cluster # 7422

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Schistosoma mansoni
cluster # 7422 cluster # 7422 Sequences # 5 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7422#0 length = 570 sequences # 5

consensusID : consensus_7422#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 570
fasta sequence

                              [ACTCGACTACAAACAATTAAACATATTGAAGGAGAGAAGGTATTCAAAGGAATAACAGATTG-TTTTATGCAAACACTACGTGATGAAGGTGTTCATGGTCTGTTCAAAGGTGCTGGTTGTCGTGTTATGGTTATGGCACCATTATTTGGTATAGCACAAACTGTGTATTATCTTGGTGTTGCTGAACGAATTTTAGGCTATCCAAGATATTAAAAAAAATGAATGAAATGT--ACACACACACACACAAACATTCATTTTCAATTCATAAAAATGAAATGATGCTTTGATGCCCTATCACCAAATGTATTCATTCATGTCTACTTATTTTTAATAGAGGATAGGGGAACAGTAAGGATTAGTAAGTTATGCAATGCATTCCTTCTTTTATTTTCTTTCAGACAATAAATCATTATTATTTTCCATACAATTTTGTAATAGGTAATTTGTATTGCTTTGTCAGTAGATAATTAGCGATTGTGATGTGTCAGCTTCGATTGAATTCCATAATGATGTTATGTTTCCTTCTTTCAATCNCTTATTCTTCATTATAGNTGATTATTNTAATTTCCC]

[+] EMBL CD181835             [ACTCGACTACAAACAATTAAACATATTGAAGGAGAGAAGGTATTCAAAGGAATAACAGATTG TTTTATGCAAACACTACGTGATGAAGGTGTTCATGGTCTGTTCAAAGGTGCTGGTTGTCGTGTTATGGTTATGGCACCATTATTTGGTATAGCACANACTGTGTATTATCTTGGTGTTGCTGAACGAATTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD153290             [    GACTACAAACAATTAAACATATTGAAGGAGAGAAGGTATTCAAAGGAATAACAGATTG TTTTATGCAAACACTACGTGATGAAGGTGTTCATGGTCTGTTCAAAGGTGCTGGTTGTCGTGTTATGGTTATGGCACCATTATTTGGTATAGCACAAACAGTGTATTATCTTGGTGTTGCTGAACGAATTTTAGGCTATCCAAGATATTAAAAAAAATGAATGAAATGT  ACACACACACACACAAACATTCATTTTCAATTCATAAAAATGAAATGATGCTTTGATGCCCTATCACCAAATGTATTCATTCATGTCTACTTATTTTTAATAGAGGATAGGGGAACAGTAAGGATTAGTAAGTTATGCAATGCATTCCTTCTTTTATTTTCTTTCAGACAATAAATCATTATTATTTTCCATACAATTTTGTAATAGGTAATTTGTATTGCTTTGTCAGTAGATAATTAGCGATTGTGATGTGTCAGCTTCGATTGAATTCCATAATGATGTTATGTTTCCTTCTTTCAATCNCTTATTCTTCATTATAGNTGATTATTNTAATTTCCC]
[-] EMBL CD178808             [                                                  AATAACAGATTG TTTTATGCAAACACTACGTGATGAAGGTGTTCATGGTCTGTTCAAAGGTGCTGGTTGTCGTGTTATGGTTATGGCACCATTATTTGGTATAGCACAAACTGTGTATTATCTTGGTGTTGCTGAACGAATTTTAGGCTATCCAAGATATTAAAAAAAATGAATGAAATGT    ACACACACACACAAACATTCATTTTCAATTCATAAAAATGAAATGATGCTTTGATGCCCTATCACCAAATGTATTCATTCATGTCTACTTATTTTTAATAGAGGATAGGGGGACAGTAAGGATTAGTAAGTTATGAAATGCATTCCTTCTCTTATTTTCTTTCAGACAATAAATCATTATTATTTTCTATACAATTTTGTAATAGGTAATTTGTATTGCTTTGTCAGTAGATAATTAGCGATTGTGATGTGTCAGCTTCGATTGAATTCCATAATGATGTTATGTTTCCTTCTTTCAATCCCTTATTCTTCATTATAGTTGATTATT          ]
[-] EMBL CD179155             [                                                  AATAACAGATTGTTTTTATGCAAACACTACGTGATGAAGGTGTTCATGGTCTGTCAAAAGGTGCTGGTTGTCGTGTTATGGTTATGGCACCATTATTTGGTATAGCACAAACTGTGTATTATCTTGGTGTTGCTGAACGAATTTTAGGCTATCCAAGATATTAAAAAAAA GAATGAAATGT    ACACACACACACAAACATTCATTTTCAATTCATAAAAATGAAATGATGCTTTGATGCCCTATCACCAAATGTATTCATTCATGTCTACTTATTTTTAATAGAGGATAGGGGGACAGTAAGGATTAGTAAGTTATGCAATGCATTCCTTCTTTTATTTTCTTTCAGACAATAAATCATTATTATTTTCTATACAATTTTGTAATAGGTAATTTGTATTGCTTTGTCAGTAGATAATTAGCGATTGTGATGTGTCAGCTTCGATTGAATTCCATAATGAT                                                           ]
[-] EMBL CD122232             [                                                           TTG TTTTATGCAAACACTACGTGATGAAGGTGTTCATGGTCTGTTCAAAGGTGCTGGTTGTCGTGTTATGGTTATGGCACCATTATTTGGTATAGCACAAACTGTGTATTATCTTGGTGTTGCTGAACGAATTTTAGGCTATCCAAGATATTAAAAAAAATGAATGAAATGTACACACACACACACACAAACATTCATTTTCAATTCATAAAAATGAAATGATGCTTTGATGCCCTATCACCAAATGTATTCATTCATGTCTACTTATTTTTAATAGAGGATAGGGGAACAGTAAGGATTAGTAAGTTATGCAATGCATTCCTTCTTTTATTTTCTTTCAGACAATAAATCATTATTATTTTCCATACAATTTTGTAATAGGTAATTTGTATTGCTTTGTCAGTAGATAATTAGCGATTGTGATGTGTCAGCTTCGATTGAATTCCATAATGATGTTA                                                       ]




>consensus_7422#0
ACTCGACTACAAACAATTAAACATATTGAAGGAGAGAAGGTATTCAAAGGAATAACAGAT
TGTTTTATGCAAACACTACGTGATGAAGGTGTTCATGGTCTGTTCAAAGGTGCTGGTTGT
CGTGTTATGGTTATGGCACCATTATTTGGTATAGCACAAACTGTGTATTATCTTGGTGTT
GCTGAACGAATTTTAGGCTATCCAAGATATTAAAAAAAATGAATGAAATGTACACACACA
CACACAAACATTCATTTTCAATTCATAAAAATGAAATGATGCTTTGATGCCCTATCACCA
AATGTATTCATTCATGTCTACTTATTTTTAATAGAGGATAGGGGAACAGTAAGGATTAGT
AAGTTATGCAATGCATTCCTTCTTTTATTTTCTTTCAGACAATAAATCATTATTATTTTC
CATACAATTTTGTAATAGGTAATTTGTATTGCTTTGTCAGTAGATAATTAGCGATTGTGA
TGTGTCAGCTTCGATTGAATTCCATAATGATGTTATGTTTCCTTCTTTCAATCNCTTATT
CTTCATTATAGNTGATTATTNTAATTTCCC

clustalw multiple alignements is not computed in this case