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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7660#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1058 fasta sequence
[CCCTCAGGCCANNGAATCGGCACGAGGCGGAATATCTAGATCGTGATTTATCTAATATCAATTTAAATGAATTAAAACAGAAAATGCAAGATAAAGCCAGATATTGTGAAAGTCGCCGAAATGTCCTTTTAGATCACGTACATAAAGGGTACGATAAAGGATTTTGGGAGCAATCCGATATTTGTTAGTGTGTTTGCTTAACTGTATGCCCATCCATTCACACGCACATAGAGTGTCACAGTCTTTGTTTCCATGTGTATAGTTTCTATTTTTGAATCACTATGATCTCGTTGATATCAATTTTTCTATTTTTCCTCGTTTATGCGTACCTCAATAGTTTTGCATATGTATATGCACTCTCACTAATATCAATGAAATATAAATGATGAAGACTTAACCAAGCCAGGTCATCATTATATGTTTATAGACCATTCTTTTTTCTATGACCCTAATCAGCAATTACGTACTGTTTGCATTCCTGAGTCTTGTCATCCTTTCCAACTTTGTTTCCTTTGTTGTGTTATTTATATATTCTTCCTCCCTAAGTCATATTTCATTTATTAATTAGTTGAATGGATTATTGTCACTGTTAGTAAAGTTTCTATTATTAAGATTAGCATCGATTTCTCGAATAACCATAGCATCGTACAAACTGATACAGTTAAATTGCTAGGAATTTTCCAATCCATTTTGTTTTGCCATGTACAGTTTCGTTTCTGCTTTTATTTATTTGTCTACATGTTTACACAACAGTACTAAGCATGTTGACACATACATTTGTATGACTATTGTTCTTGTCAAATATTTTGGTGTGTGTCATCCTGGTCAACATTAGACCAGGAAATCTGTTTTCAGTTTTTGATTGTAAATCGACTACTACTTGCAAACATTCATATGTGTAACTTATGCTGGAGTACGCATATGATTTGCATCTCTTGTTAGGATTCTACTATTTCTAAGTTGCTTTCTGCCCTCACCCATGATTTTTCATGGTCATATGAAGTACTTAGATTTTAGTTTCCAATTGCCTAGATAATTAACATTACAAGAGAATCAAT]
[+] EMBL CD083724 [CCCTCAGGCCANNGAATCGGCACGAGGCGGAATATCTAGATCGTGATTTATCTAATATCAATTTAAATGAATTAAAACAGAAAATGCAAGATAAAGCCAGATATTGTGAAAGTCGCCGAAATGTCCTTTTAGATCACGTACATAAAGGGTACGATAAAGGATTTTGGGAGCAATCCGATATTTGTTAGTGTGTTTGCTTAACTGTATGCCCATCCATTCACACGCACATAGAGTGTCACAGTCTTTGTTTCCATGTGTATAGTTTCTATTTTTGAATCACTATGATCTCGTTGATATCAATTTTTCTATTTTTCCTCGTTTATGCGTACCTCAATAGTTTTGCATATGTATATGCACTCTCACTAATATCAATGAAATATAAATGATGAAGACTTAACCAAGCCAGGTCATCATTATATGTTTATAGACCATTCTTTTTTCTATGACCCTAATCAGCAATTACGTACTGTTTGCATTCCTGAGTCTTGTCATCCTTTCCAACTTTGTTTCCTTTGTTGTGTTATTTATATATTCT ]
[+] EMBL CD079134 [ TGTTTCCATGTGTATAGTTTCTATTTTTGAATCACTATGATCTCGTTGATATCAATTTTTCTATTTTTCCTCGTTTATGCGTACCTCAATAGTTTTGCATATGTATATGCACTCTCACTAATATCAATGAAATATAAATGATGAAGACTTAACCAAGCCAGGTCATCATTATATGTTTATAGACCATTCTTTTTTCTATGACCCTAATCAGCAATTACGTACTGTTTGCATTCCTGAGTCTTGTCATCCTTTCCAACTTTGTTTCCTTTGTTGTGTTATTTATATATTCTTCCTCCCTAAGTCATATTTCATTTATTAATTAGTTGAATGGATTATTGTCACTGTTAGTAAAGTTTCTATTATTAAGATTAGCATCGATTTCTCGAATAACCATAGCATCGTACAAACTGATACAGTTAAATTGCTAGGAATTTTCCAATCCATTTTGTTTTGCCATGTACAGTTTCGTTTCTGCTTTTATTTATTTGTCTACATGTTTACACAACAGTACTAAGCATGTTGACACATACATTTGTATGACTATTGTTCTTGTCAAATATTTTGGTGTGTGTCATCCTG ]
[-] EMBL CD196478 [ GCATTCCTGAGTCTGGTCATCCTTTCCAACTTTGTTTCCTTTGTTGTGTTATTTATATATTCTTCCTCCCTAAGTCATATTTCATTTATTAATTAGTTGAATGGATTATTGTCACTGTTAGTAAAGTTTCTATTATTAAGATTAGCATCGATTTCTCGAATAACCATAGCATCGTACAAACTGATACAGTTAAATTGCTAGGAATTTTCCAATCCATTTTGTTTTGCCATGTACAGTTTCGTTTCTGCTTTTA TTATTTGTCTACATGTTTACACAACAGTACTAAGCATGTTGACACATACATTTGTATGACTATTGTTCTTGTCAAATATTTTGGTGTGTGTCATCCTGGTCAACATTAGACCCGGAAATCTGTTTTCAGTTTTTGATTGTAAATCGACTACTACTTGCAAACATTCATATGTGTAACTTATGCTGGAGTACGCATAT ]
[-] EMBL AI976192 [ ATATATTCTTCCTCCNTAAGTCATATTTCATTTATTAATTAGTTGAATGGATTATTGTCACTGTTAGTAAAGTTTCTATTATTAAGATTAGCATCGATTTCTCGAATAACCATAGCATCGTACAAACTGATACAGTTAAATTGCTAGGAATTTTCCAATCCATTTTGTTTTGCCATGTACAGTTTCGTTTCTGCTTTTATTTATTTGTCTACATGTTTACACAACAGTACTAAGCATGTTGACACATACATTTGTATGACTATTGTTCTTGTCAAATATTTTGGTGTGTGTCATCCTGGTCAACATTAGACCAGGAAATCTGTTTTCAGTTTTTGATTGTAAATCGACTACTACTTGCAAACATTCATATGTGTAACTTATGCTGGAGTACGCATATGATTTGCATCTCTTGTTAGGATTCTACTATTTCTAAGTTGCTTTCTGCCCTCACCCATGATTTTTCATGGTCATATGAAGTACTTAGATTTTAGTTTCCAATTGCCTAGATAATTAACATTACAAGAGAATCAAT]
[-] EMBL AI975109 [ GCTTTTATTTATTTGTCCACATGTTTACACAACAGTACTAAGCATGTTGACACATACATTTGTATGACTATTGTTCTTGTCAAATATTTTGGTGTGTGTCATCCTGGTCAACATTAGACCAGGAAATCTGTTTTCAGTTTTTGATTGTAAATCGACTACTACTTGCAAACATTCATATGTGTAACTTATGCTGGAGTACGCATATGATTTGCATCTCTTGTTAGGATTCTACTATTTCTAAGTTGCTTTCTGCCCTCACCCATGATTTTTCATGGTCATATGAAGTACTTAGATTTTAGTTTCCAATTGCCTAGATAATTAACATTACAAGAGAATCAAT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||