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Schistosoma mansoni
cluster # 7627 cluster # 7627       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7627#0 length = 1647 sequences # 5  

consensusID : consensus_7627#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1647
fasta sequence
                              [AGAGACTGAATAGTAAATTATGTTATAAACATTTATTATATGTTCTCATAAAGATTAAATTTCTTTTTAATAATGGCTTCTCAACATTGTTCAATTCGTTTAATTCGTCAAGATACATCTATTCCATGGGGTTTTCGATTAGAAGGCGGTACTGATTTTGGTCATTCTATTACTATACAACATGTAAATCCTGGAAGTATAGCCGATTACAGTGGACTTCGGGCTGGTGATCATGTAGTACGAATTAATCAATCTGAAACTAAATGGATGAGACATGATGATGCGAAAATGGAGATCATACGATCAAGTAATGATTTAGAATTGTTTGTTCAACGTAGTGACATAGCAAATACATATACACATCAAAATAATTTTTCTCCATCACCAAAACATTCTTTAAGTAGATCACCAAAACCAGTTTCTCCACAACCAGTTAATCGACAAACTATTTGGCAACCTAAAATTGTTTCATCTGTTCAAATGTCACCAAATAATAGTCATAATAATCATCAAGCATATGGGACTCATGTTAATTTAGAGGCTACATCGCAAAATGAAGAGTCATCATCNTATCGGAGTTAAACACAATATCTCACCACTTCCATTTGGTCAATCACCACCGGCACCCGGAGAAAACGTACTAACAAAAGTCGGTGAGGGACGTTATAGAAAAATTAGCCACTCATCATAC-ATTCACCTATGGGTTNTATATAATCAAAAAAATAGAAATCAAACATTTGAAAGAACATTATCTAATGCTACAGGTAATCAACTTGATGGTGCAGCACCTCGAGTATCACCAACAACACCGCCATCAANGCATTGCGGATCATGTGGAGGTTTTATACGCGGTGTTTTTGTTAAAGTACAAGGTCGTATCCCAATGCATCCTGAATGCCTTAAATGTTGTAAATGTGGAATAGGTTTACGCAATATTGGTTATTTCTACATTAAAGAACAATTATATTGTGAAACTCATGCTAAACAGGCTGCACCACCTCCTGAACCTGGCATGAAAGCTGTTGTTGTTTATAAATAACAGGTGAACTTTGAAAAAAAAAATAATAATAATTTCAGTTCTATAAAAGATATTTAATACCCAATTATTTCCTGGCAACAAAATGTTTAGTTTATAAAATTTGTTACTAAAATCACTAGAATTAGTTTAAAATTGGATATTATGTAAAGCCATCTTAACTCTCATCATCAGTTGGTATGTATATTAAATTATAACTTATATAACTTTAAATGATATGAAATAAATATCTACAATTTATTATACCCCTTCTGTTTGCTTTGAGAAGAAAAACAACAAANAAAGCTCTCTTCCCGATTATCAGTCAATTTTTTTTGGGGGGGATTCAAGGAAATATTTACAACCTTTCTAGATGTTTCATTCTAATTATTCTGTAGTTTACTTAATTATCTTCAATAATATTCATCATTAATGATCGTAATTATAAAATTGTAGTTGTTTAACTAATCAGAAATTGATTTTATTGATTAGATTATTGTTAATTGCGATCAATTTATGAACCTTTTAAATATTGATTGTGTATCCGGTAATAGAATCATCAATTTAGTTTTATCAAAATTGTTATGACCATTTCAATGAAGATAAAAGAAAAGAAAGTATGTTTAAAAAAA]

[+] EMBL CD079988             [AGAGACTGAATAGTAAATTATGTTATAAACATTTATTATATGTTCTCATAAAGATTAAATTTCTTTTTAATAATGGCTTCTCAACATTGTTCAATTCGTTTAATTCGTCAAGATACATCTATTCCATGGGGTTTTCGATTAGAAGGCGGTACTGATTTTGGTCATTCTATTACTATACAACATGTAAATCCTGGAAGTATAGCCGATTACAGTGGACTTCGGGCTGGTGATCATGTAGTACGAATTAATCAATCTGAAACTAAATGGATGAGACATGATGATGCGAAAATGGAGATCATACGATCAAGTAATGATTTAGAATTGTTTGTTCAACGTAGTGACATAGCAAATACATATACACATCAAAATAATTTTTCTCCATCACCAAAACATTCTTTAAGTAGATCACCAAAACCAGTTTCTCCACAACCAGTTAATCGACAAACTATTTGGCAACCTAAAATTGTTTCATCTGTTCAAATGTCACCAAATAATAGTCATAATAATCATCAAGCATATGGGACTCATGTTAATTTAGAGGCTACATCGCAAAATGAAGAGTCATCATCNTATCGGAGTTAAACACAATATCTCACCACTTCCATTTGGTCAATCACCACCGGCACCCGGAGAAAACGTACTAACAAAAGTCGGTGAGGGACGTTATAGAAAAATTAGCCACTCATCATAC ATTCACCTATGGGTTNTATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD063647             [                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAATGGAGATCATACGATCAAGTAATGA NTAGAA TGTGTGTTCAACGTAGTGACATAGCAAATACATATACACATCAAAATAA TTTTCTCCATCACCAAAACATTCTTTAAGTAGATCACCAAAACCAGTTTCTCCACAACCAGTTAATCGACAAACTATTTGGCAACCTAAAATTGTTTCATCTGTTCAAATGTCACCAAATAATAGTCATAATAATCATCAAGCATATGGGACTCATGTTAATTTAGAGGCTACATCGCAAAATGAAGAGTCATCATC TATCGGAGTTAAACACAATATCTCACCACTTCCATTTGGTCAATCACCACCGGCACCCGGAGAAAACGTACTAACAAAAGTCGGTGAGGGACGTTATAGAAAAATTAGCCACTCATCATACAATTCACCTATGGGTT TATATAATCAAAAAAATAGAAATCAAACATTTGAAAGAACATTATCTAATGCTACAGGTAATCAACTTGATGGTGCAGCACCTCGAGTATCACCAACAACACCGCCATCAANGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD080296             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              aggctAACTTGATGGTGCAGCACCTCGAGTATCACCAACAACACCGCCATCAATGCATTGCGGATCATGTGGAGGTTTTATACGCGGTGTTTTTGTTAAAGTACAAGGTCGTATCCCAATGCATCCTGAATGCCTTAAATGTTGTAAATGTGGAATAGGTTTACGCAATATTGGTTATTTCTACATTAAAGAACAATTATATTGTGAAACTCATGCTAAACAGGCTGCACCACCTCCTGAACCTGGCATGAAAGCTGTTGTTGTTTATAAATAACAGGTGAACTTTGAAAAAAAAAATAATAATAATTTCAGTTCTATAAAAGATATTTAATACCCAATTATTTCCTGGCAACAAAATGTTTAGTTTATAAAATTTGTTACTAAAATCACTAGAATTAGTTTAAAATTGGATATTATGTAAAGCCATCTTAACTCTCATCATCAGTTGGTATGTATATTAAATTATAACTTATATAACTTTAAATGATATGAAATAAATATCTACAATTTATTATACCCCTTCTGTTTGCTTTGAGAAGAAAAACAACAAANAAAGCTCTCTTCCCGATTATCAGTCAATTTTTTTTGGGGGGGATTCAAGGAAATATTTACAACCTTTCTAGATGTTTCATTCTAATTATTCTGTAGTTTACTTAATTATCT                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD197835             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTATACGCGGTGTTTTTGTTAAAGTACAAGGTCGTATCCCAATGCATCCTGAATGCCTTAAATGTTGTAAATGTGGAATAGGTTTACGCAATATTGGTTATTTCTACATTAAAGAACAATTATATTGTGAAACTCATGCTAAACAGGCTGCACCACCTCCTGAACCTGGCATGAAAGCTGTTGTTGTTTATAAATAACAGGTGAACTTTGAAAAAAAAAATAATAATAATTTCAGTTCTATAAAAGATATTTAATACCCAATTATTTCCTGGCAACAAAATGTTTAGTTTATAAAATTTGTTACTAAAATCACTAGAATTAGTTTAAAATTGGATATTATGTAAAGCCATCTTAACTCTCATCATCAGTTGGTATGTATATTAAATTATAACTTATATAACTTTAAATGATATGAAATAAATATCTACAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD074214             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GAACTTTGAAAAAAAAAATAATAATAATTTCAGTTCTATAAAAGATATTTAATACCCAATTATTTCCTGGCAACAAAATGTTTAGTTTATAAAATTTGTTACTAAAATCACTAGAATTAGTTTAAAATTGGATATTATGTAAAGCCATTTTAACTTTCATCATCAGTTGGTATGTATATTAAATTATAACTTATATAACTTTAAATGATATGAAATAAATATTTACAATTTATTATACCCCTTCTGTTTGCTTTGAGAAGAAAAACAACAAAAAAAGCTTTTTTCCCGATTATCAGTCAATTTTTTTTGGGGGGGATTCAAGGAAATATTTACAACCTTTTTAGATGTTTCATTTTAATTATTCTGTAGTTTACTTAATTATTTTCAATAATATTCATCATTAATGATCGTAATTATAAAATTGTAGTTGTTTAACTAATCAGAAATTGATTTTATTGATTAGATTATTGTTAATTGCGATCAATTTATGAACCTTTTAAATATTGATTGTGTATCCGGTAATAGAATCATCAATTTAGTTTTATCAAAATTGTTATGACCATTTCAATGAAGATAAAAGAAAAGAAAGTATGTTTAAAAAAA]


>consensus_7627#0 AGAGACTGAATAGTAAATTATGTTATAAACATTTATTATATGTTCTCATAAAGATTAAAT TTCTTTTTAATAATGGCTTCTCAACATTGTTCAATTCGTTTAATTCGTCAAGATACATCT ATTCCATGGGGTTTTCGATTAGAAGGCGGTACTGATTTTGGTCATTCTATTACTATACAA CATGTAAATCCTGGAAGTATAGCCGATTACAGTGGACTTCGGGCTGGTGATCATGTAGTA CGAATTAATCAATCTGAAACTAAATGGATGAGACATGATGATGCGAAAATGGAGATCATA CGATCAAGTAATGATTTAGAATTGTTTGTTCAACGTAGTGACATAGCAAATACATATACA CATCAAAATAATTTTTCTCCATCACCAAAACATTCTTTAAGTAGATCACCAAAACCAGTT TCTCCACAACCAGTTAATCGACAAACTATTTGGCAACCTAAAATTGTTTCATCTGTTCAA ATGTCACCAAATAATAGTCATAATAATCATCAAGCATATGGGACTCATGTTAATTTAGAG GCTACATCGCAAAATGAAGAGTCATCATCNTATCGGAGTTAAACACAATATCTCACCACT TCCATTTGGTCAATCACCACCGGCACCCGGAGAAAACGTACTAACAAAAGTCGGTGAGGG ACGTTATAGAAAAATTAGCCACTCATCATACATTCACCTATGGGTTNTATATAATCAAAA AAATAGAAATCAAACATTTGAAAGAACATTATCTAATGCTACAGGTAATCAACTTGATGG TGCAGCACCTCGAGTATCACCAACAACACCGCCATCAANGCATTGCGGATCATGTGGAGG TTTTATACGCGGTGTTTTTGTTAAAGTACAAGGTCGTATCCCAATGCATCCTGAATGCCT TAAATGTTGTAAATGTGGAATAGGTTTACGCAATATTGGTTATTTCTACATTAAAGAACA ATTATATTGTGAAACTCATGCTAAACAGGCTGCACCACCTCCTGAACCTGGCATGAAAGC TGTTGTTGTTTATAAATAACAGGTGAACTTTGAAAAAAAAAATAATAATAATTTCAGTTC TATAAAAGATATTTAATACCCAATTATTTCCTGGCAACAAAATGTTTAGTTTATAAAATT TGTTACTAAAATCACTAGAATTAGTTTAAAATTGGATATTATGTAAAGCCATCTTAACTC TCATCATCAGTTGGTATGTATATTAAATTATAACTTATATAACTTTAAATGATATGAAAT AAATATCTACAATTTATTATACCCCTTCTGTTTGCTTTGAGAAGAAAAACAACAAANAAA GCTCTCTTCCCGATTATCAGTCAATTTTTTTTGGGGGGGATTCAAGGAAATATTTACAAC CTTTCTAGATGTTTCATTCTAATTATTCTGTAGTTTACTTAATTATCTTCAATAATATTC ATCATTAATGATCGTAATTATAAAATTGTAGTTGTTTAACTAATCAGAAATTGATTTTAT TGATTAGATTATTGTTAATTGCGATCAATTTATGAACCTTTTAAATATTGATTGTGTATC CGGTAATAGAATCATCAATTTAGTTTTATCAAAATTGTTATGACCATTTCAATGAAGATA AAAGAAAAGAAAGTATGTTTAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)