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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7473#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1191 fasta sequence
[ATTATCACCAAGAAAAAGAAGAAGAACAGCAACAACAACAAAAGTGTACGAAAGAGGTGGATTCAAACAACTTAATCAATACTACGAATAGTAATGGTAACCAAAATAACATTGAAATATTTAATTGGTTCATGTTTAATCCACAAGATAATAAATTACAATTGAAAGAGAATTCTTTACAGTTTCTAAGCTCAATATTCAATGAATATACTATGTATGGTCAGTACTTATTTACATTAGATTTTGAAACAATAGAAGATTATTTAATCGGTTTACGTTGGATAGCTAAACAATTAGAAGCGATTCATGTAAACAAAAACAGTACACAGAAACAAATTCATCTATCCTATTATTTA-TCTGCTG-CT-GTC-TCTGATTATTATTTAAATAGAGAATATCGTCCAGAGCACAAAATACAAACAAAATCAATGTTATCTACTACTACTACTACTGCTAAGAATAAGTGATGATTATTTAGACAAATCTTTATCAAGAATAGAAGA--TTTACACTTATCATTACAACCAGTACCTAAAGTTATGAAATTACTTACTACATTATGGTCACCTTCTTCATATGTGATTAGTTTTAAACTTGAAACAGATCATCAATTGTTACTAGTTAAAGCAAAACAATCCCTTGAAATGTACAATCCCAATGTGATAGTTGCTAATCTTTTACAAACTAGATCAAAAGAAGTATGGTTAGTATTTAAACAGAATAATACACAAGATATAACTGTTGAACATATAAATATGGAGAATAATACCGATGAAATCAATAAACAACAAATAATATCACAAGAAATTGAATCTATTCTAATTCCTCGATTGATACAACTTCATGAACAAACAATTGATCAAACTATTAAGTAACTTTAACCTTTTGTAAGATTATAATCTGTTCAGTTTTATTATTCCTTTGAAATAAAAACTAATTGTATATTTTCATGGAGTTTCGTCTTGTTAGCGGGACG-AAGATTGGTTTAAAGCATGTTTCATGCATGATGGTGTTGTTGCACGCTGATTGGCTAATTCTTATCTAATCAGCTATAGTAGTTGCTTGGAGAAGACTCTAGAATCTTCTCATGTAAAATCTATAAATATACTAACGTATTTCTTATTGCGATTCTTACTACTTCCATCTATCCTTGTTATTTGGAAAATAATTNCTTCCCCTGTCCAANNNNNNNNNNN]
[-] EMBL CD163334 [ATTATCACCAAGAAAAAGAAGAAGAACAGCAACAACAACAAAAGTGTACGAAAGAGGTGGATTCAAACAACTTAATCAATACTACGAATAGTAATGGTAACCAAAATAACATTGAAATATTTAATTGGTTCATGTTTAATCCACAAGATAATAAATTACAATTGAAAGAGAATTCTTTACAGTTTCTAAGCTCAATATTCAATGAATATACTATGTATGGTCAGTACTTATTTACATTAGATTTTGAAACAATAGAAGATTATTTAATCGGTTTACGTTGGATAGCTAAACAATTAGAAGCGATTCATGTAAACAAAAACAGTACACAGAAACAAATTCATCTATCCTATTATTTA TCTGCTG CT GTC TCTGATTATTATTTAAATAGAGAA ]
[-] EMBL CD197150 [ ATTTTGAAACAATAGAAGATTATTTAATCGGTTTACGTTGGATAGCTAAACAATTAGAAGCGATTCATGTAAACAAAAACAGTACACAGAAACAAATTCATCTATCCTATTATTTATTCTGCTGCCTGGTCTTCGGATTATAATTTAATAAGAGAATATCGTCCAGAGCACAAAATACAAACAAAATCAATGTTATCTACTACTACTACTACTGCTAAGAATAAGTGATGATTATTTAGACAAATCTTTATCAAGAATAGAAGA TTTACACTTATCATTACAACCAGTACCTAAAGTTATGAAATTACTTACTACATTATGGTCACCTTCTTCATATGTGATTAGTTTTAAACTTGAAACAGATCATCAATTGTTACTAGTTAAAGCAAAACAATCCCTTGAA ]
[+] EMBL CD082958 [ tGAAGATTTTTACACTTATCATTACAACCAGTACCTAAAGTTATGAAATTACTTACTACATTATGGTCACCTTCTTCATATGTGATTAGTTTTAAACTTGAAACAGATCATCAATTGTTACTAGTTAAAGCAAAACAATCCCTTGAAATGTACAATCCCAATGTGATAGTTGCTAATCTTTTACAAACTAGATCAAAAGAAGTATGGTTAGTATTTAAACAGAATAATACACAAGATATAACTGTTGAACATATAAATATGGAGAATAATACCGATGAAATCAATAAACAACAAATAATATCACAAGAAATTGAATCTATTCTAATTCCTCGATTGATACAACTTCATGAACAAACAATTGATCAAACTATTAAGTAACTTTAACCTTTTGTAAGATTATAATCTGTTCAGTTTTATTATTCCTTTGAAATAAAAACTAATTGTATATTTTCATGGAGTTTCGTCTTGTTAGCGGGACG AAGATTGGTTTAAAGCATGTTTCATGCATGATGGTGTTGTTGCACGCTGATTGGCTAATTCTTATCTAATCAGCTATAGTAGTTGCTTGGAGAAGACTCTAGAATCTTCTCATGTAAAATCTATAAATATACTAACGTATTTCTTATTGCGATTCTTACTACTTCCATCTATCCTTGTTATTTGGAAAATAATTNCTTCCCCTGTCCAANNNNNNNNNNN]
[-] EMBL CD076541 [ TTAAAGCAAAACAATCCCTTGAAATGTACAATCCCAATGTGATAGTTGCTAATCTTTTACAAACTAGATCAAAAGAAGTATGGTTAGTATTTAACCAGAATAATACACAAGATATAACTGTTGAACATATAAATATGGAGAATAATACCGATGAAATCAATAACCACCAAATAATATCCCAAGAAATTGAATCTATTCTAATTCCTCGATTGATACAACTTCATGAACAAACAATTGATCAAACTATTAAGTAACTTTACCCTTTTGTAAGATTATAATCTGTTCAGTTTTATTATTCCTTTGAAATAAAAACTAATTGTATATTTTCATGGAGTTTCGTCTTGTTAGCGGGACG AAGATTGGTTTAAAGCATGTTTCATGCATGATGGTGTTGTTGCACGCTGATTGGCTAATTCTTATCTAATCAGCTATAGTAGTTGCTTGGAGAAGACTCTAGAATCTTCTCATGTAAAATCTATAAATATACTAACGTATTTCTTATTGCGATTCTTACTACTTCCATCTATCCTTGTTATTTGGAATATAATTTCT ]
[-] EMBL CD136620 [ cnnGGACGAAAGATTGGTNTAAAGCATGTTTCATGCATGATGGTGTTGTTGCACGCTGATTGGCTAATTCTTATCTAATCAGCTATAGTAGTTGCTTGGAGAAGACTCTAGAATCTTCTCATGTAAAATCTATAA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||