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Schistosoma mansoni
cluster # 7430 cluster # 7430       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7430#0 length = 948 sequences # 5  

consensusID : consensus_7430#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 948
fasta sequence
                              [AAATGTATTTTATATATATATATATCACAGAAGGTGATATAAATCACCATGATTGTTAACTTTGAAGGTATGAACAAAAAAACTTGGAAGTATAGAAATGTATAGTGTTTATTATACGATGTACGATTTTTGCATCAAAATATATGACGAGAGAACCAAGAAAGAAACAGTGCATGTGCTATATCTATATAGTTTATGCATTGATGTCTATTAGTGCTTAATTAAGGAACATAGGCACAAACACAATGATAATAAACGGTGATACTAATGATAATAATGTGTAATAATCGTACAATGCAAGAATGAAAATTTACAAAAACAGGAAAAAAAGAGCGGGAATGAATGTTGTTCCGAAAAAAAACAACCGGCGTCACAGTATATCGCATAACGTTTGATTGGGTAACAAAAGATATGTCTTTCTTTTTATTCTCCAATGAAAAAATTGTTTTTCGGGGGCTTTTTCACACTAGTCCACCACTTTAGTCGACTTTTACAACTCCGTAAATTTTTCGAACAAACCAGAAGCACGCGTAAAAGCCAACAGAACCTGACGAAGATAATAACAAGAGTAAACATTTTAAAAAATGTTGTAGAACAGTATTTAAAATTCAGCCACTAGAAATACTGATAATTGGTAACCGATATAATCTAAGAATGGAAAAGGAGAGAGGTAATAGCCAAGAAAAAGTGTTCATATCCCCCTTGCCTAAGTCTTATTAAATCTAAGTGCAACTTCTAATCAACTATGAGCTATAATGTAATCGGCTTTACATGAAGGATACCCGACTGTCCAAACGGAAATAGACGGAGTAAGTGTTAAACAAGTGACCTAATGGTTAAAGGACAACTGTTTCAATCACTAACCCACTAAGCTTCATAACTGTTCAGTATGAAAAACGAACTTTAAGCGAACAACTAGCAGTATCACATACCGGAATATGGGACCAA]

[+] EMBL CD073365             [AAATGTATTTTATATATATATATATCACAGAAGGTGATATAAATCACCATGATTGTTAACTTTGAAGGTATGAACAAAAAAACTTGGAAGTATAGAAATGTATAGTGTTTATTATACGATGTACGATTTTTGCATCAAAATATATGACGAGAGAACCAAGAAAGAAACAGTGCATGTGCTATATCTATATAGTTTATGCATTGATGTCTATTAGTGCTTAATTAAGGAACATAGGCACAAACACAATGATAATAAACGGTGATACTAATGATAATAATGTGTAATAATCGTACAATGCAAGAATGAAAATTTACAAAAACAGGAAAAAAAGAGCGGGAATGAATGTTGTTCCGAAAAAAAACAACCGGCGTCACAGTATATCGCATAACGTTTGATTGGGTAACAAAAGATATGTCTTTCTTTTTATTCTCCAATGAAAAAATTGTTTTTCGGGGGCTTTTTCACACTAGTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL AA999413             [AAATGTATTTTATATATATATATATCACAGATGGTGATATAAATCACCATGATTGTTAACTTTGAAGGTATGAACAAAAAAACTTGGAAGTATAGAAATGTATAGTGTTTATTATACGATGTACGATTTTTGCATCAAAATATATGACGAGAGAACCAAGAAAGANNCAGTGCATGTGCTATATCTATATAGTTTATGCATTGATGTCTATTAGTGCTTAATTAAGGAACATAGGCACAAACACAATGATAATAAACGGTGATACTAATGATAATAATGTGTAATAATCGTACAATGCAAGATTGACAATTTACAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL AA999414             [AAATGTATTTTATATATATATATATCACAGAAGGCGATATAAATCACCATGATTGTTAACTTTGAAGGTATGAACAAAAAAACTTGGAAGTATAGAAATGTATAGTGTTTATTATACGATGTACGATTTTTGCATCAAAATATATGACGAGAGAACCAAGAAAGANACAGTGCATGTGCTATATCTATATAGTTTATGCATTGATGTCTATTAGTGCTTAATTAAGGAACATAGGCACAAACACAATGATAATAAACGGTGATACTAATGATAATAATGTGTAATAATCGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD078907             [ AATGTATTTTATATATATATATATCACAGAAGGTGATATAAATCACCATGATTGTTAACTTTGAAGGTATGAACAAAAAAACTTGGAAGTATAGAAATGTATAGTGTTTATTATACGATGTACGATTTTTGCATCAAAATATATGACGAGAGAACCAAGAAAGAAACAGTGCATGTGCTATATCTATATAGTTTATGCATTGATGTCTATTAGTGCTTAATTAAGGAACATAGGCACAAACACAATGATAATAAACGGTGATACTAATGATAATAATGTGTAATAATCGTACAATGCAAGAATGAAAATTTACAAAAACAGGAAAAAAAGAGCGGGAATGAATGTTGTTCCGAAAAAAAACAACCGGCGTCACAGTATATCGCATAACGTTTGATTGGGTAACAAAAGATATGTCTTTCTTTTTATTCTCCAATGAAAAAATTGTTTTTCGGGGGCTTTTTCACACTAGTCCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD147228             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TCGCATAACGTTTGATTGGGTAACAAAAGATATGTCTTTCTTTTTATTCTCCAATGAAAAAATTGTTTTTCGGGGGCTTTTTCACACTAGTCCACCACTTTAGTCGACTTTTACAACTCCGTAAATTTTTCGAACAAACCAGAAGCACGCGTAAAAGCCAACAGAACCTGACGAAGATAATAACAAGAGTAAACATTTTAAAAAATGTTGTAGAACAGTATTTAAAATTCAGCCACTAGAAATACTGATAATTGGTAACCGATATAATCTAAGAATGGAAAAGGAGAGAGGTAATAGCCAAGAAAAAGTGTTCATATCCCCCTTGCCTAAGTCTTATTAAATCTAAGTGCAACTTCTAATCAACTATGAGCTATAATGTAATCGGCTTTACATGAAGGATACCCGACTGTCCAAACGGAAATAGACGGAGTAAGTGTTAAACAAGTGACCTAATGGTTAAAGGACAACTGTTTCAATCACTAACCCACTAAGCTTCATAACTGTTCAGTATGAAAAACGAACTTTAAGCGAACAACTAGCAGTATCACATACCGGAATATGGGACCAA]


>consensus_7430#0 AAATGTATTTTATATATATATATATCACAGAAGGTGATATAAATCACCATGATTGTTAAC TTTGAAGGTATGAACAAAAAAACTTGGAAGTATAGAAATGTATAGTGTTTATTATACGAT GTACGATTTTTGCATCAAAATATATGACGAGAGAACCAAGAAAGAAACAGTGCATGTGCT ATATCTATATAGTTTATGCATTGATGTCTATTAGTGCTTAATTAAGGAACATAGGCACAA ACACAATGATAATAAACGGTGATACTAATGATAATAATGTGTAATAATCGTACAATGCAA GAATGAAAATTTACAAAAACAGGAAAAAAAGAGCGGGAATGAATGTTGTTCCGAAAAAAA ACAACCGGCGTCACAGTATATCGCATAACGTTTGATTGGGTAACAAAAGATATGTCTTTC TTTTTATTCTCCAATGAAAAAATTGTTTTTCGGGGGCTTTTTCACACTAGTCCACCACTT TAGTCGACTTTTACAACTCCGTAAATTTTTCGAACAAACCAGAAGCACGCGTAAAAGCCA ACAGAACCTGACGAAGATAATAACAAGAGTAAACATTTTAAAAAATGTTGTAGAACAGTA TTTAAAATTCAGCCACTAGAAATACTGATAATTGGTAACCGATATAATCTAAGAATGGAA AAGGAGAGAGGTAATAGCCAAGAAAAAGTGTTCATATCCCCCTTGCCTAAGTCTTATTAA ATCTAAGTGCAACTTCTAATCAACTATGAGCTATAATGTAATCGGCTTTACATGAAGGAT ACCCGACTGTCCAAACGGAAATAGACGGAGTAAGTGTTAAACAAGTGACCTAATGGTTAA AGGACAACTGTTTCAATCACTAACCCACTAAGCTTCATAACTGTTCAGTATGAAAAACGA ACTTTAAGCGAACAACTAGCAGTATCACATACCGGAATATGGGACCAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)