cluster # 7612

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Schistosoma mansoni
cluster # 7612 cluster # 7612 Sequences # 5 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7612#0 length = 570 sequences # 5

consensusID : consensus_7612#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 570
fasta sequence

                              [GCATCCCCAACACAATAGGAGCGTCACAGTCCGTATTCAAGCTATTCGTGCTATTGATTTTGTCAGTGAGTAGTATTGATTCATATCTCTGGGGTAGGGGCTCCAGTTTACCAAGGATTAAAACGCTGCTATGCTAATAAATAGGAACTATCACCAACCCCTATCTAGGAGCTTTAATGCCAGCTGTACCCGATCATGGACCTTTGTTTGTTACTAGTGTGATAGTTGACTAAGATAGATTTTGAGTAGTAACCGGTTAATGTTAGACTTATTTAGTACAGGATAATGTGCATTTAATTGTGCATATTTTCTTCATGATGCAACATTTGAAAAGCTTTCGTATATTCTATGCATGACAACGTACAACTCATACCAGTTATGTTTTATTTTTTAGAGAGACATAACTATTTTTCTATTCAGTTCTCATTAAGGAAATAGTAGTGAATTAACAATAGTAGAATTCGGATTACGTAATGGTGATTGAGCCTATCATAATGGCGGAATCCGAAACATTTTTCAATCATTCTGG-CAACTAACAATCAATTGATAGAATACGAACAACCCGNAGGC]

[+] EMBL CD161119             [GCATCCCCAACACAATAGGAGCGTCACAGTCCGTATTCAAGCTATTCGTGCTATTGATTTTGTCAGTGAGTAGTATTGATTCATATCTCTGGGGTAGGGGCTCCAGTTTACCAAGGATTAAAACGCTGCTATGCTAATAAATAGGAACTATCACCAACCCCTATCTAGGAGCTTTAATGCCAGCTGTACCCGATCATGGACCTTTGTTTGTTACTAGTGTGATAGTTGACTAAGATAGATTTTGAGTAGTAACCGGTTAATGTTAGACTTATTTAGTACAGGATAATGTGCATTTAATTGTGCATATTTTCTTCATGATGCAACATTTGAAAAGCTTTCGTATATTCTATGCATGACAACGTACAACTCATACCAGTTATGTTTTATTTTTTAGAGAGACATAACTATTTTTCTATTCAGTTCTCATTAAGGAAATAGTAGTGAATTAACAATAGTAGAATTCGGATTACGTAATGGTGATTGAGCCTATCATAATAGCGGAATCCGAAACATTNTCCAATCATTCTGGNNCACTAAC ATCAATTGATAGAATACGAACAACCCGNAGGC]
[+] EMBL CD161106             [GCATCCCCAACACAATAGGAGCGTCACAGTCCGTATTCAAGCTATTCGTGCTATTGATTTTGTCAGTGAGTAGTATTGATTCATATCTCTGGGGTAGGGGCTCCAGTTTACCAAGGATTAAAACGCTGCTATGCTAATAAATAGGAACTATCACCAACCCCTATCTAGGAGCTTTAATGCCAGCTGTACCCGATCATGGACCTTTGTTTGTTACTAGTGTGATAGTTGACTAAGATAGATTTTGAGTAGTAACCGGTTAATGTTAGACTTATTTAGTACAGGATAATGTGCATTTAATTGTGCATATTTTCTTCATGATGCAACATTTGAAAAGCTTTCGTATATTCTATGCATGACAACGTACAACTCATACCAGTTATGTTTTATTTTTTAGAGAGACATAACTATTTTTCTATTCAGTTCTCATTAAGGAAATAGTAGTGAATTAACAATAGTAGAATTCGGATTACGTAATGGTGATTGAGCCTATCATAATGGCGGAATCCGAAACATTTTTCAATCATTCTGG CAACTAACAATCAATTGAT                      ]
[+] EMBL CD161118             [GCATCCCCAACACAATAGGAGCGTCACAGTCCGTATTCAAGCTATTCGTGCTATTGATTTTGTCAGTGAGTAGTATTGATTCATATCTCTGGGGTAGGGGCTCCAGTTTACCAAGGATTAAAACGCTGCTATGCTAATAAATAGGAACTATCACCAACCCCTATCTAGGAGCTTTAATGCCAGCTGTACCCGATCATGGACCTTTGTTTGTTACTAGTGTGATAGTTGACTAAGATAGATTTTGAGTAGTAACCGGTTAATGTTAGACTTATTTAGTACAGGATAATGTGCATTTAATTGTGCATATTTTCTTCATGATGCAACATTTGAAAAGCTTTCGTATATTCTATGCATGACAACGTACAACTCATACCAGTTATGTTTTATTTTTTAGAGAGACATAACTATTTTTCTATTCAGTTCTCATTAAGGAAATAGTAGTGAATTAACAATAGTAGAATTCGGATTACGTAATGGTGATTGAGCCTATCATAATGGCGGAATCCGAAACATTTTTCAATCATTCTGG CAACTAACAATCAATTGAT                      ]
[+] EMBL CD161156             [GCATCCCCAACACAATAGGAGCGTCACAGTCCGTATTCAAGCTATTCGTGCTATTGATTTTGTCAGTGAGTAGTATTGATTCATATCTCTGGGGTAGGGGCTCCAGTTTACCAAGGATTAAAACGCTGCTATGCTAATAAATAGGAACTATCACCAACCCCTATCTAGGAGCTTTAATGCCAGCTGTACCCGATCATGGACCTTTGTTTGTTACTAGTGTGATAGTTGACTAAGATAGATTTTGAGTAGTAACCGGTTAATGTTAGACTTATTTAGTACAGGATAATGTGCATTTAATTGTGCATATTTTCTTCATGATGCAACATTTGAAAAGCTTTCGTATATTCTATGCATGACAACGTACAACTCATACCAGTTATGTTTTATTTTTTAGAGAGACATAACTATTTTTCTATTCAGTTCTCATTAAGGAAATAGTAGTGAATTAACAATAGTAGAATTCGGATTACGTAATGGTGATTGAGCCTATCATAATGGCGGAATCCGAAACATTTTTCAATCATTCTGG CAACTAACAATCAATTGAT                      ]
[+] EMBL CD161101             [GCATCCCCAACACAATAGGAGCGTCACAGTCCGTATTCAAGCTATTCGTGCTATTGATTTTGTCAGTGAGTAGTATTGATTCATATCTCTGGGGTAGGGGCTCCAGTTTACCAAGGATTAAAACGCTGCTATGCTAATAAATAGGAACTATCACCAACCCCTATCTAGGAGCTTTAATGCCAGCTGTACCCGATCATGGACCTTTGTTTGTTACTAGTGTGATAGTTGACTAAGATAGATTTTGAGTAGTAACCGGTTAATGTTAGACTTATTTAGTACAGGATAATGTGCATTTAATTGTGCATATTTTCTTCATGATGCAACATTTGAAAAGCTTTCGTATATTCTATGCATGACAACGTACAACTCATACCAGTTATGTTTTATTTTTTAGAGAGACATAACTATTTTTCTATTCAGTTCTCATTAAGGAAATAGTAGTGAATTAACAATAGTAGAATTCGGATTACGTAATGGTGATTGAGCCTATCATAATGGCGGAATCCGAAACATTTTTCAATCATTCTGG CAACTAACAATCAATTGAT                      ]




>consensus_7612#0
GCATCCCCAACACAATAGGAGCGTCACAGTCCGTATTCAAGCTATTCGTGCTATTGATTT
TGTCAGTGAGTAGTATTGATTCATATCTCTGGGGTAGGGGCTCCAGTTTACCAAGGATTA
AAACGCTGCTATGCTAATAAATAGGAACTATCACCAACCCCTATCTAGGAGCTTTAATGC
CAGCTGTACCCGATCATGGACCTTTGTTTGTTACTAGTGTGATAGTTGACTAAGATAGAT
TTTGAGTAGTAACCGGTTAATGTTAGACTTATTTAGTACAGGATAATGTGCATTTAATTG
TGCATATTTTCTTCATGATGCAACATTTGAAAAGCTTTCGTATATTCTATGCATGACAAC
GTACAACTCATACCAGTTATGTTTTATTTTTTAGAGAGACATAACTATTTTTCTATTCAG
TTCTCATTAAGGAAATAGTAGTGAATTAACAATAGTAGAATTCGGATTACGTAATGGTGA
TTGAGCCTATCATAATGGCGGAATCCGAAACATTTTTCAATCATTCTGGCAACTAACAAT
CAATTGATAGAATACGAACAACCCGNAGGC

clustalw multiple alignements is not computed in this case