These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7592#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1271 fasta sequence [CCGTCGCAGTTAAACGTGAACTATGATCCTCGTTTAATTGTTCACGTTGTCTAGCTCTTTGTAATTCTGATTGGATTTCATTCATTTCAACTTCCATATCTTTAATACGTTCTTCAGCTGTAGATAATTGTACACGTAATTCATCAACAACTGTCACATTAGGATTATTATTGTTACTGTTATTATTACTAACTAAATGAGAACTTTTGCTGTTTTTAATAGTTTTTTCATCATCGGAAATAGTTTCATTTTCAATAGATTCAATAAATTCGCCACCATTTTCAATAGCTGAGTGTTCTGTCGATGTTGTTGTTGTTACAGTTGCAGGTGTATTCACTTTCTCATTTTGTTGCATTGTATTCACTTTGACAATGGCTAATTCATTTTGTACTGTTTCTAATTCGCTAACCAAATGATTGGCATGATCTTTTGCTTGTTTCAATTCAATTTCACGTGTAATCAATTCTGACTGAGCTCGACTAAGTCTATCCAACGTACCAGTAGCTTCACGTTGTGTAGCAAGATAACGTTGTTCCAAAGTTGCGATACGAGCTTCTTGATCTTCACGTTGAGCTTCCAACTCTCTTAATTCTCTTTGTAAACGAGAAATCTGATCATGAGCACGTGATAATTCCTTTTGTAATGTTGTATTAGATGCTTCTAAATCTCTAGATTTTGTAGTGACTTCAACAAGTTTACGTTCAACAGCTACAGCACTGGCAGCAGCCGCCGCTGCAGCTGCAGCAACTGATGCAACTGTTTTTGCACCGGAATTTTCTGAAGAATTCACTGCTGATGAACTTTCATCGTTTGAATCTTTTGATGTGATTGGTGGTCCACCTGGNAGTAATGAGGCTAGTTTATTGCCAACATCATTCCCATCAATATCATCTTTACTGATTTGTGTGATATGATTAGAATCAAC--ATTTAAAGACAAAAAGAAATTACAAACCATAAAAACTGTACGAACATCTAATGTTAAACAACATAGGTAATTAATGAATTTTAGAAGATACTGACTAAAGTTATTTATTTAACATTTGATATGAAACTGAAGTGTGGAAGAATTCAACTTTTTACAGGTTTCAAGAATGTATTAAGTGGAAAAGTCCTAAACTATTTATTGCCTAGTGATAATCTTGCTAGTACCACATTCATTAGTGGTACAATTTAATAGAAGAACCTTAATAAAGGCAAAACTAGTGTATCACATCCATCTACTTTCTTTCTATCTTCTCTACAAACATTATAACAGCAAAGTGATTTGTTTC] [-] EMBL CD063257 [CCGTCGCAGTTAAACGTGAACTATGATCCTCGTTTAATTGTTCACGTTGTCTAGCTCTTTGTAATTCTGATTGGATTTCATTCATTTCAACTTCCATATCTTTAATACGTTCTTCAGCTGTAGATAATTGTACACGTAATTCATCAACAACTGTCACATTAGGATTATTATTGTTACTGTTATTATTACTAACTAAATGAGAACTTTTGCTGTTTTTAATAGTTTTTTCATCATCGGAAATAGTTTCATTTTCAATAGATTCAATAAATTCGCCACCATTTTCAATAGCTGAGTGTTCTGTCGATGTTGTTGTTGTTACAGTTGCAGGTGT ] [-] EMBL CD065027 [ TTTAATACGTTCTTCAGCTGTAGATAATTGTACACGTAATTCGTCAACAACTGTCACATTAGGATTATTATTGTTACTGTTATTATTACTAACTAAATGAGAACTTTTGCTGTTTTTGATAGTTTTTTCATCATCGGAGATAGTTTCATTTCCAATAGATTCAATAAATTCGCCACCATTTTCAATAGCTGAGTGTTCCGTCGATGTTGTTGTTGTTACAGTTGCAGGTGTATTCACTTTCTCATTTTGTTGCATTGTATTCACTTTGACAATGGCTAATTCATTTTGTACTGTTTCTAATTCGCTAACCAAATGATTGGCATGATCTTTTGCTTGTTTCAATTCAATTTCACGTGTAATCAATTCTGACTGAGCTCGACTAAGTCTATCCAACGTACCAGTAGCTTCACGTTGTGTAGCAAGATAACGTTGTTCCAAAGTTGCGATACGAGCTTCTTGATCTTCACGTT ] [+] EMBL CD193249 [ GTATTCACTTTGACAATGGCTAATTCATTTTGTACTGTTTCTAATTCGCTAACCAAATGATTGGCATGATCTTTTGCTTGTTTCAATTCAATTTCACGTGTAATCAATTCTGACTGAGCTCGACTAAGTCTATCCAACGTACCAGTAGCTTCACGTTGTGTAGCAAGATAACGTTGTTCCAAAGTTGCGATACGAGCTTCTTGATCTTCACGTTGAGCTTCCAACTCTCTTAATTCTCTTTGTAAACGAGAAATCTGATCATGAGCACGTGATAATTCCTTTTGTAATGTTGTATTAGATGCTTCTAAATCTCTAGATTTTGTAGTGACTTCAACAAGTTTACGTTCAACAGCTACAGCACTGGCAGCAGCCGCCGCTGCAGCTGCAGCAACTGATGCAACTGTTTTTGCACCGGAATTTTCTGAAGAATTCACTGCTGATGAACTTTCATCGTTTGAATCTTTTGATGTGATTGGTGGTCCACCTGGNAGTAATGAGGCTAGTTTATTGCCAACATCATTCCCATCAATATCATCTTTACTGATTTGTGTGATATGATTAGAATCAAC ATTTcc ] [-] EMBL CD197333 [ TAATGAGGCTAGTTTATTGCCAACATCATTCCCATCAATATCATCTTTACTGATTTGTGTGATATGATTAGAGTCAACTGATTTAAAGACAAAAAGAAATTACAAACCATAAAAACTGTACGAACATCTAATGTTAAACAACATAGGTAATTAATGAATTTTAGAAGATACTGACTAAAGTTATTTATTTAACATTTGATATGAAACTGAAGTGTGGAAGAATTCAACTTTTTACAGGTTTCAAGAATGTATTAAGTGGAAAAGTCCTAAACTATTTATTGCCTAGTGATAATCTTGCTAGTACCACATTCATTAGTGGTACAATTTAATAGAAGAACCTTAATAAAGGCAAAACTAGTGTATCACATCCATCTACTTTCTTTCTATCTTCTCTACAAACATTATAACAGCAAAGTGATTTGTTTC] [-] EMBL CD197860 [ TTTATTGCCAACATCATTCCCATCAATATCATCTTTACTGATTTGTGTGATATGATTAGAATCAACTGATTTAAAGACAAAAAGAAATTACAAACCATAAAAACTGTACGAACATCTAATGTTAAACAACATAGGTAATTAATGAATTTTAGAAGATACTGACTAAAGTTATTTATTTAACATTTGATATGAAACTGAAGTGTGGAAGAATTCAACTTTTTACAGGTTTCAAGAATGTATTAAGTGGAAAAGTCCTAAACTTTTTATTGCCTAGTGATAATCTTGCTAGTACCACATTCATTAGTGGTACAATTTAATAGAAGAACCTTAATAAAGGCAAAACTAGTGTATCACATCCATCTACTTTCTTTCTATCTTCTCTACAAACATTATAACAGCAAAGTGATTTGTTTC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||