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Schistosoma mansoni
cluster # 7558 cluster # 7558       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7558#0 length = 1089 sequences # 5  
consensusID : consensus_7558#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1089
fasta sequence 
                              [TTCACATTTCTAATGTTTGATCAATAAACAACCACTATGTACGTGTATGTATGAATTGTTTTTCCGCCCCCTTCCTTCTCTAAGTTGTTCTTAGTTGATTTCATTTTGTTCTCTGATTATTATTACTTTTATTGGTTTGCGTTGAGTCTCCTACGTTAGTTAACTCGTCGTTTATTTCTAAAAGCAAACGTATAAACTGCACTTGTGAATTTTCGTTCTCCATACAAAGCTGATAGTCAGTTATAACGTTCTGCGGAATACAGCGAAAGAGCAACACATCGTTTTACATGATGATATAAAGAATGAACGTGATCACTGATTTTGTTGTTTCTCATCGTATTTATATGCTAATACACTCCTTTCGTCTTGTTCTCGTTTGTGTTTGTTAGAACTAATGTCAATATTTCTTCAATTTTCCGCTTTTACAAATTCGATTCATTAAAACAATAGAGTAATTCGCTTAGCGATAAGTAAAAACTATTTCAAATTTCTTCTCTTTCCAGAAAAAGAAAACACCAGTTAAGATTTACTTTGTTTGTTTGTATTTTCTATTTTGTACATTTTTTGTGTGGGCGAATTTTCCGTATTTTTTTCGCACAATACAACATAACATAAATGGACCATAAAAATTA-TCTGCCAAACAGAGCATAGAATAACATCTTTTATCATCTTCAATATTAACTACATCTTTTCCCCCCTTTTTAAAATTTATCGTATGCTAATTTATTTCGATTCTTCCTATCGGTCTATTTAGATGCACTATCTACTCATTTATCTATCTGTTTTGTAGACAATAAGATTCTTCAAGAGTATTAACTACGTTTCAGTGTATTCCCTACTACGAAACACAGTGATTTCTTCAATGTTATTCATCACTTCATGATATTTTAAGATTAATATGCTTCATTTTCTTTACTCTTCTCACC-TTTTTTATCATATTGTATTGTCTCAATTTTATGAACCAAGTAATTAATTTTGTTCTTAAGCGTATTTTTCCTATAAATAATCGAAAATTCTAGAAAACAGAACATCATGTAAAGATAAAAAAAGAGAACCAAACTTCTCACTTATCGATTGTTGATATATGTT]

[-] EMBL CD179071             [TTCACATTTCTAATGTTTGATCAATAAACAACCACTATGTACGTGTATGTATGAATTGTTTTTCCGCCCCCTTCCTTCTCTAAGTTGTTCTTAGTTGATTTCATTTTGTTCTCTGATTATTATTACTTTTATTGGTTTGCGTTGAGTCTCCTACGTTAGTTAACTCGTCGTTTATTTCTAAAAGCAAACGTATAAACTGCACTTGTGAATTTTCGTTCTCCATACAAAGCTGATAGTCAGTTATAACGTTCTGCGGAATACAGCGAAAGAGCAACACATCGTTTTACATGATGATATAAAGAATGAACGTGATCACTGATTTTGTTGTTTCTCATCGTATTTATATGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD066031             [                                                                            TCTCTAAGTTGTTCTTAGTTGATTTCATTTTGTTCTCTGATTATTATTACTTTTATTGGTTTGCGTTGAGTCTCCTACGTTAGTTAACTCGTCGTTTATTTCTAAAAGCAAACGTATAAACTGCACTTGTGAATTTTCGTTCTCCATACAAAGCTGATAGTCAGTTATAACGTTCTGCGGAATACAGCGAAAGAGCAACACATCGTTTTACATGATGATATAAAGAATGAACGTGATCACTGATTTTGTTGTTTCTCATCGTATTTATATGCTAATACACTCCTTTCGTCTTGTTCTCGTTTGTGTTTGTTAGAACTAATGTCAATATTTCTTCAATTTTCCGCTTTTACAAATTCGATTCATTAAAACAATAGAGTAATTCGCTTAGCGATAAGTAAAAACTATTTCAAATTTCTTCTCTTTCCAGAAAAAGAAAACACCAGTTAAGATTTACTTTGTTTGTTTGTATTTTCTATTTTGTACATTTTTTGTGTGGGCGAATTTTCCGTATTTTTTTCGCACAATACAACATAACATAAATGGACCATAAAAATTA TCTGCCAAACAGAGCATAGAATAACATCTTTTATCATCTTCAATATTAACTACATCTTTTCTCCCCTTTTT AAATTTATCGTATGCTAATTTATTTCGATTCTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD066033             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GTAATTCGCTTAGCGATAAGTAAAAACTATTTCAAATTTCTTCTCTNTCCAGAAAAAGAAAACACCAGTTAAGATTTACTTTGTTTGTTTGTATTTTCTATTTTGTACATTTTTTGTGTGGGCGAATTTTCCGTATTTTTTTCGCACAATACAACATAACATAAATGGACCATAAAAATTA TCTGCCAAACAGAGCATAGAATAACATCTTTTATCATCTTCAATATTAACTACATCTTTTCCCCCCTTTTTAAAATTTATCGTATGCTGATTTATTTCGATTCTTCCTATCGGTCTATTTAGATGCACTATCTACTCATTTATCTATCTGTTTTGTAGACAATAAGATTCTTCAAGAGTATTAACTACGTTTCAGTGTATTCCCTACTACGAAACACAGTGATTTCTTCAATGTTATTCATCACTTCATGATATTTTAAGATTAATATGCTTCATTTTCTTTACTCTTCTCACC TTTTTTATCATATTGTATTGTCTCAATTTTATGAACCAAGTAATTAATTTTGTTCTTAAGCGTATTTTTCCTATAAATAATCGAAAATTCTAGAAAACAGAACATCATGTAAAGATAAAAAAAGAGAACCAAACTTCTCACTTATCGATTGTTGATATATGTT]
[-] EMBL CD062993             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AAAACTATTTCAAATTTCTTCTCTTTCCAGAAAAAGAAAACACCAGTTAAGATTTACTTTGTTTGTTTGTATTTTCTATTTTGTACATTTTTTGTGTGGGCGAATTTTCCGTATTTTTTTCGCACAATACAACATAACATAAATGGACCATAAAAATTA TCTGCCAAACAGAGCATAGAATAACATCTTTTATCATCTTCAATATTAACTACATCTTTTCCCCCCTTTTTAAAATTTATCGTATGCTAATTTATTTCGATTCTTCCTATCGGTCTATTTAGATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD080071             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATGGACCATAAAAATTANTCTGCCAAACAGAGCATAGAATAACATCTTTTATCATCTTCAATATTAACTACATCTTTTCCCCCCTTTTTAAAATTTATCGTATGCTAATTTATTTCGATTCTTCCTATCGGTCTATTTAGATGCACTATCTACTCATTTATCTATCTGTTTTGTAGACAATAAGATTCTTCAAGAGTATTACCTACGTTTCAGTGTATTCCCTACTACGAAACACAGTGATTTCTTCAATGTTATTCATCACTTCATGATATTTTAAGATTAATATGCTTCATTTTCTTTACTCTTCTCACCTTTTTTTATCATATTGTATTGTCTCAATTTTATGAACCAAGTAATTAATTNTGTTCTTAAGCGTATTTTTCCTATAAATAATCGAANATTCTAG                                                                      ]




>consensus_7558#0
TTCACATTTCTAATGTTTGATCAATAAACAACCACTATGTACGTGTATGTATGAATTGTT
TTTCCGCCCCCTTCCTTCTCTAAGTTGTTCTTAGTTGATTTCATTTTGTTCTCTGATTAT
TATTACTTTTATTGGTTTGCGTTGAGTCTCCTACGTTAGTTAACTCGTCGTTTATTTCTA
AAAGCAAACGTATAAACTGCACTTGTGAATTTTCGTTCTCCATACAAAGCTGATAGTCAG
TTATAACGTTCTGCGGAATACAGCGAAAGAGCAACACATCGTTTTACATGATGATATAAA
GAATGAACGTGATCACTGATTTTGTTGTTTCTCATCGTATTTATATGCTAATACACTCCT
TTCGTCTTGTTCTCGTTTGTGTTTGTTAGAACTAATGTCAATATTTCTTCAATTTTCCGC
TTTTACAAATTCGATTCATTAAAACAATAGAGTAATTCGCTTAGCGATAAGTAAAAACTA
TTTCAAATTTCTTCTCTTTCCAGAAAAAGAAAACACCAGTTAAGATTTACTTTGTTTGTT
TGTATTTTCTATTTTGTACATTTTTTGTGTGGGCGAATTTTCCGTATTTTTTTCGCACAA
TACAACATAACATAAATGGACCATAAAAATTATCTGCCAAACAGAGCATAGAATAACATC
TTTTATCATCTTCAATATTAACTACATCTTTTCCCCCCTTTTTAAAATTTATCGTATGCT
AATTTATTTCGATTCTTCCTATCGGTCTATTTAGATGCACTATCTACTCATTTATCTATC
TGTTTTGTAGACAATAAGATTCTTCAAGAGTATTAACTACGTTTCAGTGTATTCCCTACT
ACGAAACACAGTGATTTCTTCAATGTTATTCATCACTTCATGATATTTTAAGATTAATAT
GCTTCATTTTCTTTACTCTTCTCACCTTTTTTATCATATTGTATTGTCTCAATTTTATGA
ACCAAGTAATTAATTTTGTTCTTAAGCGTATTTTTCCTATAAATAATCGAAAATTCTAGA
AAACAGAACATCATGTAAAGATAAAAAAAGAGAACCAAACTTCTCACTTATCGATTGTTG
ATATATGTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)