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Schistosoma mansoni
cluster # 7639 cluster # 7639       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7639#0 length = 1380 sequences # 5  

consensusID : consensus_7639#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1380
fasta sequence
                              [GTTGAGTGTACCGATTCCATATCTATATATTCATTTAAAGAAAGTGCGTAGTCATATTTTTCAACAATGCAGACCGAAAAAAAGAAGGTTGAGGTACCTCCTACTATGAAGTTTATATTGGGTGGAACTTCTGGAATGTGTGCTTCTGTTTGCGTTCAACCTTTGGACCTCGTCAAAAATAGGATGCAAATGAGCGGTATCGGAAGTGCTACTTCTGGTCAACGTAATAGTCTTCAGGTGCTTCTATCAGTTATTAAAAATGAAGGATTTTTGGCAATATACTCAGGTTTATCAGCTGGATTACTTCGTCAAGCCACCTACTCAACTGCACGTCTAGGCATGTATACAAATTTATTTGAACAATATACAAAGCGAAAAAAAGAATCTCCCAATTTCTTCACTAAAATAAGTATAGCTGTAACTGCTGGGATATGCGGCGCATTCATTGGTACACCAGCTGAAATTTGTCTTATCCGTATGACATCCGATGGCAGATTACCACCAGCAGAACGTCTCAATTATTCCAATGTATTCAATGCTCTAACAAGAATCGCTCGTGAAGAAGGAGTGTTAACATTGTGGCGGGGTGCAGTCCCAACTATGGGTCGAGCAGCTGTAGTTAATGGTGCACAATTAGCCACTTATTCTCAAGCCAAACAAAAACTTATTGAAATCGGTCATTTCACTGATGGCTTAGGTGTACATATAATGGCTAGTTTATTAAGTGGATTTACTACATCTGTTTTCTCTTTACCAATTGATATTGCTAAGACCAGAATTCAAAATATGAAAACTATTGATGGAAAACCAGAGTATAAAAATATGGGGGATGTTATTTTACGAGTAATACGAAATGAAGGTATTCCATCATTATGGAAAGGTTTTACACCATATTTCTTACGTATTGGACCTCATACAGTATTGACATTTATCTTTTTAGAACAATTAAATCGTTTATATATAAAACATATAATAGGTGATTCAAGTGGTCAACGTTCCGGTGGACTTTAGAAATTAATCAATTCTTCACTATTCTTATTATGTTTTCTAGTATCGATTAAAGCAATAGCATTCCTTATTGTATATAATTTGTGTATGCTCCATTTTTACTATCTATACATAAGGAATTATATATGTATGTATGTGTGTGTGTATTGCATAGTTAATTTTGAGTTTCCTAGTAGTGTTTTATTGTTTCCTATCATTTATTTGTTTTCACTTCAAAATTTTGATTGCAATATTTATCTTAGATGATATTTAAATGTTACAATGATTCAATTTACCTATCGAAAGTTTTTGTTTATGCAATTCGTTTCACTTTCATTTGTGATTCAATGTTTAATTTTTATTCTATCTCTGTGTAAGTGCATATAATACAAT]

[+] EMBL CD079078             [GTTGAGTGTACCGATTCCATATCTATATATTCATTTAAAGAAAGTGCGTAGTCATATTTTTCAACAATGCAGACCGAAAAAAAGAAGGTTGAGGTACCTCCTACTATGAAGTTTATATTGGGTGGAACTTCTGGAATGTGTGCTTCTGTTTGCGTTCAACCTTTGGACCTCGTCAAAAATAGGATGCAAATGAGCGGTATCGGAAGTGCTACTTCTGGTCAACGTAATAGTCTTCAGGTGCTTCTATCAGTTATTAAAAATGAAGGATTTTTGGCAATATACTCAGGTTTATCAGCTGGATTACTTCGTCAAGCCACCTACTCAACTGCACGTCTAGGCATGTATACAAATTTATTTGAACAATATACAAAGCGAAAAAAAGAATCTCCCAATTTCTTCACTAAAATAAGTATAGCTGTAACTGCTGGGATATGCGGCGCATTCATTGGTACACCAGCTGAAATTTGTCTTATCCGTATGACATCCGATGGCAGATTACCACCAGCATAACGTCTCAATTATTCCAATGTATTCAATGCTCTATCAAGAATCGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD063722             [                                                                                                                                                                                                                                                       CAGTTATTAAAAATGAAGGATTTTTGGCAATATACTCAGGTTTATCAGCTGGATTACTTCGTCAAGCCACCTACTCAACTGCACGTTTAGGCATCTATACAAATTTATTTGAACAATATACAAAGCGAAAAAAAGAATCTCCCAATTTCTTCACTAAAATAAGTATAGCTGTAACTGCTGGGATATGCGGCGCATTCATTGGTACACCAGCTGAAATTTGTCTCATCCGTATGACATCCGATGGCAGATTACCACCAGCAGAACGTCTCAATTATTCCAATGTATTCAATGCTCTAACAAGAATCGCTCGTGAAGAAGGAGTGTTAACATTCTGGCGGGTTGCAGTCACAACTATGGGTCGAGCAGCTGTAGTTAATGGTGCACAATTAGCCACTTATTCTCAAGCCAAACAAAAACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD189674             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CGGCGCATTCATTGGTACACCAGCTG AATTGTTCTTATCCGTATGACATCCGATGGCAGATACCCACCAGCAGAACGTCTCAATTATTCCAATGTATTCAATGCTCTAACAAGAATCGCTCGTGAAGAAGGAGTGTTAACATTGTGGCGGGGTGCGGTCCCAACTATGGGTCGAGCAGCTGTAGTTAATGGTGCACAATTAGCCACTTATTCTCAAGCCAAACAAAAACTTATTGAAATCGGTCATTTCACTGATGGCTTAGGTGTACATATAATGGCTAGTTTATTAAGTGGATTTACTACATCTGTTTTCTCTTTACCAATTGATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD191637             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TCTAACAAGAATCGCTCGTGAAGAAGGAGTGTTAACATTGTGGCGGGGTGCAGTCCCAACTATGGGTCGAGCAGCTGTAGTTAATGGTGCACAATTAGCCACTTATTCTCAAGCCAAACAAAAACTTATTGAAATCGGTCATTTCACTGATGGCTTAGGTGTACATATAATGGCTAGTTTATTAAGTGGATTTACTACATCTGTTTTCTCTTTACCAATTGATATTGCTAAGACCAGAATTCAAAATATGAAAACTATTGATGGAAAACCAGAGTATAAAAATATGGGGGATGTTATTTTACGAGTAATACGAAATGAAGGTATTCCATCATTATGGAAAGGTTTTACACCATATTTCTTACGTATTGGACCTCATACAGTATTGACATTTATCTTTTTAGAACAATTAAATCGTTTATATATAAAACATATAATAGGTGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD073532             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CGAAATGAAGGTATTCCATCATTATGGAAAGGTTTTACACCATATTTCTTACGTATTGGACCTCATACAGTATTGACATTTATCTTTTTAGAACAATTAAATCGTTTATATATAACACATATAATAGGTGATTCAAGTGGTCAACGTTCCGGTGGACTTTAGAAATTAATCAATTCTTCACTATTCTTATTATGTTTTCTAGTATCGATTAAAGCAATAGCATTCCTTATTGTATATAATTTGTGTATGCTCCATTTTTACTATCTATACATAAGGAATTATATATGTATGTATGTGTGTGTGTATTGCATAGTTAATTTTGAGTTTCCTAGTAGTGTTTTATTGTTTCCTATCATTTATTTGTTTTCACTTCAAAATTTTGATTGCAATATTTATCTTAGATGATATTTAAATGTTACAATGATTCAATTTACCTATCGAAAGTTTTTGTTTATGCAATTCGTTTCACTTTCATTTGTGATTCAATGTTTAATTTTTATTCTATCTCTGTGTAAGTGCATATAATACAAT]


>consensus_7639#0 GTTGAGTGTACCGATTCCATATCTATATATTCATTTAAAGAAAGTGCGTAGTCATATTTT TCAACAATGCAGACCGAAAAAAAGAAGGTTGAGGTACCTCCTACTATGAAGTTTATATTG GGTGGAACTTCTGGAATGTGTGCTTCTGTTTGCGTTCAACCTTTGGACCTCGTCAAAAAT AGGATGCAAATGAGCGGTATCGGAAGTGCTACTTCTGGTCAACGTAATAGTCTTCAGGTG CTTCTATCAGTTATTAAAAATGAAGGATTTTTGGCAATATACTCAGGTTTATCAGCTGGA TTACTTCGTCAAGCCACCTACTCAACTGCACGTCTAGGCATGTATACAAATTTATTTGAA CAATATACAAAGCGAAAAAAAGAATCTCCCAATTTCTTCACTAAAATAAGTATAGCTGTA ACTGCTGGGATATGCGGCGCATTCATTGGTACACCAGCTGAAATTTGTCTTATCCGTATG ACATCCGATGGCAGATTACCACCAGCAGAACGTCTCAATTATTCCAATGTATTCAATGCT CTAACAAGAATCGCTCGTGAAGAAGGAGTGTTAACATTGTGGCGGGGTGCAGTCCCAACT ATGGGTCGAGCAGCTGTAGTTAATGGTGCACAATTAGCCACTTATTCTCAAGCCAAACAA AAACTTATTGAAATCGGTCATTTCACTGATGGCTTAGGTGTACATATAATGGCTAGTTTA TTAAGTGGATTTACTACATCTGTTTTCTCTTTACCAATTGATATTGCTAAGACCAGAATT CAAAATATGAAAACTATTGATGGAAAACCAGAGTATAAAAATATGGGGGATGTTATTTTA CGAGTAATACGAAATGAAGGTATTCCATCATTATGGAAAGGTTTTACACCATATTTCTTA CGTATTGGACCTCATACAGTATTGACATTTATCTTTTTAGAACAATTAAATCGTTTATAT ATAAAACATATAATAGGTGATTCAAGTGGTCAACGTTCCGGTGGACTTTAGAAATTAATC AATTCTTCACTATTCTTATTATGTTTTCTAGTATCGATTAAAGCAATAGCATTCCTTATT GTATATAATTTGTGTATGCTCCATTTTTACTATCTATACATAAGGAATTATATATGTATG TATGTGTGTGTGTATTGCATAGTTAATTTTGAGTTTCCTAGTAGTGTTTTATTGTTTCCT ATCATTTATTTGTTTTCACTTCAAAATTTTGATTGCAATATTTATCTTAGATGATATTTA AATGTTACAATGATTCAATTTACCTATCGAAAGTTTTTGTTTATGCAATTCGTTTCACTT TCATTTGTGATTCAATGTTTAATTTTTATTCTATCTCTGTGTAAGTGCATATAATACAAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)