|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7582#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 580 fasta sequence
[CTAGTGGTATGTTTTTTAGATTGCATCAGATGACATGAATTTTGTTTTGGTTCTTAACTGTTTAAATTATTCAGATACGAGTATAACGATCCTCAAAGTTATGTATTCAATCCTAAACCGAAATAGTCTAATAAGTATCCCGTGTTGATAAGTAGTTGTGGACAGCTGAAGAGTCTTGGGGTGGAGCGAAATAGTCAACTGTTATTTCTTATTTAAGTTATCTACACAGTGTCAATCAGTTGTAAAAGCCATTCATAGATCGTGTCTTCTAAGTATGTTCTAGTTCGGAACCGTATAAAAATCTTTCCCCACCTAGGAATTCTTGTAACTTAAGTACTACTTCTGATTGTTAGGATTGTTGTTAAATCTTGAATTCATTTAGAATATTTTAAAGTACAGTACTTCGCTTCCAAAACGACATTGAACTGGTGTGTTACACTTAGTCTTGTAATTAGTAGTCCGGTAGTCATGCTTAATAGAATGACTTGTGTTATCTCTTTGCACACCAATAATCATGTAAAACTGCTGGGAATTGAGTTTTATATGGTTNNTAT-ACATCTGANNATGTGTTCCTAACTAG]
[+] EMBL CD088661 [ TAGTGGTATGTTTTTTAGATTGCATCAGATGACATGAATTTTGTTTTGGTTCTTAACTGTTTAAATTATTCAGATACGAGTATAACGATCCTCAAAGTTATGTATTCAATCCTAAACCGAAATAGTCTAATAAGTATCCCGTGTTGATAAGTAGTTGTGGACAGCTGAAGAGTCTTGGGGTGGAGCGAAATAGTCAACTGTTATTTCTCATTTAAGTTATCTACACAGTGACAATCAGTTGTAAAAGCCATTCATAGATCGTGTCTTCTAAGTATGTTCTAGTTCGGAACCGTATAAAAATCTTTCCCCACCTAGGAATTCTTGTAACTTAAGTACTACTTCTGATTGTTAGGATTGTTGTTAAATCTTGAATTCATTTAGAATATTTTAAAGTACAGTACTTCGCTTCCAAAACGACATTGAACTGGTGTGTTACACTTAGTCTTGTAATTAGTAGTCCGGTAGTCATGCTTAATAGAATGACTTGTGTTATCTCTTTGCACACCAATAATCATGTANAACTGCTGGGAATTGAGTTTTATATGGTTNNTAT ACATCTGANNATGTGTTCCTAACTAG]
[+] EMBL CD088629 [ TAGTGGTATGTTTTTTAGATTGCATCAGATGACATGAATTTTGTTTTGGTTCTTAACTGTTTAAATTATTCAGATACGAGTATAACGATCCTCAAAGTTATGTATTCAATCCTAAACCGAAATAGTCTAATAAGTATCCCGTGTTGATAAGTAGTTGTGGACAGCTGAAGAGTCTTGGGGTGGAGCGAAATAGTCAACTGTTATTTCTTATTTAAGTTATCTACACAGTGTCAATCAGTTGTAAAAGCCATTCATAGATCGTGTCTTCTAAGTATGTTCTAGTTCGGAACCGTATAAAAATCTTTCCCCACCTAGGAATTCTTGTAACTTAAGTACTACTTCTGATTGTTAGGATTGTTGTTAAATCTTGAATTCATTTAGAATATTTTAAAGTACAGTACTTCGCTTCCAAAACGACATTGAACTGGTGTGTTACACTTAGTCTTGTAATTAGTAGTCCGGTAGTCATGCTTAATAGAATGACTTGTGTTATCTCTTTGCACACCAATAATCATGTAAAACTGCTGGGAATTGAGTTNTATATGGTTta ]
[+] EMBL CD088718 [ TAGTGGTATGTTTTTTAGATTGCATCAGATGACATGAATTTTGTTTTGGTTCTTAACTGTTTAAATTATTCAGATACGAGTATAACGATCCTCAAAGTTATGTATTCAATCCTAAACCGAAATAGTCTAATAAGTATCCCGTGTTGATAAGTAGTTGTGGACAGCTGAAGAGTCTTGGGGTGGAGCGAAATAGTCAACTGTTATTTCTTATTTAAGTTATCTACACAGTGCCAATCAGTTGTAAAAGCCATTCATAGATCGTGTCTTCTAAGTATGTTCTAGTTCGGAACCGTATAAAAATCTTTCCCCACCTAGGAATTCTTGTAACTTAAGTACTACTTCTGATTGTTAGGATTGTTGTTAAATCTTGAATTCATTTAGAATATTTTAAAGTACAGTACTTCGCTTCCAAAACGACATTGAACTGGTGTGTTACACTTAGTCTTGTAATTAGTAGTCCGGTAGTCATGCTTAATAGAATGACTTGTGTTATCTCTTTGCACACCAATAATCATGTNAAACTGCTGGGAATTGAGTTNTA ]
[+] EMBL CD088604 [ TAGTGGTATGTTTTTTAGATTGCATCAGATGACATGAATTTTGTTTTGGTTCTTAACTGTTTAAATTATTCAGATACGAGTATAACGATCCTCAAAGTTATGTATTCAATCCTAAACCGAAATAGTCTAATAAGTATCCCGTGTTGATAAGTAGTTGTGGACAGCTGAAGAGTCTTGGGGTGGGGCGAAATAGTCAACTGTTATTTCTTATTTAAGTTATCTACACAGTGTCAATCAGTTGTAAAAGCCATTCATAGATCGTGTCTTCTAAGTATGTTCTAGTTCGGAACCGTATAAAAATCTTTCCCCACCTAGGAATTCTTGTAACTTAAGTACTACTTCTGATTGTTAGGATTGTTGTTAAATCTTGAATTCATTTAGAATATTTTAAAGTACAGTACTTCGCTTCCAAAACGACATTGAACTGGTGTGTTACACTTAGTCTTGTAATTAGTAGTCCGGTAGTCATGCTTAATAGAATGACTTGTGTTATCTCTTTGCACACCAATAATCATGTAAAACTGCTG ]
[+] EMBL CD088624 [catGTGGANTGTTTTTTAGATTGCATCAGATGACATGAATTTTGTTTTGGTTCTTAACTGTTTAAATTATTCAGATACGAGTATAACGATCCTCAAAGTTATGTATTCAATCCTAAACCGAAATAGTCTAATAAGTATCCCGTGTTGATAAGTAGTTGTGGACAGCTGAAGAGTCTTGGGGTGGAGCGAAATAGTCAACTGTTATTTCTTATTTAAGTTATCTACACAGTGTCAATCAGTTGTAAAAGCCATTCATAGATCGTGTCTTCTAAGTATGTTCTAGTTCGGAACCGTATAAAAATCTTTCCCCACCTAGGAATTCTTGTAACTTAAGTACTACTTCTGATTGTTAGGATTGTTGTTAAATCTTGAATTCATTTAGAATATTTTAAAGTACAGTACTTCGCTTCCAAAACGACATTGAACTGGTGTGTTACACTTAGTCTTGTAATTAGTAGTCCGGTAGTCATGCTTAATAGAATGACTTGTGTTATCTCTTTGCACACCAATAATCATGTANAACTGCTGCGAATTGAGTTTTATATGGTT TTATAACATCT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||