These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7649#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 865 fasta sequence [AATCAACTTCTTGTATGCTGCACAGTGTATGTTCTTCAGTAAGAAATCTTAGGAAATCTTGTCGAAATTTGACTAATATCAATATGATTAACAAACAGCCTTCTGAATCCGATCTTCAGTTAGATTATATGCGATTCAACTTTCTGGCTTGGTCTATGGTCGCCACTAGTTGGTTTATTGACGTTTTAATTGTAAAAGTAAAAAGTCTCAATTATAATGATAATGGTGATGATAAGATAATGAAGACTATAACAACCAAAGAGATGAAAGATCGATCTGCAGAAGTATTTCAAGGCTTTAATGATGCTTTGTATTTATTGCATCAATTAGTTGATTATTTCAATATGCCTGAATCGAATTGGATTAGAGTAAAGTTACGAAATGCGGAAGCTGTTCATCGTTTGCTAACTGGAGCATGTCCGACTCGTGCACGATTCGCT-C-TCTTACAAAATTATAGTCTCTCTTGTTTAGATTCCTCTTCTGTTACAGGGAATATTAAAGATAATCCAAGCAAACTGGAAAATAGTGATATTTCCATTTCTAATGTATCTAACCATATTAGTAGTAATGGTCAGAATCCACTGGACTGTCATGATCATTTAAATGGAAATGTATCTGCAATAATTAATCGGTCGTCACAGAGAAATGGTATATTAGTACAATCACCGGGATGTTAAACGTATCTTTGTTCTTCGTCATTTCGAAAAGTTTTGCTATTATTATAAACAATCTTCTCATTAAGCAACGAATA-GATAATCAACTTCTTTTTCACAATAGCAAACAGTTTTCCAAATCTACTCTTTGTATGACAAACAATTT-TCTTCATTAAAGTCTTAGATTTCAGCCATTAAAACTCTTGCTTTCT] [+] EMBL CD196932 [AATCAACTTCTTGTATGCTGCACAGTGTATGTTCTTCAGTAAGAAATCTTAGGAAATCTTGTCGAAATTTGACTAATATCAATATGATTAACAAACAGCCTTCTGAATCCGATCTTCAGTTAGATTATATGCGATTCAACTTTCTGGCTTGGTCTATGGTCGCCACTAGTTGGTTTATTGACGTTTTAATTGTAAAAGTAAAAAGTCTCAATTATAATGATAATGGTGATGATAAGATAATGAAGACTATAACAACCAAAGAGATGAAAGATCGATCTGCAGAGGTATTTCAAGGCTTTAATGATGCTTTGTATTTATTGCATCAATTAGTTGATTATTTCAATATGCCTGAATCGAATTGGATTAGAGTAAAGTTACGAAATGCGGAAGCTGTTCATCGTTTGCTAACTGGAGCATGTCCGACTCGTGCACGA ] [-] EMBL CD197148 [ TTCAGTAAGAAATCTTAGGAAATCTTGTCGAAATTTGACTAATATCAATATGATTAACAAACAGCCTTCTGAATCCGATCTTCAGTTAGATTATATGCGATTCAACTTTCTGGCTTGGTCTATGGTCGCCACTAGTTGGTTTATTGACGTTTTAATTGTAAAAGTAAAAAGTCTCAATTATAATGATAATGGTGATGATAAGATAATGAAGACTATAACAACCAAAGAGATGAAAGATCGATCTGCAGAAGTATTTCAAGGCTTTAATGATGCTTTGTATTTATTGCATCAATTAGTTGATTATTTCAATATGCCTGAATCGAATTGGATTAGAGTAAAGTTACGAAATGCGGAAGCTGTTCATCGTTTGCTAACTGGAGCATGTCCGACTCGTGCACGATTCGCT C TCTTACAAAA ] [+] EMBL CD196885 [ CGATCTGCAGAAGTATTTCAAGGCTTTAATGATGCTTTGTATTTATTGCATCAATTAGTTGATTATTTCAATATGCCTGAATCGAATTGGATTAGAGTAAAGTTACGAAATGCGGAAGCTGTTCATCGTTTGCTAACTGGAGCATGTCCGACTCGTGCACGATTCGCT C TCTTACAAAATTATAGTCTCTCTTGTTTAGATTCCTCTTCTGTTACAGGGAATATTAAAGATAATCCAAGCAAACTGGAAAATAGTGATATTTCCATTTCTAACGTATCTTACCATATTAGTAGTAATGGTCAGAATCCACTGGACTGTCATGATCATTTAAATGGAAATGTATCTGCAATAATTAATCGGTCGTCACAGAGAAATGGTATATTAGTACAATCACCGGGATGTTAAACGTATCT ] [-] EMBL CD077101 [ CGAAATGCGGAAGCTGTTCATCGTTTGCTAACTGGAGCATGTCCGACTCGTGCACGATTCGCT C TCTTACAAAATTATAGTCTCTCTTGTTTAGATTCCTCTTCTGTTACAGGGAATATTAAAGATAATCCAAGCAAACTGGAAAATAGTGATATTTCCATTTCTAATGTATCTAACCATATTAGTAGTAATGGTCAGAATCCACTGGACTGTCATGATCATTTAAATGGAAATGTATCTGCAATAATTAATCGGTCGTCACAGAGAAATGGTATATTAGTACAATCACCGGGATGTTAAACGTATCTTTGTTCTTCGTCATTTCGAAAAGTTTTGCTATTATTATAAACAATCTTCTCATTAAGCAACGAATA GATAATCAACTTCTTTTTCACAATAGCAAACAGTTTTCCAAATCTACTCTTTGTATGACAAACAATTT TCTTCATTAAAGTCTTAG ] [+] EMBL CD118650 [ CTGGAGCATGTCCGACTCGTGCACGATTCGCTACTTCTTACAAAATTATAGTCTCTCTTGTTTAGATTCCTCTTCTGTTACAGGGAATACTAAAGATAATCCAAGCAAACTGGAAAATAGTGATATTTCCATTTCTAATGTATCTAACCATATTAGTAGTAATGGTCAGAATCCACTGGACTGTCATGATCATTTAAATGGAAATGTATCTGCAATAATTAATCGGCCGTCACAGAGAAATGGTATATTAGTACAATCACCGGGATGTTAAACGTATCTTTGTTCTTCGTCATTTCGAAAAGTTCTGCTATTATTATAAACAATCTTCTCATTAAGCAACGAATACCATAATCAACTTCTTTTTCACAATACCCCACAGTTTTCCAAATCTACTCTTTGTATGACAAACAATTTCTCTTCATTACAGTCTTAGATTTCAGCCATTAAAACTCTTGCTTTCT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||