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Schistosoma mansoni
cluster # 764 cluster # 764       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_764#0 length = 546 sequences # 2  

consensusID : consensus_764#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 546
fasta sequence
                              [TTTATTAATTAAGATTCCAAATATCACTCTGATGTTATTGCGAACTTAGTTGTGTAATGACAGTTACTGAGTGAGTTCAGGATGTTGACACTGATATTTTGCCACAAATAATAAAAGTCTCATCTAAATATCTCTTGTATTGATAGAAGCTGTCGTTGTTGGTCTAAGTTTAGTGTTTTATATATACATTGTACAATCGCATTTATAGTTAAATTTACTTGCTAAAATAGTAAATAAAATGAAATAGGACATTTCCTCTGATTTGCTTTTTTCCTAATTTTAGGAGGAGTTTAATCCTTATCCAGCAACACTTATGTCGCTCACCATTCTCCAACAGTCTGCACGGAAGAGATCGGAAGTAAGTCTTCAACTCCAGATAATATTAAAAAGCATTTGAATCAAGTCAATTTACAGGGAAACAGTTAGTTTGATTTTAGGTTTCCGAGATCACCAGTTAAATTGACTGAGATAATGATATTTTATTTGAGTGATCTCTGACCATCGTAGTCAGTGAGG-AAGGACATAAGCTTCATTGTGATAACCTCA]

[+] EMBL CD185602             [TTTATTAATTAAGATTCCAAATATCACTCTGATGTTATTGCGAACTTAGTTGTGTAATGACAGTTACTGAGTGAGTTCAGGATGTTGACACTGATATTTTGCCACAAATAATAAAAGTCTCATCTAAATATCTCTTGTATTGATAGAAGCTGTCGTTGTTGGTCTAAGTTTAGTGTTTTATATATACATTGTACAATCGCATTTATAGTTAAATTTACTTGCTAAAATAGTAAATAAAATGAAATAGGACATTTCCTCTGATTTGCTTTTTTCCTAATTTTAGGAGGAGTTTAATCCTTATCCAGCAACACTTATGTCGCTCACCATTCTCCAACAGTCTGCACGGAAGAGATCGGAAGTAAGTCTTCAACTCCAGATAATATTAAAAAGCATTTGAATCAAGTCAATTTACAGGGAAACAGTTAGTTTGATTTTAGGTTTCCGAGATCACCAGTTAAATTGACTGAGATAATGATATTTTATTTGAGTGATCTCTGACCATCGTAGTCAGTGAGG AAGGACATAAGCTTCATTGTGATAACCTCA]
[+] EMBL CD185464             [TTTATTAATTAAGATTCCAAATATCACTCTGATGTTATTGCGAACTTAGTTGTGTAATGACAGTTACTGAGTGAGTTCAGGATGTTGACACTGATATTTTGCCACAAATAATAAAAGTCTCATCTAAATATCTCTTGTATTGATAGAAGCTGTCGTTGTTGGTCTAAGTTTAGTGTTTTATATATACATTGTACAATCGCATTTATAGTTAAATTTACTTGCTAAAATAGTAAATAAAATGAAATAGGACATTTCCTCTGATTTGCTTTTTTCCTAATTTTAGGAGGAGTTTAATCCTTATCCAGCAACACTTATGTCGCTCACCATTCTCCAACAGTCTGCACGGAAGAGATCGGAAGTAAGTCTTCAACTCCTGATAATATTAAAAAGCATTTGAATCAAGTCAATTTACAGGGAAACAGTAAGTTTGATTTTAGGTTTCCGAGATCACCAGTTAAATTGACTGAGATAATGATATTTTATTTGAGTGATCTCTGACCATCGTAGTCAGTGAGGAAAGGACAT AGCTNCATTGTG         ]


>consensus_764#0 TTTATTAATTAAGATTCCAAATATCACTCTGATGTTATTGCGAACTTAGTTGTGTAATGA CAGTTACTGAGTGAGTTCAGGATGTTGACACTGATATTTTGCCACAAATAATAAAAGTCT CATCTAAATATCTCTTGTATTGATAGAAGCTGTCGTTGTTGGTCTAAGTTTAGTGTTTTA TATATACATTGTACAATCGCATTTATAGTTAAATTTACTTGCTAAAATAGTAAATAAAAT GAAATAGGACATTTCCTCTGATTTGCTTTTTTCCTAATTTTAGGAGGAGTTTAATCCTTA TCCAGCAACACTTATGTCGCTCACCATTCTCCAACAGTCTGCACGGAAGAGATCGGAAGT AAGTCTTCAACTCCAGATAATATTAAAAAGCATTTGAATCAAGTCAATTTACAGGGAAAC AGTTAGTTTGATTTTAGGTTTCCGAGATCACCAGTTAAATTGACTGAGATAATGATATTT TATTTGAGTGATCTCTGACCATCGTAGTCAGTGAGGAAGGACATAAGCTTCATTGTGATA ACCTCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)