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Schistosoma mansoni
cluster # 759 cluster # 759       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_759#0 length = 997 sequences # 2  

consensusID : consensus_759#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 997
fasta sequence
                              [AGGCCANAATTCGGCACGAGGCTGATTGAAATATTGAACAAAGTGAACTGGATTTCAGTTTAAAAAAGAGAATAGAAGTTTACATACCGATTAATTAAAATCATGGAATTAGTCAATCAAATTAATTTAATATCTTTAAAACAGAAAGCTACAAATTCACTCAATATGTTGGATAAAAAATTATCCAAGCTGAATAGTCAACCCATAAATGTAAAAGCTGAAAGAAAATGGACCATGAAATCCTTGTTAAAAAAATCTAAACCAAAATCTGAATGGGATAAATATTCAATGATTGATCGATCGAATTGGTTCAAATCACAAATGACTAGTAGCCCAAGTCCTACACGTTATGATATACAACGACTAGTTGTCGTACATCCGATTACCTATGGTTTCAAGAATACTGGTCGAATGAGACAGTGCTCAACGTTTACCAATGATGGTTTATGGTTGCTTCCCGGTGCTTATAACGTCACTGAAGTAGACGAAAAATTAAATCAATGTCATAGAACGTATTCATTTAAAAATTTACCTAGAAAATCTAATGATATACTATTTGGTTTACAAGATAAAAATTTGTGTTTAGCTCCAGGCCAATATAACCCTTATGGTGATGAGTGGATTAAAAAAACTCAATTACCTACCTATCACAGTGTATNTAAATCAAAATATTCCAGATCTGTTTCAAGTCAAAAGCAAGATAATGTGCCCCCCCCAGGCGCTTACAATTTGTCGTTTAAAGGAACATTTGGAATAATGTCTCCATTTGTATCACAAGTACCTAGATTTAAACGTTCAAAATCGTTTGTCCCAGGTCCTGGTACATATGATATCAGTGGAGCAACATAACATATTGAACAACTAAGTAAAATGAGTACATATTATGGATTATTCTTTGGTGACTATGGTGTTGATGATGACCCGACAAATAGATGAAAACATTATGAAAATGCTCTTTTGAGTATAAATTTCAATAGTTTTTGATTCAATAAAATTT]

[+] EMBL CD081478             [AGGCCANAATTCGGCACGAGGCTGATTGAAATATTGAACAAAGTGAACTGGATTTCAGTTTAAAAAAGAGAATAGAAGTTTACATACCGATTAATTAAAATCATGGAATTAGTCAATCAAATTAATTTAATATCTTTAAAACAGAAAGCTACAAATTCACTCAATATGTTGGATAAAAAATTATCCAAGCTGAATAGTCAACCCATAAATGTAAAAGCTGAAAGAAAATGGACCATGAAATCCTTGTTAAAAAAATCTAAACCAAAATCTGAATGGGATAAATATTCAATGATTGATCGATCGAATTGGTTCAAATCACAAATGACTAGTAGCCCAAGTCCTACACGTTATGATATACAACGACTAGTTGTCGTACATCCGATTACCTATGGTTTCAAGAATACTGGTCGAATGAGACAGTGCTCAACGTTTACCAATGATGGTTTATGGTTGCTTCCCGGTGCTTATAACGTCACTGAAGTAGACGAAAAATTAAATCAATGTCATAGAACGTATTCATTTAAAAATTTACCTAGAAAATCTAATGATATACTATTTGGTTTACAAGATAAAAATTTGTGTTTAGCTCCAGGCCAATATAACCCTTATGGTGATGAGTGGATTAAAAAAACTCAATTACCTACCTATCACAGTGTATNTAAATCAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD075302             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTATAACGTCACTGAAGTAGACGAAAAATTAAATCAATGTCATAGAACGTATTCATTTAAAAATTTACCTAGAAAATCTAATGATATACTATTTGGTTTACAAGATAAAAATTTGTGTTTAGCTCCAGGCCAATATAACCCTTATGGTGATGAGTGGATTAAAAAAACTCAATTACCTACCTATCACAGTGTATTTAAATCAAAATATTCCAGATCTGTTTCAAGTCAAAAGCAAGATAATGTGCCCCCCCCAGGCGCTTACAATTTGTCGTTTAAAGGAACATTTGGAATAATGTCTCCATTTGTATCACAAGTACCTAGATTTAAACGTTCAAAATCGTTTGTCCCAGGTCCTGGTACATATGATATCAGTGGAGCAACATAACATATTGAACAACTAAGTAAAATGAGTACATATTATGGATTATTCTTTGGTGACTATGGTGTTGATGATGACCCGACAAATAGATGAAAACATTATGAAAATGCTCTTTTGAGTATAAATTTCAATAGTTTTTGATTCAATAAAATTT]


>consensus_759#0 AGGCCANAATTCGGCACGAGGCTGATTGAAATATTGAACAAAGTGAACTGGATTTCAGTT TAAAAAAGAGAATAGAAGTTTACATACCGATTAATTAAAATCATGGAATTAGTCAATCAA ATTAATTTAATATCTTTAAAACAGAAAGCTACAAATTCACTCAATATGTTGGATAAAAAA TTATCCAAGCTGAATAGTCAACCCATAAATGTAAAAGCTGAAAGAAAATGGACCATGAAA TCCTTGTTAAAAAAATCTAAACCAAAATCTGAATGGGATAAATATTCAATGATTGATCGA TCGAATTGGTTCAAATCACAAATGACTAGTAGCCCAAGTCCTACACGTTATGATATACAA CGACTAGTTGTCGTACATCCGATTACCTATGGTTTCAAGAATACTGGTCGAATGAGACAG TGCTCAACGTTTACCAATGATGGTTTATGGTTGCTTCCCGGTGCTTATAACGTCACTGAA GTAGACGAAAAATTAAATCAATGTCATAGAACGTATTCATTTAAAAATTTACCTAGAAAA TCTAATGATATACTATTTGGTTTACAAGATAAAAATTTGTGTTTAGCTCCAGGCCAATAT AACCCTTATGGTGATGAGTGGATTAAAAAAACTCAATTACCTACCTATCACAGTGTATNT AAATCAAAATATTCCAGATCTGTTTCAAGTCAAAAGCAAGATAATGTGCCCCCCCCAGGC GCTTACAATTTGTCGTTTAAAGGAACATTTGGAATAATGTCTCCATTTGTATCACAAGTA CCTAGATTTAAACGTTCAAAATCGTTTGTCCCAGGTCCTGGTACATATGATATCAGTGGA GCAACATAACATATTGAACAACTAAGTAAAATGAGTACATATTATGGATTATTCTTTGGT GACTATGGTGTTGATGATGACCCGACAAATAGATGAAAACATTATGAAAATGCTCTTTTG AGTATAAATTTCAATAGTTTTTGATTCAATAAAATTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)