Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7653 cluster # 7653       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7653#0 length = 459 sequences # 5  

consensusID : consensus_7653#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 459
fasta sequence
                              [ACATAATTCACCAAGTAATTGATGTTAAATATCATAACAGAATTTAAATTGTTTAATGTACAGAATATAAATTAATCTAAAATGTACTAATAGTGTATATTATCAGCAGTATACATTTTTATAGTAATCTGATCACAATTTGACTTGTCATGAAATAAATCAATGGAATGTTTTTCAGTTCTAAAGGTAACTGAAAGAAAAATAGTAATGTTTCATACATCATGTCGGATTGAAATTAACATGAATTTTATTCAAATAAACAGTTTGGTTAAAGCGTTCCAATCACTGACACTTATTCCGATTAAACAAATGGTAAATATCTGTGCATACTGATTAATCGCTATAACTTAATGTGAATCAATTCAATAGCGTATGTACATAGGTGTTGTATCTCGAACTTAGAATTCTTAGTCTATCGCACGATACTTGAGCACTCGAACGCTAGAACCCTNCTAAGTC]

[+] EMBL CD179994             [ACATAATTCACCAAGTAATTGATGTTAAATATCATAACAGAATTTAAATTGTTTAATGTACAGAATATAAATTAATCTAAAATGTACTAATAGTGTATATTATCAGCAGTATACATTTTTATAGTAATCTGATCACAATTTGACTTGTCATGAAATAAATCAATGGAATGTTTTTCAGTTCTAAAGGTAACTGAAAGAAAAATAGTAATGTTTCATACATCATGTCGGATTGAAATTAACATGAATTTTATTCAAATAAACAGTTTGGTTAAAGCGTTCCAATCACTGACACTTATTCCGATTAAACAAATGGTAAATATCTGTGCATACTGATTAATCGCTATAACTTAATGTGAATCAATTCAATAGCGTATGTACATAGGTGTTGTATCTCGAACTTAGAATTCTTAGTCTATCGCACGATACTTGAGCACTCGAACGCTAGAACCCTNCTAAGTC]
[+] EMBL CD179863             [ACATAATTCACCAAGTAATTGATGTTAAATATCATAACAGAATTTAAATTGTTTAATGTACAGAATATAAATTAATCTAAAATGTACTAATAGTGTATATTATCAGCAGTATACATTTTTATAGTAATCTGATCACAATTTGACTTGTCATGAAATAAATCAATGGAATGTTTTTCAGTTCTAAAGGTAACTGAAAGAAAAATAGTAATGTTTCATACATCATGTCGGATTGAAATTAACATGAATTTTATTCAAATAAACAGTTTGGTTAAAGCGTTCCAATCACTGACACTTATNTCGATTAAAC AATGGTAAATATCTGTGCATACTGATTAATCGCTATAACT                                                                                                               ]
[+] EMBL CD179893             [ACATAATTCACCAAGTAATTGATGTTAAATATCATAACAGAATTTAAATTGTTTAATGTACAGAATATAAATTAATCTAAAATGTACTAATAGTGTATATTATCAGCAGTATACATTTTTATAGTAATCTGATCACAATTTGACTTGTCATGAAATAAATCAATGGAATGTTTTTCAGTTCTAAAGGTAACTGAAAGAAAAATAGTAATGTTTCATACATCATGTCGGATTGAAATTAACATGAATTTTATTCAAATAAACAGTTTGGTTAAAGCGTTCCAATCACTGACACTTATTCCGATTAAACAAATGG                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD179895             [ACATAATTCACCAAGTAATTGATGTTAAATATCATAACAGAATTTAAATTGTTTAATGTACAGAATATAAATTAATCTAAAATGTACTAATAGTGTATATTATCAGCAGTATACATTTTTATAGTAATCTGATCACAATTTGACTTGTCATGAAATAAATCAATGGAATGTTTTTCAGTTCTAAAGGTAACTGAAAGAAAAATAGTAATGTTTCATACATCATGTCGGATTGAAATTAACATGAATTTTATTCAAATAAACAGTTTGGTTAAAGCGTTCC ATCACTGACACTTATNTCGATTAAc                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD179902             [ACATAATTCACCAAGTAATTGATGTTAAATATCATAACAGAATTTAAATTGTTTAATGTACAGAATATAAATTAATCTAAAATGTACTAATAGTGTATATTATCAGCAGTATACATTTTTATAGTAATCTGATCACAATTTGACTTGTCATGAAATAAATCAATGGAATGTTTTTCAGTTCTAAAGGTAACTGAAAGAAAAATAGTAATGTTTCATACATCATGTCGGATTGAAATTAACATGAATTCTATTCAAATAAACAGTTTGGTTAAAGCGTTCCAATCACTGACACTTATTCC                                                                                                                                                                ]


>consensus_7653#0 ACATAATTCACCAAGTAATTGATGTTAAATATCATAACAGAATTTAAATTGTTTAATGTA CAGAATATAAATTAATCTAAAATGTACTAATAGTGTATATTATCAGCAGTATACATTTTT ATAGTAATCTGATCACAATTTGACTTGTCATGAAATAAATCAATGGAATGTTTTTCAGTT CTAAAGGTAACTGAAAGAAAAATAGTAATGTTTCATACATCATGTCGGATTGAAATTAAC ATGAATTTTATTCAAATAAACAGTTTGGTTAAAGCGTTCCAATCACTGACACTTATTCCG ATTAAACAAATGGTAAATATCTGTGCATACTGATTAATCGCTATAACTTAATGTGAATCA ATTCAATAGCGTATGTACATAGGTGTTGTATCTCGAACTTAGAATTCTTAGTCTATCGCA CGATACTTGAGCACTCGAACGCTAGAACCCTNCTAAGTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)