These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7574#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 977 fasta sequence [ATGAAGAAATAGTTTGCGATCTTATTGACAAATTAGGCAACATAGATAGAGTCATTGTTGTTGCAGTGTTATTCTCATGTGTAAACGATGTTGTTTCGATTGTTGGTACGATATCAGTAACTGATGTTTTAGAATCAGTTACGTTATTTGTTTCAGTAGATAAGATTGAACTGGTATGCAGGAATGATAATTCTTTATCCAAATTAATCTCTAAACCAAGCTGGGTGACAGTTGGTAAAATCAATGTAGCCTCATATGGTTGCGATCTTGGTAGATTCGTAGCTGTATTGTTTGATCCATACGTATTATCGTCTTTAATATTTTCATCATTACTAATATTTTGCACTGTAACGGGTGTTTCAATAAGTTGAGTTGCACTTGATGTTATCGGATTTATAAGATTAGATCTATCCATATGAAGTTGAATTATTTCGCCTAATGATGGCTCCATAATTGTATTTCTTTCAAATTCAGAAGTCGATCTCAATCTATCCTCTTCACGTGTGGTTAAAATCTGAGAAGTACGATGAGGTTTAGGTGGTGGTTGTGAGAATTCAAAACAATGTATTGATTCTGGTTGACTGGACAGAATTTTTGAAGCTAGTGAAAGCGACCAACTAGGGTGGTTGTCTGAATCAGAAATGGATGTATGGTTCAGATTGAATGAGCGAGATATAGAGTACTCATTTTGTTGATGTTCAGACGGCTTTAAGCTGCTTAAGTCTGGTAATTGTTCACTACCTTGGTCAAATGAAGGAGAAGACGAAAAAAGATATCCTCTGATTGAACTATCCTGAAGTGTATCAACGATCTGTGTAGATTTCTTACTTAGTTGTATGTTGTCAGAATTTCCCCCAGTATCCTTTGATTCTTCATGTTTTCTCTGGTCAGATAAAGATATATGGTCATCTCGAGAATTAAGAAAGGCATCCATTCTTAAATTAAGTTGAGACAGTGATGTGACTGCATTCTGAGCG] [+] EMBL CD114304 [ATGAAGAAATAGTTTGCGATCTTATTGACAAATTAGGCAACATAGATAGAGTCATTGTTGTTGCAGTGTTATTCTCATGTGTAAACGATGTTGTTTCGATTGTTGGTACGATATCAGTAACTGATGTTTTAGAATCAGTTACGTTATTTGTTTCAGTAGATAAGATTGAACTGGTATGCAGGAATGATAATTCTTTATCCAAATTAATCTCTAAACCAAGCTGGGTGACAGTTGGT AAATCAATGTAGCCTCATATGGTTGCGATCTTGGTAGATTCGTAGCTGTGTTGTTTGATCCATACGTATTATCGTCTTTAATATTTTCATCATTACTAATATTTCGCACTGTAACGGGTGTTTCAATAAGTTGAGTTGCACTTGATGTTATCGGATTTATAAGATTAGATCTATCCATATGAAGTTGAGTTATTTCGCCTAATGATGGCTCCATAATTGTATTTCTTTCAAATTCAGAAGTCGATCTCAATCTATCCTCTTCACGTGTGGTTAAAATCTGAGAAGTACGATGAGGTTTAGGTGGTGGTTGTGAGAATTCAAAACAATGTATTGATTCTGGTTGACTGGACAGAATTTTTTGAGCTAGTGAA ] [-] EMBL CD194867 [ cCAGTGTTATTCTCATGTGTAAACGATGTTGTTTCGATTGTTGGTACGATATCAGTAACTGATGTTTTAGAATCAGTTACGTTATTTGTTTCAGTAGATAAGATTGAACTGGTATGCAGGAATGATAATTCTTTATCCAAATTAATCTCTAAACCAAGCTGGGTGACAGTTGGTAAAATCAATGTAGCCTCATATGGTTGCGATCTTGGTAGATTCGTAGCTGTATTGTTTGATCCATACGTATTATCGTCTTTAATATTTTCATCATTACTAATATTTTGCACTGTAACGGGTGTTTCAATAAGTTGAGTTGCACTTGATGTTATCGGATTTATAAGATTAGATCTATCCATATGAAGTTGAATTATTTCGCCTAATGATGGCTCCATAATTGTATTTCTTTCAAATTCAGAAGTCGATCTCAATCTATCCTCTTCACGTGTGGTTAAAATCTGAGAAGTACGATGAGGTTTAGGTGGTGGTTGTGAGAATTCAAAACAA ] [-] EMBL CD195087 [ GTGTATTTCTCATGTG AAACGATGTTG TTCGATTG TGGTACGATATCAGTAACTGATG TTTAGAATCAGTTACGTTATTTGTTTCAGTAGATAAGATTGAACTGGTATGCAGGAATGATAATTCTTTATCCAAATTAATCTCTAAACCAAGCTGGGTGACAGTTGGTAAAATCAATGTAGCCTCATATGGTTGCGATCTTGGTAGATTCGTAGCTGTATTGTTTGATCCATACGTATTATCGTCTTTAATATTTTCATCATTACTAATATTTTGCACTGTAACGGGTGTTTCAATAAGTTGAGTTGCACTTGATGTTATCGGATTTATAAGATTAGATCTATCCATATGAAGTTGAATTATTTCGCCTAATGATGGCTCCATAATTGTATTTCTTTCAAATTCAGAAGTCGATCTCAATCTATCCTCTTCACGTGTGGTTAAAATCTGAGAAGTACGATGAGGTTTAGGTGGTGGTTGTGAGAATTCAAAACAA ] [+] EMBL CD069713 [ GGTGGTTGTGAGAATTCAAAACAATGTATTGATTCTGGTTGACTGGACAGAATTTTTGAAGCTAGTGAAAGCGACCAACTAGGGTGGTTGTCTGAATCAGAAATGGATGTATGGTTCAGATTGAATGAGCGAGATATAGAGTACTCATTTTGTTGATGTTCAGACGGCTTTAAGCTGCTTAAGTCTGGTAATTGTTCACTACCTTGGTCAAATGAAGGAGAAGACGAAAAAAGATATCCTCTGATTGAACTATCCTGAAGTGTATCAACGATCTGTGTAGATTTCTTACTTAGTTGTATGTTGTCAGAATTTCCCCCAGTATCCTTTGATTCTTCATGTTTTCTCTGGTCAGATAAAGATATATGGTCATCTCGAGAATTAAGAAAGGCATCCATTCTTAAATTAAGTTGAGACAGTGATGTGACTGCATTCTGAGCG] [+] EMBL CD069764 [ GGTGGTTGTGAGAATTCAAAACAATGTATTGATTCTGGTTGACTGGACAGAATTTTTGAAGCTAGTGAAAGCGACCAACTAGGGTGGTTGTCTGAATCAGAAATGGATGTATGGTTCAGATTGAATGAGCGAGATATAGAGTACTCATTTTGTTGATGTTCAGACGGCTTTAAGCTGCTTAAGTCTGGTAATTGTTCACTACCTTGGTCAAATGAAGGAGAAGACGAAAAAAGATATCCTCTGATTGAACTATCCTGAAGTGTATCAACGATCTGTGTAGATTTCTTACTTAGTTGTATGTTGTCAGAATTTCCCCCAGTATCCTTTGATTCTTCATGTTTTCTCTGGTCAGATAAAGATATATGGTCATCTCGAGAATTAAGAAAGGCATCCATTCTTAAATTAAGTTGAGACAGTGATG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||