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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7421#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 762 fasta sequence
[TGTCATTAAACTGTCTTCACCACACGCTTCTTGTATCAAATCGCATAATTGATCCGGTGATAGTGGTGCATCAATAACTTTTTCACGTGGTTCTGGTGGTAAGCCAACAGTTACTTGCTTTTGTANAACTAATATAACAGCTAACGATTTAGCCAAACTATCAGCACGTTTACCTAAGAGACCAGCTGTGTAACGTAGTAGGAACCATGATGTTGTCTGCGTGGCTCGTTCATAGACCTCTTTTAGTAATGAACGAACAGTAGCTGGTTGTGTTGGGTCTATTCCAGTATTCCAATCTAAACCACGTAATTGGTGTAATCTTCCAAGTATTTCAACTTGTTCAGCTAAATTATCAGTACATCTTAATCGTTTAACTAATTGATCCGGTGATAAGGAATTTAACCAATCTGTAGAATCCAGTCCACATGTACTCGATCTTCCGTCAGATGCACGACGACTATGCGTACCTGAATAATTTGAACTGTTAGTAGGGTTAATTTGATCTGAATTGACTAAATGGGATGGGGAACGTTGTGATTGTTGACCTCCATAAGTATTTGAATCTGAAGTTTGACAAGTAATATTTGGATCAACTTGTTGATGTTCATGAGATCGAGAAGTTGAAGAATGTTGATGTTGATATGTTTCTGTAGATGAAGTATTACTTT-CCGGATTGATAATGCGTTNTAATGCTAAACGTGACGC-TTTGGATGTTAATCTTCATTTTTGTGTTGAAGTAGACGATNATTTGTACGATCATCA]
[-] EMBL CD190778 [TGTCATTAAACTGTCTTCACCACACGCTTCTTGTATCAAATCGCATAATTGATCCGGTGATAGTGGTGCATCAATAACTTTTTCACGTGGTTCTGGTGGTAAGCCAACAGTTACTTGCTTTTGTANAACTAATATAACAGCTAACGATTTAGCCAAACTATCAGCACGTTTACCTAAGAGACCAGCTGTGTAACGTAGTAGGAACCATGATGTTGTCTGCGTGGCTCGTTCATAGACCTCTTTTAGTAATGAACGAACAGTAGCTGGTTGTGTTGGGTCTATTCCAGTATTCCAATCTAAACCACGTAATTGGTGTAATCTTCCAAGTATTTCAACTTGTTCAGCTAAATTATCAGTACATCTTAATCGTTTAACTAATTGATCCGGCGATAAGGAATTTAACCAATCTGTAGAATCCAGTCCACATGTACTCGATCTTCCGTCAGATGCACGACGACTATGCGTACCTGAATAATTTGAACTGTTAGTAGGGTTAAT ]
[-] EMBL CD166536 [ aAACTAATATATCAGCTAACGATTTAGCCAAACTATCAGCACGTTTACCTAAGAGACCAGCTGTGTAACGTAGTAGGAACCATGATGTTGTCTGCGTGGCTCGTTCATAGACCTCTTTTAGTAATGAACGAACAGTAGCTGGTTGTGTTGGGTCTATTCCAGTATTCCAATCTAAACCACGTAATTGGTGTAATCTTCCAAGTATTTCAACTTGTTCAGCTAAATTATCAGTACATCTTAATCGTTTAACTAATTGATCCGGTGATAAGGAATTTAACCAATCTGTAGAATCCAGTCCACATGTACTCGATCTTCCGTCAGATGCACGACGACTATGCGTACCTGAATAATTTGAACTGTTAGTAGGGTTAATTTGATCTGAATTGACTAAATGGGATGGGGAACGTTGTGATTG TGACCTCCATAAGTATTTGAtgtccgtcg ]
[+] EMBL CD115553 [ TACCTAANA A CAGCTG GT ACGTA TAGGAACCATGATGTTGTCTGCGTGGCTCGTTCATAGACCTCTTTTA TAATGAACGAACAGTAGCTGGTTGTGTTGGGTCTATTCCAGTATTCCAATCTAAACCACGTAATTGGTGTAATCTTCCAAGTATTTCAACTTGTTCAGCTAAATTATCAGTACATCTTAATCGTTTAACTAATTGATCCGGTGATAAGGAATTTAACCAATCTGTAGAATCCAGTCCACATGTACTCGATCTTCCGTCAGATGCACGACGACTATGCGTACCTGAATAATTTGAACTGTTAGTAGGGTTAATTTGATCTGAATTGACTAAATGGGATGGGGAACGTTGTGATTGTTGACCTCCATAAGTATTTGAATCTGAAGTTTGACAAGTAATATTTGGATCAACTTGTTGATGTTCATGAGATCGAGAAGTTGAAGAATGTTGATGTTGATATGTTTCTGTAGATGAAGTATTACTTT CCGGATTGATAATGCGTTNTAATGCTAAACGTGACGC TTTGGATGTTA ]
[+] EMBL CD068454 [ TATTCCAATCTAAACCACGTAATTGGTGTAATCTTCCAAGTATTTCAACTTGTTCAGCTAAATTATCAGTACATCTTAATCGTTTAACTAATTGATCCGGTGATAAGGAATTTAACCAATCTGTAGAATCCAGTCC ]
[+] EMBL CD132608 [ GTCCACATGTACTCGATCTTCCGTCAGATGCACGACGACTATGCGTACCTGAATAATTTGAACTGTTAGTAGGGTTAATTTGATCTGAATTGACTAAATGGGATGGGGAACGTTGTGATTGTTGACCTCCATAAGTATTTGAATCTGAAGTTTGACAAGTAATATTTGGATCAACTTGTTGATGTTCATGAGATCGAGAAGTTGAAGAATGTTGATGTTGATATGTTTCTGTAGATGAAGTATTACTTTCCCGGA TGAATATGCGTTTTAATGCTAAACGTGACGCTTTTGGATGTAAATCTTCATTTTTGTGTTGAAGTAGACGATNATTTGTACGATCATCA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||