cluster # 7613

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Schistosoma mansoni
cluster # 7613 cluster # 7613 Sequences # 5 consensus # 2

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consensus_7613#0 length = 1547 sequences # 3

consensus_7613#1 length = 687 sequences # 2

consensusID : consensus_7613#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1547
fasta sequence

                              [CTCGAGCCAAAATTCGGCACGAGGACTGGCCTCTCAGCGGTAGACTTTAAAAACCTGTTTGCCCTTACAACATACACATCCCAAGTCATCAGATAATCAAATAGTGTAGTAATTCTTTGTATATGGGCGATTATTTTACGCTCTATTTCTTTGACAATGTTTAAAAAGATCACTACAGTCTAATTGAATGCATACTAAATTAAAAATTCTTGTACTTTGTAGTTCTACCTCAGATGTTGAACAATCATACTTTTAAGCTATCTTATAGTATTTTTCTTGCCATTTACTTTCAAATTTTAGTAACTAAGTTCATCGTTCAGATGAGAATTGACACTACTCCTAAACCGTTTATTCAAATGTATTATATTTAGAGCACTAATTGATTAAATAAATACTTCAGTGTGTTATTATAAATTTCTACGATTATTCTTCAACATTAGAACGAAGTTTAACAAAAATTGGGCACCAAGTATAATTTTTTATTATAAATGTTTGGCTACTAGGTCAAGTGATACTGTAAAAACTATTGAAATAGGTCTGTACTAATGTATTAATAAATTATAACCAGAAAAGTTATTACCTATAGCCAATAGATTTTTATTCATTTTACTGGCCCTTCATTCCTATTTAGCTCCAATTTCTTATAATTGATGAAACTNTCCTGAAGTTTATTNTACCCCTTGTTTTTATTGCTTAAATTTCTTTACAGATATACTGTTGAACGAAGAAATACACATAGATTACTGTTAGACCTATGTGATCTACATCATATTCCCGTCCCAAAATCAATTAAATTCTGTTTGTAGTTACTATTTAATATTAATTTACTACTTTTGTTTTAAAGTATTCCTTTATTCTCATATATTATTTATTTAGTATTTTATTTTACTTGGTTGTTTTTAATAACTCTTACAATTTCTGTTTCTTCTATTGGGATCACTCTTTTTTTTCTTCAATTTTCGCAATTACTACACTAGATTTTATGAAGGCTGTGTATCTGTACCCTTTAAAATATTTACATGAAAATATTGCATACTAATTATTAACCAGCTTCTTTAGTAATGTATTCCCATATTTATATTATAAGCTTTATCATGTTATTGTTTTCAGGTATTTTTATATTTACAATTTATTTATACTTATCAGGTCATTACTACAGTTGTCGTATTTTATATTTTATGACAATGTATATTCGTCATCATTGTGTATTTGCTATAATGATATTCGCAACATTTTAAAATGATAAATTGTCTGTATACGTTACGCAATACACTACATTTTCTTTATTTTATCCGATTTTCGCGAGATTCCCCGTAGTTTAATCGTATTAATAAAAAAGGCTTACAATTAGTTGTAGGAAAAAGTACCACACAAACTACCTGCAACAAGCAATACTTCACACCAAAGTTCAACGGCAACAGAAACTACAACAAGATCAGGAAGAAGAGTACACTCCAGATAGGTACGTCACAACAACCATATTTATCTAGCCCAAATCCTGAAATTGTTCTTATAACACAAAAATTCCTTATTTTTATTAGCTGTTC]

[+] EMBL CD079669             [CTCGAGCCAAAATTCGGCACGAGGACTGGCCTCTCAGCGGTAGACTTTAAAAACCTGTTTGCCCTTACAACATACACATCCCAAGTCATCAGATAATCAAATAGTGTAGTAATTCTTTGTATATGGGCGATTATTTTACGCTCTATTTCTTTGACAATGTTTAAAAAGATCACTACAGTCTAATTGAATGCATACTAAATTAAAAATTCTTGTACTTTGTAGTTCTACCTCAGATGTTGAACAATCATACTTTTAAGCTATCTTATAGTATTTTTCTTGCCATTTACTTTCAAATTTTAGTAACTAAGTTCATCGTTCAGATGAGAATTGACACTACTCCTAAACCGTTTATTCAAATGTATTATATTTAGAGCACTAATTGATTAAATAAATACTTCAGTGTGTTATTATAAATTTCTACGATTATTCTTCAACATTAGAACGAAGTTTAACAAAAATTGGGCACCAAGTATAATTTTTTATTATAAATGTTTGGCTACTAGGTCAAGTGATACTGTAAAAACTATTGAAATAGGTCTGTACTAATGTATTAATAAATTATAACCAGAAAAGTTATTACCTATAGCCAATAGATTTTTATTCATTTTACTGGCCCTTCATTCCTATTTAGCTCCAATTTCTTATAATTGATGAAACTNTCCTGAAGTTTATTNTACCCCTTGTTTTTATTGCTTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD073929             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TTTTATTCATTTTACTGGCCCTTCATTCCTATTTAGCTCCAATTTCTTATAATTGATGAAACTTTCCTGAAGTTTATTTTACCCCTTGTTTTTATTGCTTAAATTTCTTTACAGATATACTGTTGAACGAAGAAATACACATAGATTACTGTTAGACCTATGTGATCTACATCATATTCCCGTCCCAAAATCAATTAAATTCTGTTTGTAGTTACTATTTAATATTAATTTACTACTTTTGTTTTAAAGTATTCCTTTATTCTCATATATTATTTATTTAGTATTTTATTTTACTTGGTTGTTTTTAATAACTCTTACAATTTCTGTTTCTTCTATTGGGATCACTCTTTTTTTTCTTCAATTTTCGCAATTACTACACTAGATTTTATGAAGGCTGTGTATCTGTACCCTTTAAAATATTTACATGAAAATATTGCATACTAATTATTAACCAGCTTCTTTAGTAATGTATTCCCATATTTATATTATAAGCTTTATCATGTTATTGTTTTCAGGTATTTTTATATTTACAATTTATTTATACTTATCAGGTCATTACTACAGTTGTCGTATTTTATATTTTATGACAATGTATATTCGTCATCATTGTGTATTTGCTATAATGATATTCGCAACATTTTAAAATGATAAATTGTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD169292             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATTACTACAGTTGTCGTATTTTATATTTTATGACAATGTATATTCGTCATCATTGTGTATTTGCTATAATAATATTCGCAACATTTTAATATGATAAATTGTCTGTATACGTTACGCAATACACTACATTTTCTTTATTTTATCCGATTTTCGCGAGATTCCCCGTAGTTTAATCGTATTAATAAAAAAGGCTTACAATTAGTTGTAGGAAAAAGTACCACACAAACTACCTGCAACAAGCAATACTTCACACCAAAGTTCAACGGCAACAGAAACTACAACAAGATCAGGAAGAAGAGTACACTCCAGATAGGTACGTCACAACAACCATATTTATCTAGCCCAAATCCTGAAATTGTTCTTATAACACAAAAATTCCTTATTTTTATTAGCTGTTC]




>consensus_7613#0
CTCGAGCCAAAATTCGGCACGAGGACTGGCCTCTCAGCGGTAGACTTTAAAAACCTGTTT
GCCCTTACAACATACACATCCCAAGTCATCAGATAATCAAATAGTGTAGTAATTCTTTGT
ATATGGGCGATTATTTTACGCTCTATTTCTTTGACAATGTTTAAAAAGATCACTACAGTC
TAATTGAATGCATACTAAATTAAAAATTCTTGTACTTTGTAGTTCTACCTCAGATGTTGA
ACAATCATACTTTTAAGCTATCTTATAGTATTTTTCTTGCCATTTACTTTCAAATTTTAG
TAACTAAGTTCATCGTTCAGATGAGAATTGACACTACTCCTAAACCGTTTATTCAAATGT
ATTATATTTAGAGCACTAATTGATTAAATAAATACTTCAGTGTGTTATTATAAATTTCTA
CGATTATTCTTCAACATTAGAACGAAGTTTAACAAAAATTGGGCACCAAGTATAATTTTT
TATTATAAATGTTTGGCTACTAGGTCAAGTGATACTGTAAAAACTATTGAAATAGGTCTG
TACTAATGTATTAATAAATTATAACCAGAAAAGTTATTACCTATAGCCAATAGATTTTTA
TTCATTTTACTGGCCCTTCATTCCTATTTAGCTCCAATTTCTTATAATTGATGAAACTNT
CCTGAAGTTTATTNTACCCCTTGTTTTTATTGCTTAAATTTCTTTACAGATATACTGTTG
AACGAAGAAATACACATAGATTACTGTTAGACCTATGTGATCTACATCATATTCCCGTCC
CAAAATCAATTAAATTCTGTTTGTAGTTACTATTTAATATTAATTTACTACTTTTGTTTT
AAAGTATTCCTTTATTCTCATATATTATTTATTTAGTATTTTATTTTACTTGGTTGTTTT
TAATAACTCTTACAATTTCTGTTTCTTCTATTGGGATCACTCTTTTTTTTCTTCAATTTT
CGCAATTACTACACTAGATTTTATGAAGGCTGTGTATCTGTACCCTTTAAAATATTTACA
TGAAAATATTGCATACTAATTATTAACCAGCTTCTTTAGTAATGTATTCCCATATTTATA
TTATAAGCTTTATCATGTTATTGTTTTCAGGTATTTTTATATTTACAATTTATTTATACT
TATCAGGTCATTACTACAGTTGTCGTATTTTATATTTTATGACAATGTATATTCGTCATC
ATTGTGTATTTGCTATAATGATATTCGCAACATTTTAAAATGATAAATTGTCTGTATACG
TTACGCAATACACTACATTTTCTTTATTTTATCCGATTTTCGCGAGATTCCCCGTAGTTT
AATCGTATTAATAAAAAAGGCTTACAATTAGTTGTAGGAAAAAGTACCACACAAACTACC
TGCAACAAGCAATACTTCACACCAAAGTTCAACGGCAACAGAAACTACAACAAGATCAGG
AAGAAGAGTACACTCCAGATAGGTACGTCACAACAACCATATTTATCTAGCCCAAATCCT
GAAATTGTTCTTATAACACAAAAATTCCTTATTTTTATTAGCTGTTC

consensusID : consensus_7613#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 687
fasta sequence

                              [AATATTGAATTTAATTCAATCGGCTATAGTGTTCCTTCAAAGGCAACTTCATCCACTAGCGAAATTTCACCTAGCGACAGAATATAAGATACGGGAAAAATAATTCAACTATAATTTCGGATATACTGTTGAACGAAGAAATACACATAGATTACTGTTAGACCTATGTGATCTACATCATATTCCCGTCCCAAAATCAATTAAATTCTGTTTGTAGTTACTATTTAATATTAATTTACTACTTTTGTTTTAAAGTATTCCTTTATTCTCATATATTATTTATTTAGTATTTTATTTTACTTGGTTGTTTTTAATAACTCTTACAATTTCTGTTTCTTCTATTGGGATCACTCTTTTTTTTCTTCAATTTTCGCAATTACTACACTAGATTTTATGAAGGCTGTGTATCTGTACCCTTTAAAATATTTACATGAAAATATTGCATACTAATTATTAACCAGCTTCTTTAGTAATGTATTCCCATATTTATATTATAAGCTTTATCATGTTATTGTTTTCAGGTATTTTTATATTTACAATTTATTTATACTTATCAGGTCATTACTACAGTTGTCGTATTTTATATTTTATGACAATGTATATTCGTCATCATTGTGTATTTGCTATAATAATATTCGCAACATTTTAATATGATAAATTGTCTGTATACGTTACGCAATACACTAC]

[-] EMBL CD074092             [AATATTGAATTTAATTCAATCGGCTATAGTGTTCCTTCAAAGGCAACTTCATCCACTAGCGAAATTTCACCTAGCGACAGAATATAAGATACGGGAAAAATAATTCAACTATAATTTCGGATATACTGTTGAACGAAGAAATACACATAGATTACTGTTAGACCTATGTGATCTACATCATATTCCCGTCCCAAAATCAATTAAATTCTGTTTGTAGTTACTATTTAATATTAATTTACTACTTTTGTTTTAAAGTATTCCTTTATTCTCATATATTATTTATTTAGTATTTTATTTTACTTGGTTGTTTTTAATAACTCTTACAATTTCTGTTTCTTCTATTGGGATCACTCTTTTTTTTCTTCAATTTTCGCAATTACTACACTAGATTTTATGAAGGCTGTGTATCTGTACCCTTTAAAATATTTACATGAAAATATTGCATACTAATTATTAACCAGCTTCTTTAGTAATGTATTCCCATATTTATATTATAAGCTTTATCATGTTATTGTTTTCAGGTATTTTTATATTTACAATTTATTTATACTTATCAGGTCATTACTACAGTTGTCGTATTTTATATTTTATGACAATGTATATTCGTCATCATTGTGTATTTGCTATAATAATATTCGCAACATTTTAATATGATAAATTGTCT                       ]
[-] EMBL CD074302             [                                                                      CTAGCGACAGAATATAAGATACGGAAAAAATAATTCAACTATAATTTCGGATATACTGTTGAACGAAGAAATACACATAGATTACTGTTAGACCTATGTGATCTACATCATATTCCCGTCCCAAAATCAATTAAATTCTGTTTGTAGTTACTATTTAATATTAATTTACTACTTTTGTTTTAAAGTATTCCTTTATTCTCATATATTATTTATTTAGTATTTTATTTTACTTGGTTGTTTTTAATAACTCTTACAATTTCTGTTTCTTCTATTGGGATCACTCTTTTTTTTCTTCAATTTTCGCAATTACTACACTAGATTTTATGAAGGCTGTGTATCTGTACCCTTTAAAATATTTACATGAAAATATTGCATACTAATTATTAACCAGCTTCTTTAGTAATGTATTCCCATATTTATATTATAAGCTTTATCATGTTATTGTTTTCAGGTATTTTTATATTTACAATTTATTTATACTTATCAGGTCATTACTACAGTTGTCGTATTTTATATTTTATGACAATGTATATTCGTCATCATTGTGTATTTGCTATAATAATATTCGCAACATTTTAATATGATAAATTGTCTGTATACGTTACGCAATACACTAC]




>consensus_7613#1
AATATTGAATTTAATTCAATCGGCTATAGTGTTCCTTCAAAGGCAACTTCATCCACTAGC
GAAATTTCACCTAGCGACAGAATATAAGATACGGGAAAAATAATTCAACTATAATTTCGG
ATATACTGTTGAACGAAGAAATACACATAGATTACTGTTAGACCTATGTGATCTACATCA
TATTCCCGTCCCAAAATCAATTAAATTCTGTTTGTAGTTACTATTTAATATTAATTTACT
ACTTTTGTTTTAAAGTATTCCTTTATTCTCATATATTATTTATTTAGTATTTTATTTTAC
TTGGTTGTTTTTAATAACTCTTACAATTTCTGTTTCTTCTATTGGGATCACTCTTTTTTT
TCTTCAATTTTCGCAATTACTACACTAGATTTTATGAAGGCTGTGTATCTGTACCCTTTA
AAATATTTACATGAAAATATTGCATACTAATTATTAACCAGCTTCTTTAGTAATGTATTC
CCATATTTATATTATAAGCTTTATCATGTTATTGTTTTCAGGTATTTTTATATTTACAAT
TTATTTATACTTATCAGGTCATTACTACAGTTGTCGTATTTTATATTTTATGACAATGTA
TATTCGTCATCATTGTGTATTTGCTATAATAATATTCGCAACATTTTAATATGATAAATT
GTCTGTATACGTTACGCAATACACTAC

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_7613#0      CTCGAGCCAAAATTCGGCACGAGGACTGGCCTCTCAGCGGTAGACTTTAAAAACCTGTTT 60
consensus_7613#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7613#0      GCCCTTACAACATACACATCCCAAGTCATCAGATAATCAAATAGTGTAGTAATTCTTTGT 120
consensus_7613#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7613#0      ATATGGGCGATTATTTTACGCTCTATTTCTTTGACAATGTTTAAAAAGATCACTACAGTC 180
consensus_7613#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7613#0      TAATTGAATGCATACTAAATTAAAAATTCTTGTACTTTGTAGTTCTACCTCAGATGTTGA 240
consensus_7613#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7613#0      ACAATCATACTTTTAAGCTATCTTATAGTATTTTTCTTGCCATTTACTTTCAAATTTTAG 300
consensus_7613#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7613#0      TAACTAAGTTCATCGTTCAGATGAGAATTGACACTACTCCTAAACCGTTTATTCAAATGT 360
consensus_7613#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7613#0      ATTATATTTAGAGCACTAATTGATTAAATAAATACTTCAGTGTGTTATTATAAATTTCTA 420
consensus_7613#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7613#0      CGATTATTCTTCAACATTAGAACGAAGTTTAACAAAAATTGGGCACCAAGTATAATTTTT 480
consensus_7613#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7613#0      TATTATAAATGTTTGGCTACTAGGTCAAGTGATACTGTAAAAACTATTGAAATAGGTCTG 540
consensus_7613#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7613#0      TACTAATGTATTAATAAATTATAACCAGAAAAGTTATTACCTATAGCCAATAGATTTTTA 600
consensus_7613#1      ---------------------------------------------------AATATTGAA 9
                                                                         *   **  *

consensus_7613#0      TTCATTTTACTGGCCCTTCATTCCTATTTAGCTCCAATTTCTTATAATTGATGAAACTNT 660
consensus_7613#1      TTTAATTCAATCGGCTATAGTGTTCCTTCAAAGGCAACTTCATCCACTAGCGAAATTTCA 69
                      ** * ** * * * *  *  *     ** *    *** *** *  * * *   **  *  

consensus_7613#0      CCTGAAGTTT--ATTNTACCCCTTGTTTTTATTGCTTAAATTTCTTTACAGATATACTGT 718
consensus_7613#1      CCTAGCGACAGAATATAAGATACGGGAAAAATAATTCAACTATAATTTCGGATATACTGT 129
                      ***   *     **   *      *     **   * ** * *  ** * **********

consensus_7613#0      TGAACGAAGAAATACACATAGATTACTGTTAGACCTATGTGATCTACATCATATTCCCGT 778
consensus_7613#1      TGAACGAAGAAATACACATAGATTACTGTTAGACCTATGTGATCTACATCATATTCCCGT 189
                      ************************************************************

consensus_7613#0      CCCAAAATCAATTAAATTCTGTTTGTAGTTACTATTTAATATTAATTTACTACTTTTGTT 838
consensus_7613#1      CCCAAAATCAATTAAATTCTGTTTGTAGTTACTATTTAATATTAATTTACTACTTTTGTT 249
                      ************************************************************

consensus_7613#0      TTAAAGTATTCCTTTATTCTCATATATTATTTATTTAGTATTTTATTTTACTTGGTTGTT 898
consensus_7613#1      TTAAAGTATTCCTTTATTCTCATATATTATTTATTTAGTATTTTATTTTACTTGGTTGTT 309
                      ************************************************************

consensus_7613#0      TTTAATAACTCTTACAATTTCTGTTTCTTCTATTGGGATCACTCTTTTTTTTCTTCAATT 958
consensus_7613#1      TTTAATAACTCTTACAATTTCTGTTTCTTCTATTGGGATCACTCTTTTTTTTCTTCAATT 369
                      ************************************************************

consensus_7613#0      TTCGCAATTACTACACTAGATTTTATGAAGGCTGTGTATCTGTACCCTTTAAAATATTTA 1018
consensus_7613#1      TTCGCAATTACTACACTAGATTTTATGAAGGCTGTGTATCTGTACCCTTTAAAATATTTA 429
                      ************************************************************

consensus_7613#0      CATGAAAATATTGCATACTAATTATTAACCAGCTTCTTTAGTAATGTATTCCCATATTTA 1078
consensus_7613#1      CATGAAAATATTGCATACTAATTATTAACCAGCTTCTTTAGTAATGTATTCCCATATTTA 489
                      ************************************************************

consensus_7613#0      TATTATAAGCTTTATCATGTTATTGTTTTCAGGTATTTTTATATTTACAATTTATTTATA 1138
consensus_7613#1      TATTATAAGCTTTATCATGTTATTGTTTTCAGGTATTTTTATATTTACAATTTATTTATA 549
                      ************************************************************

consensus_7613#0      CTTATCAGGTCATTACTACAGTTGTCGTATTTTATATTTTATGACAATGTATATTCGTCA 1198
consensus_7613#1      CTTATCAGGTCATTACTACAGTTGTCGTATTTTATATTTTATGACAATGTATATTCGTCA 609
                      ************************************************************

consensus_7613#0      TCATTGTGTATTTGCTATAATGATATTCGCAACATTTTAAAATGATAAATTGTCTGTATA 1258
consensus_7613#1      TCATTGTGTATTTGCTATAATAATATTCGCAACATTTTAATATGATAAATTGTCTGTATA 669
                      ********************* ****************** *******************

consensus_7613#0      CGTTACGCAATACACTACATTTTCTTTATTTTATCCGATTTTCGCGAGATTCCCCGTAGT 1318
consensus_7613#1      CGTTACGCAATACACTAC------------------------------------------ 687
                      ******************                                          

consensus_7613#0      TTAATCGTATTAATAAAAAAGGCTTACAATTAGTTGTAGGAAAAAGTACCACACAAACTA 1378
consensus_7613#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7613#0      CCTGCAACAAGCAATACTTCACACCAAAGTTCAACGGCAACAGAAACTACAACAAGATCA 1438
consensus_7613#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7613#0      GGAAGAAGAGTACACTCCAGATAGGTACGTCACAACAACCATATTTATCTAGCCCAAATC 1498
consensus_7613#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7613#0      CTGAAATTGTTCTTATAACACAAAAATTCCTTATTTTTATTAGCTGTTC 1547
consensus_7613#1      -------------------------------------------------