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Schistosoma mansoni
cluster # 7665 cluster # 7665       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7665#0 length = 1602 sequences # 5  

consensusID : consensus_7665#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1602
fasta sequence
                              [CTGTGTTTATATACTACATTGAAATTGTTCTATTCTATACAAACTGTTGTTGTCTACATACTGTTTTGCCTGTTGATGTGTCCATGTATATGTGTAGGTTCACATTGATGTATGTTCTCATCAATTATAGAGTAATTTTGCATCATTTTCTTTTATTTTACTGTTTGTTCCGTCTTATTCATATATTGTCTGTCGATAGAATACATAAACATACTTGGTTTCGAACTCATTCATACAATAATACGCATTTACTGATTGTACACATATATGTGATAAAAATGCAAGTAATGTAATCAGTTTAATTTCCATAGATTATAATTGTTATAATACGAAATTTAATTCCACGAAATAATGAATTTATTGGTGGAAATAATGTTTATCAAAGCCATGATTCATTGCAAACAAGAAAAAAAGGAATAACATGGAAAAATAATACTGGAAAACAAAAAAAGATCAACCCGGCGATGGGTGTACTGTAATTATTTGTCTCTATAAGTTTGTTTGTGTATTTCTATTTGACATTACCGAATTGTATTAATCCCTATTTACATCCTCCTTATGTTTTTTTTCTTTTGTCTTTCATCATTGCTCCTATATTGGATCTTTTTTTCNCTGTACATAAAACTTTGTGGTTGCATGGGTCTGTGTATTTATGTTTAATATTCAATACTGCAAATAAAAAACGGATGTGTTGTGAATGGGAAATTCTTGTTCGCACACACATACCGCTCTCAGTATCTGTCACAAATTTCCAGTCTGTTTGTATTAAGCTCTGTTCTCTTCCTGAAAGCTCATCTACTTCAGTAACGAATACTTTTTTAGCCATTATTTTTTTACAGTCACGAAGATCGTCAATTAATTCTTATGAATATGTATATTCACCCTTGAAATATGACTGGTTTTTGTTCTTTCTTTCACATTTTCTGTCACCTGCTTATTATCAGTATTCCAGACTAATTGGAAAGAACTATTCAGTTTCCGTCTTTAATCAATAAAGACATCAACTCTGAGTCGCTTCATGTAATTATAATGTATGAACATTGATAAGCATTCAAGAATTTCATTAGTCATGTATTATAGTTAAAGTGCATCTGTTGTTGTTTCATGGTTGGTCTAGTTCATCGTCTTGTTCGTAATACTTATTTCGTACATTCAGTGTGCCCTTCCTTTACCTTTTTACATCCATGTAAGTATTAATTTCCAGTGGATATCTTATCAAGAGAGAAGTTATTTTAACGGTGACATTTTTAAACATGAATGTCCGCGCAAAGTGATGCAGCTGTTCTTTCCACATATGTGGATTGTACACATCAAAAACATTCATTTGCTTCAACTGGTTCCTGAAACTATTACTATTATCATTACCATTATTATTATTACTATTTATTACATAACACATTGTTTTCTGTTTGTAATTTGTCTATGATCTATTTTATCCTTGTGGTGATTATCATTTTAAATCAATCAATCGATCAACAACAACAAAAAAACAAACAAACATTACACAAGAAAACATATTTGTATTTGACTATTGTTTATTTTTGTGTGTGTATGTGTTTGTGGTTGATATTTCCAGTTATTGTCAAAATAAAAATTATTATT]

[-] EMBL CD122951             [CTGTGTTTATATACTACATTGAAATTGTTCTATTCTATACAAACTGTTGTTGTCTACATACTGTTTTGCCTGTTGATGTGTCCATGTATATGTGTAGGTTCACATTGATGTATGTTCTCATCAATTATAGAGTAATTTTGCATCATTTTCTTTTATTTTACTGTTTGTTCCGTCTTATTCATATATTGTCTGTCGATAGAATACATAAACATACTTGGTTTCGAACTCATTCATACAATAATACGCATTTACTGATTGTACACATATATGTGATAAAAATGCAAGTAATGTAATCAGTTTAATTTCCATAGATTATAATTGTTATAATACGAAATTTAATTCCACGAAATAATGAATTTATTGGTGGAAATAATGTTTATCAAAGCCATGATTCATTGCAAACAAGAAAAAAAGGAATAACATGGAAAAATAATACTGGAAAACAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD162553             [                                                                                                                                                                                                        ATACATAAACATACTTGGTTTCGAACTCATTCATACAATAATACGCATTTACTGATTGTACACATATATGTGATAAAAATGCAAGTAATGTAATCAGTTTAATTTCCATAGATTATAATTGTTATAATACGAAATTTAATTCCACGAAATAATGAATTTATTGGTGGAAATAATGTTTATCAAAGCCATGATTCATTGCAAACAAGAAAAAAAGGAATAACATGGAAAAATAATACTGGAAAACAAAAAAAGATCAACCCGGCGATGGGTGTACTGTAATTATTTGTCTCTATAAGTTTGTTTGTGTATTTCTATTTGACATTACCGAATTGTATTAATCCCTATTTACATCCTCCTTATGTTTTTTTTCTTTTGTCTTTCATCATTGCTCCTATATTGGATCTTTTTTTCNCTGTACATAAAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD081922             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AGTTTGTTTGTGTATTTCTATTTGACATTACCGAATTGTATTAATCCCTATTTACATCCTCCTTATGTTCTTTTTCTTTTGTCTTTCATCATTGCTCCTATATTGGATCTTTTTTTC CTGTACATAAAACTTTGTGGTTGCATGGGTCTGTGTATTTATGTTTAATATTCAATACTGCAAATAAAAAACGGATGTGTTGTGAATGGGAAATTCTTGTTCGCACACACATACCGCTCTCAGTATCTGTCACAAATTTCCAGTCTGTTTGTATTAAGCTCTGTTCTCTTCCTGAAAGCTCATCTACTTCAGTAACGAATACTTTTTTAGCCATTATTTTTTTACAGTCACGAAGATCGTCAATTAATTCTTATGAATATGTATATTCACCCTTGAAATATGACTGGTTTTTGTTCTTTCTTTCACATTTTCTGTCACCTGCTTATTATCAGTATTCCAGACTAATTGGAAAGAACTATTCAGTTTCCGTCTTTAATCAATAAAGACATCAACTCTGAGTCGCTTCATGTAATTATAATGTATGAACATTGATAAGCATTCAAGAATTTCATTAGTCATGTATTATAGTTAAAGTGCATCTGTTGTTGTTTCATGGTTGGTCTAGTTCATCGTCTTGTTCGT ATACTTATTTCGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD093225             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 CGTCAATTAATTCTTATGAATATGTATATTCACCCTTGAAATATGACTGGTTTTTGTTCTTTCTTTCACATTTTCTGTCACCTGCTTATTATCAGTATTCCAGACTAATTGGAAAGAACTATTCAGTTTCCGTCTTTAATCAATAAAGACATCAACTCTGAGTCGCTTCATGTAATTATAATGTATGAACATTGATAAGCATTCAAGAATTTCATTAGTCATGTATTATAGTTAAAGTGCATCTGTTGTTGTTTCATGGTTGGTCTAGTTCATCGTCTTGTTCGTAATACT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD077032             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGTTGGTCTAGTTCATCGTCTTGTTCGTAATACTTATTTCGTACATTCAGTGTGCCCTTCCTTTACCTTTTTACATCCATGTAAGTATTAATTTCCAGTGGATATCTTATCAAGAGAGAAGTTATTTTAACGGTGACATTTTTAAACATGAATGTCCGCGCAAAGTGATGCAGCTGTTCTTTCCACATATGTGGATTGTACACATCAAAAACATTCATTTGCTTCAACTGGTTCCTGAAACTATTACTATTATCATTACCATTATTATTATTACTATTTATTACATAACACATTGTTTTCTGTTTGTAATTTGTCTATGATCTATTTTATCCTTGTGGTGATTATCATTTTAAATCAATCAATCGATCAACAACAACAAAAAAACAAACAAACATTACACAAGAAAACATATTTGTATTTGACTATTGTTTATTTTTGTGTGTGTATGTGTTTGTGGTTGATATTTCCAGTTATTGTCAAAATAAAAATTATTATT]


>consensus_7665#0 CTGTGTTTATATACTACATTGAAATTGTTCTATTCTATACAAACTGTTGTTGTCTACATA CTGTTTTGCCTGTTGATGTGTCCATGTATATGTGTAGGTTCACATTGATGTATGTTCTCA TCAATTATAGAGTAATTTTGCATCATTTTCTTTTATTTTACTGTTTGTTCCGTCTTATTC ATATATTGTCTGTCGATAGAATACATAAACATACTTGGTTTCGAACTCATTCATACAATA ATACGCATTTACTGATTGTACACATATATGTGATAAAAATGCAAGTAATGTAATCAGTTT AATTTCCATAGATTATAATTGTTATAATACGAAATTTAATTCCACGAAATAATGAATTTA TTGGTGGAAATAATGTTTATCAAAGCCATGATTCATTGCAAACAAGAAAAAAAGGAATAA CATGGAAAAATAATACTGGAAAACAAAAAAAGATCAACCCGGCGATGGGTGTACTGTAAT TATTTGTCTCTATAAGTTTGTTTGTGTATTTCTATTTGACATTACCGAATTGTATTAATC CCTATTTACATCCTCCTTATGTTTTTTTTCTTTTGTCTTTCATCATTGCTCCTATATTGG ATCTTTTTTTCNCTGTACATAAAACTTTGTGGTTGCATGGGTCTGTGTATTTATGTTTAA TATTCAATACTGCAAATAAAAAACGGATGTGTTGTGAATGGGAAATTCTTGTTCGCACAC ACATACCGCTCTCAGTATCTGTCACAAATTTCCAGTCTGTTTGTATTAAGCTCTGTTCTC TTCCTGAAAGCTCATCTACTTCAGTAACGAATACTTTTTTAGCCATTATTTTTTTACAGT CACGAAGATCGTCAATTAATTCTTATGAATATGTATATTCACCCTTGAAATATGACTGGT TTTTGTTCTTTCTTTCACATTTTCTGTCACCTGCTTATTATCAGTATTCCAGACTAATTG GAAAGAACTATTCAGTTTCCGTCTTTAATCAATAAAGACATCAACTCTGAGTCGCTTCAT GTAATTATAATGTATGAACATTGATAAGCATTCAAGAATTTCATTAGTCATGTATTATAG TTAAAGTGCATCTGTTGTTGTTTCATGGTTGGTCTAGTTCATCGTCTTGTTCGTAATACT TATTTCGTACATTCAGTGTGCCCTTCCTTTACCTTTTTACATCCATGTAAGTATTAATTT CCAGTGGATATCTTATCAAGAGAGAAGTTATTTTAACGGTGACATTTTTAAACATGAATG TCCGCGCAAAGTGATGCAGCTGTTCTTTCCACATATGTGGATTGTACACATCAAAAACAT TCATTTGCTTCAACTGGTTCCTGAAACTATTACTATTATCATTACCATTATTATTATTAC TATTTATTACATAACACATTGTTTTCTGTTTGTAATTTGTCTATGATCTATTTTATCCTT GTGGTGATTATCATTTTAAATCAATCAATCGATCAACAACAACAAAAAAACAAACAAACA TTACACAAGAAAACATATTTGTATTTGACTATTGTTTATTTTTGTGTGTGTATGTGTTTG TGGTTGATATTTCCAGTTATTGTCAAAATAAAAATTATTATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)