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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7505#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1272 fasta sequence
[AGCGATCTGTATCAGAAAACTTATGTCAAAAAGATGTGTGCTGCTGATGATGATAGTGAATAACTAGTGATGTGCAAGTAGTAGTTTAAAGCGATTGCAAACACTGAATTAATGAATACTAAAATGACAAGAAGCATAACGTATTGTTGGTGTTGTGTTGCTTTTTACAATAAAGACAGGAAAAACAAAGCTAGTTAGTATACATTGTGTAATGACAGAGACAAACGACTGATTGTCGAAGAAAAATGTTCAAAAAATGAGAGAATTATAACAATCCACAAATGGTATATATATATATGAAGAGACAAAACTAAACTAATAAATGTATATAGAATATGGGGA-AATAAGAAATTAAT-AATAAACGGTGCTCTAATTCACTTATCCCTGTTCGTCGTTACACTGTAGTAGTAGCATAAAGCAACACAGATTATTGTAGTTGCAATAGTAACAAACTCTACGTGCGATGATTAGCTTTGTCATTTGATGATTTGTGTGTAGTTGTTGTTGCTGTAGTGTTAGTAGAAGAATCGTTTTGTTGTAATGTAGTCATACCATTACTTTCAGAGTTCGAACCAGGCGATTTGCTGGCTGCTGGCGTCCCACCATTATTACTATTGTTGGTGTTATTACAACCGCCATTGTTGTTACCAGTGCCGTTATTATTATTACTATTATTTGAAGTTTTAGAAACATGATTGGTGGAAGAATTATTTGAAACTGACAAATTAGTATTGTTATTATTAGTTGTATTATTATTATTGTTGTTATTATTATTATTATTTGCAGATGAGCTTTTTCCAGTAGTGTTATTATTCCCGGCCACATTGTTATATTTTTCCAATTTAGCTATAATATGCTTGCCATAATTAAATTTGCGTAGAACATTTTGCATAGGACGGATTCGATTAATTAATACACGACGTTGTTCAGTATCGGCTAATTCTAGCATACGTTGAACTACATAATTTGCATATTGATCTTTCATCATATCAACTAATGATGAAGAGATGTTATTAGTTGTTACTGACGAGGTGTCTCCATTAATATTCACATTAGAAATTGGATGTAAAATTTCTTCAATTAATACAGCTCTTTCAGATGGTACAGCGTTGGCAATTGCTTTCTCCATAACATTCGATGCAAATTTATGCGAACTTAAAGCACATACACGACCACGTAGATTTTGAATAATACGTGATTTATCCTCATTTGAACCATGCTCTAAAACATGTTGAATGACGTAGTTGCCGTACTGATCTTTGAATAAATGTT]
[+] EMBL CD187828 [AGCGATCTGTATCAGAAAACTTATGTCAAAAAGATGTGTGCTGCTGATGATGATAGTGAATAACTAGTGATGTGCAAGTAGTAGTTTAAAGCGATTGCAAACACTGAATTAATGAATACTAAAATGACAAGAAGCATAACGTATTGTTGGTGTTGTGTTGCTTTTTACAATAAAGACAGGAAAAACAAAGCTAGTTAGTATACATTGTGTAATGACAGAGACAAACGACTGATTGTCGAAGAAAAATGTTCAAAAAATGAGAGAATTATAACAATCCACAAATGGTATATATATATATGAAGAGACAAAACTAAACTAATAAATGTATATAGAATATGGGGA AATAAGAAATTAAT AATAAACGGTGCTCTAATTCACTTATCCCTGTTCGTCGTTACACTGTAGTAGTAGCATAAAGCAACACAGATTATTGTAGTTGCAATAGTAACAAACTCTACGTGCGATGATTAGCTTTGTCATTTGATGATTTGTGTGTAGTTGTTGTTGCTGTAGTGTTAGTAGAAGAATC ]
[+] EMBL CD069146 [ GTGTTGTGTTGCTTTTTACAATAAAGACAGGAAAAACAAAGCTAGTTAGTATACATTGTGTAATGACAGAGACAAACGACTGGTTGTCGAAGAAAAATGTTCAAAAAATGAGAGAATTATAACAATCCACAAATGGTATATATATATATGAAGAGACAAAACTAAACTAATAAATGTATATAGAATATGGGGACAATAAGACATTACTCACTAAACGGTGCTCTAATTCACTTATCCCTGTTCGTCGTTACACTGTAGTAGTAGCATAAAGCAACACAGATTATTGTAGTTGCAATAGTAACAAACTCTACGTGCGATGATTAGCTTTGTCATTTGATGATTTGTGTGTAGTTGTTGTTGCTGTAGTGTTAGTAGAAGAATCGTTTTGTTGTAATGTAGTCATACCATTACTTTCAGAGTTCGAACCAGGCGATTT ]
[-] EMBL CD152084 [ CTGTAGTAGTAGCATAAAGCAACACAGATTATTGTAGTTGCAATAGTAACAAACTCTACGTGCGATGATTAGCTTTGTCATTTGATGATTTGTGTGTAGTTGTTGTTGCTGTAGTGTTAGTAGAAGAATCGTTTTGTTGTAATGTAGTCATACCATTACTTTCAGAGTTCGAACCAGCCGATTTGCTGGCTGCTGGCGTCCCACCATTATTACTATTGTTGGTGTTATTACAACCGCCATTGTTGTTACCAGTGCCGTTATTATTATTACTATTATTTGAAGTTTTAGAAACATGATTGGTGGAAGAATTATTTGAAA ]
[-] EMBL CD146086 [ ATTACTATTATTTGAAGTTTTAGAAACATGATTGGTGGAAGAATTATTTGAAACTGACAAATTAGTATTGTTATTATTAGTTGTATTATTATTATTGTTGTTATTATTATTATTATTTGCAGATGAGCTTTTTCCAGTAGTGTTATTATTCCCGGCCACATTGTTATATTTTTCCAATTTAGCTATAATATGCTTGCCATAATTAAATTTGCGTAGAACATTTTGCATAGGACGGATTCGATTAATTAATACACGACGTTGTTCAGTATCGGCTAATTCTA ]
[-] EMBL AI975784 [ TAATT AATTTGCGTAGAACATTTTGCATAGGACGGATTCGATTAATTAATACACGACGTTGTTCAGTATCAGCTAATTCTAGCATACGTTGAACTACATAATTTGCATATTGATCTTTCATCATATCAACTAATGATGAAGAGATGTTATTAGTTGTTACTGACGAGGTGTCTCCATTAATATTCACATTAGAAATTGGATGTAAAATTTCTTCAATTAATACAGCTCTTTCAGATGGTACAGCGTTGGCAATTGCTTTCTCCATAACATTCGATGCAAATTTATGCGAACTTAAAGCACATACACGACCACGTAGATTTTGAATAATACGTGATTTATCCTCATTTGAACCATGCTCTAAAACATGTTGAATGACGTAGTTGCCGTACTGATCTTTGAATAAATGTT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||