCGATAAGCATAATGTCCAATCTGAACACGGTTTCGACTTGTCTACAGAACAATAATCATGCAAGGATAAAGATGAATAACGTTCCAAAAGAGTTGTGGATTGCTTAAAGTCATTTAATTGAGATGACAAAAGATTCCAAGTTACCGACTCGACTTCTTCCATTAAATAAGGTAAAATTGGTGCTAAAAGAGCTTTTAGACATTCAACAGTTAACCAAAATAC ] [+] EMBL CD162370 [ TAAAGTCATTTAATTGAGATGACAAAAGATTCCAAGTTACCGACTCGACTTCTTCCATTAAATAAGGTAAAATTGGTGCTAAAAGAGCTTTTAGGCATTCAACAGTTAACCAAAATACTGTCTGTGTGTTTCGTCGGGATGAATCATCTGGACTATTGAAGTATAATCTGTCTTTAACTGAAGTTATATATACAGATGATAAATACGATAAAAATTGATCAATTTCAGATAGAATTGTATTATATCGAAATTGTGGATAGTAAGTATTCAATGAATTTGAAATATTAGTTGAAAGAGAATAGAGAACAGCTTTATCCAATGCAGTAAGACAAAGAGAATTGCACGTATCTTCACTAACATTGTTTGCCATATCCAAAATTAATTTAGACAGTGAGTAATTTGTTTTTTCATTGTAATTTAGCTGGGTAACTGGACAAAAATCGTATAAATTTCCAGTCATAAAGCGTAGACTGTTGCGTAGAGCTTTATAACTAGCAGCATTTTGACTGATTTCTTTAGAACCTAAATGACATACAGTATCTAAACCGGAATAACATGCCCACCGACGCATTATGTCAACACATCCATTTTGACTAGAAATTAATTCTTTTGGAGTAATACCATTTCCTANAGATTTCGAC ] [-] EMBL CD162393 [ TGCCATATCCANAATTAATTTAGACAGTGAGTAATTTGTTTTTTCATTGTAATTTAGCTGGGTAACTGGACTAAAATCGTATAAATTTCCAGTCATAAAGCGTAGACTGTTGCGTAGAGCTTTATAACTAGCAGCATTTTGACTGATTTCTTTAGAACCTAAATGACATACAGTATCTAAACCGGAATAACATGCCCACCGACGCATTATGTCAACACATCCATTTTGACTAGAAATTAATTCTTTTGGAGTAATTCCATTTCCTAAAGATTTCGACATTTTACGACCACACGAATCTGCAACAAAACCATGTATTACAAGATTTCTAAAATAAAATAAAATCTGAAAGTTAGAAAATCACAGAAGAATACAGAGAAAAGTAATATGTGATTTTAACTATAAAGTAATTGGTTTCCATAAAACTTTTAAACGACTAACACATTAATATTGATGATAATATACACATTCCAGTTCTAACGTTTCATTTACTGTTATATCTAGAGCTTTAAATTCTTGCTATGCCGCGTACTACGATGCTACTTGAACGATCAAACCTGCAACGTCTCAAGAGAAAAGACTAGTAAGTAGGAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||