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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7428#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 638 fasta sequence
[AAGTTGTTGAGATGTCTCTATAACGCTGCATTCTCCAATGAACTTGGTTAAAAGCCTGAAGTTGGTCACAACCAGATCAAAATTTTTGCATT-ACTTAATCGAGGATAATTTGGTTGGTAAGACTACGGTGTATCGGTTTTCAACCAGACCTGGATCGATTTCAAATTCCGTCAAGACAACTGCACGTCCAAAACCTTCATCCCTTGTTGGTAAACATGCACCACTGACTCTTACAAAGTCGGCCGTAGCTCGAGCTCTACAGCTTTTGCAAATGAATCCAAAAGCCACAGGTTTACGAATTGGAGTTAGGACCCGTGGATGCAACGGCTTGTCATATACTTTGGACTTTTGTTTTGAAGGACGCCAACCTGGAGATGAGGTTGTAGAACAAGATAACGTGCGCATTTTTATTGATCGCCGAGCACAGCTGACGTTATTAGGCACTGAAATGGACTATCAGCAGGACGTGCTATCAAGTCAATTTGTTTTTAATAACCCTAATATTAAAGGCACATGTGGGTGCGGAGAGAGCTTCAGTGTATAGATTTCGATTCTTAATTGTGATCTAGCACCTGTGTATACTTCCAGATATGTATGAAATTTAAGTCGACTTATTCTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL CD079251 [AAGTTGTTGAGATGTCTCTATAACGCTGCATTCTCCAATGAACTTGGTTAAAAGCCTGAAGTTGGTCACAACCAGATCAAAATTTTTGCATT ACTTAATCGAGGATAATTTGGTTGGTAAGACTACGGTGTATCGGTTTTCAACCAGACCTGGATCGATTTCAAATTCCGTCAAGACAACTGCACGTCCAAAACCTTCATCCCTTGTTGGTAAACATGCACCACTGACTCTTACAAAGTCGGCCGTAGCTCGAGCTCTACAGCTTTTGCAAATGAATCCAAAAGCCACAGGTTTACGAATTGGAGTTAGGACCCGTGGATGCAACGGCTTGTCATATACTTTGGACTTTTGTTTTGAAGGACGCCAACCTGGAGATGAGGTTGTAGAACAAGATAACGTGCGCATTTTTATTGATCGCCGAGCACAGCTGACGTTATTAGGCACTGAAATGGACTATCAGCAGGACGTGCTATCAAGTCAATTTGTTTTTAATAACCCTAATATTAAAGGCACATGTGGGTGCGGAGAGAGCTTCAGTGTATAGATTTCGATTCTTAATTGTGATCTAGCACCTGTGTATACTTCCAGATATGTATGANATTTAAGTCGA ]
[-] EMBL CD068534 [ TCACAACCAGATCGAAATTTTTGCATTGACTTAATCGAGGATAATTTGGTTGGTAAGACTACGGTGTATCGGTTTTCAACCAGACCTGGATCGATTTCAAATTCCGTCAAGACAACTGCACGTCCAAAACCTTCATCCCTTGTTGGTAAACATGCACCACTGACTCTTACAAAGTCGGCCGTAGCTCGAGCTCTACAGCTTTTGCAAATGAATCCAAAAGCCACAGGTTTACGAATTGGAGTTAGGACCCGTGGATGCAACGGCTTGTCATATACTTTGGACTTTTGTTTTGAAGGACGCCAACCTGGAGATGAGGTTGTAG ACAAGATAACGTGCGCA ]
[-] EMBL CD146500 [ CCAAAACCTTCATCCCTTGTTGGTAAACATGCACCACTGACTCTTACAAAGTCGGCCGTAGCTCGAGCTCTACAGCTTTTGCAAATGAATCCAAAAGCCACAGGTTTACGAATTGGAGTTAGGACCCGTGGATGCAACGGCTTGTCATATACTTTGGACTTTTGTTTTGAAGGACGCCAACCTGGAGATGAGGTTGTAGAACAAGATAACGTGCGCATTTTTATTGATCGCCGAGCACAGCTGACGTTATTAGGCACTGAAATGGACTATCAGCAGGACGTGCTATCAAGTCAATTTGTTTTTAATAACCCTAATATT ]
[-] EMBL AI395349 [ ATCCAAAAGCCACAGGTTTACGAATTGGAGTTAGGACCCGTGGATGCAACGGCTTGTCATATACTTTGGACTTGTGTTTTGAAGGACGCCAACCTGGAGATGAGGTTGTAGAACAAGATAACGTGCGCATTTTTATTGATCGCCGAGCACAGCTGACGTTATTAGGCACTGAAATGGACTATCAGCAGGACGTGCTATCAAGTCAATTTGTTTTTAATAACCCTAATATTAAAGGCACATGTGGGTGCGGAGAGAGCTTCAGTGTATAGATTTCGATTCTTAATTGTGATCTAGCACCTGTGTATACTTCCAGATATGTATGAAATTTAAGTCGACTTATTCTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL CD135154 [ ACAAGATAACGTGCGCATTTTTATTGATCGCCGAGCACAGCTGACGTTATTAGGCACTGAAATGGACTATCAGCAGGACGTGCTATCAAGTCAATTTGTTTTTAATAACCCTAATATTAAAGGCACATGTGGGTGCGGAGAGAGCTTCAGTGTATAGATTTCGATTCTTAATTGTGATCTAGCACCTGTGTATACTTCCAGATATGTATGAAATTTAAGTCGAC ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||