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Schistosoma mansoni
cluster # 7664 cluster # 7664       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7664#0 length = 971 sequences # 5  
consensusID : consensus_7664#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 971
fasta sequence 
                              [TCCGAGCCAATAATTCGGCACGAGGGAAAGTTATTAGGACAAATTATTGGTCAATTGGCAATCTTTTACCAAGTGTATCATTCAATAAGAAGAGTAAAAAATATTTATTTTTTCAAAAATCTGTTAATCAGAATAGTCGAGTGTGGAAAAGTGTATTTCGAGCAACATTGAGTTCATAATACCATATATATACTTTTTTCTGAATCCTGTTTTTGTTTGGATTAAGCGGATATACATGAATTCAAATTAATGAGTCATTTGAGATAAACATATAGAACAAATTTATTACTTACTTGCTTAAACATGCCACCCTTATTGAGGCATAGGCTAACAACTAGAGATCTCTAACCAAAATTGTGCTGAGTTCTTAATTTAGTTGTTGTCGGGTGTTATCCTTTTTCTTGATGTCTGCCCCCAGCTTCCGTTACCATGTCTTTTTCTGACTGCCTGTTTTCTTTTTGCCTTCAAGATTCAAAGTTAGGGTTTGCCATGTGATCCATTTTGATGATTTCTGTGATTTGTGCACTATCCACCTTTAGAGTCTTTTCCTAATTTCTTGCTTAATTTGCAACTAATTTGTTCTCTGACAGTAACTTACACCTGATGATCTCTAACTAATAGATATGG--AGTATTTTGTGTCGACGGTTATTTATAAATACTTGTACTTTTGGCGATGATTCAGTTAGTTCTTCAGGTTTTAACTCCGTGCAATGGACCTGCTTTAATGTTTGAGTTAAAAATTCCTGACGTTTTGTCTTGAATGACAGTTCTTAAGTCCCAGATTTTCATTCAGTAGTAGGCATGTCCCCCTTGTATTGCCAATCCATGCTTTTAAATCTGCATGTGATCCTTCTTGTTTAGCGCTGATTTTGTTCATTTATGTAAAGGCTTTCACCTCTTCCAGGG-TTCACCACC-AGTGTAACT-TGA-TTGTA-CCACTTTA-TGTGCA-TAAAATCTTACATTTTTGTTTTTGA]

[+] EMBL CD082847             [TCCGAGCCAATAATTCGGCACGAGGGAAAGTTATTAGGACAAATTATTGGTCAATTGGCAATCTTTTACCAAGTGTATCATTCAATAAGAAGAGTAAAAAATATTTATTTTTTCAAAAATCTGTTAATCAGAATAGTCGAGTGTGGAAAAGTGTATTTCGAGCAACATTGAGTTCATAATACCATATATATACTTTTTTCTGAATCCTGTTTTTGTTTGGATTAAGCGGATATACATGAATTCAAATTAATGAGTCATTTGAGATAAACATATAGAACAAATTTATTACTTACTTGCTTAAACATGCCACCCTTATTGAGGCATAGGCTAACAACTAGAGATCTCTAACCAAAATTGTGCTGAGTTCTTAATTTAGTTGTTGTCGGGTGTTATCCTTTTTCTTGATGTCTGCCCCCAGCTTCCGTTACCATGTCTTTTTCTGACTGCCTGTTTTCTTTTTGCCTTCAAGATTCAAAGTTAGGGTTTGCCATGTGATCCATTTTGATGATTTCTGTGATTTGTGCACTATCCACCTTTAGAGTCTTTTCCTAATTTCTTGCTTAATTTGCAACTAATTTGTTCTCTGACAGTAACTTACACCTGATGATCTCTAACTAATAGATATGG  AGTATTTTGTGTCGACGGTTATTTATAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD082217             [                                                                                                                                                                                          acgagACTTTTTTCTGAATCCTGTTTTTGTTTGGATTATTCGGATATACATGAATTCAAATTAATGAGTCATTTGAGATAAACATATAGAACAAATTTATTACTTACTTGCTTAAACATGCCACCCTTATTGAGGCATAGGCTAACAACTAGAGATCTCTAACCAAAATTGTGCTGAGTTCTTAATTTAGTTGTTGTCGGGTGTTATCCTTTTTCTTGATGTCTGCCCCCAGCTTCCGTTACCATGTCTTTTTCTGACTGCCTGTTTTCTTTTTGCCTTCAAGATTCAAAGTTAGGGTTTGCCATGTGATCCATTTTGATGATTTCTGTGATTTGTGCACTATCCACCTTTAGAGTCTTTTCCTAATTTCTTGCTTAATTTGCAACTAATTTGTTCTCTGACAGTAACTTACACCTGATGATCTCTAACTAATAGATATGGNAACTATTTTGTGTCGACGGTTATTTATAAATACTTGTACTTTTGGCGATGATTCAGTTAGTTCTTCAGGTTTTAACTCCGTGCAATGGACCTGCTTTAATGTTTGAGTTAAAAATTCCTGACGTTTTGTCTTGAATGACAGTTCTTAAGTCCCAGATTTTCATTCAGTAGTAGGCATGTCCCCCTTGTATTGCCAATCCATGCTNTTAAATCTGCATGTGATCCTTCTTG TTAGCGCTGATTNTGNTCATTTATGTAAAGGGCTTCA CTCTTNCAGGG NTCACCANC AGTGTAACTNNGA TTGTA CCACTTTA TGTGCA TAAAAT                   ]
[-] EMBL CD076433             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CCCAGCTTCCGTTACCATGTCTTTTTCTGACTGCCTGTTTTCTTTTTGCCTTCAAGATTCAAAGTTAGGGTTTGCCATGTGATCCATTTTGATGATTTCTGTGATTTGTGCACTATCCACCTTTAGAGTCTTTTCCTAATTTCTTGCTTAATTTGCAACTAATTTGTTCTCTGACAGTAACTTACACCTGATGATCTCTAACTAATAGATATGG  AGTATTTTGTGTCGACGGTTATTTATAAATACTTGTACTTTTGGCGATGATTCAGTTAGTTCTTCAGGTTTTAACTCCGTGCAATGGACCTGCTTTAATGTTTGAGTTAAAAATTCCTGACGTTTTGTCTTGAATGACAGTTCTTAAGTCCCAGATTTTCATTCAGTAGTAGGCATGTCCCCCTTGTATTGCCAATCCATGCTTTTAAATCTGCATGTGATCCTTCTTGTTTAGCGCTGATTTTGTTCATTTATGTAAAGGCTTTCACCTCTTCCAGGGTTTCACCACCAAGTGTAACT TGATTTGTACCCACTTTATTGTGCATTAAAATCTTACATTTTTGTTTTTGA]
[+] EMBL CD084309             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      gTTTTTGCCTTCAAGATTCAAAGTTAGGGTTTGCCATGTGATCCATTTTGATGATTTCTGTGATTTGTGCACTATCCACCTTTAGAGTCTTTTCCTAATTTCTTGCTTAATTTGCAACTAATTTGTTCTCTGACAGTAACTTACACCTGATGATCTCTAACTAATAGATATGG  AGTATTTTGTGTCGACGGTTATTTATAAATACTTGTACTTTTGGCGATGATTCAGTTAGTTCTTCAGGTTTTAACTCCGTGCAATGGACCTGCTTTAATGTTTGAGTTAAAAATTCCTGACGTTTTGTCTTGAATGACAGTTCTTAAGTCCCAGATTTTCATTCAGTAGTAGGCATGTCCCCCTTGTATTGCCAATCCATGCTTTTAAATCTGCATGTGATCCTTCTTGTTTAGCGCTGATTTTGTTCATTTATGTAAAGGCTTTCACCTCTTCCAGGG                                                                        ]
[-] EMBL CD075829             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTGCAACTAATTTGTTTTTTGACAGTAACTTACACCTGATGATCTTTAACTAATAGATATGG  AGTATTTTGTGTCGACGGTTATTTATAAATACTTGTACTTTTGGCGATGATTCAGTTAGTTTTTCAGGTTTTAACTCCGTGCAATGGACCTGCTTTAATGTTTGAGTTAAAAATTCCTGACGTTTTGTTTTGAATGACAGTTTTTAAGTCCCAGATTTTCATTCAGTAGTAGGCATGTCCCCCTTGTATTGCCAATCCATGCTTTTAAATTTGCATGTGATCCTTTTTGTTTAGCGCTGATTTTGTTCATTTATGTAAAGGCTTTCACCTTTTTCAGGGTTTCACCCCCAAGTGTAACT TGATTTGTACCCCCTTTATTGTGCATTAAAATTTT                ]




>consensus_7664#0
TCCGAGCCAATAATTCGGCACGAGGGAAAGTTATTAGGACAAATTATTGGTCAATTGGCA
ATCTTTTACCAAGTGTATCATTCAATAAGAAGAGTAAAAAATATTTATTTTTTCAAAAAT
CTGTTAATCAGAATAGTCGAGTGTGGAAAAGTGTATTTCGAGCAACATTGAGTTCATAAT
ACCATATATATACTTTTTTCTGAATCCTGTTTTTGTTTGGATTAAGCGGATATACATGAA
TTCAAATTAATGAGTCATTTGAGATAAACATATAGAACAAATTTATTACTTACTTGCTTA
AACATGCCACCCTTATTGAGGCATAGGCTAACAACTAGAGATCTCTAACCAAAATTGTGC
TGAGTTCTTAATTTAGTTGTTGTCGGGTGTTATCCTTTTTCTTGATGTCTGCCCCCAGCT
TCCGTTACCATGTCTTTTTCTGACTGCCTGTTTTCTTTTTGCCTTCAAGATTCAAAGTTA
GGGTTTGCCATGTGATCCATTTTGATGATTTCTGTGATTTGTGCACTATCCACCTTTAGA
GTCTTTTCCTAATTTCTTGCTTAATTTGCAACTAATTTGTTCTCTGACAGTAACTTACAC
CTGATGATCTCTAACTAATAGATATGGAGTATTTTGTGTCGACGGTTATTTATAAATACT
TGTACTTTTGGCGATGATTCAGTTAGTTCTTCAGGTTTTAACTCCGTGCAATGGACCTGC
TTTAATGTTTGAGTTAAAAATTCCTGACGTTTTGTCTTGAATGACAGTTCTTAAGTCCCA
GATTTTCATTCAGTAGTAGGCATGTCCCCCTTGTATTGCCAATCCATGCTTTTAAATCTG
CATGTGATCCTTCTTGTTTAGCGCTGATTTTGTTCATTTATGTAAAGGCTTTCACCTCTT
CCAGGGTTCACCACCAGTGTAACTTGATTGTACCACTTTATGTGCATAAAATCTTACATT
TTTGTTTTTGA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)