cluster # 7451

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Schistosoma mansoni
cluster # 7451 cluster # 7451 Sequences # 5 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7451#0 length = 874 sequences # 5
consensusID : consensus_7451#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 874
fasta sequence
                              [TGAAAAAGGTTTATGAAATCATTTACTTTTGGTCGGAGTTGTATTAAAAGTCAATCTTCTTGGTTGGAGTCCATCTAATGGTTCTGATCAATGAGTAAATAATTCACGCCATTATATTTTTTACATTCCAATAGTTCTAAAAACACCCTTCATAATTAGTTTTTACTGTCATTGACAACACTTTCAACTGTTTATTTTCGTATTGTTAGTTCTACTCACTATGCTTATGTGAGGAGTGACAAGTCCTGTCAAATAACAGGTTCCAAACTATATAAGCAAAAAGTATAGAATTCTGGTAAGATGTTATTTTCTGGAATGTCACACAAAAATCTTAATTATTTATATATTCACTCTTTTTTCTTCCACTTTGCAGCTT-GAAAAAAGTCTAAACCTAGATCAT-GGAAGAAAAAGGTGATCAAGTTCTGTTGAGTCATGATAATCTCGATAGAGCTTCACCTGATTTATGGCCANAACAAAGTAATTGTCTTATTTATACTTTTATTTAGTTCCTGGTGTCACTGAATTCCTTACATCCCGGCAAAACNAAATAAACTTACATACCCCTCCGAAATATGCTACTGATTTGGATAAAGAGGATCTGGAACTTATTCATGATTTTGGGAGTCTGTCAACTCAACAGCTAATGGATAAAATTAAACATCTACAGAATTTAGCTTATCAAGTTGGATTGGAAGAAGCAAAAGAAATGACCCGTGGG-AAATTTTTAAATATTCTTGGGAAACGCTAATTTCTGGGTTCTAAAACTGAATATAACTATGTTCCACTCGTTTT-CGTTTAAATGGTTTATTAAACCAACG-TTATTTATATTATGGT-GGCATTTTTTGCTGTTTATAATTCCCCACATATATATATA]

[+] EMBL CD181097             [TGAAAAAGGTTTATGAAATCATTTACTTTTGGTCGGAGTTGTATTAAAAGTCAATCTTCTTGGTTGGAGTCCATCTAATGGTTCTGATCAATGAGTAAATAATTCACGCCATTATATTTTTTACATTCCAATAGTTCTAAAAACACCCTTCATAATTAGTTTTTACTGTCATTGACAACACTTTCAACTGTTTATTTTCGTATTGTTAGTTCTACTCACTATGCTTATGTGAGGAGTGACAAGTCCTGTCAAATAACAGGTTCCAAACTATATAAGCAAAAAGTATAGAATTCTGGTAAGATGTTATTTTCTGGAATGTCACACAAAAATCTTAATTATTTATATATTCACTCTTTTTTCTTCCACTTTGCAGCTT GAAAAAAGTCTAAACCTAGATCAT GGAAGAAAAAGGTGATCAAGTTCTGTTGAGTCATGATAATCTCGATAGAGCTTCACCTGATTTATGGCCAGAACAAAGTAATTGTCTTATTTATACTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL AI111141             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCTT GAAAAAAGTCTAAACCTAGATCATGGGAAGAAAAAGGTGATCAAGTTCTGTTGAGTCATGATAATCTCGATAGAGCTTCACCTGATTTATGGCCANAACAAAGTAATTGTCTTATTTATACTTTTATTTAGTTCCTGGTGTCACTGAATTCCTTACATCCCGGCAAAACNAAATAAACTTACATACCCCTCCGAAATATGCTACTGATTTGGATAAAGAGGATCTGGAACTTATTCATGATTTTGGGAGTCTGTCAACTCAACAGCTAATGGATAAAATTAAACATCTACAGAATTTAGCTTATCAAGTTGGATTGGAAGAAGCAAAAGAAATGACCCGTGGGAAAATTTTTAAATATTCTTGGGAAACGCTAATTTCTGGGTTCTAAAACTGAATATAACTATGTTCCACTCGTTTT CGTTTAAATGGTTTATTAAACCAACGTTTATTTATATTATGGTNGGCATTTTTTGCTGTTTATAATTCCCCACATATATATATA]
[+] EMBL AI111140             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCTTGGAAAAAAGTCTAAACCTAGATCAT GGAAGAAAAAGGTGATCAAGTTCTGTTGAGTCATGATAATCTCGATAGAGCTTCACCTGATTTATGGCCAAAACAAAGTAATTGTCTTATTTATACTTTTATTTAGTTCCTGGTGTCACTGAATTCCTTACATCCCGGCAAAACNAAATAAACTTACATACCCCTCCGAAATATGCTACTGATTTGGATAAAGAGGATCTGGAACTTATTCATGATTTNGGGAGTCTGTCAACTCAACAGCTAATGGATAAAATTAAACATCTACAGAATTTAGCTTATCAAGTTGGATTGGAAGAAGCAAAAGAAATGACCCGTGGG AAATTTTTAAATATTCTTGGGAAACGCTAATTTCTGGGTTCTAAAACTGAATATAACTATGTTCCACTCGTTTTCCGTTTAAATGGTTTATTAAACCAACG TTATTTATATTATGGT GGCATTTTTTGCTG TTATAATT CCCNCATATATATAT ]
[+] EMBL AI111138             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCTT GAAAAAAGTCTAAACCTAGATCAT GGAANAAAAAGGTGATCAANTTCTGTTGAGTCATGATAATCTCGATAGAGCTTCACCTGATTTATGGCCANAACAAAGTAATTGTCTTATTTATACTTTTATTTAGTTCCTGGTGTCNCTGAATTCCTTACNTCCCGGCAAAACGAAATAAACTTACATACCCCTCCGAAATATGCTACTGATTTGGATAAAGAGGATCTGGAACTTATTCATGATTTTGGGANTCTGTCAACTCAACAGCTAATGGATAAAATTAAACATCTACAGAATTTAGCTTATCAAGTTGGATTGGAANAAGCAAAANAAATGACCCGTGGG AAATTTTTAAATATTCTTGGGAAACNCTAATTTCTGGGTTCTAAAACTGAATATAACTATGTTCCACTCGTTTT CGTTTAAATGGTTTATTAAACCAACG TTATTTATATTATGGT GGCATTTTTTGCTGTTn                       ]
[+] EMBL AI110957             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GCTT GAAAAAAGTCTAAACCTAGATCAT GGAAGAAAAAGGTGATCAAGTNCTGTTGAGTCATGATAATCTCGATAGAGCTTCACCTGATTTATGGCCANAACAAAGTAATTGTCTTATTTATACTTTTATTTAGTTCCTGGTGTCACTGAATTCCTTACATCCCGGCAAAACNAAATAAACTTACATACCCCTCCGAAATATGCTACTGATTTGGATAAAGAGGATCTGGAACTTATTCATGATTTNGGGAGTCTGTCAA                                                                                                                                                                                                                                                      ]




>consensus_7451#0
TGAAAAAGGTTTATGAAATCATTTACTTTTGGTCGGAGTTGTATTAAAAGTCAATCTTCT
TGGTTGGAGTCCATCTAATGGTTCTGATCAATGAGTAAATAATTCACGCCATTATATTTT
TTACATTCCAATAGTTCTAAAAACACCCTTCATAATTAGTTTTTACTGTCATTGACAACA
CTTTCAACTGTTTATTTTCGTATTGTTAGTTCTACTCACTATGCTTATGTGAGGAGTGAC
AAGTCCTGTCAAATAACAGGTTCCAAACTATATAAGCAAAAAGTATAGAATTCTGGTAAG
ATGTTATTTTCTGGAATGTCACACAAAAATCTTAATTATTTATATATTCACTCTTTTTTC
TTCCACTTTGCAGCTTGAAAAAAGTCTAAACCTAGATCATGGAAGAAAAAGGTGATCAAG
TTCTGTTGAGTCATGATAATCTCGATAGAGCTTCACCTGATTTATGGCCANAACAAAGTA
ATTGTCTTATTTATACTTTTATTTAGTTCCTGGTGTCACTGAATTCCTTACATCCCGGCA
AAACNAAATAAACTTACATACCCCTCCGAAATATGCTACTGATTTGGATAAAGAGGATCT
GGAACTTATTCATGATTTTGGGAGTCTGTCAACTCAACAGCTAATGGATAAAATTAAACA
TCTACAGAATTTAGCTTATCAAGTTGGATTGGAAGAAGCAAAAGAAATGACCCGTGGGAA
ATTTTTAAATATTCTTGGGAAACGCTAATTTCTGGGTTCTAAAACTGAATATAACTATGT
TCCACTCGTTTTCGTTTAAATGGTTTATTAAACCAACGTTATTTATATTATGGTGGCATT
TTTTGCTGTTTATAATTCCCCACATATATATATA
clustalw multiple alignements is not computed in this case