Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7574 cluster # 7574       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7574#0 length = 977 sequences # 5  

consensusID : consensus_7574#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 977
fasta sequence
                              [ATGAAGAAATAGTTTGCGATCTTATTGACAAATTAGGCAACATAGATAGAGTCATTGTTGTTGCAGTGTTATTCTCATGTGTAAACGATGTTGTTTCGATTGTTGGTACGATATCAGTAACTGATGTTTTAGAATCAGTTACGTTATTTGTTTCAGTAGATAAGATTGAACTGGTATGCAGGAATGATAATTCTTTATCCAAATTAATCTCTAAACCAAGCTGGGTGACAGTTGGTAAAATCAATGTAGCCTCATATGGTTGCGATCTTGGTAGATTCGTAGCTGTATTGTTTGATCCATACGTATTATCGTCTTTAATATTTTCATCATTACTAATATTTTGCACTGTAACGGGTGTTTCAATAAGTTGAGTTGCACTTGATGTTATCGGATTTATAAGATTAGATCTATCCATATGAAGTTGAATTATTTCGCCTAATGATGGCTCCATAATTGTATTTCTTTCAAATTCAGAAGTCGATCTCAATCTATCCTCTTCACGTGTGGTTAAAATCTGAGAAGTACGATGAGGTTTAGGTGGTGGTTGTGAGAATTCAAAACAATGTATTGATTCTGGTTGACTGGACAGAATTTTTGAAGCTAGTGAAAGCGACCAACTAGGGTGGTTGTCTGAATCAGAAATGGATGTATGGTTCAGATTGAATGAGCGAGATATAGAGTACTCATTTTGTTGATGTTCAGACGGCTTTAAGCTGCTTAAGTCTGGTAATTGTTCACTACCTTGGTCAAATGAAGGAGAAGACGAAAAAAGATATCCTCTGATTGAACTATCCTGAAGTGTATCAACGATCTGTGTAGATTTCTTACTTAGTTGTATGTTGTCAGAATTTCCCCCAGTATCCTTTGATTCTTCATGTTTTCTCTGGTCAGATAAAGATATATGGTCATCTCGAGAATTAAGAAAGGCATCCATTCTTAAATTAAGTTGAGACAGTGATGTGACTGCATTCTGAGCG]

[+] EMBL CD114304             [ATGAAGAAATAGTTTGCGATCTTATTGACAAATTAGGCAACATAGATAGAGTCATTGTTGTTGCAGTGTTATTCTCATGTGTAAACGATGTTGTTTCGATTGTTGGTACGATATCAGTAACTGATGTTTTAGAATCAGTTACGTTATTTGTTTCAGTAGATAAGATTGAACTGGTATGCAGGAATGATAATTCTTTATCCAAATTAATCTCTAAACCAAGCTGGGTGACAGTTGGT AAATCAATGTAGCCTCATATGGTTGCGATCTTGGTAGATTCGTAGCTGTGTTGTTTGATCCATACGTATTATCGTCTTTAATATTTTCATCATTACTAATATTTCGCACTGTAACGGGTGTTTCAATAAGTTGAGTTGCACTTGATGTTATCGGATTTATAAGATTAGATCTATCCATATGAAGTTGAGTTATTTCGCCTAATGATGGCTCCATAATTGTATTTCTTTCAAATTCAGAAGTCGATCTCAATCTATCCTCTTCACGTGTGGTTAAAATCTGAGAAGTACGATGAGGTTTAGGTGGTGGTTGTGAGAATTCAAAACAATGTATTGATTCTGGTTGACTGGACAGAATTTTTTGAGCTAGTGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD194867             [                                                              cCAGTGTTATTCTCATGTGTAAACGATGTTGTTTCGATTGTTGGTACGATATCAGTAACTGATGTTTTAGAATCAGTTACGTTATTTGTTTCAGTAGATAAGATTGAACTGGTATGCAGGAATGATAATTCTTTATCCAAATTAATCTCTAAACCAAGCTGGGTGACAGTTGGTAAAATCAATGTAGCCTCATATGGTTGCGATCTTGGTAGATTCGTAGCTGTATTGTTTGATCCATACGTATTATCGTCTTTAATATTTTCATCATTACTAATATTTTGCACTGTAACGGGTGTTTCAATAAGTTGAGTTGCACTTGATGTTATCGGATTTATAAGATTAGATCTATCCATATGAAGTTGAATTATTTCGCCTAATGATGGCTCCATAATTGTATTTCTTTCAAATTCAGAAGTCGATCTCAATCTATCCTCTTCACGTGTGGTTAAAATCTGAGAAGTACGATGAGGTTTAGGTGGTGGTTGTGAGAATTCAAAACAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD195087             [                                                                 GTGTATTTCTCATGTG AAACGATGTTG TTCGATTG TGGTACGATATCAGTAACTGATG TTTAGAATCAGTTACGTTATTTGTTTCAGTAGATAAGATTGAACTGGTATGCAGGAATGATAATTCTTTATCCAAATTAATCTCTAAACCAAGCTGGGTGACAGTTGGTAAAATCAATGTAGCCTCATATGGTTGCGATCTTGGTAGATTCGTAGCTGTATTGTTTGATCCATACGTATTATCGTCTTTAATATTTTCATCATTACTAATATTTTGCACTGTAACGGGTGTTTCAATAAGTTGAGTTGCACTTGATGTTATCGGATTTATAAGATTAGATCTATCCATATGAAGTTGAATTATTTCGCCTAATGATGGCTCCATAATTGTATTTCTTTCAAATTCAGAAGTCGATCTCAATCTATCCTCTTCACGTGTGGTTAAAATCTGAGAAGTACGATGAGGTTTAGGTGGTGGTTGTGAGAATTCAAAACAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD069713             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGTGGTTGTGAGAATTCAAAACAATGTATTGATTCTGGTTGACTGGACAGAATTTTTGAAGCTAGTGAAAGCGACCAACTAGGGTGGTTGTCTGAATCAGAAATGGATGTATGGTTCAGATTGAATGAGCGAGATATAGAGTACTCATTTTGTTGATGTTCAGACGGCTTTAAGCTGCTTAAGTCTGGTAATTGTTCACTACCTTGGTCAAATGAAGGAGAAGACGAAAAAAGATATCCTCTGATTGAACTATCCTGAAGTGTATCAACGATCTGTGTAGATTTCTTACTTAGTTGTATGTTGTCAGAATTTCCCCCAGTATCCTTTGATTCTTCATGTTTTCTCTGGTCAGATAAAGATATATGGTCATCTCGAGAATTAAGAAAGGCATCCATTCTTAAATTAAGTTGAGACAGTGATGTGACTGCATTCTGAGCG]
[+] EMBL CD069764             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GGTGGTTGTGAGAATTCAAAACAATGTATTGATTCTGGTTGACTGGACAGAATTTTTGAAGCTAGTGAAAGCGACCAACTAGGGTGGTTGTCTGAATCAGAAATGGATGTATGGTTCAGATTGAATGAGCGAGATATAGAGTACTCATTTTGTTGATGTTCAGACGGCTTTAAGCTGCTTAAGTCTGGTAATTGTTCACTACCTTGGTCAAATGAAGGAGAAGACGAAAAAAGATATCCTCTGATTGAACTATCCTGAAGTGTATCAACGATCTGTGTAGATTTCTTACTTAGTTGTATGTTGTCAGAATTTCCCCCAGTATCCTTTGATTCTTCATGTTTTCTCTGGTCAGATAAAGATATATGGTCATCTCGAGAATTAAGAAAGGCATCCATTCTTAAATTAAGTTGAGACAGTGATG                 ]


>consensus_7574#0 ATGAAGAAATAGTTTGCGATCTTATTGACAAATTAGGCAACATAGATAGAGTCATTGTTG TTGCAGTGTTATTCTCATGTGTAAACGATGTTGTTTCGATTGTTGGTACGATATCAGTAA CTGATGTTTTAGAATCAGTTACGTTATTTGTTTCAGTAGATAAGATTGAACTGGTATGCA GGAATGATAATTCTTTATCCAAATTAATCTCTAAACCAAGCTGGGTGACAGTTGGTAAAA TCAATGTAGCCTCATATGGTTGCGATCTTGGTAGATTCGTAGCTGTATTGTTTGATCCAT ACGTATTATCGTCTTTAATATTTTCATCATTACTAATATTTTGCACTGTAACGGGTGTTT CAATAAGTTGAGTTGCACTTGATGTTATCGGATTTATAAGATTAGATCTATCCATATGAA GTTGAATTATTTCGCCTAATGATGGCTCCATAATTGTATTTCTTTCAAATTCAGAAGTCG ATCTCAATCTATCCTCTTCACGTGTGGTTAAAATCTGAGAAGTACGATGAGGTTTAGGTG GTGGTTGTGAGAATTCAAAACAATGTATTGATTCTGGTTGACTGGACAGAATTTTTGAAG CTAGTGAAAGCGACCAACTAGGGTGGTTGTCTGAATCAGAAATGGATGTATGGTTCAGAT TGAATGAGCGAGATATAGAGTACTCATTTTGTTGATGTTCAGACGGCTTTAAGCTGCTTA AGTCTGGTAATTGTTCACTACCTTGGTCAAATGAAGGAGAAGACGAAAAAAGATATCCTC TGATTGAACTATCCTGAAGTGTATCAACGATCTGTGTAGATTTCTTACTTAGTTGTATGT TGTCAGAATTTCCCCCAGTATCCTTTGATTCTTCATGTTTTCTCTGGTCAGATAAAGATA TATGGTCATCTCGAGAATTAAGAAAGGCATCCATTCTTAAATTAAGTTGAGACAGTGATG TGACTGCATTCTGAGCG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)