cluster # 7538

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Schistosoma mansoni
cluster # 7538 cluster # 7538 Sequences # 5 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7538#0 length = 665 sequences # 5

consensusID : consensus_7538#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 665
fasta sequence

                              [AACACATTGTCCCTTCCTTAACATTAATGTCATGGAGAAAACCAGTTAGTTCAAATGTAACT-TTTAA-GGAAAAAATTACATAATTTGCTACGTATTGAGTTTAG-CAATTTAGCTAACCACCTGCTCGCTCATGTGTAGGTAAACCCAACATAGATACCGTTGGTCGTATTCGGTTATTAGGTTCATGGAATTTCGATAATCCATATAAATTCAGGAGTTCAGAGCCAATACGCTTTAATATATTGAATTTGGCTTGTTTATAACATTTATGTTAAGGTGTTTCATCAGATTTCAGCTTTCTCTGGTTTCGAACATCATTTGACGGGAAGCCCACCAAAAACTTGCCCTCAACACAAAGAATGCATAACGTTCCTTTTTTATAGTCATATTTATTCATAACAGCTATACCAGAATCTTTATCAGGTTTGAGAAACACAATATGTGATCTACTCTGGAAACTTTTTAAAGCCTTGAAATGTTTAAATATCAGAATATTCGTGTTTTATTTAAGAACCAAGAAATTACTGGTTAGAATGAATCTTTTTTACCTTCAACCTATTTCGTTTATCTGGAGTAGTTAGAACAAGAAGACTCACTAGCTATACATAAAGTAATACTAGATTTATAACATAAAATTCAATTTGTACCGTACTCCTATTTACATC]

[+] EMBL CD085427             [AACACATTGTCCCTTCCTTAACATTAATGTCATGGAGAAAACCAGTTAGTTCAAATGTAACT TTTAA GGAAAAAATTACATAATTTGCTACGTATTGAGTTTAG CAATTTAGCTAACCACCTGCTCGCTCATGTGTAGGTAAACCCAACATAGATACCGTTGGTCGTATTCGGTTATTAGGTTCATGGAATTTCGATAATCCATATAAATTCAGGAGTTCAGAGCCAATACGCTTTAATATATTGAATTTGGCTTGTTTATAACATTTATGTTAAGGTGTTTCATCAGATTTCAGCTTTCTCTGGTTTCGAACATCATTTGACGGGAAGCCCACCAAAAACTTGCCCTCAACACAAAGAATGCATAACGTTCCTTTTTTATAGTCATATTTATTCATAACAGCTATACCAGAATCTTTATCAGGTTTGAGAAACACAATATGTGATCTACTCTGGAAACTTTTTAAAGCCTTGAAATGTTTAAATATCAGAATATTCGTGTTTTATTTAAGAACCAAGAAATTACTGGTTAGAATGAATCTTTTTTACCTTCAACCTATTTCGTTTATCTGGAGTAGTTAGAACAAGAAGACTCACTAGCTATACATAAAGTAATACTAGATTTATAACATAAAATTCAATTTGTACCGTACCTCTATTTACAT ]
[+] EMBL CD085408             [AACACATTGTCCCTTCCTTAACATTAATGTCATGGAGAAAACCAGTTAGTTCAAATGTAACT TTTAA GGAAAAAA TACATAATTTGCTACGTATTGAGTTTAG CAATTTAGCTAACCACCTGCTCGCTCATGTGTAGGTAAACCCAACATAGATACCGTTGGTCGTATTCGGTTATTAGGTTCATGGAATTTCGATAATCCATATAAATTCAGGAGTTCAGAGCCAATACGCTTTAATATATTGAATTTGGCTTGTTTATAACATTTATGTTAAGGTGTTTCATCAGATTTCAGCTTTCTCTGGTTTCGAACATCATTTGACGGGAAGCCCACCAAAAACTTGCCCTCAACACAAAGAATGCATAACGTTCCTTTTTTATAGTCATATTTATTCATAACAGCTATACCAGAATCTTTATCAGGTTTGAGAAACACAATATGTGATCTACTCTGGAAACTTTTTAAAGCCTTGAAATGTTTAAATATCAGAATATTCGTGTTTTATTTAAGAACCCAGAAATTACTGGCTAGAATGAATCTTTTTTACCTTCAACCTATTTCGTTTATCTGGAGTAGCTAGAACAAGAAGACTCACTAGCTATACATAAAGTAATACTAGATTTATAACATAAAATTCAATTTGGACCGGACTCCTATTTACAT ]
[+] EMBL CD085379             [AACACATTGTCCCTTCCTTAACATTAATGTCATGGAGAAAACCAGTTAGTTCAAATGTAACTCTTTAAGGGAAAAAATTACATAATTTGCTACGTATTGAGTTTAG CAATTTAGCTAACCGCCTGCTCGCTCATGTGTAGGTAAACCCAACATAGATACCGTTGGTCGTATTCGGTTATTAGGTTCATGGAATTTCGATAATCCATATAAATTCAGGAGTTCAGAGCCAATACGCTTTAATATATTGAATTTGGCTTGTTTATAACATTTATGTTAAGGTGTTTCATCAGATTTCAGCTTTCTCTGGTTTCGAACATCATTTGACGGGAAGCCCACCAAAAACTTGCCCTCAACACAAAGAATGCATAACGTTCCTTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD085520             [ cnnCANTGTGCCTTCCTTAACATTAATGTCATGGAGAGAACCAGTTAGTTCAAATGTANC  TTTAA GGAAAAAGTTACATAATNTGCTACGTA TGAGGTTAGCCAATTTAGCTAACCACCTGCTCGCTCATGTGTAGGTAAACCCAACATAGATACCGTTGGTCGTATTCGGTTATTAGGTTCATGGAATTTCGATAATCCATATAAATTCAGGAGTTCAGAGCCAATACGCTTTAATATATTGAATTTGGCTTGTTTATAACATTTATGTTAAGGTGTTTCATCAGATTTCAGCTTTCTCTGGTTTCGAACATCATTTGACGGGAAGCCCACCAAAAACTTGCCCTCAACACAAAGAATGCATAACGTTCCTTTTTTATAGTCATATTTATTCATAACAGCTATACCAGAATCTTTATCAGGTTTGAGAAACACAATATGTGATCTACTCTGGAAACTTTTTAAAGCCTTGAAATGTTTAAATATCAGAATATTCGAGTTTTATTTAAGAACCAAGAAATTACTGGTTAGAATGAATCTTTTTTACCTTCAACCTATTTCGTTTATCTGGAGTAGTTAGAACAAGAAGACTCACTAGCTATACATAAAGTAATACTAGATTTATAACATAAAATTCAATTTGTACAGTACTCCTATTTACATC]
[-] EMBL CD085524             [                                                                                                                 AGCTAACCACCTGCTCGCTCATGTGTAGGTAAACCCAACATAGATACCGTTGGTCGTATTCGGTTATTAGGTTCATGGAATTTCGATAATCCATATAAATTCAGGAGTTCAGAGCCAATACGCTTTAATATATTGAATTTGGCTTGTTTATAACATTTATGTTAAGGTGTTTCATCAGATTTCAGCTTTCTCTGGTTTCGAACATCATTTGACGGGAAGCCCACCAAAAACTTGCCCTCAACACAAAGAATGCATAACGTTCCTTTTTTATAGTCATATTTATTCATAACAGCTATACCAGAATCTTTATCAGGTTTGAGAAACACAATATGTGATCTACTCTGGAAACTTTTTAAAGCCTTGAAATGTTTAAATATCAGAATATTCGAGTTTTATTTAAGAACCAAGAAATTACTGGTTAGAATGAATCTTTTTTACCTTCAACCTATTTCGTTTATCTGGAGTAGTTAGAACAAGAAGACTCACTAGCTATACATAAAGTAATACTAGATTTATAACATAAAATTCAATTTGTACAGTACTCCTATTTACATC]




>consensus_7538#0
AACACATTGTCCCTTCCTTAACATTAATGTCATGGAGAAAACCAGTTAGTTCAAATGTAA
CTTTTAAGGAAAAAATTACATAATTTGCTACGTATTGAGTTTAGCAATTTAGCTAACCAC
CTGCTCGCTCATGTGTAGGTAAACCCAACATAGATACCGTTGGTCGTATTCGGTTATTAG
GTTCATGGAATTTCGATAATCCATATAAATTCAGGAGTTCAGAGCCAATACGCTTTAATA
TATTGAATTTGGCTTGTTTATAACATTTATGTTAAGGTGTTTCATCAGATTTCAGCTTTC
TCTGGTTTCGAACATCATTTGACGGGAAGCCCACCAAAAACTTGCCCTCAACACAAAGAA
TGCATAACGTTCCTTTTTTATAGTCATATTTATTCATAACAGCTATACCAGAATCTTTAT
CAGGTTTGAGAAACACAATATGTGATCTACTCTGGAAACTTTTTAAAGCCTTGAAATGTT
TAAATATCAGAATATTCGTGTTTTATTTAAGAACCAAGAAATTACTGGTTAGAATGAATC
TTTTTTACCTTCAACCTATTTCGTTTATCTGGAGTAGTTAGAACAAGAAGACTCACTAGC
TATACATAAAGTAATACTAGATTTATAACATAAAATTCAATTTGTACCGTACTCCTATTT
ACATC

clustalw multiple alignements is not computed in this case