These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7421#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 762 fasta sequence [TGTCATTAAACTGTCTTCACCACACGCTTCTTGTATCAAATCGCATAATTGATCCGGTGATAGTGGTGCATCAATAACTTTTTCACGTGGTTCTGGTGGTAAGCCAACAGTTACTTGCTTTTGTANAACTAATATAACAGCTAACGATTTAGCCAAACTATCAGCACGTTTACCTAAGAGACCAGCTGTGTAACGTAGTAGGAACCATGATGTTGTCTGCGTGGCTCGTTCATAGACCTCTTTTAGTAATGAACGAACAGTAGCTGGTTGTGTTGGGTCTATTCCAGTATTCCAATCTAAACCACGTAATTGGTGTAATCTTCCAAGTATTTCAACTTGTTCAGCTAAATTATCAGTACATCTTAATCGTTTAACTAATTGATCCGGTGATAAGGAATTTAACCAATCTGTAGAATCCAGTCCACATGTACTCGATCTTCCGTCAGATGCACGACGACTATGCGTACCTGAATAATTTGAACTGTTAGTAGGGTTAATTTGATCTGAATTGACTAAATGGGATGGGGAACGTTGTGATTGTTGACCTCCATAAGTATTTGAATCTGAAGTTTGACAAGTAATATTTGGATCAACTTGTTGATGTTCATGAGATCGAGAAGTTGAAGAATGTTGATGTTGATATGTTTCTGTAGATGAAGTATTACTTT-CCGGATTGATAATGCGTTNTAATGCTAAACGTGACGC-TTTGGATGTTAATCTTCATTTTTGTGTTGAAGTAGACGATNATTTGTACGATCATCA] [-] EMBL CD190778 [TGTCATTAAACTGTCTTCACCACACGCTTCTTGTATCAAATCGCATAATTGATCCGGTGATAGTGGTGCATCAATAACTTTTTCACGTGGTTCTGGTGGTAAGCCAACAGTTACTTGCTTTTGTANAACTAATATAACAGCTAACGATTTAGCCAAACTATCAGCACGTTTACCTAAGAGACCAGCTGTGTAACGTAGTAGGAACCATGATGTTGTCTGCGTGGCTCGTTCATAGACCTCTTTTAGTAATGAACGAACAGTAGCTGGTTGTGTTGGGTCTATTCCAGTATTCCAATCTAAACCACGTAATTGGTGTAATCTTCCAAGTATTTCAACTTGTTCAGCTAAATTATCAGTACATCTTAATCGTTTAACTAATTGATCCGGCGATAAGGAATTTAACCAATCTGTAGAATCCAGTCCACATGTACTCGATCTTCCGTCAGATGCACGACGACTATGCGTACCTGAATAATTTGAACTGTTAGTAGGGTTAAT ] [-] EMBL CD166536 [ aAACTAATATATCAGCTAACGATTTAGCCAAACTATCAGCACGTTTACCTAAGAGACCAGCTGTGTAACGTAGTAGGAACCATGATGTTGTCTGCGTGGCTCGTTCATAGACCTCTTTTAGTAATGAACGAACAGTAGCTGGTTGTGTTGGGTCTATTCCAGTATTCCAATCTAAACCACGTAATTGGTGTAATCTTCCAAGTATTTCAACTTGTTCAGCTAAATTATCAGTACATCTTAATCGTTTAACTAATTGATCCGGTGATAAGGAATTTAACCAATCTGTAGAATCCAGTCCACATGTACTCGATCTTCCGTCAGATGCACGACGACTATGCGTACCTGAATAATTTGAACTGTTAGTAGGGTTAATTTGATCTGAATTGACTAAATGGGATGGGGAACGTTGTGATTG TGACCTCCATAAGTATTTGAtgtccgtcg ] [+] EMBL CD115553 [ TACCTAANA A CAGCTG GT ACGTA TAGGAACCATGATGTTGTCTGCGTGGCTCGTTCATAGACCTCTTTTA TAATGAACGAACAGTAGCTGGTTGTGTTGGGTCTATTCCAGTATTCCAATCTAAACCACGTAATTGGTGTAATCTTCCAAGTATTTCAACTTGTTCAGCTAAATTATCAGTACATCTTAATCGTTTAACTAATTGATCCGGTGATAAGGAATTTAACCAATCTGTAGAATCCAGTCCACATGTACTCGATCTTCCGTCAGATGCACGACGACTATGCGTACCTGAATAATTTGAACTGTTAGTAGGGTTAATTTGATCTGAATTGACTAAATGGGATGGGGAACGTTGTGATTGTTGACCTCCATAAGTATTTGAATCTGAAGTTTGACAAGTAATATTTGGATCAACTTGTTGATGTTCATGAGATCGAGAAGTTGAAGAATGTTGATGTTGATATGTTTCTGTAGATGAAGTATTACTTT CCGGATTGATAATGCGTTNTAATGCTAAACGTGACGC TTTGGATGTTA ] [+] EMBL CD068454 [ TATTCCAATCTAAACCACGTAATTGGTGTAATCTTCCAAGTATTTCAACTTGTTCAGCTAAATTATCAGTACATCTTAATCGTTTAACTAATTGATCCGGTGATAAGGAATTTAACCAATCTGTAGAATCCAGTCC ] [+] EMBL CD132608 [ GTCCACATGTACTCGATCTTCCGTCAGATGCACGACGACTATGCGTACCTGAATAATTTGAACTGTTAGTAGGGTTAATTTGATCTGAATTGACTAAATGGGATGGGGAACGTTGTGATTGTTGACCTCCATAAGTATTTGAATCTGAAGTTTGACAAGTAATATTTGGATCAACTTGTTGATGTTCATGAGATCGAGAAGTTGAAGAATGTTGATGTTGATATGTTTCTGTAGATGAAGTATTACTTTCCCGGA TGAATATGCGTTTTAATGCTAAACGTGACGCTTTTGGATGTAAATCTTCATTTTTGTGTTGAAGTAGACGATNATTTGTACGATCATCA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||