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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7425#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 604 fasta sequence
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[+] EMBL CD092217 [GTGATAAACATGGTAGACATGACAATAAAATTGACATTTTCTACTGCATTATGCAATATAAACATTGTGTATAAGGTTGGGTTATTATTTTTTGGAAGATAACAAGATAAGAGCAATGGAACATTTAGAATGATGAAATAAGTGATATCAGTTTCACTGTGATTAACTACTGATTTGTCAGTTTATTACTGTTGATTCGATGTATTGATTTGGATACGTACCTTTCCTTATTCATGTCGAATATTCAATGTTGATCATAAAATGATAATGGGATATTTTAAATATTCCCAGAGTTGAATAAACAAATCAAGTATCTTGTTACTATTCTTTATGAGCGTTTAAGTAAACAATAGGTTGAAACGCTATCAAAAATTAATAAGCGGTAAGGTTTATTGGAAACGTCAGTCAGTTAAATAAAAACATAAAACCTATAATCAATCCGCATTATTTCAAATCGCCACTCCACATTAGTACAACGGACCCCAGATTGGTGAAAGTAGTAATAGCAGTAGAAATCGCTAGGTCATAAAACAATGTAGTTAANAAAAAGATTAAAAACTGTAATATAATTTTGAAACTCAGTAGCTGAATAAAATTCAACTCA]
[+] EMBL CD092265 [GTGATAAACATGGTAGACATGACAATAAAATTGACATTATCTACTGCATTATGCAATATAAACATTGTGTATAAGGTCGGGTTATTATTTTTTGGAAGATAACAAGATAAGAGCAATGGAACATTTAGAATGATGAAATAAATGATATCAGTTTCACTGTGATTAACTACTGATTTGTCAGTTTATTACTGTTGATTCGATGTATTGATTTGGATACGTACCTTTCCTTATTCATGTCGAATATTCAATGTTGATCATAAAATGATAATGGGATATTTTAAATATTCCCAGAGTAGAATAAACAAATCAAGTATCTTGTTACTATTCTTTATGAGCGTTTAAGTAAACAATAGGTTGAAACGCTATCAAAAATTAATAAGCGGTAAGATTTATTGGAAACGTCAGTCAGTTAAATAAAAACATAAAACCTATAATCAATCCGCATTATTTCAAATCGCCACTCCACATTAGTACAACGGACCCCAGATTGGTGAAAGTAGTAATAGCAGTAGAAATCGCTAGGTCATAAAACAATGTAGTTAAAAAAAAGATTAAAAACTGTAATATAGTTTTGAAACTCAGTAGCT ]
[+] EMBL CD092277 [GTGATAAACATGGTAGACATGACAATAAAATTGACATTATCTACTGCATTATGCAATATAAACATTGTGTATAAGGTTGGGTTATTATTTTTTGGAAGATAACAAGATAAGAGCAATGGAACATTTAGAATGATGAAATAAATGATATCAGTTTCACTGTGATTAACTACTGATTTGTCAGTTTATTACTGTTGATTCGATGTATTGATTTGGATACGTACCTTTCCTTATTCATGTCGAATATTCAATGTTGATCATAAAATGATAATGGGATATTTTAAATATTCCCAGAGTTGAATAAACAAATCAAGCATCTTGTTACTATTCTTTATGAGCGTTTAAGTAAACAATAGGTTGAAACGCTATCAAAAATTAATAAGCGGTAAGATTTATTGGAAACGTCAGTCAGTTAAATAAAAACATAAAACCTATAATCAATCCGCATTATTTCAAATCGCCACTCCACATTAGTACAACGGACCCCAGATTGGTGAAAGTAGTAATAGCAGTAGAAATCGCTAGGTCATAAAACAATGTAGTTAAAAAAAAGATTAAAAACTGTAATATAGTTNTGAAACTCAGTAGCT ]
[+] EMBL CD092210 [GTGATAAACATGGTAGACATGACAATAAAATTGACATTTTCTACTGCATTATGCAATATAAACATTGTGTATAAGGTTGGGTTATTATTTTTTGGAAGATAACAAGATAAGAGCAATGGAACATTTAGAATGATGAAATAAATGATATCAGTTTCACTGTGATTAACTACTGATTTGTCAGTTTATTACTGTTGATTCGATGTATTGATTTGGATACGTACCTTTCCTTATTCATGTCGAATATTCAATGTTGATCATAAAATGATAATGGGATATTTTAAATATTCCCAGAGTTGAATAAACAAATCAAGTATCTTGTTACTATTCTTTATGAGCGTTTAAGTAAACAATAGGTTGAAACGCTATCAAAAATTAATAAGCGGTAAGATTTATCGGAAACGTCAGTCAGTTAAATAAAAACATAAAACCTATAATCAATCCGCATTATTTCAAATCGCCACTCCACATTAGTACAACGGACCCCAGATTGGTGAAAGTAGTAATAGCAGTAGAAATCGCTAGGTCATAAAACAATGTAGTTAAAAAAAAGATTAAAAACTGTAATATAATTTTGAAACTCAGTAGCT ]
[-] EMBL CD092287 [ TGATAAACATGGTAGACATGACAATANAATTGACATTATCTACTGCATTATGCAATATAAACATTGTGTATAAGGTTGGGTTATTATTTTTTGGAAGATAACAAGATAAGAGCAATGGAACATTTAGAATGATGAAATAAATGATATCAGTTTCACTGTGATTAACTACTGATTTGTCAGTTTATTACTGTTGATTCGATGTATTGATTTGGATACGTACCTTTCCTTATTCATGTCGAATATTCAATGTTGATCATAAAATGATAATGGGATATTTTAAATATTCCCAGAGTTGAATAAACAAATCAAGTATCTTGTTACTATTCTTTATGAGCGTTTAAGTAAACAATAGGTTGAAACGCTATCAAAAATTAATAAGCGGTAAGATTTATTGGAAACGTCAGTCAGTTAAATAAAAACATAAAACCTATAATCAATCCGCATTATTTCAAATCGCCACTCCACATTAGTACAACGGACCCCAGATTGGTGAAAGTAGTAATAGCAGTAGAAATCGCTAGGTCATAAAACAATGTAGTTAAAAAAAAGATTAAAAACTGTAATATAGTTTTGAAACTCAGTAGCTG ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||