These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7538#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 665 fasta sequence [AACACATTGTCCCTTCCTTAACATTAATGTCATGGAGAAAACCAGTTAGTTCAAATGTAACT-TTTAA-GGAAAAAATTACATAATTTGCTACGTATTGAGTTTAG-CAATTTAGCTAACCACCTGCTCGCTCATGTGTAGGTAAACCCAACATAGATACCGTTGGTCGTATTCGGTTATTAGGTTCATGGAATTTCGATAATCCATATAAATTCAGGAGTTCAGAGCCAATACGCTTTAATATATTGAATTTGGCTTGTTTATAACATTTATGTTAAGGTGTTTCATCAGATTTCAGCTTTCTCTGGTTTCGAACATCATTTGACGGGAAGCCCACCAAAAACTTGCCCTCAACACAAAGAATGCATAACGTTCCTTTTTTATAGTCATATTTATTCATAACAGCTATACCAGAATCTTTATCAGGTTTGAGAAACACAATATGTGATCTACTCTGGAAACTTTTTAAAGCCTTGAAATGTTTAAATATCAGAATATTCGTGTTTTATTTAAGAACCAAGAAATTACTGGTTAGAATGAATCTTTTTTACCTTCAACCTATTTCGTTTATCTGGAGTAGTTAGAACAAGAAGACTCACTAGCTATACATAAAGTAATACTAGATTTATAACATAAAATTCAATTTGTACCGTACTCCTATTTACATC] [+] EMBL CD085427 [AACACATTGTCCCTTCCTTAACATTAATGTCATGGAGAAAACCAGTTAGTTCAAATGTAACT TTTAA GGAAAAAATTACATAATTTGCTACGTATTGAGTTTAG CAATTTAGCTAACCACCTGCTCGCTCATGTGTAGGTAAACCCAACATAGATACCGTTGGTCGTATTCGGTTATTAGGTTCATGGAATTTCGATAATCCATATAAATTCAGGAGTTCAGAGCCAATACGCTTTAATATATTGAATTTGGCTTGTTTATAACATTTATGTTAAGGTGTTTCATCAGATTTCAGCTTTCTCTGGTTTCGAACATCATTTGACGGGAAGCCCACCAAAAACTTGCCCTCAACACAAAGAATGCATAACGTTCCTTTTTTATAGTCATATTTATTCATAACAGCTATACCAGAATCTTTATCAGGTTTGAGAAACACAATATGTGATCTACTCTGGAAACTTTTTAAAGCCTTGAAATGTTTAAATATCAGAATATTCGTGTTTTATTTAAGAACCAAGAAATTACTGGTTAGAATGAATCTTTTTTACCTTCAACCTATTTCGTTTATCTGGAGTAGTTAGAACAAGAAGACTCACTAGCTATACATAAAGTAATACTAGATTTATAACATAAAATTCAATTTGTACCGTACCTCTATTTACAT ] [+] EMBL CD085408 [AACACATTGTCCCTTCCTTAACATTAATGTCATGGAGAAAACCAGTTAGTTCAAATGTAACT TTTAA GGAAAAAA TACATAATTTGCTACGTATTGAGTTTAG CAATTTAGCTAACCACCTGCTCGCTCATGTGTAGGTAAACCCAACATAGATACCGTTGGTCGTATTCGGTTATTAGGTTCATGGAATTTCGATAATCCATATAAATTCAGGAGTTCAGAGCCAATACGCTTTAATATATTGAATTTGGCTTGTTTATAACATTTATGTTAAGGTGTTTCATCAGATTTCAGCTTTCTCTGGTTTCGAACATCATTTGACGGGAAGCCCACCAAAAACTTGCCCTCAACACAAAGAATGCATAACGTTCCTTTTTTATAGTCATATTTATTCATAACAGCTATACCAGAATCTTTATCAGGTTTGAGAAACACAATATGTGATCTACTCTGGAAACTTTTTAAAGCCTTGAAATGTTTAAATATCAGAATATTCGTGTTTTATTTAAGAACCCAGAAATTACTGGCTAGAATGAATCTTTTTTACCTTCAACCTATTTCGTTTATCTGGAGTAGCTAGAACAAGAAGACTCACTAGCTATACATAAAGTAATACTAGATTTATAACATAAAATTCAATTTGGACCGGACTCCTATTTACAT ] [+] EMBL CD085379 [AACACATTGTCCCTTCCTTAACATTAATGTCATGGAGAAAACCAGTTAGTTCAAATGTAACTCTTTAAGGGAAAAAATTACATAATTTGCTACGTATTGAGTTTAG CAATTTAGCTAACCGCCTGCTCGCTCATGTGTAGGTAAACCCAACATAGATACCGTTGGTCGTATTCGGTTATTAGGTTCATGGAATTTCGATAATCCATATAAATTCAGGAGTTCAGAGCCAATACGCTTTAATATATTGAATTTGGCTTGTTTATAACATTTATGTTAAGGTGTTTCATCAGATTTCAGCTTTCTCTGGTTTCGAACATCATTTGACGGGAAGCCCACCAAAAACTTGCCCTCAACACAAAGAATGCATAACGTTCCTTTT ] [-] EMBL CD085520 [ cnnCANTGTGCCTTCCTTAACATTAATGTCATGGAGAGAACCAGTTAGTTCAAATGTANC TTTAA GGAAAAAGTTACATAATNTGCTACGTA TGAGGTTAGCCAATTTAGCTAACCACCTGCTCGCTCATGTGTAGGTAAACCCAACATAGATACCGTTGGTCGTATTCGGTTATTAGGTTCATGGAATTTCGATAATCCATATAAATTCAGGAGTTCAGAGCCAATACGCTTTAATATATTGAATTTGGCTTGTTTATAACATTTATGTTAAGGTGTTTCATCAGATTTCAGCTTTCTCTGGTTTCGAACATCATTTGACGGGAAGCCCACCAAAAACTTGCCCTCAACACAAAGAATGCATAACGTTCCTTTTTTATAGTCATATTTATTCATAACAGCTATACCAGAATCTTTATCAGGTTTGAGAAACACAATATGTGATCTACTCTGGAAACTTTTTAAAGCCTTGAAATGTTTAAATATCAGAATATTCGAGTTTTATTTAAGAACCAAGAAATTACTGGTTAGAATGAATCTTTTTTACCTTCAACCTATTTCGTTTATCTGGAGTAGTTAGAACAAGAAGACTCACTAGCTATACATAAAGTAATACTAGATTTATAACATAAAATTCAATTTGTACAGTACTCCTATTTACATC] [-] EMBL CD085524 [ AGCTAACCACCTGCTCGCTCATGTGTAGGTAAACCCAACATAGATACCGTTGGTCGTATTCGGTTATTAGGTTCATGGAATTTCGATAATCCATATAAATTCAGGAGTTCAGAGCCAATACGCTTTAATATATTGAATTTGGCTTGTTTATAACATTTATGTTAAGGTGTTTCATCAGATTTCAGCTTTCTCTGGTTTCGAACATCATTTGACGGGAAGCCCACCAAAAACTTGCCCTCAACACAAAGAATGCATAACGTTCCTTTTTTATAGTCATATTTATTCATAACAGCTATACCAGAATCTTTATCAGGTTTGAGAAACACAATATGTGATCTACTCTGGAAACTTTTTAAAGCCTTGAAATGTTTAAATATCAGAATATTCGAGTTTTATTTAAGAACCAAGAAATTACTGGTTAGAATGAATCTTTTTTACCTTCAACCTATTTCGTTTATCTGGAGTAGTTAGAACAAGAAGACTCACTAGCTATACATAAAGTAATACTAGATTTATAACATAAAATTCAATTTGTACAGTACTCCTATTTACATC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||