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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7665#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1602 fasta sequence
[CTGTGTTTATATACTACATTGAAATTGTTCTATTCTATACAAACTGTTGTTGTCTACATACTGTTTTGCCTGTTGATGTGTCCATGTATATGTGTAGGTTCACATTGATGTATGTTCTCATCAATTATAGAGTAATTTTGCATCATTTTCTTTTATTTTACTGTTTGTTCCGTCTTATTCATATATTGTCTGTCGATAGAATACATAAACATACTTGGTTTCGAACTCATTCATACAATAATACGCATTTACTGATTGTACACATATATGTGATAAAAATGCAAGTAATGTAATCAGTTTAATTTCCATAGATTATAATTGTTATAATACGAAATTTAATTCCACGAAATAATGAATTTATTGGTGGAAATAATGTTTATCAAAGCCATGATTCATTGCAAACAAGAAAAAAAGGAATAACATGGAAAAATAATACTGGAAAACAAAAAAAGATCAACCCGGCGATGGGTGTACTGTAATTATTTGTCTCTATAAGTTTGTTTGTGTATTTCTATTTGACATTACCGAATTGTATTAATCCCTATTTACATCCTCCTTATGTTTTTTTTCTTTTGTCTTTCATCATTGCTCCTATATTGGATCTTTTTTTCNCTGTACATAAAACTTTGTGGTTGCATGGGTCTGTGTATTTATGTTTAATATTCAATACTGCAAATAAAAAACGGATGTGTTGTGAATGGGAAATTCTTGTTCGCACACACATACCGCTCTCAGTATCTGTCACAAATTTCCAGTCTGTTTGTATTAAGCTCTGTTCTCTTCCTGAAAGCTCATCTACTTCAGTAACGAATACTTTTTTAGCCATTATTTTTTTACAGTCACGAAGATCGTCAATTAATTCTTATGAATATGTATATTCACCCTTGAAATATGACTGGTTTTTGTTCTTTCTTTCACATTTTCTGTCACCTGCTTATTATCAGTATTCCAGACTAATTGGAAAGAACTATTCAGTTTCCGTCTTTAATCAATAAAGACATCAACTCTGAGTCGCTTCATGTAATTATAATGTATGAACATTGATAAGCATTCAAGAATTTCATTAGTCATGTATTATAGTTAAAGTGCATCTGTTGTTGTTTCATGGTTGGTCTAGTTCATCGTCTTGTTCGTAATACTTATTTCGTACATTCAGTGTGCCCTTCCTTTACCTTTTTACATCCATGTAAGTATTAATTTCCAGTGGATATCTTATCAAGAGAGAAGTTATTTTAACGGTGACATTTTTAAACATGAATGTCCGCGCAAAGTGATGCAGCTGTTCTTTCCACATATGTGGATTGTACACATCAAAAACATTCATTTGCTTCAACTGGTTCCTGAAACTATTACTATTATCATTACCATTATTATTATTACTATTTATTACATAACACATTGTTTTCTGTTTGTAATTTGTCTATGATCTATTTTATCCTTGTGGTGATTATCATTTTAAATCAATCAATCGATCAACAACAACAAAAAAACAAACAAACATTACACAAGAAAACATATTTGTATTTGACTATTGTTTATTTTTGTGTGTGTATGTGTTTGTGGTTGATATTTCCAGTTATTGTCAAAATAAAAATTATTATT]
[-] EMBL CD122951 [CTGTGTTTATATACTACATTGAAATTGTTCTATTCTATACAAACTGTTGTTGTCTACATACTGTTTTGCCTGTTGATGTGTCCATGTATATGTGTAGGTTCACATTGATGTATGTTCTCATCAATTATAGAGTAATTTTGCATCATTTTCTTTTATTTTACTGTTTGTTCCGTCTTATTCATATATTGTCTGTCGATAGAATACATAAACATACTTGGTTTCGAACTCATTCATACAATAATACGCATTTACTGATTGTACACATATATGTGATAAAAATGCAAGTAATGTAATCAGTTTAATTTCCATAGATTATAATTGTTATAATACGAAATTTAATTCCACGAAATAATGAATTTATTGGTGGAAATAATGTTTATCAAAGCCATGATTCATTGCAAACAAGAAAAAAAGGAATAACATGGAAAAATAATACTGGAAAACAA ]
[-] EMBL CD162553 [ ATACATAAACATACTTGGTTTCGAACTCATTCATACAATAATACGCATTTACTGATTGTACACATATATGTGATAAAAATGCAAGTAATGTAATCAGTTTAATTTCCATAGATTATAATTGTTATAATACGAAATTTAATTCCACGAAATAATGAATTTATTGGTGGAAATAATGTTTATCAAAGCCATGATTCATTGCAAACAAGAAAAAAAGGAATAACATGGAAAAATAATACTGGAAAACAAAAAAAGATCAACCCGGCGATGGGTGTACTGTAATTATTTGTCTCTATAAGTTTGTTTGTGTATTTCTATTTGACATTACCGAATTGTATTAATCCCTATTTACATCCTCCTTATGTTTTTTTTCTTTTGTCTTTCATCATTGCTCCTATATTGGATCTTTTTTTCNCTGTACATAAAAC ]
[+] EMBL CD081922 [ AGTTTGTTTGTGTATTTCTATTTGACATTACCGAATTGTATTAATCCCTATTTACATCCTCCTTATGTTCTTTTTCTTTTGTCTTTCATCATTGCTCCTATATTGGATCTTTTTTTC CTGTACATAAAACTTTGTGGTTGCATGGGTCTGTGTATTTATGTTTAATATTCAATACTGCAAATAAAAAACGGATGTGTTGTGAATGGGAAATTCTTGTTCGCACACACATACCGCTCTCAGTATCTGTCACAAATTTCCAGTCTGTTTGTATTAAGCTCTGTTCTCTTCCTGAAAGCTCATCTACTTCAGTAACGAATACTTTTTTAGCCATTATTTTTTTACAGTCACGAAGATCGTCAATTAATTCTTATGAATATGTATATTCACCCTTGAAATATGACTGGTTTTTGTTCTTTCTTTCACATTTTCTGTCACCTGCTTATTATCAGTATTCCAGACTAATTGGAAAGAACTATTCAGTTTCCGTCTTTAATCAATAAAGACATCAACTCTGAGTCGCTTCATGTAATTATAATGTATGAACATTGATAAGCATTCAAGAATTTCATTAGTCATGTATTATAGTTAAAGTGCATCTGTTGTTGTTTCATGGTTGGTCTAGTTCATCGTCTTGTTCGT ATACTTATTTCGTA ]
[+] EMBL CD093225 [ CGTCAATTAATTCTTATGAATATGTATATTCACCCTTGAAATATGACTGGTTTTTGTTCTTTCTTTCACATTTTCTGTCACCTGCTTATTATCAGTATTCCAGACTAATTGGAAAGAACTATTCAGTTTCCGTCTTTAATCAATAAAGACATCAACTCTGAGTCGCTTCATGTAATTATAATGTATGAACATTGATAAGCATTCAAGAATTTCATTAGTCATGTATTATAGTTAAAGTGCATCTGTTGTTGTTTCATGGTTGGTCTAGTTCATCGTCTTGTTCGTAATACT ]
[-] EMBL CD077032 [ GGTTGGTCTAGTTCATCGTCTTGTTCGTAATACTTATTTCGTACATTCAGTGTGCCCTTCCTTTACCTTTTTACATCCATGTAAGTATTAATTTCCAGTGGATATCTTATCAAGAGAGAAGTTATTTTAACGGTGACATTTTTAAACATGAATGTCCGCGCAAAGTGATGCAGCTGTTCTTTCCACATATGTGGATTGTACACATCAAAAACATTCATTTGCTTCAACTGGTTCCTGAAACTATTACTATTATCATTACCATTATTATTATTACTATTTATTACATAACACATTGTTTTCTGTTTGTAATTTGTCTATGATCTATTTTATCCTTGTGGTGATTATCATTTTAAATCAATCAATCGATCAACAACAACAAAAAAACAAACAAACATTACACAAGAAAACATATTTGTATTTGACTATTGTTTATTTTTGTGTGTGTATGTGTTTGTGGTTGATATTTCCAGTTATTGTCAAAATAAAAATTATTATT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||