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Schistosoma mansoni
cluster # 7640 cluster # 7640       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7640#0 length = 1105 sequences # 5  
consensusID : consensus_7640#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1105
fasta sequence 
                              [CTGTCGAGGATCTTAATTAGGGTTGACGCCTATCCATTTCTGTTAGTAGACTCGCAAAATGACTCATTAGTTTATGGGTTACGCAATTTTCATGAAGTAAATCCTCTTTAAATCAATCATATGAACATTCATAAAACAAATACGATATAGTAAGCAAAGATGGATACGCACAGGTTGCACATATGCCAATTAGAGACTGACCAGTTGCAGTCCTAAAAACATCAATGGGAAGATCCAAAAAAAACAATACTAAGCAAATACGATATAGTTTTAAAATAAATGGGGATTTCTCAATTTTGTCAGTCTTCTTTTACATTCCATTTTATTATACATTTACGATAAACAACCACCCAAAAAGCGTACAGATTTCTATACATTTTGTTTTTTCCTTCAGCTATTGCACATACAGGACCTGTGCTAGGCCTCAAATTCTCATCAGATGGCTTACATTTAATTTCATGNNGGGGGGTTCCGGTTTAACAGTAAATTCTGCATCTCTTCGTCTTTGGACGCCTGGTCCTGGTGATTGTGATCAATCATCACATATTCCTAGATTGCGTCCCGTAAACTTCGGGAACATAGTTCTCAACTCAGAAAGTGACCAACTTTTTGACGCTAGGAATCAAACTTTCACAAGTTCTAATTCCTCAGGAAGTGGGAATCAGAGTCCACAATCGTCTGTCTTACCAATAAGATTGGATACCACACACGGGTCAATAGGCGATTTGTGGGGAGCCTCGTCGTTATGTATTTTTGTCCCTGTAAAAAACCGCTTATTAATATCTTCAGCGTCTAAATACGACACATCGACTAAAATTATAACGCGACACTTTTCAAAAATACGTGCATGTGTTTGGAATGATCGTCATTTAGAATTGTATACCTGCGGAGCTGATGGAAATCTGTTTACATGGCCCATTCTTCCTCTTTCAAGCAACAATGTGATTGATGATGATCAATTTTAATTTATACATCTTAGTATTTTGTAAATAAACATGTATAGTGATGATTGAAATCTTATAATTAACCATTGCATACTTTAACTTGTGTTGTTATTATCATTACTGAATATGAATCAGATCACCAGTTAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL CD082076             [CTGTCGAGGATCTTAATTAGGGTTGACGCCTATCCATTTCTGTTAGTAGACTCGCAAAATGACTCATTAGTTTATGGGTTACGCAATTTTCATGAAGTAAATCCTCTTTAAATCAATCATATGAACATTCATAAAACAAATACGATATAGTAAGCAAAGATGGATACGCACAGGTTGCACATATGCCAATTAGAGACTGACCAGTTGCAGTCCTAAAAACATCAATGGGAAGATCCAAAAAAAACAATACTAAGCAAATACGATATAGTTTTAAAATAAATGGGGATTTCTCAATTTTGTCAGTCTTCTTTTACATTCCATTTTATTATACATTTACGATAAACAACCACCCAAAAAGCGTACAGATTTCTATACATTTTGTTTTTTCCTTCAGCTATTGCACATACAGGACCTGTGCTAGGCCTCAAATTCTCATCAGATGGCTTACATTTAATTTCATGNNGGGGGGTTCCGGTTTAACAGTAAATTCTGCATCTCTTCGTCTTTGGACGCCTGGTCCTGGTGATTGTGATCAATCATCACATATTCCTAGATTGCGTCCCGTANACTTCGGGAACATAGTTCTCAACTCAGAAAGTGACCAACTNTTTGACGCTAGGAATCAAACTTTCACAAGTTCTAATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD146343             [                                                                                                                                                                                                                                            cAAAAAAACAATACTAAGCAAATACGATATAGTTTTAAAATAAATGGGGATTTCTCAATTTTGTCAGTCTTCTTTTACATTCCATTTTATTATACATTTACGATAAACAACCACCCAAAAAGCGTACAGATTTCTATACATTTTGTTTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD075691             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTAATTTCATG  GGGGGGTTCCGGTTTAACAGTAAATTCTGCATCTCTTCGTCTTTGGACGCCTGGTCCTGGTGATTGTGATCAATCATCACATATTCCTAGATTGCGTCCCGTAAACTTCGGGAACATAGTTCTCAACTCAGAAAGTGACCAACTTTTTGACGCTAGGAATCAAACTTTCACAAGTTCTAATTCCTCAGGAAGTGGGAATCAGAGTCCACAATCGTCTGTCTTACCAATAAGATTGGATACCACACACGGGTCAATAGGCGATTTGTGGGGAGCCTCGTCGTTATGTATTTTTGTCCCTGTAAAAAACCGCTTATTAATATCTTCAGCGTCTAAATACGACACATCGACTAAAATTATAACGCGACACTTTTCAAAAATACGTGCATGTGTTTGGAATGATCGTCATTTAGAATTGTATACCTGCGGAGCTGATGGAAATCTGTTTACATGGCCCATTCTTCCTCTTTCAAGCAACAATGTGATTGATGATGATCAATTTTAATTTATACATCTTAGTATTTTGTAAATAAACATGTATAGTGATGATTGAAATCTTATAATTAACCATT                                                                         ]
[-] EMBL CD077097             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TGGACGCCTGGTCCTGGTGATTGTGATCAATCATCACATATTCCTAGATTGCGTCCCGTAAACTTCGGGAACATAGTTCTCAACTCAGAAAGTGACCAACTTTTTGACGCTAGGAATCAAACTTTCACAAGTTCTAATTCCTCAGGAAGTGGGAATCAGAGTCCACAATCGTCTGTCTTACCAATAAGATTGGATACCACACACGGGTCAATAGGCGATTTGTGGGGAGCCTCGTCGTTATGTATTTTTGTCCCTGTAAAAAACCGCTTATTAATATCTTCAGCGTCTAAATACGACACATCGACTAAAATTATAACGCGACACTTTTCAAAAATACGTGCATGTGTTTGGAATGATCGTCATTTAGAATTGTATACCTGCGGAGCTGATGGAAATCTGTTTACATGGCCCATTCTTCCTCTTTCAAGCAACAATGTGATTGATGATGATCAATTTTAATTTATACATCTTAGTATTTTGTAAATAAACATGTATAGTGATGATTGAAATCTTATAATTAACCATT                                                                         ]
[-] EMBL AI395343             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTTATGTAATTNTGTCCCTGTAAAAAACCGCTTATTAATATCTTCAGCGTCTAAATACGACACATCGACTAAAATTATAACGCGACACTTTTCAAAAATACGTGCATGTGTTTGGAATGATCGTCATTTAGAATTGTATACCTGCGGAGCTGATGGAAATCTGTTTACATGGCCCATTCTTCCTCTTTCAAGCAACAATGTGATTGATGATGATCAATTTTAATTTATACATCTTAGTATTTTGTAAATAAACATGTATAGTGATGATTGAAATCTTATAATTAACCATTGCATACTTTAACTTGTGTTGTTATTATCATTACTGAATATGAATCAGATCACCAGTTAAAAAAAAAAAAAAAA]




>consensus_7640#0
CTGTCGAGGATCTTAATTAGGGTTGACGCCTATCCATTTCTGTTAGTAGACTCGCAAAAT
GACTCATTAGTTTATGGGTTACGCAATTTTCATGAAGTAAATCCTCTTTAAATCAATCAT
ATGAACATTCATAAAACAAATACGATATAGTAAGCAAAGATGGATACGCACAGGTTGCAC
ATATGCCAATTAGAGACTGACCAGTTGCAGTCCTAAAAACATCAATGGGAAGATCCAAAA
AAAACAATACTAAGCAAATACGATATAGTTTTAAAATAAATGGGGATTTCTCAATTTTGT
CAGTCTTCTTTTACATTCCATTTTATTATACATTTACGATAAACAACCACCCAAAAAGCG
TACAGATTTCTATACATTTTGTTTTTTCCTTCAGCTATTGCACATACAGGACCTGTGCTA
GGCCTCAAATTCTCATCAGATGGCTTACATTTAATTTCATGNNGGGGGGTTCCGGTTTAA
CAGTAAATTCTGCATCTCTTCGTCTTTGGACGCCTGGTCCTGGTGATTGTGATCAATCAT
CACATATTCCTAGATTGCGTCCCGTAAACTTCGGGAACATAGTTCTCAACTCAGAAAGTG
ACCAACTTTTTGACGCTAGGAATCAAACTTTCACAAGTTCTAATTCCTCAGGAAGTGGGA
ATCAGAGTCCACAATCGTCTGTCTTACCAATAAGATTGGATACCACACACGGGTCAATAG
GCGATTTGTGGGGAGCCTCGTCGTTATGTATTTTTGTCCCTGTAAAAAACCGCTTATTAA
TATCTTCAGCGTCTAAATACGACACATCGACTAAAATTATAACGCGACACTTTTCAAAAA
TACGTGCATGTGTTTGGAATGATCGTCATTTAGAATTGTATACCTGCGGAGCTGATGGAA
ATCTGTTTACATGGCCCATTCTTCCTCTTTCAAGCAACAATGTGATTGATGATGATCAAT
TTTAATTTATACATCTTAGTATTTTGTAAATAAACATGTATAGTGATGATTGAAATCTTA
TAATTAACCATTGCATACTTTAACTTGTGTTGTTATTATCATTACTGAATATGAATCAGA
TCACCAGTTAAAAAAAAAAAAAAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)