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Schistosoma mansoni
cluster # 7612 cluster # 7612       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7612#0 length = 570 sequences # 5  

consensusID : consensus_7612#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 570
fasta sequence
                              [GCATCCCCAACACAATAGGAGCGTCACAGTCCGTATTCAAGCTATTCGTGCTATTGATTTTGTCAGTGAGTAGTATTGATTCATATCTCTGGGGTAGGGGCTCCAGTTTACCAAGGATTAAAACGCTGCTATGCTAATAAATAGGAACTATCACCAACCCCTATCTAGGAGCTTTAATGCCAGCTGTACCCGATCATGGACCTTTGTTTGTTACTAGTGTGATAGTTGACTAAGATAGATTTTGAGTAGTAACCGGTTAATGTTAGACTTATTTAGTACAGGATAATGTGCATTTAATTGTGCATATTTTCTTCATGATGCAACATTTGAAAAGCTTTCGTATATTCTATGCATGACAACGTACAACTCATACCAGTTATGTTTTATTTTTTAGAGAGACATAACTATTTTTCTATTCAGTTCTCATTAAGGAAATAGTAGTGAATTAACAATAGTAGAATTCGGATTACGTAATGGTGATTGAGCCTATCATAATGGCGGAATCCGAAACATTTTTCAATCATTCTGG-CAACTAACAATCAATTGATAGAATACGAACAACCCGNAGGC]

[+] EMBL CD161119             [GCATCCCCAACACAATAGGAGCGTCACAGTCCGTATTCAAGCTATTCGTGCTATTGATTTTGTCAGTGAGTAGTATTGATTCATATCTCTGGGGTAGGGGCTCCAGTTTACCAAGGATTAAAACGCTGCTATGCTAATAAATAGGAACTATCACCAACCCCTATCTAGGAGCTTTAATGCCAGCTGTACCCGATCATGGACCTTTGTTTGTTACTAGTGTGATAGTTGACTAAGATAGATTTTGAGTAGTAACCGGTTAATGTTAGACTTATTTAGTACAGGATAATGTGCATTTAATTGTGCATATTTTCTTCATGATGCAACATTTGAAAAGCTTTCGTATATTCTATGCATGACAACGTACAACTCATACCAGTTATGTTTTATTTTTTAGAGAGACATAACTATTTTTCTATTCAGTTCTCATTAAGGAAATAGTAGTGAATTAACAATAGTAGAATTCGGATTACGTAATGGTGATTGAGCCTATCATAATAGCGGAATCCGAAACATTNTCCAATCATTCTGGNNCACTAAC ATCAATTGATAGAATACGAACAACCCGNAGGC]
[+] EMBL CD161106             [GCATCCCCAACACAATAGGAGCGTCACAGTCCGTATTCAAGCTATTCGTGCTATTGATTTTGTCAGTGAGTAGTATTGATTCATATCTCTGGGGTAGGGGCTCCAGTTTACCAAGGATTAAAACGCTGCTATGCTAATAAATAGGAACTATCACCAACCCCTATCTAGGAGCTTTAATGCCAGCTGTACCCGATCATGGACCTTTGTTTGTTACTAGTGTGATAGTTGACTAAGATAGATTTTGAGTAGTAACCGGTTAATGTTAGACTTATTTAGTACAGGATAATGTGCATTTAATTGTGCATATTTTCTTCATGATGCAACATTTGAAAAGCTTTCGTATATTCTATGCATGACAACGTACAACTCATACCAGTTATGTTTTATTTTTTAGAGAGACATAACTATTTTTCTATTCAGTTCTCATTAAGGAAATAGTAGTGAATTAACAATAGTAGAATTCGGATTACGTAATGGTGATTGAGCCTATCATAATGGCGGAATCCGAAACATTTTTCAATCATTCTGG CAACTAACAATCAATTGAT                      ]
[+] EMBL CD161118             [GCATCCCCAACACAATAGGAGCGTCACAGTCCGTATTCAAGCTATTCGTGCTATTGATTTTGTCAGTGAGTAGTATTGATTCATATCTCTGGGGTAGGGGCTCCAGTTTACCAAGGATTAAAACGCTGCTATGCTAATAAATAGGAACTATCACCAACCCCTATCTAGGAGCTTTAATGCCAGCTGTACCCGATCATGGACCTTTGTTTGTTACTAGTGTGATAGTTGACTAAGATAGATTTTGAGTAGTAACCGGTTAATGTTAGACTTATTTAGTACAGGATAATGTGCATTTAATTGTGCATATTTTCTTCATGATGCAACATTTGAAAAGCTTTCGTATATTCTATGCATGACAACGTACAACTCATACCAGTTATGTTTTATTTTTTAGAGAGACATAACTATTTTTCTATTCAGTTCTCATTAAGGAAATAGTAGTGAATTAACAATAGTAGAATTCGGATTACGTAATGGTGATTGAGCCTATCATAATGGCGGAATCCGAAACATTTTTCAATCATTCTGG CAACTAACAATCAATTGAT                      ]
[+] EMBL CD161156             [GCATCCCCAACACAATAGGAGCGTCACAGTCCGTATTCAAGCTATTCGTGCTATTGATTTTGTCAGTGAGTAGTATTGATTCATATCTCTGGGGTAGGGGCTCCAGTTTACCAAGGATTAAAACGCTGCTATGCTAATAAATAGGAACTATCACCAACCCCTATCTAGGAGCTTTAATGCCAGCTGTACCCGATCATGGACCTTTGTTTGTTACTAGTGTGATAGTTGACTAAGATAGATTTTGAGTAGTAACCGGTTAATGTTAGACTTATTTAGTACAGGATAATGTGCATTTAATTGTGCATATTTTCTTCATGATGCAACATTTGAAAAGCTTTCGTATATTCTATGCATGACAACGTACAACTCATACCAGTTATGTTTTATTTTTTAGAGAGACATAACTATTTTTCTATTCAGTTCTCATTAAGGAAATAGTAGTGAATTAACAATAGTAGAATTCGGATTACGTAATGGTGATTGAGCCTATCATAATGGCGGAATCCGAAACATTTTTCAATCATTCTGG CAACTAACAATCAATTGAT                      ]
[+] EMBL CD161101             [GCATCCCCAACACAATAGGAGCGTCACAGTCCGTATTCAAGCTATTCGTGCTATTGATTTTGTCAGTGAGTAGTATTGATTCATATCTCTGGGGTAGGGGCTCCAGTTTACCAAGGATTAAAACGCTGCTATGCTAATAAATAGGAACTATCACCAACCCCTATCTAGGAGCTTTAATGCCAGCTGTACCCGATCATGGACCTTTGTTTGTTACTAGTGTGATAGTTGACTAAGATAGATTTTGAGTAGTAACCGGTTAATGTTAGACTTATTTAGTACAGGATAATGTGCATTTAATTGTGCATATTTTCTTCATGATGCAACATTTGAAAAGCTTTCGTATATTCTATGCATGACAACGTACAACTCATACCAGTTATGTTTTATTTTTTAGAGAGACATAACTATTTTTCTATTCAGTTCTCATTAAGGAAATAGTAGTGAATTAACAATAGTAGAATTCGGATTACGTAATGGTGATTGAGCCTATCATAATGGCGGAATCCGAAACATTTTTCAATCATTCTGG CAACTAACAATCAATTGAT                      ]


>consensus_7612#0 GCATCCCCAACACAATAGGAGCGTCACAGTCCGTATTCAAGCTATTCGTGCTATTGATTT TGTCAGTGAGTAGTATTGATTCATATCTCTGGGGTAGGGGCTCCAGTTTACCAAGGATTA AAACGCTGCTATGCTAATAAATAGGAACTATCACCAACCCCTATCTAGGAGCTTTAATGC CAGCTGTACCCGATCATGGACCTTTGTTTGTTACTAGTGTGATAGTTGACTAAGATAGAT TTTGAGTAGTAACCGGTTAATGTTAGACTTATTTAGTACAGGATAATGTGCATTTAATTG TGCATATTTTCTTCATGATGCAACATTTGAAAAGCTTTCGTATATTCTATGCATGACAAC GTACAACTCATACCAGTTATGTTTTATTTTTTAGAGAGACATAACTATTTTTCTATTCAG TTCTCATTAAGGAAATAGTAGTGAATTAACAATAGTAGAATTCGGATTACGTAATGGTGA TTGAGCCTATCATAATGGCGGAATCCGAAACATTTTTCAATCATTCTGGCAACTAACAAT CAATTGATAGAATACGAACAACCCGNAGGC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)