Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7421 cluster # 7421       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7421#0 length = 762 sequences # 5  

consensusID : consensus_7421#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 762
fasta sequence
                              [TGTCATTAAACTGTCTTCACCACACGCTTCTTGTATCAAATCGCATAATTGATCCGGTGATAGTGGTGCATCAATAACTTTTTCACGTGGTTCTGGTGGTAAGCCAACAGTTACTTGCTTTTGTANAACTAATATAACAGCTAACGATTTAGCCAAACTATCAGCACGTTTACCTAAGAGACCAGCTGTGTAACGTAGTAGGAACCATGATGTTGTCTGCGTGGCTCGTTCATAGACCTCTTTTAGTAATGAACGAACAGTAGCTGGTTGTGTTGGGTCTATTCCAGTATTCCAATCTAAACCACGTAATTGGTGTAATCTTCCAAGTATTTCAACTTGTTCAGCTAAATTATCAGTACATCTTAATCGTTTAACTAATTGATCCGGTGATAAGGAATTTAACCAATCTGTAGAATCCAGTCCACATGTACTCGATCTTCCGTCAGATGCACGACGACTATGCGTACCTGAATAATTTGAACTGTTAGTAGGGTTAATTTGATCTGAATTGACTAAATGGGATGGGGAACGTTGTGATTGTTGACCTCCATAAGTATTTGAATCTGAAGTTTGACAAGTAATATTTGGATCAACTTGTTGATGTTCATGAGATCGAGAAGTTGAAGAATGTTGATGTTGATATGTTTCTGTAGATGAAGTATTACTTT-CCGGATTGATAATGCGTTNTAATGCTAAACGTGACGC-TTTGGATGTTAATCTTCATTTTTGTGTTGAAGTAGACGATNATTTGTACGATCATCA]

[-] EMBL CD190778             [TGTCATTAAACTGTCTTCACCACACGCTTCTTGTATCAAATCGCATAATTGATCCGGTGATAGTGGTGCATCAATAACTTTTTCACGTGGTTCTGGTGGTAAGCCAACAGTTACTTGCTTTTGTANAACTAATATAACAGCTAACGATTTAGCCAAACTATCAGCACGTTTACCTAAGAGACCAGCTGTGTAACGTAGTAGGAACCATGATGTTGTCTGCGTGGCTCGTTCATAGACCTCTTTTAGTAATGAACGAACAGTAGCTGGTTGTGTTGGGTCTATTCCAGTATTCCAATCTAAACCACGTAATTGGTGTAATCTTCCAAGTATTTCAACTTGTTCAGCTAAATTATCAGTACATCTTAATCGTTTAACTAATTGATCCGGCGATAAGGAATTTAACCAATCTGTAGAATCCAGTCCACATGTACTCGATCTTCCGTCAGATGCACGACGACTATGCGTACCTGAATAATTTGAACTGTTAGTAGGGTTAAT                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD166536             [                                                                                                                             aAACTAATATATCAGCTAACGATTTAGCCAAACTATCAGCACGTTTACCTAAGAGACCAGCTGTGTAACGTAGTAGGAACCATGATGTTGTCTGCGTGGCTCGTTCATAGACCTCTTTTAGTAATGAACGAACAGTAGCTGGTTGTGTTGGGTCTATTCCAGTATTCCAATCTAAACCACGTAATTGGTGTAATCTTCCAAGTATTTCAACTTGTTCAGCTAAATTATCAGTACATCTTAATCGTTTAACTAATTGATCCGGTGATAAGGAATTTAACCAATCTGTAGAATCCAGTCCACATGTACTCGATCTTCCGTCAGATGCACGACGACTATGCGTACCTGAATAATTTGAACTGTTAGTAGGGTTAATTTGATCTGAATTGACTAAATGGGATGGGGAACGTTGTGATTG TGACCTCCATAAGTATTTGAtgtccgtcg                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD115553             [                                                                                                                                                                          TACCTAANA A CAGCTG GT ACGTA TAGGAACCATGATGTTGTCTGCGTGGCTCGTTCATAGACCTCTTTTA TAATGAACGAACAGTAGCTGGTTGTGTTGGGTCTATTCCAGTATTCCAATCTAAACCACGTAATTGGTGTAATCTTCCAAGTATTTCAACTTGTTCAGCTAAATTATCAGTACATCTTAATCGTTTAACTAATTGATCCGGTGATAAGGAATTTAACCAATCTGTAGAATCCAGTCCACATGTACTCGATCTTCCGTCAGATGCACGACGACTATGCGTACCTGAATAATTTGAACTGTTAGTAGGGTTAATTTGATCTGAATTGACTAAATGGGATGGGGAACGTTGTGATTGTTGACCTCCATAAGTATTTGAATCTGAAGTTTGACAAGTAATATTTGGATCAACTTGTTGATGTTCATGAGATCGAGAAGTTGAAGAATGTTGATGTTGATATGTTTCTGTAGATGAAGTATTACTTT CCGGATTGATAATGCGTTNTAATGCTAAACGTGACGC TTTGGATGTTA                                              ]
[+] EMBL CD068454             [                                                                                                                                                                                                                                                                                               TATTCCAATCTAAACCACGTAATTGGTGTAATCTTCCAAGTATTTCAACTTGTTCAGCTAAATTATCAGTACATCTTAATCGTTTAACTAATTGATCCGGTGATAAGGAATTTAACCAATCTGTAGAATCCAGTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD132608             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTCCACATGTACTCGATCTTCCGTCAGATGCACGACGACTATGCGTACCTGAATAATTTGAACTGTTAGTAGGGTTAATTTGATCTGAATTGACTAAATGGGATGGGGAACGTTGTGATTGTTGACCTCCATAAGTATTTGAATCTGAAGTTTGACAAGTAATATTTGGATCAACTTGTTGATGTTCATGAGATCGAGAAGTTGAAGAATGTTGATGTTGATATGTTTCTGTAGATGAAGTATTACTTTCCCGGA TGAATATGCGTTTTAATGCTAAACGTGACGCTTTTGGATGTAAATCTTCATTTTTGTGTTGAAGTAGACGATNATTTGTACGATCATCA]


>consensus_7421#0 TGTCATTAAACTGTCTTCACCACACGCTTCTTGTATCAAATCGCATAATTGATCCGGTGA TAGTGGTGCATCAATAACTTTTTCACGTGGTTCTGGTGGTAAGCCAACAGTTACTTGCTT TTGTANAACTAATATAACAGCTAACGATTTAGCCAAACTATCAGCACGTTTACCTAAGAG ACCAGCTGTGTAACGTAGTAGGAACCATGATGTTGTCTGCGTGGCTCGTTCATAGACCTC TTTTAGTAATGAACGAACAGTAGCTGGTTGTGTTGGGTCTATTCCAGTATTCCAATCTAA ACCACGTAATTGGTGTAATCTTCCAAGTATTTCAACTTGTTCAGCTAAATTATCAGTACA TCTTAATCGTTTAACTAATTGATCCGGTGATAAGGAATTTAACCAATCTGTAGAATCCAG TCCACATGTACTCGATCTTCCGTCAGATGCACGACGACTATGCGTACCTGAATAATTTGA ACTGTTAGTAGGGTTAATTTGATCTGAATTGACTAAATGGGATGGGGAACGTTGTGATTG TTGACCTCCATAAGTATTTGAATCTGAAGTTTGACAAGTAATATTTGGATCAACTTGTTG ATGTTCATGAGATCGAGAAGTTGAAGAATGTTGATGTTGATATGTTTCTGTAGATGAAGT ATTACTTTCCGGATTGATAATGCGTTNTAATGCTAAACGTGACGCTTTGGATGTTAATCT TCATTTTTGTGTTGAAGTAGACGATNATTTGTACGATCATCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)