These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7514#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 847 fasta sequence [CGGCCAANAATTTGGCACGAGGGTCATGATAGGTCTACAATGACATAAAAGGAATAATGAATACAATATAATAATAATAAGAAGAATAATTTATTTGTGCATTTCTATGTTTGATCCCGTGTTTATTATGATTCAGTTATTCTTTTTGAATCGACAACTGAATCTCTATGTTAATGTGGTATGGCAACTCGAACTGATGTACGTACGTACGAAGTTCTACGTTGTGTCTGACTGATTCTTACAACAACAACAACAACAACAAAAAAAGTGTTCTGGTGTACCTGTTTTTCTTTCCCACTTTCTAAAATCAATAATTCATTGTTTAATCAATTATTCTATCCTAATCATTCCATCTATTTATGATTTATGCTTTGTACCATTTCATTCCTATAAAACTTACCTATCTCTGTCCTTCATTGTTTCACTCTGTATTTTCTGTTTTAGTAATTACTACTACTAATACTACTTATACT-ACTA---C-TAGTACTACTACCAATACTACCAATACTTACTAGTACTACTACTAATACTATTACTCATACTACTACTACTCATACTACTACCACTACTACTACTACTCATACCGCTTACAATTCATTAGAAATCTTAAGTAATATGTATTTACATTTTGTTTTCACTCTTGTGATTNTTATTGTTTGTTTGTTTTTCTTAACAACACTATCTCTCCCTCTCCATTCTCTNTATCTAATTATATTTAGCATTNTATTAGTTATCACATCATATATATACTACTGATTAACCAAAATAATTAACAGTAGTATCTTATACTATTATGATTATATTTCATTTGNATGCTAGNGATTTAATTATTTGATNNTAATGTGTGAAA] [+] EMBL CD080819 [CGGCCAANAATTTGGCACGAGGGTCATGATAGGTCTACAATGACATAAAAGGAATAATGAATACAATATAATAATAATAAGAAGAATAATTTATTTGTGCATTTCTATGTTTGATCCCGTGTTTATTATGATTCAGTTATTCTTTTTGAATCGACAACTGAATCTCTATGTTAATGTGGTATGGCAACTCGAACTGATGTACGTACGTACGAAGTTCTACGTTGTGTCTGACTGATTCTTACAACAACAACAACAACAACAAAAAAAGTGTTCTGGTGTACCTGTTTTTCTTTCCCACTTTCTAAAATCAATAATTCATTGTTTAATCAATTATTCTATCCTAATCATTCCATCTATTTATGATTTATGCTTTGTACCATTTCATTCCTATAAAACTTACCTATCTCTGTCCTTCATTGTTTCACTCTGTATTTTCTGTTTTAGTAATTACTACTACTAATACTACTTATACT ACTA C TAGTACTACTACCAATACTACCAATACTTACTAGTACTACTACTAATACTATTACTCATACTACTACTACTCATACTACTACCACTACTACTACTACTCATACCGCTTACAATTCATTAGAAATCTTAAGTAATATGTATTTACATTTTGTTTTCACTCTTGTGATTNTTATTGTTTGTTTGTTTTTCTTAACAACACTATCTCTCCCTCTCCATTCTCTNTATCTAATTATATTTAGCATTNTATTAGTTATCACATCATATATATACTACTGATTAACCAAAATAATTAACAGTAGTATCTTATACTATTATGATTATATTTCATTTGNATGCTAGNGATTTAATTATTTGATNNTAATGTGTGAAA] [-] EMBL CD127804 [ ATAAAAGGAATAATGAATCCAATATAATAATAATAAGAAGAATAATTTATTTGTGCATTTCTATGTTTGATCCCGTGTTTATTATGATTCAGTTATTCTTTTTGAATCGACAACTGAATCTCTATGTTAATGTGGTATGGCAACTCGAACTGATGTACGTACGTACGAAGTTCTACGTTGTGTCTGACTGATTCTTACAACAACAACAACAACAACAAAAAAAGTGTTCTGGTGTACCTGTTTTTCTTTCCCACTTTCTAAAATCAATAATTCATTGTTTAATCAATTATTCTATCCTAATCATTCCATCTATTTATGATTTATGCTTTGTACCATTTCATTCCTATAAAACTTACCTATCTCTGTCCTTCATTGTTTCACTCTGTATTTTCTGTTTTAGTAATTACTACTACTAATACTACTTATACT ACTA C TAGTACTACTACCAATACTA ] [+] EMBL CD088212 [ GAACTGATGTACGTACGTACGAAGTTCTACGTTGTGTCTGACTGATTCTTACAACAACAACAACAACAACAAAAAAAGTGTTCTGGTGTACCTGTTTTTCTTTCCCACTTTCTAAAATCAATAATTCATTGTTTAATCAATTATTCTATCCTAATCATCCCATCTATTTATAATTTATGCTTGGCCCCATTTCATTCATAAAAAACTCACCTATCTCTGCCCTTGATTGTTACACTCTGTATTTTCTGTTTAAGAAATTACTACTACTAATAC ACTTAT CTCACTATCNCGNGGGACTACTACCAATACTACCAATACTTACTAGTACTACTACTAATACTATTACTCATACTACTACTACTCATACTACTACCACTACTACTAC ACTC ] [-] EMBL CD088398 [ AACTGATGTACGTACGTACGAAGTTCTACGTTGTGTCTGACTGATTCTTACAACAACAACAACAACAACAAAAAAAGTGTTCTGGTGTACCTGTTTTTCTTTCCCACTTTCTAAAATCAATAATTCATTGTTTAATCAATTATTCTATCCTAATCATTCCATCTATTTATGATTTATGCTTTGTACCATTTCATTCCTATAAAACTTACCTATCTCTGTCCTTCATTGTTTCACTCTGTATTTTCTGTTTTAGTAATTACTACTACTAATACTACTTATACT ACTA C TAGTACTACTACCAATACTACCAATACTTACTAGTACTACTACTAATACTATTACTCATACTACTACTACTCATACTACTAC ] [+] EMBL CD189085 [ ACGTACGAAGTTCTACGTTGTGTCTGACTGATTCTTACAACAACAACAACAACAACAAAAAAAGTGTTCTGGTGTACCTGTTTTTCTTTCCCACTTTCTAAAATCAATAATTCATTGTTTAATCAATTATTCTATCCTAATCATTCCATCTATTTATGATTTATGCTTTGTACCATTTCATTCCTATAAAACTTACCTATCTCTGTCCTTCATTGTTTCACTCTGTATTTTCTGTTTTAGTAATTACTACTACTAATACTACTTATACT ACTA C TAGTACTACTACCAATACTACCAATACTTACTAGTACTACTACTAATACTATTACTCATACTACTACTACT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||