Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7526 cluster # 7526       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7526#0 length = 920 sequences # 5  

consensusID : consensus_7526#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 920
fasta sequence
                              [TTGTCATCATGGATAATGTAGCTTTAGTCTTTTTTTCCTGCATAGGTGATGACGGTTGTAGTTGTTGTAACTCTGGAAGTTGTGATTTCTGTTTTGTTAATCCTGTTGATGATATTGTTGGCGCTGTGCTTCATTATGATGATAATGCCAGTATGGTGGCGGTATTGGATGTTGTAAGTGCTCATGTGTTTGACGTTTACTTGTTGATTTTGACGTCGCCTTCAATTTAGGCACTGGTTTCACAGCAGATACAGAAACAGGATAAGGTATTTCACTTTCACCATTTTCTTCACGACCATCTGGTGATGAAATTTGTTTTAATTTTTGACTTTCAATTGTCATCATGGATAATGTAGCTTTAGTCTTTTTTTCCTGCATAGGTGATGACGGTTGTAGTTGTTGTAACTCTGGAAGTTGTGATTTCTGTTTTGTTAATCCTGTTGCACTAGTGGTTGTTGTTACTACTCCTGATGATAGTACAGATGGTATTATGGTCTCCCTACCTCTGGCTAAATCTTCATCATGTTCAATATTTGACTTGTCATATTTTTGATCTTTGCTACTAACATTTGTAGCAGTGCTAATGGTTGTAACAGTACTGGCTAGTGTTGAAGATTTCACTTTTCTATCTCCGGATACACCATTTGTTTTTCCACTAGATAATACTTCAGAACGCCTGTGCAAACAATGGTCGTGGTGACGATGATGAGGGTATGCACTGGTTGTTTGCGGCGGTAAATTAGTAGCAGTTATATGTCATCGGCAGTAGCATCGTAGTGACTGAATTTCTTGTCACTCTTTTCATCAAAAGCAAATGGTTCAGTTTCTTTTCGACTTCTTGAATGTGTTCTCTTAGAATGTCGTTTACATGAGTCACTATCTCGTTTTGATACCTGCTTTGAGTGACTTGACGGAAATTT]

[+] EMBL CD185232             [TTGTCATCATGGATAATGTAGCTTTAGTCTTTTTTTCCTGCATAGGTGATGACGGTTGTAGTTGTTGTAACTCTGGAAGTTGTGATTTCTGTTTTGTTAATCCTGTTGATGATATTGTTGGCGCTGTGCTTCATTATGATGATAATGCCAGTATGGTGGCGGTATTGGATGTTGTAAGTGCTCATGTGTTTGACGTTTACTTGTTGATTTTGACGTCGCCTTCAATTTAGGCACTGGTTTCACAGCAGATACAGAAACAGGATAAGGTATTTCACTCTCACCATTTTCTTCACGACCATCTGGTGATGAAATTTGTTTTAATTTTTGACTTTCAATTGTCATCATGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD185329             [TTGTCATCATGGATAATGTAGCTTTTGTCTTTTTTTCCTGCATAGGTGATGACGGTTGTAGTTGTTGTAACTCTGGAAGTTGTGATTTCTGTTTTGTTAATCCTGTTGATGATATTGTTGGCGCTGTGCTTCATTATGATGATAATGCCAGTATGGTGGCGGTATTGGATGTTGTAAGTGCTCATGTGTTTGACGTTTACTTGTTGATTTTGACGTCGCCTTCAATTTAGGCACTGGTTTCACAGCAGATACAGAAACAGGATAAGGTATTTCACTTTCACCATTTTCTTCACGACCATCTGGTGATGAAATTTGTTTTAATTTTTGACTTTCAATTGTCATCATGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD168044             [                                                                                                                                                                                  TGCTCATGTGTTTGACGTTTACTTGTTGATTTTGACGTCGCCTTCAATTTAGGCACTGGTTTCACAGCAGATACAGAAACAGGATAAGGTATTTCACTTTCACCATTTTCTTCACGACCATCTGGTGATGAAATTTGTTTTAATTTTTGACTTTCAATTGTCATCATGGATAATGTAGCTTTAGTCTTTTTTTCCTGCATAGGTGATGACGGTTGTAGTTGTTGTAACTCTGGAAGTTGTGATTTCTGTTTTGTTAATCCTGTTGCACTAGTGGTTGTTGTTACTACTCCTGATGATAGTACAGATGGTATTATGGTCTCCCTACCTCTGGCTAAATCTTCATCATGTTCAATATTTGACTTGTCATATTTTTGATCTTTGCTACTAACATTTGTAGCAGTGCTAATGGTTGTAACAGTACTGGCTAGTGTTGAAGATTTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD069210             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TAAATCTTCATCATGTTCAATATTTGACTTGTCATATTTTTGATCTTTGCTACTAACATTTGTAGCAGTGCTAATGGTTGTAACAGTACTGGCTAGTGTTGAAGATTTCACTTTTCTATCTCCGGATACACCATTTGTTTTTCCACTAGATAATACTTCAGAACGCCTGTGCAAACAATGGTCGTGGTGACGATGATGAGGGTATGCACTGGTTGTTTGCGGCGGTAAATTAGTAGCAGTTATATGTCATCGGCAGTAGCATCGTAG                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD134294             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTCTATCTCCGGATACACCATTTGTTTTTCCACTAGATAATACTTCAGAACGTCTGTGCAAACAATGGTCGTGGTGACGATGATGAGGGTATGCACTGGTTGTTTGCGGCGGTAAATTAGTAGCAGTTATATG  GTTGGTAGTAGCATCGTAGTGACTGAATTTCTTGTCACTCTTTTCATCAAAAGCAAATGGTTCAGTTTCTTTTCGACTTCTTGAATGTGTTCTCTTAGAATGTCGTTTACATGAGTCACTATCTCGTTTTGATACCTGCTTTGAGTGACTTGACGGAAATTT]


>consensus_7526#0 TTGTCATCATGGATAATGTAGCTTTAGTCTTTTTTTCCTGCATAGGTGATGACGGTTGTA GTTGTTGTAACTCTGGAAGTTGTGATTTCTGTTTTGTTAATCCTGTTGATGATATTGTTG GCGCTGTGCTTCATTATGATGATAATGCCAGTATGGTGGCGGTATTGGATGTTGTAAGTG CTCATGTGTTTGACGTTTACTTGTTGATTTTGACGTCGCCTTCAATTTAGGCACTGGTTT CACAGCAGATACAGAAACAGGATAAGGTATTTCACTTTCACCATTTTCTTCACGACCATC TGGTGATGAAATTTGTTTTAATTTTTGACTTTCAATTGTCATCATGGATAATGTAGCTTT AGTCTTTTTTTCCTGCATAGGTGATGACGGTTGTAGTTGTTGTAACTCTGGAAGTTGTGA TTTCTGTTTTGTTAATCCTGTTGCACTAGTGGTTGTTGTTACTACTCCTGATGATAGTAC AGATGGTATTATGGTCTCCCTACCTCTGGCTAAATCTTCATCATGTTCAATATTTGACTT GTCATATTTTTGATCTTTGCTACTAACATTTGTAGCAGTGCTAATGGTTGTAACAGTACT GGCTAGTGTTGAAGATTTCACTTTTCTATCTCCGGATACACCATTTGTTTTTCCACTAGA TAATACTTCAGAACGCCTGTGCAAACAATGGTCGTGGTGACGATGATGAGGGTATGCACT GGTTGTTTGCGGCGGTAAATTAGTAGCAGTTATATGTCATCGGCAGTAGCATCGTAGTGA CTGAATTTCTTGTCACTCTTTTCATCAAAAGCAAATGGTTCAGTTTCTTTTCGACTTCTT GAATGTGTTCTCTTAGAATGTCGTTTACATGAGTCACTATCTCGTTTTGATACCTGCTTT GAGTGACTTGACGGAAATTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)