cluster # 7436

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Schistosoma mansoni
cluster # 7436 cluster # 7436 Sequences # 5 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7436#0 length = 739 sequences # 5
consensusID : consensus_7436#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 739
fasta sequence
                              [CAATAACACGCTAAGAATTATAAAGACACGTAATGCCAACCTCTGATATACATATTAAATATCGGGAAGTTAAAGAAAACTTTGAAAATTACTTCAATACATTCGTCAATCTGTTACGTCATGTTCATCCAAAAAGTCTTGAATTGGCCGAACAACATTTCCAAAATGTAACGTCGTATAATTTATCCAGTGGCAAACGAATTCGAGGAGTGTTGGTTGTCCTTTCGTATATGGTGTTCAGCAATAAAAAT-GAGAACTCTAGAAAAAACTTGTCATGTGTTTATCTTATTGGTTGGTGTGTCGAATTGTTACACGCAGGATATCTTGTTTTGGATGATATAATTGACAATTCCACCCTTAGACGAGGCCAACCGTGTTGGCATTGTACTCAAATAGATTCAAACCGTGGATTAATTGGAGTTAATGATGGTTTACATCTGATTTTATCATCGAAATACTTGATCCACTCATTATTTGCTGAAAATCAAAGTGATGTTGATTCATATTCGTGGAAAGACAAA-AAT-ACGTATATCTCAAATTATGCAAGTTGTTTGATGAAATTAGTTACAAGACATGTTCNTGGTCAATGTTNTGGATGTACTATGCATCAAATCCTAATAACCAATGTATTTTGGACAGAAAACAGAATAATTTGGAGTTTGATAGTCTTACTCGAAACTACTCACCTGATGTCTTTGAAGCTATAACACACTGGAAGACGGGTTTTTATACTTTTATT]

[+] EMBL AI975950             [CAATAACACGCTAAGAATTATAAAGACACGTAATGCCAACCTCTGATATACATATTAAATATCGGGAAGTTAAAGAAAACTTTGAAAATTACTTCAATACATTTGTCAATCTGTTACGTCATGTTCATCCAAAAAGTATTGAATTGGCCGAACAACAATTCCAAAATGTAACGTCGTATAATTTATCCAGCGGCAAACGAATTCGAGGAGTGTTGGTTGTACTTTCGCATATGGGGTTCAACCATTAAAATGGAGAACTCTAGAAAAACCTGGTCATGTGATTATCTTATAGGTCGGTGTGTCGAATTGTTACACGCAGGATATCTTGTATTGGATGATAAAATTGACAATTCCACCCTTAGACGAGGCCAACCGAGATGGCATTGTACTCAAATAGATTCAAACCGTGGATTAATTGGAGTTAATGATGGTCTACATCTGATTATATCATCGAAATACTTGATCCACTCATTATTTGCTGAAAATCAAAGTGATGTTGATTCATATTCGTG                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL AI975181             [  ATAACACGCTAAGAATTATAAAGACACGTAATGCCAACCTCTGATATACATATTAAATATCGGGAAGTTAAAGAAAACTTTGAAAATTACTTCAATACATTCGTCAATCTGTTACGTCATGTTCATCCAAAAAGTCTTGAATTGGCCGAACAACATTTCCAAAATGTAACGTCGTATAATTTATCCAGTGGCAAACGAATTCGAGGAGTGTTGGTTGTCCTTTCGTATATGGTGTTCAGCAATAAAAAT GAGAACTCTAGAAAAAACTTGTCATGTGTTTATCTTATTGGTTGGTGTGTCGAATTGTTACACGCAGGATTTCTTGTTTTGGATGATATAATTGACAATTCCACCCTTAGACGAGGCCAACCGTGTTGGCATTGTACTCAAATAGATTCAAACCGTGGATTAATTGGAGTTAATGATGGTTTACATCTGATTTTATCATCGAAATACTTGATCCACTCATTATTTGCTGAAAATCAAAGTGATGTTGATTCATATTCGTGGAAAGACAAACAAT ACGTATATCT                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL AI976367             [  ATAACACGCTAAGAATTATAAAGACACGTAATGCCAACCTCTGATATACATATTAAATATCGGGAAGTTAAAGAAAACTTTGAAAATTACTTCAATACATTCGTCAATCTGTTACGTCATGTTCATCCAAAAAGTCTTGAATTGGCCGAACAACATTTCCAAAATGTAACGTCGTATAATTTATCCAGTGGCAAACGAATTCGAGGAGTGTTGGTTGACCTTTCGTATATGGTGTTCAGCAATAAAAAT GAGAACTCTAGAAAAAACTTGTCATGTGTTTATCTTATTGGTTGGTGTGTCGAATTGTTACACGCAGGATATCTTGTTTTGGATGATATAATTGACAATTCCACCCTTAGACGAGGCCAACCGTGTTGGCATTGTACTCAAATAGATTCAAACCGTGGATTAATTGGAGTTAATGATGGTGTACATCTGATTTTATCATCGAAATACTTGATCCACTCATTATTTGCTGAAAAATAAAGTGATGTTGATTCATATTCGTGGAAAGAC                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD111586             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TCGAATTGTTACACGCAGGATTTCTTGTTTTGGATGATATAATTGACAATTCCACCCTTAGACGAGGCCAACCGTGTTGGCATTGTACTCAAATAGATTCAAACCGTGGATTAATTGGAGTTAATGATGGTTTACATCTGATTTTATCATCGAAATACTTGATCCACTCATTATTTGCTGAAAATCAAAGTGATGTTGATTCATATTCGTGGAAAGACAAA AATAACGTATATCTCAAATTATGCAAGTTGTTTGATGAAATTAGTTACAAGACATGTTCNTGGTCAATGTTNTGGATGTACTATGCATCAAA                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD184584             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GAGTTAATGATGGTTTACATCTGATTTTATCATCGAAATACTTGGTCCACTCATTATTTGCTGAAAATCAAAGTGATGTTGATTTATATTCGTGGAAAGACAAA AATAACGTATATCTCAAATTATGCAAGTTGTTTGATGAAATTAGTTACAAGACATGTTC TGGTCAATGTT TGGATGTACTAT CATCAAATCCTAATAACCAATGTATTTTGGACAGAAAACAGAATAATTTGGAGTTTGATAGTCTTACTCGAAACTACTCACCTGATGTCTTTGAAGCTATAACACACTGGAAGACGGGTTTTTATACTTTTATT]




>consensus_7436#0
CAATAACACGCTAAGAATTATAAAGACACGTAATGCCAACCTCTGATATACATATTAAAT
ATCGGGAAGTTAAAGAAAACTTTGAAAATTACTTCAATACATTCGTCAATCTGTTACGTC
ATGTTCATCCAAAAAGTCTTGAATTGGCCGAACAACATTTCCAAAATGTAACGTCGTATA
ATTTATCCAGTGGCAAACGAATTCGAGGAGTGTTGGTTGTCCTTTCGTATATGGTGTTCA
GCAATAAAAATGAGAACTCTAGAAAAAACTTGTCATGTGTTTATCTTATTGGTTGGTGTG
TCGAATTGTTACACGCAGGATATCTTGTTTTGGATGATATAATTGACAATTCCACCCTTA
GACGAGGCCAACCGTGTTGGCATTGTACTCAAATAGATTCAAACCGTGGATTAATTGGAG
TTAATGATGGTTTACATCTGATTTTATCATCGAAATACTTGATCCACTCATTATTTGCTG
AAAATCAAAGTGATGTTGATTCATATTCGTGGAAAGACAAAAATACGTATATCTCAAATT
ATGCAAGTTGTTTGATGAAATTAGTTACAAGACATGTTCNTGGTCAATGTTNTGGATGTA
CTATGCATCAAATCCTAATAACCAATGTATTTTGGACAGAAAACAGAATAATTTGGAGTT
TGATAGTCTTACTCGAAACTACTCACCTGATGTCTTTGAAGCTATAACACACTGGAAGAC
GGGTTTTTATACTTTTATT
clustalw multiple alignements is not computed in this case