These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7561#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 911 fasta sequence [GCGTTATTCAATCCCCGTGAATCATTCGAAGATTGTTCTTCCGTCGTTGTGGATGTTTTCTTTCAGCTTTTAATTGTCTATATTTAATTGCTTCCTCTTCTAAACGTTTCCTATCCGCTTCTAATTTGTTTACATTAACTGGGCGTTTCGGTCGACTGCTACTAGAAGTCGTCGTAACTGAAAAAGATTTAGAAGTTTCATGATTTCCTTCATCAGCAAGTATATTGAATTGCTT-ATTATTCAAGTCTTCAGAGGTTGGCCTAACTTCACCAAGTTCAGTATCATGCCAACGCTTCAAACTAGTTACAGAGTCAATACGAGAAGCAGGAAGTATAGGTGGCTCACCATCATCATCATAACAATAGCCTTTGTTCATATGGTTATCATCATATGGAGCAGTAATGTCATTATTATCATCGCCGCCATCAGATTTTCCAGTACAGCCAAACTGACGGGTCTGTGGTGATGATGAATAAGTTGCATTACGTTCAGTAATTGGATCTGAATTTTCTTCAAAATCTAATGGATCATTTTCCATCTCTTGTAATAGCAGAGATGGTTTCGATTTAAAATGTTTACTTAACTGTTGTGATACGTCCATAGTGATTTGTGGAGGTGAATGATTCATTACATCATATTCATCTAACGAATTTGTATGTGATTGTTGTTGTTGACAATCAGCTTCAAACAAATCTTCCATAGTTGGATCCATATCACTATCATCGGGTATATCAGGTTTAGTTTCAATTATACTAGGAATTGACGATACATTTTTTTGCTGAACTGATGGTTCTGATAATGATGGTAATACAGAAGAAGACGAAGATTGAAGTAATGATGAATGAAGATTTGATTGACTAGAAATAGAATTAAACGAACCTATTGGTTGTATAGAATGAGATGTAAATGAA] [-] EMBL SMAA17934 [GCGTTATTCAATCCCCGTGAATCATTCGAAGATTGTTCTTCCGTCGTTGTGGATGTTTTC TTCAGC TTTAATTGCCAATATATAATGGCTCCCTCTTCTAAACGTTTCCTATCCGCTTCCAATTTGTTTACATTAACTGGGCGTTTCGGTCGACTGCTACTAGAAGTCGTCGTAACTGAAAAAGATTTAGAAGTTTCATGATTCCCTTCATCAGCAAGTATATTGAATTGCTTAATAATTCAAGTCTTCAGAGGTTGGCCTAACTTCACCAAGTTCAGTATCATGCCAACGCTTCAAACTAGTTACAGAGTCAATACGAGAAGCAGGAAGT ] [+] EMBL CD153479 [ TTTTCTTTCAGCTTTTAATTGTCTATATTTAATTGCTTCCTCTTCTAAACGTTTCCTATCCGCTTCTAATTTGTTTACATTAACTGGGCGTTTCGGTCGACTGCTACTAGAAGTCGTCGTAACTGAAAAAGATTTAGAAGTTTCATGATTTCCTTCATCAGCAAGTATATTGAATTGCTT ATTATTCAAGTCTTCAGAGGTTGGCCTAACTTCACCAAGTTCAGTATCATGCCAACGCTTCAAACTAGTTACAGAGTCAATACGAGAAGCAGGAAGTATAGGTGGCTCACCATCATCATCATAACAATAGCCTTTGTTCATATGGTTATCATCATATGGAGCAGTAATGTCATTATTATCATCGCCGCCATCAGATTTTCCAGTACAGCCAAACTGACGGGTCTGTGGTGATGATGAATAAGTTGCATTACGTTCAGTAATTGGATCTGAATTTTCTTCANAATCTAATGGATCATTTTCCATCTCTTGTAATAGCAGAGATGGTTTCGATTTAAAATGTTTACTTAACTGTTGTGATACGTCCATAGTGATTTGTGGAGGTGAATGATTCA ] [+] EMBL CD153112 [ TTTTCTTTCAGCTTTTAATTGTCTATATTTAATTGCTTCCTCTTCTAAACGTTTCCTATCCGCTTCTAATTTGTTTACATTAACTGGGCGTTTCGGTCGACTGCTACTAGAAGTCGTCGTAACTGAAAAAGATTTAGAAGTTTCATGCTTTCCTTCATCAGCAAGTATATTGAATTGCTT ATTATTCAAGTCTTCAGAGGTTGGCCTAACTTCACCAAGTTCAGTATCATGCCAACGCTTCAAACTAGTTACAGAGTCAATACGAGAAGCAGGAAGTATAGGTGGCTCACCATCATCATCATAACAATAGCCTTTGTTCATATGGTTATCATCATATGGAGCAGTAATGTCATTATTATCATCGCCGCCATCAGATTTTCCAGTACAGCCAAACTGACGGGTCTGTGGTGATGATGAATAAGTTGCATTACGTTCAGTAATTGGATCTGAATTTTCTTCAAAATCTAATGGATCATTTTCCATCTCTTGTAATAGCAGAGATGGTTTCGATTTAAAATGTTTACTTAACTGTTGTGATACGTCCATA ] [-] EMBL CD124639 [ TTCAAAATCTAATGGATCATTTTCCATCTCTTGTAATAGCAGAGATGGTTTCGATTTAAAATGTTTACTTAACTGTTGTGATACGTCCATAGTGATTTGTGGAGGTGAATGATTCATTACATCATATTCATCTAACGAATTTGTATGTGATTGTTGTTGTTGACAATCAGCTTCAAACAAATCTTCCATAGTTGGATCCATATCACTATCATCGGGTATATCAGGTTTAGTTTCAATTATACTAGGAATTGACGATACATTTTTTTGCTGAACTGATGGTTCTGATAATGATGGTAATACAGAAGAAGACGAAGATTGAAGTAATGATGAATGAAGATTTGATTGACTAGAAATAGAATTAAACGAACCTATTGGTTGTATAGAATGAGATGTAAATGAA] [-] EMBL CD124637 [ TTCAAAATCTAATGGATCATTTTCCATCTCTTGTAATAGCAGAGATGGTTTCGATTTAAAATGTTTACTTAACTGTTGTGATACGTCCATAGTGATTTGTGGAGGTGAATGATTCATTACATCATATTCATCTAACGAATTTGTATGTGATTGTTGTTGTTGACAATCAGCTTCAAACAAATCTTCCATAGTTGGATCCATATCACTATCATCGGGTATATCAGGTTTAGTTTCAATTATACTAGGAATTGACGATACATTTTTTTGCTGAACTGATGGTTCTGATAATGATGGTAATACAGAAGAAGACGAAGATTGAAGTAATGATGAATGAAGATTTGATTGACTAGAAATAGAATTAAACGAACCTATTGGTTGTATAGAATGAGATGTAAATGAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||