These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7480#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 468 fasta sequence [CAGTGGGCATCAGATCCCGCGAGATCATAGGTACTTCTTGCTGACGAGTGTCAAATAGCACAAGACCTAGGTCCAAAGTTTCAAGCTGACTACCTCCAACCATCATCTCAACTAGCTAATCTCTTTAATATGCTATCTAACAGTATGAACCAAGGTTCATATACCTTGAGTCTAAATATTGTCAATTCATTGGTCTTTATCAAATCAAACGTAATTTTACATCTTATTTTAGATATACCACATTACTTGATGAAGCTCGTACACCAGTGGACTCAACTAAAGATTTAATAGCACTTCGAGAGGACATGCAACAAATTCAAACGATATGTATCATGAGAAGTATGTTAGTTGTAATCTTCTAATGTTACATAAGATTTGTATTATCTTATATGTTTTATGTTTTTATAACTAATCCAAAGGAACATTTTAACAATATTATGTTAGTTAAGTTTAGCTAGTTTATTTGAG] [+] EMBL CD089461 [CAGTGGGCATCAGATCCCGCGAGATCATAGGTACTTCTTGCTGACGAGTGTCAAATAGCACAAGACCTAGGTCCAAAGTTTCAAGCTGACTACCTCCAACCATCATCTCAACTAGCTAATCTCTTTAATATGCTATCTAACAGTATGAACCAAGGTTCATATACCTTGAGTCTAAATATTGTCAATTCATTGGTCTTTATCAAATCAAATGTAATTTTACATCTTATTTTAGATATACCACATTACTTGATGAAGCTCGTACACCAGTGGACTCAACTAAAGATTTAATAGCACTTCGAGAGGACACGCAACAAATTCAAACGATATGTATCATGAGAAGTATGTTAGTTGTAATCTTCTAATGTTACATAAGATTTGTATTATCTTATATGTTTTATGTTTNTATAACTAATCCAAAGGAACATTTTAACAATGTTATGTTAGTTAAGTTTAGCTAGTTTATTTGAG] [+] EMBL CD089468 [CAGTGGGCATCAGATCCCGCGAGATCATATGTACTTCTTGCTGACGAGTGTCAAATAGCACAAGACCTATGTCCAAAGTTTCAAGCTGACTACCTCCAACCATCATCTCAACTAGCTAATCTCTTTAATATGCTATCTAACAGTATGAACCAAGGTTCATATACCTTGAGTCTAAATATTGTCAATTCATTGGTCTTTATCAAATCAAACGTAATTTTACATCTTATTTTAGATATACCACATTACTTGATGAAGCTCGTACACCAGTGGACTCAACTAAAGATTTAATAGCACTTCGAGAGGACATGCAACAAATTCAAACGATATGTATCATGAGAAGTATGTTAGTTGTAATCTTCTAATGTTACATAAGATTTGTATTATCTTATATGTTTTATGTTTTTATAACTAATCCAAAGGAACATTTTAACAATATTATGTTAGTTAAGTTTAGCTAATTTATTTGAG] [+] EMBL CD089439 [CAGTGGGCATCAGATCCCGCGAGATCATAGGTACTTCTTGCTGACGAGTGTCAAATAGCACAAGACCTAGGTCCAAAGTTTCAAGCTGACTACCTCCAACCATCATCTCAACTAGCTAATCTCTTTAATATGCTATCTAACAGTATGAACCAAGGTTCATATACCTTGAGTCTAAATATTGTCAATTCATTGGTCTTTATCAAATCAAACGTAATTTTACATCTTATTTTAGATATACCACATTACTTGATGAAGCTCGTACACCAGTGGACTCAACTAAAGATTTAATAGCACTTCGAGAGGACATGCAACAAATTCAAACGATATGTATCATGAGAAGTATGTTAGTTGTAATCTTCTAATGTTACATAAGATTTGTATTATCTTATATGTTTTATGTTTTTATAACTAATCCAAAGGAACATTTTAACAATATTATGTTAGTTAAGTTTAGCTAGTTTATTTGAG] [+] EMBL CD089431 [CAGTGGGCATCAGATCCCGCGAGATCATAGGTACTTCTTGCTGACGAGTGTCAAATAGCACAAGACCTAGGTCCAAAGTTTCAAGCTGACTACCTCCAACCATCATCTCAACTAGCTAATCTCTTTAATATGCTATCTAACAGTATGAACCAAGGTTCATATACCTTGAGTCTAAATATTGTCAATTCATTGGTCTTTATCAAATCAAACGTAATTTTACATCTTATTTTAGATATACCACATTACTTGATGAAGCTCGTACACCAGTGGACTCAACTAAAGATTTAATAGCACTTCGAGAGGACATGCAACAAATTCAAACGATATGTATCATGAGAAGTATGTTAGTTGTAATCTTCTAATGTTACATAAGATTTGTATTATCTTATATGTTTTATGTTTTTATAACTAATCCAAAGGA ] [+] EMBL CD089420 [CAGTGGGCATCAGATCCCGCGAGATCATAGGTACTTCTTGCTGACGAGTGTCAAATAGCACAAGACCTAGGTCCAAAGTTTCAAGCTGACTACCTCCAACCATCATCTCAACTAGCTAATCTCTTTAATATGCTATCTAACAGTATGAACCAAGGTTCATATACCTTGAGTCTAAATATTGTCAATTCATTGGTCTTTATCAAATCAAACGTAATTTTACATCTTATTTTAGATATACCACATTACTTGATGAAGCTCGTACACCAGTGGACTCAACTAAAGATTTAATAGCACTTCGAGAGGACATGCAACAAATTCAAACGATATGTATCATGAGAAGTATGTTAGTTGTAATCTTCTAATGTTACATAAGATTTGNATTATCTTATA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||