These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7451#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 874 fasta sequence [TGAAAAAGGTTTATGAAATCATTTACTTTTGGTCGGAGTTGTATTAAAAGTCAATCTTCTTGGTTGGAGTCCATCTAATGGTTCTGATCAATGAGTAAATAATTCACGCCATTATATTTTTTACATTCCAATAGTTCTAAAAACACCCTTCATAATTAGTTTTTACTGTCATTGACAACACTTTCAACTGTTTATTTTCGTATTGTTAGTTCTACTCACTATGCTTATGTGAGGAGTGACAAGTCCTGTCAAATAACAGGTTCCAAACTATATAAGCAAAAAGTATAGAATTCTGGTAAGATGTTATTTTCTGGAATGTCACACAAAAATCTTAATTATTTATATATTCACTCTTTTTTCTTCCACTTTGCAGCTT-GAAAAAAGTCTAAACCTAGATCAT-GGAAGAAAAAGGTGATCAAGTTCTGTTGAGTCATGATAATCTCGATAGAGCTTCACCTGATTTATGGCCANAACAAAGTAATTGTCTTATTTATACTTTTATTTAGTTCCTGGTGTCACTGAATTCCTTACATCCCGGCAAAACNAAATAAACTTACATACCCCTCCGAAATATGCTACTGATTTGGATAAAGAGGATCTGGAACTTATTCATGATTTTGGGAGTCTGTCAACTCAACAGCTAATGGATAAAATTAAACATCTACAGAATTTAGCTTATCAAGTTGGATTGGAAGAAGCAAAAGAAATGACCCGTGGG-AAATTTTTAAATATTCTTGGGAAACGCTAATTTCTGGGTTCTAAAACTGAATATAACTATGTTCCACTCGTTTT-CGTTTAAATGGTTTATTAAACCAACG-TTATTTATATTATGGT-GGCATTTTTTGCTGTTTATAATTCCCCACATATATATATA] [+] EMBL CD181097 [TGAAAAAGGTTTATGAAATCATTTACTTTTGGTCGGAGTTGTATTAAAAGTCAATCTTCTTGGTTGGAGTCCATCTAATGGTTCTGATCAATGAGTAAATAATTCACGCCATTATATTTTTTACATTCCAATAGTTCTAAAAACACCCTTCATAATTAGTTTTTACTGTCATTGACAACACTTTCAACTGTTTATTTTCGTATTGTTAGTTCTACTCACTATGCTTATGTGAGGAGTGACAAGTCCTGTCAAATAACAGGTTCCAAACTATATAAGCAAAAAGTATAGAATTCTGGTAAGATGTTATTTTCTGGAATGTCACACAAAAATCTTAATTATTTATATATTCACTCTTTTTTCTTCCACTTTGCAGCTT GAAAAAAGTCTAAACCTAGATCAT GGAAGAAAAAGGTGATCAAGTTCTGTTGAGTCATGATAATCTCGATAGAGCTTCACCTGATTTATGGCCAGAACAAAGTAATTGTCTTATTTATACTTT ] [+] EMBL AI111141 [ GCTT GAAAAAAGTCTAAACCTAGATCATGGGAAGAAAAAGGTGATCAAGTTCTGTTGAGTCATGATAATCTCGATAGAGCTTCACCTGATTTATGGCCANAACAAAGTAATTGTCTTATTTATACTTTTATTTAGTTCCTGGTGTCACTGAATTCCTTACATCCCGGCAAAACNAAATAAACTTACATACCCCTCCGAAATATGCTACTGATTTGGATAAAGAGGATCTGGAACTTATTCATGATTTTGGGAGTCTGTCAACTCAACAGCTAATGGATAAAATTAAACATCTACAGAATTTAGCTTATCAAGTTGGATTGGAAGAAGCAAAAGAAATGACCCGTGGGAAAATTTTTAAATATTCTTGGGAAACGCTAATTTCTGGGTTCTAAAACTGAATATAACTATGTTCCACTCGTTTT CGTTTAAATGGTTTATTAAACCAACGTTTATTTATATTATGGTNGGCATTTTTTGCTGTTTATAATTCCCCACATATATATATA] [+] EMBL AI111140 [ GCTTGGAAAAAAGTCTAAACCTAGATCAT GGAAGAAAAAGGTGATCAAGTTCTGTTGAGTCATGATAATCTCGATAGAGCTTCACCTGATTTATGGCCAAAACAAAGTAATTGTCTTATTTATACTTTTATTTAGTTCCTGGTGTCACTGAATTCCTTACATCCCGGCAAAACNAAATAAACTTACATACCCCTCCGAAATATGCTACTGATTTGGATAAAGAGGATCTGGAACTTATTCATGATTTNGGGAGTCTGTCAACTCAACAGCTAATGGATAAAATTAAACATCTACAGAATTTAGCTTATCAAGTTGGATTGGAAGAAGCAAAAGAAATGACCCGTGGG AAATTTTTAAATATTCTTGGGAAACGCTAATTTCTGGGTTCTAAAACTGAATATAACTATGTTCCACTCGTTTTCCGTTTAAATGGTTTATTAAACCAACG TTATTTATATTATGGT GGCATTTTTTGCTG TTATAATT CCCNCATATATATAT ] [+] EMBL AI111138 [ GCTT GAAAAAAGTCTAAACCTAGATCAT GGAANAAAAAGGTGATCAANTTCTGTTGAGTCATGATAATCTCGATAGAGCTTCACCTGATTTATGGCCANAACAAAGTAATTGTCTTATTTATACTTTTATTTAGTTCCTGGTGTCNCTGAATTCCTTACNTCCCGGCAAAACGAAATAAACTTACATACCCCTCCGAAATATGCTACTGATTTGGATAAAGAGGATCTGGAACTTATTCATGATTTTGGGANTCTGTCAACTCAACAGCTAATGGATAAAATTAAACATCTACAGAATTTAGCTTATCAAGTTGGATTGGAANAAGCAAAANAAATGACCCGTGGG AAATTTTTAAATATTCTTGGGAAACNCTAATTTCTGGGTTCTAAAACTGAATATAACTATGTTCCACTCGTTTT CGTTTAAATGGTTTATTAAACCAACG TTATTTATATTATGGT GGCATTTTTTGCTGTTn ] [+] EMBL AI110957 [ GCTT GAAAAAAGTCTAAACCTAGATCAT GGAAGAAAAAGGTGATCAAGTNCTGTTGAGTCATGATAATCTCGATAGAGCTTCACCTGATTTATGGCCANAACAAAGTAATTGTCTTATTTATACTTTTATTTAGTTCCTGGTGTCACTGAATTCCTTACATCCCGGCAAAACNAAATAAACTTACATACCCCTCCGAAATATGCTACTGATTTGGATAAAGAGGATCTGGAACTTATTCATGATTTNGGGAGTCTGTCAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||