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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7592#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1271 fasta sequence
[CCGTCGCAGTTAAACGTGAACTATGATCCTCGTTTAATTGTTCACGTTGTCTAGCTCTTTGTAATTCTGATTGGATTTCATTCATTTCAACTTCCATATCTTTAATACGTTCTTCAGCTGTAGATAATTGTACACGTAATTCATCAACAACTGTCACATTAGGATTATTATTGTTACTGTTATTATTACTAACTAAATGAGAACTTTTGCTGTTTTTAATAGTTTTTTCATCATCGGAAATAGTTTCATTTTCAATAGATTCAATAAATTCGCCACCATTTTCAATAGCTGAGTGTTCTGTCGATGTTGTTGTTGTTACAGTTGCAGGTGTATTCACTTTCTCATTTTGTTGCATTGTATTCACTTTGACAATGGCTAATTCATTTTGTACTGTTTCTAATTCGCTAACCAAATGATTGGCATGATCTTTTGCTTGTTTCAATTCAATTTCACGTGTAATCAATTCTGACTGAGCTCGACTAAGTCTATCCAACGTACCAGTAGCTTCACGTTGTGTAGCAAGATAACGTTGTTCCAAAGTTGCGATACGAGCTTCTTGATCTTCACGTTGAGCTTCCAACTCTCTTAATTCTCTTTGTAAACGAGAAATCTGATCATGAGCACGTGATAATTCCTTTTGTAATGTTGTATTAGATGCTTCTAAATCTCTAGATTTTGTAGTGACTTCAACAAGTTTACGTTCAACAGCTACAGCACTGGCAGCAGCCGCCGCTGCAGCTGCAGCAACTGATGCAACTGTTTTTGCACCGGAATTTTCTGAAGAATTCACTGCTGATGAACTTTCATCGTTTGAATCTTTTGATGTGATTGGTGGTCCACCTGGNAGTAATGAGGCTAGTTTATTGCCAACATCATTCCCATCAATATCATCTTTACTGATTTGTGTGATATGATTAGAATCAAC--ATTTAAAGACAAAAAGAAATTACAAACCATAAAAACTGTACGAACATCTAATGTTAAACAACATAGGTAATTAATGAATTTTAGAAGATACTGACTAAAGTTATTTATTTAACATTTGATATGAAACTGAAGTGTGGAAGAATTCAACTTTTTACAGGTTTCAAGAATGTATTAAGTGGAAAAGTCCTAAACTATTTATTGCCTAGTGATAATCTTGCTAGTACCACATTCATTAGTGGTACAATTTAATAGAAGAACCTTAATAAAGGCAAAACTAGTGTATCACATCCATCTACTTTCTTTCTATCTTCTCTACAAACATTATAACAGCAAAGTGATTTGTTTC]
[-] EMBL CD063257 [CCGTCGCAGTTAAACGTGAACTATGATCCTCGTTTAATTGTTCACGTTGTCTAGCTCTTTGTAATTCTGATTGGATTTCATTCATTTCAACTTCCATATCTTTAATACGTTCTTCAGCTGTAGATAATTGTACACGTAATTCATCAACAACTGTCACATTAGGATTATTATTGTTACTGTTATTATTACTAACTAAATGAGAACTTTTGCTGTTTTTAATAGTTTTTTCATCATCGGAAATAGTTTCATTTTCAATAGATTCAATAAATTCGCCACCATTTTCAATAGCTGAGTGTTCTGTCGATGTTGTTGTTGTTACAGTTGCAGGTGT ]
[-] EMBL CD065027 [ TTTAATACGTTCTTCAGCTGTAGATAATTGTACACGTAATTCGTCAACAACTGTCACATTAGGATTATTATTGTTACTGTTATTATTACTAACTAAATGAGAACTTTTGCTGTTTTTGATAGTTTTTTCATCATCGGAGATAGTTTCATTTCCAATAGATTCAATAAATTCGCCACCATTTTCAATAGCTGAGTGTTCCGTCGATGTTGTTGTTGTTACAGTTGCAGGTGTATTCACTTTCTCATTTTGTTGCATTGTATTCACTTTGACAATGGCTAATTCATTTTGTACTGTTTCTAATTCGCTAACCAAATGATTGGCATGATCTTTTGCTTGTTTCAATTCAATTTCACGTGTAATCAATTCTGACTGAGCTCGACTAAGTCTATCCAACGTACCAGTAGCTTCACGTTGTGTAGCAAGATAACGTTGTTCCAAAGTTGCGATACGAGCTTCTTGATCTTCACGTT ]
[+] EMBL CD193249 [ GTATTCACTTTGACAATGGCTAATTCATTTTGTACTGTTTCTAATTCGCTAACCAAATGATTGGCATGATCTTTTGCTTGTTTCAATTCAATTTCACGTGTAATCAATTCTGACTGAGCTCGACTAAGTCTATCCAACGTACCAGTAGCTTCACGTTGTGTAGCAAGATAACGTTGTTCCAAAGTTGCGATACGAGCTTCTTGATCTTCACGTTGAGCTTCCAACTCTCTTAATTCTCTTTGTAAACGAGAAATCTGATCATGAGCACGTGATAATTCCTTTTGTAATGTTGTATTAGATGCTTCTAAATCTCTAGATTTTGTAGTGACTTCAACAAGTTTACGTTCAACAGCTACAGCACTGGCAGCAGCCGCCGCTGCAGCTGCAGCAACTGATGCAACTGTTTTTGCACCGGAATTTTCTGAAGAATTCACTGCTGATGAACTTTCATCGTTTGAATCTTTTGATGTGATTGGTGGTCCACCTGGNAGTAATGAGGCTAGTTTATTGCCAACATCATTCCCATCAATATCATCTTTACTGATTTGTGTGATATGATTAGAATCAAC ATTTcc ]
[-] EMBL CD197333 [ TAATGAGGCTAGTTTATTGCCAACATCATTCCCATCAATATCATCTTTACTGATTTGTGTGATATGATTAGAGTCAACTGATTTAAAGACAAAAAGAAATTACAAACCATAAAAACTGTACGAACATCTAATGTTAAACAACATAGGTAATTAATGAATTTTAGAAGATACTGACTAAAGTTATTTATTTAACATTTGATATGAAACTGAAGTGTGGAAGAATTCAACTTTTTACAGGTTTCAAGAATGTATTAAGTGGAAAAGTCCTAAACTATTTATTGCCTAGTGATAATCTTGCTAGTACCACATTCATTAGTGGTACAATTTAATAGAAGAACCTTAATAAAGGCAAAACTAGTGTATCACATCCATCTACTTTCTTTCTATCTTCTCTACAAACATTATAACAGCAAAGTGATTTGTTTC]
[-] EMBL CD197860 [ TTTATTGCCAACATCATTCCCATCAATATCATCTTTACTGATTTGTGTGATATGATTAGAATCAACTGATTTAAAGACAAAAAGAAATTACAAACCATAAAAACTGTACGAACATCTAATGTTAAACAACATAGGTAATTAATGAATTTTAGAAGATACTGACTAAAGTTATTTATTTAACATTTGATATGAAACTGAAGTGTGGAAGAATTCAACTTTTTACAGGTTTCAAGAATGTATTAAGTGGAAAAGTCCTAAACTTTTTATTGCCTAGTGATAATCTTGCTAGTACCACATTCATTAGTGGTACAATTTAATAGAAGAACCTTAATAAAGGCAAAACTAGTGTATCACATCCATCTACTTTCTTTCTATCTTCTCTACAAACATTATAACAGCAAAGTGATTTGTTTC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||