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Schistosoma mansoni
cluster # 7514 cluster # 7514       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7514#0 length = 847 sequences # 5  

consensusID : consensus_7514#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 847
fasta sequence
                              [CGGCCAANAATTTGGCACGAGGGTCATGATAGGTCTACAATGACATAAAAGGAATAATGAATACAATATAATAATAATAAGAAGAATAATTTATTTGTGCATTTCTATGTTTGATCCCGTGTTTATTATGATTCAGTTATTCTTTTTGAATCGACAACTGAATCTCTATGTTAATGTGGTATGGCAACTCGAACTGATGTACGTACGTACGAAGTTCTACGTTGTGTCTGACTGATTCTTACAACAACAACAACAACAACAAAAAAAGTGTTCTGGTGTACCTGTTTTTCTTTCCCACTTTCTAAAATCAATAATTCATTGTTTAATCAATTATTCTATCCTAATCATTCCATCTATTTATGATTTATGCTTTGTACCATTTCATTCCTATAAAACTTACCTATCTCTGTCCTTCATTGTTTCACTCTGTATTTTCTGTTTTAGTAATTACTACTACTAATACTACTTATACT-ACTA---C-TAGTACTACTACCAATACTACCAATACTTACTAGTACTACTACTAATACTATTACTCATACTACTACTACTCATACTACTACCACTACTACTACTACTCATACCGCTTACAATTCATTAGAAATCTTAAGTAATATGTATTTACATTTTGTTTTCACTCTTGTGATTNTTATTGTTTGTTTGTTTTTCTTAACAACACTATCTCTCCCTCTCCATTCTCTNTATCTAATTATATTTAGCATTNTATTAGTTATCACATCATATATATACTACTGATTAACCAAAATAATTAACAGTAGTATCTTATACTATTATGATTATATTTCATTTGNATGCTAGNGATTTAATTATTTGATNNTAATGTGTGAAA]

[+] EMBL CD080819             [CGGCCAANAATTTGGCACGAGGGTCATGATAGGTCTACAATGACATAAAAGGAATAATGAATACAATATAATAATAATAAGAAGAATAATTTATTTGTGCATTTCTATGTTTGATCCCGTGTTTATTATGATTCAGTTATTCTTTTTGAATCGACAACTGAATCTCTATGTTAATGTGGTATGGCAACTCGAACTGATGTACGTACGTACGAAGTTCTACGTTGTGTCTGACTGATTCTTACAACAACAACAACAACAACAAAAAAAGTGTTCTGGTGTACCTGTTTTTCTTTCCCACTTTCTAAAATCAATAATTCATTGTTTAATCAATTATTCTATCCTAATCATTCCATCTATTTATGATTTATGCTTTGTACCATTTCATTCCTATAAAACTTACCTATCTCTGTCCTTCATTGTTTCACTCTGTATTTTCTGTTTTAGTAATTACTACTACTAATACTACTTATACT ACTA   C TAGTACTACTACCAATACTACCAATACTTACTAGTACTACTACTAATACTATTACTCATACTACTACTACTCATACTACTACCACTACTACTACTACTCATACCGCTTACAATTCATTAGAAATCTTAAGTAATATGTATTTACATTTTGTTTTCACTCTTGTGATTNTTATTGTTTGTTTGTTTTTCTTAACAACACTATCTCTCCCTCTCCATTCTCTNTATCTAATTATATTTAGCATTNTATTAGTTATCACATCATATATATACTACTGATTAACCAAAATAATTAACAGTAGTATCTTATACTATTATGATTATATTTCATTTGNATGCTAGNGATTTAATTATTTGATNNTAATGTGTGAAA]
[-] EMBL CD127804             [                                            ATAAAAGGAATAATGAATCCAATATAATAATAATAAGAAGAATAATTTATTTGTGCATTTCTATGTTTGATCCCGTGTTTATTATGATTCAGTTATTCTTTTTGAATCGACAACTGAATCTCTATGTTAATGTGGTATGGCAACTCGAACTGATGTACGTACGTACGAAGTTCTACGTTGTGTCTGACTGATTCTTACAACAACAACAACAACAACAAAAAAAGTGTTCTGGTGTACCTGTTTTTCTTTCCCACTTTCTAAAATCAATAATTCATTGTTTAATCAATTATTCTATCCTAATCATTCCATCTATTTATGATTTATGCTTTGTACCATTTCATTCCTATAAAACTTACCTATCTCTGTCCTTCATTGTTTCACTCTGTATTTTCTGTTTTAGTAATTACTACTACTAATACTACTTATACT ACTA   C TAGTACTACTACCAATACTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD088212             [                                                                                                                                                                                              GAACTGATGTACGTACGTACGAAGTTCTACGTTGTGTCTGACTGATTCTTACAACAACAACAACAACAACAAAAAAAGTGTTCTGGTGTACCTGTTTTTCTTTCCCACTTTCTAAAATCAATAATTCATTGTTTAATCAATTATTCTATCCTAATCATCCCATCTATTTATAATTTATGCTTGGCCCCATTTCATTCATAAAAAACTCACCTATCTCTGCCCTTGATTGTTACACTCTGTATTTTCTGTTTAAGAAATTACTACTACTAATAC ACTTAT CTCACTATCNCGNGGGACTACTACCAATACTACCAATACTTACTAGTACTACTACTAATACTATTACTCATACTACTACTACTCATACTACTACCACTACTACTAC ACTC                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD088398             [                                                                                                                                                                                               AACTGATGTACGTACGTACGAAGTTCTACGTTGTGTCTGACTGATTCTTACAACAACAACAACAACAACAAAAAAAGTGTTCTGGTGTACCTGTTTTTCTTTCCCACTTTCTAAAATCAATAATTCATTGTTTAATCAATTATTCTATCCTAATCATTCCATCTATTTATGATTTATGCTTTGTACCATTTCATTCCTATAAAACTTACCTATCTCTGTCCTTCATTGTTTCACTCTGTATTTTCTGTTTTAGTAATTACTACTACTAATACTACTTATACT ACTA   C TAGTACTACTACCAATACTACCAATACTTACTAGTACTACTACTAATACTATTACTCATACTACTACTACTCATACTACTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD189085             [                                                                                                                                                                                                            ACGTACGAAGTTCTACGTTGTGTCTGACTGATTCTTACAACAACAACAACAACAACAAAAAAAGTGTTCTGGTGTACCTGTTTTTCTTTCCCACTTTCTAAAATCAATAATTCATTGTTTAATCAATTATTCTATCCTAATCATTCCATCTATTTATGATTTATGCTTTGTACCATTTCATTCCTATAAAACTTACCTATCTCTGTCCTTCATTGTTTCACTCTGTATTTTCTGTTTTAGTAATTACTACTACTAATACTACTTATACT ACTA   C TAGTACTACTACCAATACTACCAATACTTACTAGTACTACTACTAATACTATTACTCATACTACTACTACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]


>consensus_7514#0 CGGCCAANAATTTGGCACGAGGGTCATGATAGGTCTACAATGACATAAAAGGAATAATGA ATACAATATAATAATAATAAGAAGAATAATTTATTTGTGCATTTCTATGTTTGATCCCGT GTTTATTATGATTCAGTTATTCTTTTTGAATCGACAACTGAATCTCTATGTTAATGTGGT ATGGCAACTCGAACTGATGTACGTACGTACGAAGTTCTACGTTGTGTCTGACTGATTCTT ACAACAACAACAACAACAACAAAAAAAGTGTTCTGGTGTACCTGTTTTTCTTTCCCACTT TCTAAAATCAATAATTCATTGTTTAATCAATTATTCTATCCTAATCATTCCATCTATTTA TGATTTATGCTTTGTACCATTTCATTCCTATAAAACTTACCTATCTCTGTCCTTCATTGT TTCACTCTGTATTTTCTGTTTTAGTAATTACTACTACTAATACTACTTATACTACTACTA GTACTACTACCAATACTACCAATACTTACTAGTACTACTACTAATACTATTACTCATACT ACTACTACTCATACTACTACCACTACTACTACTACTCATACCGCTTACAATTCATTAGAA ATCTTAAGTAATATGTATTTACATTTTGTTTTCACTCTTGTGATTNTTATTGTTTGTTTG TTTTTCTTAACAACACTATCTCTCCCTCTCCATTCTCTNTATCTAATTATATTTAGCATT NTATTAGTTATCACATCATATATATACTACTGATTAACCAAAATAATTAACAGTAGTATC TTATACTATTATGATTATATTTCATTTGNATGCTAGNGATTTAATTATTTGATNNTAATG TGTGAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)