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Schistosoma mansoni
cluster # 7570 cluster # 7570       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7570#0 length = 555 sequences # 5  

consensusID : consensus_7570#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 555
fasta sequence
                              [TTATCGATTTAAAATAACAAAAAAAATCTGATATAGTAGATAGTAATAATAATGAACGTGATAAGTTTCAATTATAATTATAGATACTATATAATATAGAAGATAAATCGTATATAAATGGCAACAGTGATGGATTTTGAACTTGTATAGTAATAATAAATACTGTTAAATACTGTGAAACAACAGATTATGTTCAATGATTAAAAAAAAGTAAATCGTGTTAATTGTGTTCATCTCTCTCAAAATCACCTAGAATGGTGTATAAATTGAAGGATAAAGATGATGTTTGCTCTTCACCGAACATAAGTTATAGAAAAAGCTTAATAATCTTTCCAGGGATGAAATAAAAAATATATATGTAGTTGTAAAGAATAACATCAACTGGTAAACATGTGAGACGTTTCTCGAATAACTATTCATACTACTTATTACTCAATAATGGTAGTAGTAACTGTTAATGTTGCTGATATCGTTGAAGGAAAATGAGATGTACAGATATAAGGAAAAAAATTAGAATCGAATGCAAATTACATTTTGTAGACATGTTTAAATAAA]

[+] EMBL AI067986             [TTATCGATTTAAAATAACAAAAAAAATCTGATATAGTAGATAGTAATAATAATGAACGTGATAAGTTTCAATTATAATTATAGATACTATATAATATAGAAGATAAATCGTATATAAATGGCAACAGTGATGGATTTTGAACTTGTATAGTAATAATAAATACTGTTAAATACTGTGAAACAACAGATTATGTTCAATGATTAAAAAAAAGTAAATCGTGTTAATTGTGTTCATCTCTCTCAAAATCACCTAGAATGGTGTATAAATTGAAGGATAAAGATGATGTTTGCTCTTCACCGAACATAAGTTATAGAAAAAGCTTAATAATCTTTCCAGGGATGAAATAAAAAATATATATGTAGTTGTAAAGAATAACATCAACTGGTAAACATGTGAGACGTTTCTCGAATAACTATTCATACTACTTATTACTCAATAATGGTAGTAGTAACTGTTAATGTTGCTGATATCGTTGAAGGAAAATGAGATGTACAGATATAAGGAAAAAAATTAGAATCGAATGCAAATTACATTTTGTAGACATGTTTAAATAAA]
[+] EMBL AI067250             [TTATCGATTTAAAATAACAAAAAAAATCTGATATAGTAGATAGTAATAATAATGAACGTGATAAGTTTCAATTATAATTATAGATACTATATAATATAGAAGATAAATCGTATATAAATGGCAACAGTGATGGATTTTGAACTTGTATAGTAATAATAAATACTGTTAAATACTGTGAAACAACAGATTATGTTCAATGATTAAAAAAAAGTAAATCGTGTTAATTGTGTTCATCTCTCTCAAAATCACCTAGAATGGTGTATAAATTGAAGGATAAAGATGATGTTTGCTCTTCACCGAACATAAGTTATAGAAAAAGCTTAATAATCTTTCCAGGGATGAAATAAAAAATATATATGTAGTTGTAAAGAATAACATCAACTGGTAAACATGTGAGACGTTTCTCGAATAACTATTCATACTACTTATTACTCAATAATGGTAGTAGTAACTGTTAATGTTGCTGATATCGTTGAAGGAAAATGAGATGTACAGATATAAGGAAAAAAATTAGAATCGAATGCAAATTACATTTTGTAGACATGTTTAA     ]
[+] EMBL AI067500             [TTATCGATTTAAAATAACAAAAAAAATCTGATATAGTAGATAGTAATAATAATGAACGTGATAAGTTTCAATTATAATTATAGATACTATATAATATAGAAGATAAATCGTATATAAATGGCAACAGTGATGGATTTTGAACTTGTATAGTAATAATAAATACTGTTAAATACTGTGAAACAACAGATTATGTTCAATGATTAAAAAAAAGTAAATCGTGTTAATTGTGTTCATCTCTCTCAAAATCACCTAGAATGGTGTATAAATTGAAGGATAAAGATGATGTTTGCTCTTCACCGAACATAAGTTATAGAAAAAGCTT ATAATC TTCCA GGATGAAAT AAAAATATATATGTAGTTGTAAAGAATAACA CAACTG                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL AI067162             [TTATCGATTTAAAATAACAAAAAAAATCTGATATAGTAGATAGTAATAATAATGAACGTGATAAGTTTCAATTATAATTATAGATACTATATAATATAGAAGATAAATCGTATATAAATGGCAACAGTGATGGATTTTGAACTTGTATAGTAATAATAAATACTGTTAAATACTGTGAAACAACAGATGATGTTCAATGATTAAAAAAAAGTAAATCGTGTTAATTGTGTTCATCTCTCTCAAAATCACCTACAATGGTGTATAAATTGAAGGATAAAGATGATGTTTGCTCTTCACCGAACATAAGTTATAGAAAAAGCTTAATAATCTTTCCAGAGATGAAATAAAAAATATATATGTAGTTGTAAAGAATAACA                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AI067423             [TTATCGATTTAAAATAACAAAAAAAATCTGATATAGTAGATAGTAATAATAATGAACGTGATAAGTTTCAATTATAATTATAGATACTATATAATATAGAAGATAAATCGTATATAAATGGCAACAGTGATGGATTTTGAACTTGTATAGTAATAATAAATACTGTTAAATACTGTGAAACAACAGATTATGTTCAATGATTAAAAAAAAGTAAATCGTGTTAATTGTGTTCATCTCTCTCAAAATCACCTAGAATGGTGTATAAATTGAAGGATAAAGATGATGTTTGCTCTTCACCGAACATAAGTTATAGAAAAAGCTTAATAATCTTTCCAGGGATGAAATAAAAAATATATATGTAGTTGTAAAGAATAc                                                                                                                                                                                    ]


>consensus_7570#0 TTATCGATTTAAAATAACAAAAAAAATCTGATATAGTAGATAGTAATAATAATGAACGTG ATAAGTTTCAATTATAATTATAGATACTATATAATATAGAAGATAAATCGTATATAAATG GCAACAGTGATGGATTTTGAACTTGTATAGTAATAATAAATACTGTTAAATACTGTGAAA CAACAGATTATGTTCAATGATTAAAAAAAAGTAAATCGTGTTAATTGTGTTCATCTCTCT CAAAATCACCTAGAATGGTGTATAAATTGAAGGATAAAGATGATGTTTGCTCTTCACCGA ACATAAGTTATAGAAAAAGCTTAATAATCTTTCCAGGGATGAAATAAAAAATATATATGT AGTTGTAAAGAATAACATCAACTGGTAAACATGTGAGACGTTTCTCGAATAACTATTCAT ACTACTTATTACTCAATAATGGTAGTAGTAACTGTTAATGTTGCTGATATCGTTGAAGGA AAATGAGATGTACAGATATAAGGAAAAAAATTAGAATCGAATGCAAATTACATTTTGTAG ACATGTTTAAATAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)