These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7430#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 948 fasta sequence [AAATGTATTTTATATATATATATATCACAGAAGGTGATATAAATCACCATGATTGTTAACTTTGAAGGTATGAACAAAAAAACTTGGAAGTATAGAAATGTATAGTGTTTATTATACGATGTACGATTTTTGCATCAAAATATATGACGAGAGAACCAAGAAAGAAACAGTGCATGTGCTATATCTATATAGTTTATGCATTGATGTCTATTAGTGCTTAATTAAGGAACATAGGCACAAACACAATGATAATAAACGGTGATACTAATGATAATAATGTGTAATAATCGTACAATGCAAGAATGAAAATTTACAAAAACAGGAAAAAAAGAGCGGGAATGAATGTTGTTCCGAAAAAAAACAACCGGCGTCACAGTATATCGCATAACGTTTGATTGGGTAACAAAAGATATGTCTTTCTTTTTATTCTCCAATGAAAAAATTGTTTTTCGGGGGCTTTTTCACACTAGTCCACCACTTTAGTCGACTTTTACAACTCCGTAAATTTTTCGAACAAACCAGAAGCACGCGTAAAAGCCAACAGAACCTGACGAAGATAATAACAAGAGTAAACATTTTAAAAAATGTTGTAGAACAGTATTTAAAATTCAGCCACTAGAAATACTGATAATTGGTAACCGATATAATCTAAGAATGGAAAAGGAGAGAGGTAATAGCCAAGAAAAAGTGTTCATATCCCCCTTGCCTAAGTCTTATTAAATCTAAGTGCAACTTCTAATCAACTATGAGCTATAATGTAATCGGCTTTACATGAAGGATACCCGACTGTCCAAACGGAAATAGACGGAGTAAGTGTTAAACAAGTGACCTAATGGTTAAAGGACAACTGTTTCAATCACTAACCCACTAAGCTTCATAACTGTTCAGTATGAAAAACGAACTTTAAGCGAACAACTAGCAGTATCACATACCGGAATATGGGACCAA] [+] EMBL CD073365 [AAATGTATTTTATATATATATATATCACAGAAGGTGATATAAATCACCATGATTGTTAACTTTGAAGGTATGAACAAAAAAACTTGGAAGTATAGAAATGTATAGTGTTTATTATACGATGTACGATTTTTGCATCAAAATATATGACGAGAGAACCAAGAAAGAAACAGTGCATGTGCTATATCTATATAGTTTATGCATTGATGTCTATTAGTGCTTAATTAAGGAACATAGGCACAAACACAATGATAATAAACGGTGATACTAATGATAATAATGTGTAATAATCGTACAATGCAAGAATGAAAATTTACAAAAACAGGAAAAAAAGAGCGGGAATGAATGTTGTTCCGAAAAAAAACAACCGGCGTCACAGTATATCGCATAACGTTTGATTGGGTAACAAAAGATATGTCTTTCTTTTTATTCTCCAATGAAAAAATTGTTTTTCGGGGGCTTTTTCACACTAGTCC ] [+] EMBL AA999413 [AAATGTATTTTATATATATATATATCACAGATGGTGATATAAATCACCATGATTGTTAACTTTGAAGGTATGAACAAAAAAACTTGGAAGTATAGAAATGTATAGTGTTTATTATACGATGTACGATTTTTGCATCAAAATATATGACGAGAGAACCAAGAAAGANNCAGTGCATGTGCTATATCTATATAGTTTATGCATTGATGTCTATTAGTGCTTAATTAAGGAACATAGGCACAAACACAATGATAATAAACGGTGATACTAATGATAATAATGTGTAATAATCGTACAATGCAAGATTGACAATTTACAAAA ] [+] EMBL AA999414 [AAATGTATTTTATATATATATATATCACAGAAGGCGATATAAATCACCATGATTGTTAACTTTGAAGGTATGAACAAAAAAACTTGGAAGTATAGAAATGTATAGTGTTTATTATACGATGTACGATTTTTGCATCAAAATATATGACGAGAGAACCAAGAAAGANACAGTGCATGTGCTATATCTATATAGTTTATGCATTGATGTCTATTAGTGCTTAATTAAGGAACATAGGCACAAACACAATGATAATAAACGGTGATACTAATGATAATAATGTGTAATAATCGTA ] [-] EMBL CD078907 [ AATGTATTTTATATATATATATATCACAGAAGGTGATATAAATCACCATGATTGTTAACTTTGAAGGTATGAACAAAAAAACTTGGAAGTATAGAAATGTATAGTGTTTATTATACGATGTACGATTTTTGCATCAAAATATATGACGAGAGAACCAAGAAAGAAACAGTGCATGTGCTATATCTATATAGTTTATGCATTGATGTCTATTAGTGCTTAATTAAGGAACATAGGCACAAACACAATGATAATAAACGGTGATACTAATGATAATAATGTGTAATAATCGTACAATGCAAGAATGAAAATTTACAAAAACAGGAAAAAAAGAGCGGGAATGAATGTTGTTCCGAAAAAAAACAACCGGCGTCACAGTATATCGCATAACGTTTGATTGGGTAACAAAAGATATGTCTTTCTTTTTATTCTCCAATGAAAAAATTGTTTTTCGGGGGCTTTTTCACACTAGTCCA ] [+] EMBL CD147228 [ TCGCATAACGTTTGATTGGGTAACAAAAGATATGTCTTTCTTTTTATTCTCCAATGAAAAAATTGTTTTTCGGGGGCTTTTTCACACTAGTCCACCACTTTAGTCGACTTTTACAACTCCGTAAATTTTTCGAACAAACCAGAAGCACGCGTAAAAGCCAACAGAACCTGACGAAGATAATAACAAGAGTAAACATTTTAAAAAATGTTGTAGAACAGTATTTAAAATTCAGCCACTAGAAATACTGATAATTGGTAACCGATATAATCTAAGAATGGAAAAGGAGAGAGGTAATAGCCAAGAAAAAGTGTTCATATCCCCCTTGCCTAAGTCTTATTAAATCTAAGTGCAACTTCTAATCAACTATGAGCTATAATGTAATCGGCTTTACATGAAGGATACCCGACTGTCCAAACGGAAATAGACGGAGTAAGTGTTAAACAAGTGACCTAATGGTTAAAGGACAACTGTTTCAATCACTAACCCACTAAGCTTCATAACTGTTCAGTATGAAAAACGAACTTTAAGCGAACAACTAGCAGTATCACATACCGGAATATGGGACCAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||