These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7665#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1602 fasta sequence [CTGTGTTTATATACTACATTGAAATTGTTCTATTCTATACAAACTGTTGTTGTCTACATACTGTTTTGCCTGTTGATGTGTCCATGTATATGTGTAGGTTCACATTGATGTATGTTCTCATCAATTATAGAGTAATTTTGCATCATTTTCTTTTATTTTACTGTTTGTTCCGTCTTATTCATATATTGTCTGTCGATAGAATACATAAACATACTTGGTTTCGAACTCATTCATACAATAATACGCATTTACTGATTGTACACATATATGTGATAAAAATGCAAGTAATGTAATCAGTTTAATTTCCATAGATTATAATTGTTATAATACGAAATTTAATTCCACGAAATAATGAATTTATTGGTGGAAATAATGTTTATCAAAGCCATGATTCATTGCAAACAAGAAAAAAAGGAATAACATGGAAAAATAATACTGGAAAACAAAAAAAGATCAACCCGGCGATGGGTGTACTGTAATTATTTGTCTCTATAAGTTTGTTTGTGTATTTCTATTTGACATTACCGAATTGTATTAATCCCTATTTACATCCTCCTTATGTTTTTTTTCTTTTGTCTTTCATCATTGCTCCTATATTGGATCTTTTTTTCNCTGTACATAAAACTTTGTGGTTGCATGGGTCTGTGTATTTATGTTTAATATTCAATACTGCAAATAAAAAACGGATGTGTTGTGAATGGGAAATTCTTGTTCGCACACACATACCGCTCTCAGTATCTGTCACAAATTTCCAGTCTGTTTGTATTAAGCTCTGTTCTCTTCCTGAAAGCTCATCTACTTCAGTAACGAATACTTTTTTAGCCATTATTTTTTTACAGTCACGAAGATCGTCAATTAATTCTTATGAATATGTATATTCACCCTTGAAATATGACTGGTTTTTGTTCTTTCTTTCACATTTTCTGTCACCTGCTTATTATCAGTATTCCAGACTAATTGGAAAGAACTATTCAGTTTCCGTCTTTAATCAATAAAGACATCAACTCTGAGTCGCTTCATGTAATTATAATGTATGAACATTGATAAGCATTCAAGAATTTCATTAGTCATGTATTATAGTTAAAGTGCATCTGTTGTTGTTTCATGGTTGGTCTAGTTCATCGTCTTGTTCGTAATACTTATTTCGTACATTCAGTGTGCCCTTCCTTTACCTTTTTACATCCATGTAAGTATTAATTTCCAGTGGATATCTTATCAAGAGAGAAGTTATTTTAACGGTGACATTTTTAAACATGAATGTCCGCGCAAAGTGATGCAGCTGTTCTTTCCACATATGTGGATTGTACACATCAAAAACATTCATTTGCTTCAACTGGTTCCTGAAACTATTACTATTATCATTACCATTATTATTATTACTATTTATTACATAACACATTGTTTTCTGTTTGTAATTTGTCTATGATCTATTTTATCCTTGTGGTGATTATCATTTTAAATCAATCAATCGATCAACAACAACAAAAAAACAAACAAACATTACACAAGAAAACATATTTGTATTTGACTATTGTTTATTTTTGTGTGTGTATGTGTTTGTGGTTGATATTTCCAGTTATTGTCAAAATAAAAATTATTATT] [-] EMBL CD122951 [CTGTGTTTATATACTACATTGAAATTGTTCTATTCTATACAAACTGTTGTTGTCTACATACTGTTTTGCCTGTTGATGTGTCCATGTATATGTGTAGGTTCACATTGATGTATGTTCTCATCAATTATAGAGTAATTTTGCATCATTTTCTTTTATTTTACTGTTTGTTCCGTCTTATTCATATATTGTCTGTCGATAGAATACATAAACATACTTGGTTTCGAACTCATTCATACAATAATACGCATTTACTGATTGTACACATATATGTGATAAAAATGCAAGTAATGTAATCAGTTTAATTTCCATAGATTATAATTGTTATAATACGAAATTTAATTCCACGAAATAATGAATTTATTGGTGGAAATAATGTTTATCAAAGCCATGATTCATTGCAAACAAGAAAAAAAGGAATAACATGGAAAAATAATACTGGAAAACAA ] [-] EMBL CD162553 [ ATACATAAACATACTTGGTTTCGAACTCATTCATACAATAATACGCATTTACTGATTGTACACATATATGTGATAAAAATGCAAGTAATGTAATCAGTTTAATTTCCATAGATTATAATTGTTATAATACGAAATTTAATTCCACGAAATAATGAATTTATTGGTGGAAATAATGTTTATCAAAGCCATGATTCATTGCAAACAAGAAAAAAAGGAATAACATGGAAAAATAATACTGGAAAACAAAAAAAGATCAACCCGGCGATGGGTGTACTGTAATTATTTGTCTCTATAAGTTTGTTTGTGTATTTCTATTTGACATTACCGAATTGTATTAATCCCTATTTACATCCTCCTTATGTTTTTTTTCTTTTGTCTTTCATCATTGCTCCTATATTGGATCTTTTTTTCNCTGTACATAAAAC ] [+] EMBL CD081922 [ AGTTTGTTTGTGTATTTCTATTTGACATTACCGAATTGTATTAATCCCTATTTACATCCTCCTTATGTTCTTTTTCTTTTGTCTTTCATCATTGCTCCTATATTGGATCTTTTTTTC CTGTACATAAAACTTTGTGGTTGCATGGGTCTGTGTATTTATGTTTAATATTCAATACTGCAAATAAAAAACGGATGTGTTGTGAATGGGAAATTCTTGTTCGCACACACATACCGCTCTCAGTATCTGTCACAAATTTCCAGTCTGTTTGTATTAAGCTCTGTTCTCTTCCTGAAAGCTCATCTACTTCAGTAACGAATACTTTTTTAGCCATTATTTTTTTACAGTCACGAAGATCGTCAATTAATTCTTATGAATATGTATATTCACCCTTGAAATATGACTGGTTTTTGTTCTTTCTTTCACATTTTCTGTCACCTGCTTATTATCAGTATTCCAGACTAATTGGAAAGAACTATTCAGTTTCCGTCTTTAATCAATAAAGACATCAACTCTGAGTCGCTTCATGTAATTATAATGTATGAACATTGATAAGCATTCAAGAATTTCATTAGTCATGTATTATAGTTAAAGTGCATCTGTTGTTGTTTCATGGTTGGTCTAGTTCATCGTCTTGTTCGT ATACTTATTTCGTA ] [+] EMBL CD093225 [ CGTCAATTAATTCTTATGAATATGTATATTCACCCTTGAAATATGACTGGTTTTTGTTCTTTCTTTCACATTTTCTGTCACCTGCTTATTATCAGTATTCCAGACTAATTGGAAAGAACTATTCAGTTTCCGTCTTTAATCAATAAAGACATCAACTCTGAGTCGCTTCATGTAATTATAATGTATGAACATTGATAAGCATTCAAGAATTTCATTAGTCATGTATTATAGTTAAAGTGCATCTGTTGTTGTTTCATGGTTGGTCTAGTTCATCGTCTTGTTCGTAATACT ] [-] EMBL CD077032 [ GGTTGGTCTAGTTCATCGTCTTGTTCGTAATACTTATTTCGTACATTCAGTGTGCCCTTCCTTTACCTTTTTACATCCATGTAAGTATTAATTTCCAGTGGATATCTTATCAAGAGAGAAGTTATTTTAACGGTGACATTTTTAAACATGAATGTCCGCGCAAAGTGATGCAGCTGTTCTTTCCACATATGTGGATTGTACACATCAAAAACATTCATTTGCTTCAACTGGTTCCTGAAACTATTACTATTATCATTACCATTATTATTATTACTATTTATTACATAACACATTGTTTTCTGTTTGTAATTTGTCTATGATCTATTTTATCCTTGTGGTGATTATCATTTTAAATCAATCAATCGATCAACAACAACAAAAAAACAAACAAACATTACACAAGAAAACATATTTGTATTTGACTATTGTTTATTTTTGTGTGTGTATGTGTTTGTGGTTGATATTTCCAGTTATTGTCAAAATAAAAATTATTATT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||