Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7643 cluster # 7643       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7643#0 length = 795 sequences # 5  
consensusID : consensus_7643#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 795
fasta sequence 
                              [TCGATAAGATGCTTGACTCCATCGACTTTCTAATGATAATTTCTCTGTATATAAAATTGCTTTTTGCCAATCTGCTTGTAATGCATAACACCATATTAATTCCCAATAACAAAGATGATGATAATGTATCCAATCTGATTGTGAATTTATTGAACGTTGAAATAATATAATAGCCTTCTGTAAATTTCCAGATATTTCTTCTAAACGACCAGCTAATAATAAGAATATAGCACTATTTGGATATATAATAGACCAATAATCTAATAATTCACGAGCTTCTTTCATATGCTCTGGTTGTTCAGAAGATACGCTGACAACACTGTCACCTAACATATGAGTAGCATATAAATCATATGCTAATAATAATAGAGCACATAATGGACCACGTAATGAATCTTTCATTCCTGCACCCAATCTTAACTGTTCTAAACCGAATTGGCGATCTCCAGAGAATCCAACAAATTCCAATAATTTTAAGACACTTCTAGGAAGCATAGAGATCATTAAATTAAAAGCTCCAACACCTAAATGTACACCACTTTCAAAAGCTGATTTACTAATTTCATTTTGCCAATTTCGATATTTCAATATTCTCCAACATATACGATAACATTTATAACATTGTCTTATCTTTAATGAACATTTGATAAGACTTGTTAATTTTTCATCTTGTAACATTGAAAGAAATGCTAATTGAAGTAAACCTTCTGCATAACAAAGTTCAGCATGAGCCTGTTCATCAGTATATAAACCATAAATGGTATTACGACTTTTTTCTGTTTGTTTAATAAATGT]

[+] EMBL CD121335             [TCGATAAGATGCTTGACTCCATCGACTTTCTAATGATAATTTCTCTGTATATAAAATTGCTTTTTGCCAATCTGCTTGTAATGCATAACACCATATTAATTCCCAATAACAAAGATGATGATAATGTATCCAATCTGATTGTGAATTTATTGAACGTTGAAATAATATAATAGCCTTCTGTAAATTTCCAGATATTTCTTCTAAACGACCAGCTAATAATAAGAATATAGCACTATTTGGATATATAATAGACCAATAATCTAATAATTCACGAGCTTCTTTCATATGCTCTGGTTGTTCAGAAGATACGCTGACAACACTGTCACCTAACATATGAGTAGCATATAAATCATATGCTAATAATAATAGAGCACATAATGGACCACGTAATGAATCTTTCATTCCTGCACCCAATCTTAACTGTTCTAAAGCGAATTGGCGATCTCCAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD158253             [        ATGCTTGACTCCATCGACTTTCTAATGATAATTTCTCTGTATATAAAATTGCTTTTTGCCAATCTGCTTGTAATGCATAACACCGTATTAATTCCCAATAACAAAGATGATGATAATGTATCCAATCTGATTGTGAATTTATTGAACGTTGAAATAATATAATAGCCTTCTGTAAATTTCCAGATATTTCTTCTAAACGACCAGCTAATAATAAGAATATAGCACTATTTGGATATATAATAGACCAATAATCTAATAATTCACGAGCTTCTTTCATATGCTCTGGTTGTTCAGAAGATACGCTGACAACACTGTCACCTAACATATGAGTAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD121346             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AATAATAATAGAGCACATAATGGACCACGTAATGAATCTTTCATTCCTGCACCCAATCTTAACTGTTCTAAACCGAATTGGCGATCTCCAGAGAATCCAACAAATTCCAATAATTGTAAGACACTTCTAGGAAGCATAGAGATCATTAAATTAAAAGCTCCAACACCTAAATGTACACCACTTTCAAAAGCTGATTTACTAATTTCATTTTGCCAATTTCGATATTTCAATATTCTCCAACATATACGATAACATTTATAACATTGTCTTATCTTTAATGAACATTTGATAAGACTTGTTAATTTTTCATCTTGTAACATTGAAAGAAATGCTAATTGAAGTAAACCTTCTGCATAACAAAGTTCAGCATGAGCCTGTTCATCAGTATATAAACCATAAATGGTATTACGACTTTTTTCTGTTTGTTTAATAAATGT]
[-] EMBL CD121348             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ACATAATGGACCACGTAATGAATCTTTCATTCCTGCACCCAATCTTAACTGTTCTAAACCGAATTGGCGATCTCCAGAGAATCCAACAAATTCCAATAATTTTAAGACACTTCTAGGAAGCATAGAGATCATTAAATTAAAAGCTCCAACACCTAAATGTACACCACTTTCAAAAGCTGATTTACTAATTTCATTTTGCCAATTTCGATATTTCAATATTCTCCAACATATACGATAACATTTATAACATTGTCTTATCTTTAATGAACATTTGATAAGACTTGTTAATTTTTCATCTTGTAACATTGAAAGAAATGCTAATTGAAGTAAACCTTCTGCATAACAAAGTTCAGCATGAGCCTGTTCATCAGTATATAAACCATAAATGGTATTACGACTTTTTTCTGTTTGTTTAATAAATGT]
[-] EMBL CD098016             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AATTGGCGATCTCCAGAGAATCCAACAAATGGCAATAATTTTAAGACACTTCTAGGAAGCATAGAGATCATTAAATTAAAAGCTCCAACACCTAAATGTACACCACTTTCAAAAGCTGATTTACTAATTTCATTTTGCCAATTTCGATATTTCAATATTCTCCAACATATACGATAACATTTATAACATTGTCTTATCTTTAATGAACATTTGATAAGACTTGTTAATTTTTCATCTTGTAACATTGAAAGAAATGCTAATTGAAGTAAACCTTCTGCATAACAAAGTTCAGCATGAGCCTGTTCATCAGTATATAAACCATAAATGGTATTACGACTTTTTTCTGTTTGT           ]




>consensus_7643#0
TCGATAAGATGCTTGACTCCATCGACTTTCTAATGATAATTTCTCTGTATATAAAATTGC
TTTTTGCCAATCTGCTTGTAATGCATAACACCATATTAATTCCCAATAACAAAGATGATG
ATAATGTATCCAATCTGATTGTGAATTTATTGAACGTTGAAATAATATAATAGCCTTCTG
TAAATTTCCAGATATTTCTTCTAAACGACCAGCTAATAATAAGAATATAGCACTATTTGG
ATATATAATAGACCAATAATCTAATAATTCACGAGCTTCTTTCATATGCTCTGGTTGTTC
AGAAGATACGCTGACAACACTGTCACCTAACATATGAGTAGCATATAAATCATATGCTAA
TAATAATAGAGCACATAATGGACCACGTAATGAATCTTTCATTCCTGCACCCAATCTTAA
CTGTTCTAAACCGAATTGGCGATCTCCAGAGAATCCAACAAATTCCAATAATTTTAAGAC
ACTTCTAGGAAGCATAGAGATCATTAAATTAAAAGCTCCAACACCTAAATGTACACCACT
TTCAAAAGCTGATTTACTAATTTCATTTTGCCAATTTCGATATTTCAATATTCTCCAACA
TATACGATAACATTTATAACATTGTCTTATCTTTAATGAACATTTGATAAGACTTGTTAA
TTTTTCATCTTGTAACATTGAAAGAAATGCTAATTGAAGTAAACCTTCTGCATAACAAAG
TTCAGCATGAGCCTGTTCATCAGTATATAAACCATAAATGGTATTACGACTTTTTTCTGT
TTGTTTAATAAATGT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)