These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7667#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 620 fasta sequence [TGTAATGCATCGGAATAGTGGTCATGATTATGGAATAATGGTTCATCAAGGTGATGTAATTGGTTGTTTGTTAGATTTAGACAAAGGATCGATTTCTTGGTCGTGTAATGGAAAAATATTTCGTCGTGCATTCACTATACCTGACCAATTAAGAGGTGAAGCTTTCTTACCAGCGGCTAGTCTAAAAGATTCACGTATCCTATTTAATTTCGGTGAA-GAACAACCGTTAGAATTCCCACCAGATGGTCCTTTTATTCCTGTAGCTCAATCTGCTGATGATAGTCAAGTATCTAATCGAAATCCTGGTTGGCGCATGAATCAGTACGATGCAACGAATGCTTTAGATGTTGCACCCGACGGCAGTCAAGTTCAATCACATTTTAATCAAGGTTGGCAAGGTTGTCGATCGAATCATGGTATTCGTGGTCTTGGACGCTTCTACTTTGAAGTAACTCCTATTGAATCTACTGGATTATGGCGCGTCGGTTGGTCAACAGATGATGGGAATTTAATTGTTGGCACAGATCAATATGGTTTCGGTTATGGTGCAGATAATGAAGGTTTCGGTTTGAATGGACAACAAGGCAAACGTATACATTGTGATGAAATTGAAAATTATG] [+] EMBL CD089652 [TGTAATGCATCGGAATAGTGGTCATGATTATGGAATAATGGTTCATCAAGGTGATGTAATTGGTTGTTTGTTAGATTTAGACAAAGGATCGATTTCTTGGTCGTGTAATGGAAAAATATTTCGTCGTGCATTCACTATACCTGACCAATTAAGAGGTGAAGCTTTCTTACCAGCGGCTAGTCTAAAAGATTCACGTATCCTATTTAATTTCGGTGAA GAACAACCGTTAGAATTCCCACCAGATGGTCCTTTTATTCCTGTAGCTCAATCTGCTGATGATAGTCAAGTATCTAATCGAAATCCTGGTTGGCGCATGAATCAGTACGATGCAACGAATGCTTTAGATGTTGCACCCGACGGCAGTCAAGTTCAATCACATTTTAATCAAGGTTGGCAAGGTTGTCGATCGAATCATGGTATTCGTGGTCTTGGACGCTTCTACT ] [+] EMBL CD063983 [ ccggacgcTTCACTATACCTGACCAATTAAGAGGAGAAGC TTCTTACCAGCGGCTAGTCTAAAAGATTCACGTATCCTATTTAATTTCGGTGAA GAACGACCGTTAGAATTCCCACCAGATGGTCCATTTATTCCTGTAGCTCAATCTGCTGATGATAGTCAAGTATCTAATCGAAATCCTGGTTGGCGCATGAATCAGTACGATGCAACGAATGCTTTAGATGTTGCACCCGACGGTAGTCAAGTTCAATCACATCTTAATCAAGGTTGGCAAGGTTGTCGATCGAATCATGGTATTCGTGGTCTTGGACGCTTTTACTTTGAAGTAACTCCTATTGAATCTACTGGATTATGGCGCGTCGGTTGGTCAACAGATGATGGGAATTTAATTGTTGGCACAGATCAATATGGTTTCGGTTATGGTGCAGATAATGAAGGTTTCGGTTTGAATGGACAACAAGGCAAACGTATACATTGTGATGAAATTGAAAATTATG] [+] EMBL CD167469 [ CTGACCAATTAAGAGGTGAAGCTTTCTTACCAGCGGCTAGTCTAAAAGATTCACGTATCCTATTTAATTTCGGTGAAGGAACAACCGTTAGAATTCCCACCAGATGGTCCTTTTATTCCTGTAGCTCAATCTGCTGATGATAGTCAAGTATCTAATCGAAATCCTGGTTGGCGCATGAATCAGTACGATGCAACGAATGCTTTAGATGTTGCACCCGACGGCAGTCAAGTTCAATCACATTTTAATCAAGGTTGGCAAGGTTGTCGATCGAATCATGGTATTCGTGGTCTTGGACGCTTCTACTTTGAAGTAACTCCTATTG ] [+] EMBL CD064322 [ ACCAATT AGAGGTGAAGCTTTCTTACCAGCGGCTAGTCTAAAAGATTCACGTATCCTATTTAATTTCGGTGAA GAACAACCGTTAGAATTCCCACCAGATGGTCCTTTTATTCCTGTAGCTCAATCTGCTGATGATAGTCAAGTATCTAATCGAAATCCTGGTTGGCGCATGAATCAGTACGATGCAACGAATGCTTTAGATGTTGCACCCGACGGCAGTCAAGTTCAATCACATTTTAATCAAGGTTGGCAAGGTTGTCGATCGAATCATGGTATTCGTGGTCTTGGACGCTTCTACTTTGAAG ] [-] EMBL CD146373 [ TAGTCAAGTATCTAATCGAAATCCTGGTTGGCGCATGAATCAGTACGATGCAACGAATGCTTTAGATGTTGCACCCGACGGCAGTCAAGTTCAATCACATTTTAATCAAGGTTGGCAAGGTTGTCGATCGAATCATGGTATTCGTGGTCTTGGACGCTTTTACTTCGAA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||