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Schistosoma mansoni
cluster # 7418 cluster # 7418       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7418#0 length = 1352 sequences # 5  
consensusID : consensus_7418#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1352
fasta sequence 
                              [GTAGCTTCATCTCCATATGATCCTACTGACCATGAGATTGACGATGCCCGAAGTATATAGCACAAATCTGATGATACAGAAATACATGATTCCAGCGGATGAAGAGCTTTTAACATGTGATATA---CTTGACTTTTTGTTGGTATAGTGATATGCACATTAGCACTTGACAAAGGACCAGTAGAAGGTATATACTCTTCACCTTTTGGTAATGAATTGATTAAGGAATGAAACAATGAAGAAGCAGTATTTACGTAATTTGAATAATTTTTAAATTTATCCCACCGGTTCATAGCCGATAAGCATAATGTCCAATCTGAACACGGTTTCAACTTGTCTACAGAACAATAATCATGCAAGGATAAAGATGAATAACGTTCCAAAAGAGTTGTGGATTGCTTAAAGTCATTTAATTGAGATGACAAAAGATTCCAAGTTACCGACTCGACTTCTTCCATTAAATAAGGTAAAATTGGTGCTAAAAGAGCTTTTAGACATTCAACAGTTAACCAAAATACTGTCTGTGTGTTTCGTCGGGATGAATCATCTGGACTATTGAAGTATAATCTGTCTTTAACTGAAGTTATATATACAGATGATAAATACGATAAAAATTGATCAATTTCAGATAGAATTGTATTATATCGAAATTGTGGATAGTAAGTATTCAATGAATTTGAAATATTAGTTGAAAGAGAATAGAGAACAGCTTTATCCAATGCAGTAAGACAAAGAGAATTGCACGTATCTTCACTAACATTGTTTGCCATATCCAAAATTAATTTAGACAGTGAGTAATTTGTTTTTTCATTGTAATTTAGCTGGGTAACTGGACAAAAATCGTATAAATTTCCAGTCATAAAGCGTAGACTGTTGCGTAGAGCTTTATAACTAGCAGCATTTTGACTGATTTCTTTAGAACCTAAATGACATACAGTATCTAAACCGGAATAACATGCCCACCGACGCATTATGTCAACACATCCATTTTGACTAGAAATTAATTCTTTTGGAGTAATACCATTTCCTANAGATTTCGACATTTTACGACCACACGAATCTGCAACAAAACCATGTATTACAAGATTTCTAAAATAAAATAAAATCTGAAAGTTAGAAAATCACAGAAGAATACAGAGAAAAGTAATATGTGATTTTAACTATAAAGTAATTGGTTTCCATAAAACTTTTAAACGACTAACACATTAATATTGATGATAATATACACATTCCAGTTCTAACGTTTCATTTACTGTTATATCTAGAGCTTTAAATTCTTGCTATGCCGCGTACTACGATGCTACTTGAACGATCAAACCTGCAACGTCTCAAGAGAAAAGACTAGTAAGTAGGAA]

[+] EMBL CD086450             [GTAGCTTCATCTCCATATGATCCTACTGACCATGAGATTGACGATGCCCGAAGTATATAGCACAAATCTGATGATACAGAAATACATGATTCCAGCGGATGAAGAGCTTTTAACATGTGATATA   CTTGACTTTTTGTTGGTATAGTGATATGCACATTAGCACTTGACAAAGGACCAGTAGAAGGTATATACTCTTCACCTTTTGGTAATGAATTGATTAAGGAATGAAACAATGAAGAAGCAGTATTTACGTAATTTGAATAATTTTTAAATTTATCCCACCGGTTCATAGCCGATAAGCATAATGTCCAATCTGAACACGGTTTCAACTTGTCTACAGAACAATAATCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD086451             [GTAGCTTCATCTCCATATGATCCTACTGACCATGAGATTGACGATGCCCGAAGTATATAGCACAAATCTGATGATACAGAAATACATGATTCCAGCGGATGAAGAGCTTTTAACATGTGATATA   CTTGACTTTTTGTTGGTATAGTGATATGCACATTAGCACTTGACAAAGGACCAGTAGAAGGTATATACTCTTCACCTTTTGGTAATGAATTGATTAAGGAATGAAACAATGAAGAAGCAGTATTTACGTAATTTGAATAATTTTTAAATTTATCCCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD119275             [                                                                      ATGATACAGAAATACATGATTCCAGCGGATGAAGAGCTTTTAACATGTGATATACTTCTTGACTTTTTGTTGGTATAGTGATATGCACATTAGCACTTGACAAAGGACCAGTAGAAGGTATATACTCTTCACTTTTTGGTAATGAATTGATTAAGGAATGAAACAATGAAGAAGCAGTATTTACGTAATTTGAATAATTTTTAAATTTATCCCACCGGTTCATAGCCGATAAGCATAATGTCCAATCTGAACACGGTTTCGACTTGTCTACAGAACAATAATCATGCAAGGATAAAGATGAATAACGTTCCAAAAGAGTTGTGGATTGCTTAAAGTCATTTAATTGAGATGACAAAAGATTCCAAGTTACCGACTCGACTTCTTCCATTAAATAAGGTAAAATTGGTGCTAAAAGAGCTTTTAGACATTCAACAGTTAACCAAAATAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD162370             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TAAAGTCATTTAATTGAGATGACAAAAGATTCCAAGTTACCGACTCGACTTCTTCCATTAAATAAGGTAAAATTGGTGCTAAAAGAGCTTTTAGGCATTCAACAGTTAACCAAAATACTGTCTGTGTGTTTCGTCGGGATGAATCATCTGGACTATTGAAGTATAATCTGTCTTTAACTGAAGTTATATATACAGATGATAAATACGATAAAAATTGATCAATTTCAGATAGAATTGTATTATATCGAAATTGTGGATAGTAAGTATTCAATGAATTTGAAATATTAGTTGAAAGAGAATAGAGAACAGCTTTATCCAATGCAGTAAGACAAAGAGAATTGCACGTATCTTCACTAACATTGTTTGCCATATCCAAAATTAATTTAGACAGTGAGTAATTTGTTTTTTCATTGTAATTTAGCTGGGTAACTGGACAAAAATCGTATAAATTTCCAGTCATAAAGCGTAGACTGTTGCGTAGAGCTTTATAACTAGCAGCATTTTGACTGATTTCTTTAGAACCTAAATGACATACAGTATCTAAACCGGAATAACATGCCCACCGACGCATTATGTCAACACATCCATTTTGACTAGAAATTAATTCTTTTGGAGTAATACCATTTCCTANAGATTTCGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD162393             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGCCATATCCANAATTAATTTAGACAGTGAGTAATTTGTTTTTTCATTGTAATTTAGCTGGGTAACTGGACTAAAATCGTATAAATTTCCAGTCATAAAGCGTAGACTGTTGCGTAGAGCTTTATAACTAGCAGCATTTTGACTGATTTCTTTAGAACCTAAATGACATACAGTATCTAAACCGGAATAACATGCCCACCGACGCATTATGTCAACACATCCATTTTGACTAGAAATTAATTCTTTTGGAGTAATTCCATTTCCTAAAGATTTCGACATTTTACGACCACACGAATCTGCAACAAAACCATGTATTACAAGATTTCTAAAATAAAATAAAATCTGAAAGTTAGAAAATCACAGAAGAATACAGAGAAAAGTAATATGTGATTTTAACTATAAAGTAATTGGTTTCCATAAAACTTTTAAACGACTAACACATTAATATTGATGATAATATACACATTCCAGTTCTAACGTTTCATTTACTGTTATATCTAGAGCTTTAAATTCTTGCTATGCCGCGTACTACGATGCTACTTGAACGATCAAACCTGCAACGTCTCAAGAGAAAAGACTAGTAAGTAGGAA]




>consensus_7418#0
GTAGCTTCATCTCCATATGATCCTACTGACCATGAGATTGACGATGCCCGAAGTATATAG
CACAAATCTGATGATACAGAAATACATGATTCCAGCGGATGAAGAGCTTTTAACATGTGA
TATACTTGACTTTTTGTTGGTATAGTGATATGCACATTAGCACTTGACAAAGGACCAGTA
GAAGGTATATACTCTTCACCTTTTGGTAATGAATTGATTAAGGAATGAAACAATGAAGAA
GCAGTATTTACGTAATTTGAATAATTTTTAAATTTATCCCACCGGTTCATAGCCGATAAG
CATAATGTCCAATCTGAACACGGTTTCAACTTGTCTACAGAACAATAATCATGCAAGGAT
AAAGATGAATAACGTTCCAAAAGAGTTGTGGATTGCTTAAAGTCATTTAATTGAGATGAC
AAAAGATTCCAAGTTACCGACTCGACTTCTTCCATTAAATAAGGTAAAATTGGTGCTAAA
AGAGCTTTTAGACATTCAACAGTTAACCAAAATACTGTCTGTGTGTTTCGTCGGGATGAA
TCATCTGGACTATTGAAGTATAATCTGTCTTTAACTGAAGTTATATATACAGATGATAAA
TACGATAAAAATTGATCAATTTCAGATAGAATTGTATTATATCGAAATTGTGGATAGTAA
GTATTCAATGAATTTGAAATATTAGTTGAAAGAGAATAGAGAACAGCTTTATCCAATGCA
GTAAGACAAAGAGAATTGCACGTATCTTCACTAACATTGTTTGCCATATCCAAAATTAAT
TTAGACAGTGAGTAATTTGTTTTTTCATTGTAATTTAGCTGGGTAACTGGACAAAAATCG
TATAAATTTCCAGTCATAAAGCGTAGACTGTTGCGTAGAGCTTTATAACTAGCAGCATTT
TGACTGATTTCTTTAGAACCTAAATGACATACAGTATCTAAACCGGAATAACATGCCCAC
CGACGCATTATGTCAACACATCCATTTTGACTAGAAATTAATTCTTTTGGAGTAATACCA
TTTCCTANAGATTTCGACATTTTACGACCACACGAATCTGCAACAAAACCATGTATTACA
AGATTTCTAAAATAAAATAAAATCTGAAAGTTAGAAAATCACAGAAGAATACAGAGAAAA
GTAATATGTGATTTTAACTATAAAGTAATTGGTTTCCATAAAACTTTTAAACGACTAACA
CATTAATATTGATGATAATATACACATTCCAGTTCTAACGTTTCATTTACTGTTATATCT
AGAGCTTTAAATTCTTGCTATGCCGCGTACTACGATGCTACTTGAACGATCAAACCTGCA
ACGTCTCAAGAGAAAAGACTAGTAAGTAGGAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)