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Schistosoma mansoni
cluster # 7476 cluster # 7476       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7476#0 length = 575 sequences # 5  

consensusID : consensus_7476#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 575
fasta sequence
                              [AGGCTGTCCAAATGAACCATATCCTGTATCATATAGGCCTCTTGTTTTGCTCACTTTATATAAGTTATACGCTATGAATAAGCAACCAAACTGTTCAGCATTAAACGTGTTATCAACAGCTTGAGGACGATCTACATCAATAAAGTAGTGTTATAATTTCTTCTATTTCAACCCAGCCACTCTTATGGCTTAGCACTTTTCGGACACCTTAATTCACCCAACGAGTTCCCAAATCAGAACGCCACTGAATAGGAACGTAACTATTTTAAAAATGACAAGATAGAATGGTTGTAAGAATTCACAATAAGAAAAATGTTAGAATATGTATATTATTTTACACAGGAGGTTTATTGACTTTTCTTCAACTATCTCTAACGTTGATCGGCTAAGAAATATCCACTCAGCATGCCCCAACACAATCCTGCACGGAACATGCTTTAATCTAATCCACATATTGTTATTTCTTGTGGTCTGCGTGCCCTGTTAATGTACAACGTGATAATACCGCCAATTAGAGAGCAGTGAATTATCGATCGGACCAATGACACACGAAACCCATACGAGCAGTCTAGAGT]

[+] EMBL CD067084             [AGGCTGTCCAAATGAACCATATCCTGTATCATATAGGCCTCTTGTTTTGCTCACTTTATATAAGTTATACGCTATGAATAAGCAACCAAACTGTTCAGCATTAAACGTGTTATCAACAGCTTGAGGACGATCTACATCAATAAAGTAGTGTTATAATTTCTTCTATTTCAACCCAGCCACTCTTATGGCTTAGCACTTTTCGGACACCTTAATTCACCCAACGAGTTCCCAAATCAGAACGCCACTGAATAGGAACGTAACTATTTTAAAAATGACAAGATAGAATGGTTGTAAGAATTCACAATAAGAAAAATGTTAGAATATGTATATTATTTTACACAGGAGGTTTATTGACTTTTCTTCAACTATCTCTAACGTTGATCGGCTAAGAAATATCCACTCAGCATGCCCCAACACAATCCTGCACGGAACATGCTNTAATCTAATCCACATATTGGTA                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD067065             [AGGCTGTCCAAATGAACCATATCCTGTATCATATAGGCCTCTTGTTTTGCTCACTTTATATAAGTTATACGCTATGAATAAGCAACCAAACTGTTCAGCATTAAACGTGTTATCAACAGCTTGAGGACGATCTACATCAATAAAGTAGTGTTATAATTTCTTCTATTTCAACCCAGCCACTCTTATGGCTTAGCACTTTTCGGACACCTTAATTCACCCAACGAGTTCCCAAATCATAACGCCACTGAATAGGAACGTAACTATTTTAAAAATGACAAGATAGAATGGTTGTAAGAATTCACAATAAGAAAAATGTTAGAATATGTATATTATNTTACACAGGAGGTTTATTGACTTTTCTTCAACTATCTCTAACGTTGATCGGCTAAGAAATATCCACTCAGCATGCCCCAACACAATCCTGCACGGAACATGCTTTAATCTAATCCACATATT                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD060583             [                                                                                                                                                 TAGTGTTAGAAGGTCGGCTAGGTCGACCCAGCCACTCGTATGGCTTAGCAC TTTCGGACACCTTAATTCACCCAACGAGTTCCCGAATCAGAACGCCACTGAATAGGAACGTAACTATTTTAGAAATGACGAGATAGAATGGTTGTAAGAATTCACAATAAGAGAAATGTTAGAATATGTATATTATGTTACACAGGAGGTGTATTGACTGTTCTTCGACGAGCTCTAACGGTGATCGGCTAAGTAATATCCACTCAGCATGCCCCGACACAATCCTGCACGGGACATGCTTTAATCCAATCCACATATTGTTATTTCTTGTGGTCTGCGTGCCCTGTTAATGTACAACGTGATAATACCGCCAATTAGAGAGCAGTGAATTATCGATCGGACCAATGACACACGAAAC                    ]
[-] EMBL CD066462             [                                                                                                                                                                                                                                GTTCCCAAATCAGAACGCCACTGAATAGGAACGCAACTATTTTAAAAATGACAAGATAGAATGGTTGTAAGAATTCACAATAAGAAAAATGTTAGAATATGTATATTATTTTACACAGGAGGTTTATTGACTTTTCTTCAACTATCTCTAACGTTGATCGGCTAGGAAATATCCACTCAGCATGCCCCAACACAATCCTGCACGGAACATGCTTTAATCCAATCCACATATTGTTATTTCTTGTGGTCTGCGTGCCCTGTTAATGTACAACGTGATAATACCGCCAATTAGAGAGCAGTGAATTATCGATCGGACCAATGACACACGAAACCCATACGAGCAGTCTAGAGT]
[-] EMBL CD067377             [                                                                                                                                                                                                                                                 CCATTGAATAGGAACGTAACTATTTTAAAAATGACAAGATAGAATGGTTGTAAGAATTCACAATAAGAAAAATGTTAGAATATGTATATTATTTTACACAGGAGGTTTATTGACTTTTCTTCAACTATCTCTAACGTTGATCGGGTAAGAAATATCCACTCAGCATGCCCCAACACAATCTGGCACGGAACATGCTTTAATCTAATCCACATATTGTTATTTATTGTGGTCTGCGTGCCCTGTTAATGTACAACGTGATAATACCGCCAATTAGAGAGCAGTGAATTATCGATCGGACCAATGACACACGAAACCCATACGAGCAGTCTAGAGT]


>consensus_7476#0 AGGCTGTCCAAATGAACCATATCCTGTATCATATAGGCCTCTTGTTTTGCTCACTTTATA TAAGTTATACGCTATGAATAAGCAACCAAACTGTTCAGCATTAAACGTGTTATCAACAGC TTGAGGACGATCTACATCAATAAAGTAGTGTTATAATTTCTTCTATTTCAACCCAGCCAC TCTTATGGCTTAGCACTTTTCGGACACCTTAATTCACCCAACGAGTTCCCAAATCAGAAC GCCACTGAATAGGAACGTAACTATTTTAAAAATGACAAGATAGAATGGTTGTAAGAATTC ACAATAAGAAAAATGTTAGAATATGTATATTATTTTACACAGGAGGTTTATTGACTTTTC TTCAACTATCTCTAACGTTGATCGGCTAAGAAATATCCACTCAGCATGCCCCAACACAAT CCTGCACGGAACATGCTTTAATCTAATCCACATATTGTTATTTCTTGTGGTCTGCGTGCC CTGTTAATGTACAACGTGATAATACCGCCAATTAGAGAGCAGTGAATTATCGATCGGACC AATGACACACGAAACCCATACGAGCAGTCTAGAGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)