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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7649#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 865 fasta sequence
[AATCAACTTCTTGTATGCTGCACAGTGTATGTTCTTCAGTAAGAAATCTTAGGAAATCTTGTCGAAATTTGACTAATATCAATATGATTAACAAACAGCCTTCTGAATCCGATCTTCAGTTAGATTATATGCGATTCAACTTTCTGGCTTGGTCTATGGTCGCCACTAGTTGGTTTATTGACGTTTTAATTGTAAAAGTAAAAAGTCTCAATTATAATGATAATGGTGATGATAAGATAATGAAGACTATAACAACCAAAGAGATGAAAGATCGATCTGCAGAAGTATTTCAAGGCTTTAATGATGCTTTGTATTTATTGCATCAATTAGTTGATTATTTCAATATGCCTGAATCGAATTGGATTAGAGTAAAGTTACGAAATGCGGAAGCTGTTCATCGTTTGCTAACTGGAGCATGTCCGACTCGTGCACGATTCGCT-C-TCTTACAAAATTATAGTCTCTCTTGTTTAGATTCCTCTTCTGTTACAGGGAATATTAAAGATAATCCAAGCAAACTGGAAAATAGTGATATTTCCATTTCTAATGTATCTAACCATATTAGTAGTAATGGTCAGAATCCACTGGACTGTCATGATCATTTAAATGGAAATGTATCTGCAATAATTAATCGGTCGTCACAGAGAAATGGTATATTAGTACAATCACCGGGATGTTAAACGTATCTTTGTTCTTCGTCATTTCGAAAAGTTTTGCTATTATTATAAACAATCTTCTCATTAAGCAACGAATA-GATAATCAACTTCTTTTTCACAATAGCAAACAGTTTTCCAAATCTACTCTTTGTATGACAAACAATTT-TCTTCATTAAAGTCTTAGATTTCAGCCATTAAAACTCTTGCTTTCT]
[+] EMBL CD196932 [AATCAACTTCTTGTATGCTGCACAGTGTATGTTCTTCAGTAAGAAATCTTAGGAAATCTTGTCGAAATTTGACTAATATCAATATGATTAACAAACAGCCTTCTGAATCCGATCTTCAGTTAGATTATATGCGATTCAACTTTCTGGCTTGGTCTATGGTCGCCACTAGTTGGTTTATTGACGTTTTAATTGTAAAAGTAAAAAGTCTCAATTATAATGATAATGGTGATGATAAGATAATGAAGACTATAACAACCAAAGAGATGAAAGATCGATCTGCAGAGGTATTTCAAGGCTTTAATGATGCTTTGTATTTATTGCATCAATTAGTTGATTATTTCAATATGCCTGAATCGAATTGGATTAGAGTAAAGTTACGAAATGCGGAAGCTGTTCATCGTTTGCTAACTGGAGCATGTCCGACTCGTGCACGA ]
[-] EMBL CD197148 [ TTCAGTAAGAAATCTTAGGAAATCTTGTCGAAATTTGACTAATATCAATATGATTAACAAACAGCCTTCTGAATCCGATCTTCAGTTAGATTATATGCGATTCAACTTTCTGGCTTGGTCTATGGTCGCCACTAGTTGGTTTATTGACGTTTTAATTGTAAAAGTAAAAAGTCTCAATTATAATGATAATGGTGATGATAAGATAATGAAGACTATAACAACCAAAGAGATGAAAGATCGATCTGCAGAAGTATTTCAAGGCTTTAATGATGCTTTGTATTTATTGCATCAATTAGTTGATTATTTCAATATGCCTGAATCGAATTGGATTAGAGTAAAGTTACGAAATGCGGAAGCTGTTCATCGTTTGCTAACTGGAGCATGTCCGACTCGTGCACGATTCGCT C TCTTACAAAA ]
[+] EMBL CD196885 [ CGATCTGCAGAAGTATTTCAAGGCTTTAATGATGCTTTGTATTTATTGCATCAATTAGTTGATTATTTCAATATGCCTGAATCGAATTGGATTAGAGTAAAGTTACGAAATGCGGAAGCTGTTCATCGTTTGCTAACTGGAGCATGTCCGACTCGTGCACGATTCGCT C TCTTACAAAATTATAGTCTCTCTTGTTTAGATTCCTCTTCTGTTACAGGGAATATTAAAGATAATCCAAGCAAACTGGAAAATAGTGATATTTCCATTTCTAACGTATCTTACCATATTAGTAGTAATGGTCAGAATCCACTGGACTGTCATGATCATTTAAATGGAAATGTATCTGCAATAATTAATCGGTCGTCACAGAGAAATGGTATATTAGTACAATCACCGGGATGTTAAACGTATCT ]
[-] EMBL CD077101 [ CGAAATGCGGAAGCTGTTCATCGTTTGCTAACTGGAGCATGTCCGACTCGTGCACGATTCGCT C TCTTACAAAATTATAGTCTCTCTTGTTTAGATTCCTCTTCTGTTACAGGGAATATTAAAGATAATCCAAGCAAACTGGAAAATAGTGATATTTCCATTTCTAATGTATCTAACCATATTAGTAGTAATGGTCAGAATCCACTGGACTGTCATGATCATTTAAATGGAAATGTATCTGCAATAATTAATCGGTCGTCACAGAGAAATGGTATATTAGTACAATCACCGGGATGTTAAACGTATCTTTGTTCTTCGTCATTTCGAAAAGTTTTGCTATTATTATAAACAATCTTCTCATTAAGCAACGAATA GATAATCAACTTCTTTTTCACAATAGCAAACAGTTTTCCAAATCTACTCTTTGTATGACAAACAATTT TCTTCATTAAAGTCTTAG ]
[+] EMBL CD118650 [ CTGGAGCATGTCCGACTCGTGCACGATTCGCTACTTCTTACAAAATTATAGTCTCTCTTGTTTAGATTCCTCTTCTGTTACAGGGAATACTAAAGATAATCCAAGCAAACTGGAAAATAGTGATATTTCCATTTCTAATGTATCTAACCATATTAGTAGTAATGGTCAGAATCCACTGGACTGTCATGATCATTTAAATGGAAATGTATCTGCAATAATTAATCGGCCGTCACAGAGAAATGGTATATTAGTACAATCACCGGGATGTTAAACGTATCTTTGTTCTTCGTCATTTCGAAAAGTTCTGCTATTATTATAAACAATCTTCTCATTAAGCAACGAATACCATAATCAACTTCTTTTTCACAATACCCCACAGTTTTCCAAATCTACTCTTTGTATGACAAACAATTTCTCTTCATTACAGTCTTAGATTTCAGCCATTAAAACTCTTGCTTTCT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||