cluster # 7670

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Schistosoma mansoni
cluster # 7670 cluster # 7670 Sequences # 5 consensus # 2

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consensus_7670#0 length = 1040 sequences # 3

consensus_7670#1 length = 538 sequences # 2

consensusID : consensus_7670#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1040
fasta sequence

                              [TTNTATTTCAAAAGATCGATATAATTCAGAATTCCATGTATCAAATCGTACAATTGAATCATCAGTACCCATAAATGTAATTGGAACTGGTGTACGTGAAAATTCTGATTCTAATGATGTAAAACGTTTATTTGATGATGTTGGTCCAATAATAAGTTGTGCTTTAGGTAAACGAAATCTTACATCAGTTATACCAGTTTGTTGTATAGAATCTTTCCATTTAGGATCAATTAATACATTTAATAGATTGACATCTTTATCACCTTTTCTTGTAATTTCAGCCTTTGTAATACGTCCTTCAAAAGTTCTATCCACTTTTCCTTCAGTATCTTTGATTGGATCAACTGATCCACCAAGATAAACTTTTCCATCAGTCGATACTAAAGGTGCTCGACCAGCAATTGATCTACTTGCTTGGCTACGATGATCAAGTGTAATTGTCAAATTATCTCTATCTCGAATTAGTTGTAAAACTTGTGGTTTTTCTGGAATTAATGATGAATTCAAAAATATTTCTTCAGTTACTGTACGTTGTGCTTTACCAGTTTGATCAGTAATTGCATAAATGTAATAAAGTAATGAGTTCTTTATATAAACATAACTTTTTGATTGATCACTTTCACTAAACCATAATAAACCAGATGTAACACCAAATGGTAATGTAAAATTAATTGTTAATACTTCTTCTTCAACAGTTCTTTGTAAACGATTCATAAAATCATAAC-GTA-CAAAACTA--CCTTCANGAAAATTTACTGATGAAATATATTTAATTGGATTAGTTGGTATTTGTTCTAATATATTAGTTAAATCTTTTGGTTTACGATTTCTTTTGATATCAGGTGATTCAATATAAAAATTATTAATTGCAAAATCAATAATTGATTGATTATCAATATTATTGGATTGTAATTGAATAATATTCCCAAATAATAAACCAATCAATGATTTTAATAAATCAATATTACGGTTAGTAACTATTGATAATCGATCAGATTTATGAAGATCTGATTTTTGTGATGTAATATATTGATTATTATTAT]

[-] EMBL CD118054             [TTNTATTTCAAAAGATCGATATAATTCAGAATTCCATGTATCAAATCGTACAATTGAATCATCAGTACCCATAAATGTAATTGGAACTGGTGTACGTGAAAATTCTGATTCTAATGATGTAAAACGTTTATTTGATGATGTTGGTCCAATAATAAGTTGTGCTTTAGGTAAACGAAATCTTACATCAGTTATACCAGTTTGTTGTATAGAATCTTTCCATTTAGGATCAATTAATACATTTAATAGATTGACATCTTTATCACCTTTTCTTGTAATTTCAGCCTTTGTAATACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD116919             [                                                                                                                                                                                  CTTACATCAGTTATACCAGTTTGTTGTATAGAATCTTTCCATTTAGGATCAATTAATACATTTAATAGATTGACATCTTTATCACCTTTTCTTGTAATTTCAGCCTTTGTAATACGTCCTTCAAAAGTTCTATCCACTTTTCCTTCAGTATCTTTGATTGGATCAACTGATCCACCAAGATAAACTTTTCCATCAGTCGATACTAAAGGTGCTCGACCAGCAATTGATCTACTTGCTTGGCTACGATGATCAAGTGTAATTGTCAAATTATCTCTATCTCGAATTAGTTGTAAAACTTGTGGTTTTTCTGGAATTAATGATGAATTCAAAAATATTTCTTCAGTTACTGTACGTTGTGCTTTACCAGTTTGATCAGTAATTGCATAAATGTAATAAAGTAATGAGTTCTTTATATAAACATAACTTTTTGATTGATCACTTTCACTAAACCATAATAAACCAGATGTAACACCAAATGGTAATGTAAAATTAATTGTTAATACTTCTTCTTCAACAGTTCTTTGTAAACGATTCATAAAATCATAAC GTA CAAAACTA  CCTTCANGAAAATTTACTGATGAAATATATTTAATT                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD184353             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TTCTTTGTAAACGATTCATAAAATCATAACNGTACCAAAACTANNCCTTCAGGAAAATTTACTGATGAAATATATTTAATTGGATTAGTTGGTATTTGTTCTAATATATTAGTTAAATCTTTTGGTTTACGATTTCTTTTGATATCAGGTGATTCAATATAAAAATTATTAATTGCAAAATCAATAATTGATTGATTATCAATATTATTGGATTGTAATTGAATAATATTCCCAAATAATAAACCAATCAATGATTTTAATAAATCAATATTACGGTTAGTAACTATTGATAATCGATCAGATTTATGAAGATCTGATTTTTGTGATGTAATATATTGATTATTATTAT]




>consensus_7670#0
TTNTATTTCAAAAGATCGATATAATTCAGAATTCCATGTATCAAATCGTACAATTGAATC
ATCAGTACCCATAAATGTAATTGGAACTGGTGTACGTGAAAATTCTGATTCTAATGATGT
AAAACGTTTATTTGATGATGTTGGTCCAATAATAAGTTGTGCTTTAGGTAAACGAAATCT
TACATCAGTTATACCAGTTTGTTGTATAGAATCTTTCCATTTAGGATCAATTAATACATT
TAATAGATTGACATCTTTATCACCTTTTCTTGTAATTTCAGCCTTTGTAATACGTCCTTC
AAAAGTTCTATCCACTTTTCCTTCAGTATCTTTGATTGGATCAACTGATCCACCAAGATA
AACTTTTCCATCAGTCGATACTAAAGGTGCTCGACCAGCAATTGATCTACTTGCTTGGCT
ACGATGATCAAGTGTAATTGTCAAATTATCTCTATCTCGAATTAGTTGTAAAACTTGTGG
TTTTTCTGGAATTAATGATGAATTCAAAAATATTTCTTCAGTTACTGTACGTTGTGCTTT
ACCAGTTTGATCAGTAATTGCATAAATGTAATAAAGTAATGAGTTCTTTATATAAACATA
ACTTTTTGATTGATCACTTTCACTAAACCATAATAAACCAGATGTAACACCAAATGGTAA
TGTAAAATTAATTGTTAATACTTCTTCTTCAACAGTTCTTTGTAAACGATTCATAAAATC
ATAACGTACAAAACTACCTTCANGAAAATTTACTGATGAAATATATTTAATTGGATTAGT
TGGTATTTGTTCTAATATATTAGTTAAATCTTTTGGTTTACGATTTCTTTTGATATCAGG
TGATTCAATATAAAAATTATTAATTGCAAAATCAATAATTGATTGATTATCAATATTATT
GGATTGTAATTGAATAATATTCCCAAATAATAAACCAATCAATGATTTTAATAAATCAAT
ATTACGGTTAGTAACTATTGATAATCGATCAGATTTATGAAGATCTGATTTTTGTGATGT
AATATATTGATTATTATTAT

consensusID : consensus_7670#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 538
fasta sequence

                              [TCCCCAAAANANAATTCCNATGTATCAAATCGTACAATTGAATCATCAGTACCCATAAATGTAATTGGAACTGGTGTACGTGAAAATCCTGATTCTAATGATGTAAAACGTTTATTTGATGATGTTGGTCCAATAATAAGTTGTGCTTTAGGTAAACGAAATCTTACATCAGTTATACCAGTTTGTTGTATAGAATCTTTCCATTTAGGATCAATTAATACATTTAATAGATTGACATCTTTATCACCTTTTCTTGTAATTTCAGCCTTTGTAATACGTCCTTCAAAAGTTCTATCCGCTTTTCCTTCAGTATCTTTGATTGGATCAACTGATCCACCAAGATAAACTTTTCCATCAGTCGATACTAAAGGTGCTCGACCAGCAATTGATCTACTTGCTTGGCTACGATGATCAAGTGTAATTGTCAAATTATCTCTATCTCGAATTAGTTGTAAAACTTGTGGTTTTTCTGGAATTAATGATGAATTCAAAAATATTTCTTCAGTTACTGTACGTTATGATTTTATGAATCGTTTAC]

[-] EMBL CD184250             [TCCCCAAAANANAATTCCNATGTATCAAATCGTACAATTGAATCATCAGTACCCATAAATGTAATTGGAACTGGTGTACGTGAAAATCCTGATTCTAATGATGTAAAACGTTTATTTGATGATGTTGGTCCAATAATAAGTTGTGCTTTAGGTAAACGAAATCTTACATCAGTTATACCAGTTTGTTGTATAGAATCTTTCCATTTAGGATCAATTAATACATTTAATAGATTGACATCTTTATCACCTTTTCTTGTAATTTCAGCCTTTGTAATACGTCCTTCAAAAGTTCTATCCGCTTTTCCTTCAGTATCTTTGATTGGATCAACTGATCCACCAAGATAAACTTTTCCATCAGTCGATACTAAAGGTGCTCGACCAGCAATTG                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD123240             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TCCACTTTTCCTTCAGTATCTTTGATTGGATCAACTGATCCACCAAGATAAACTTTTCCATCAGTCGATACTAAAGGTGCTCGACCAGCAATTGATCTACTTGCTTGGCTACGATGATCAAGTGTAATTGTCAAATTATCTCTATCTCGAATTAGTTGTAAAACTTGTGGTTTTTCTGGAATTAATGATGAATTCAAAAATATTTCTTCAGTTACTGTACGTTATGATTTTATGAATCGTTTAC]




>consensus_7670#1
TCCCCAAAANANAATTCCNATGTATCAAATCGTACAATTGAATCATCAGTACCCATAAAT
GTAATTGGAACTGGTGTACGTGAAAATCCTGATTCTAATGATGTAAAACGTTTATTTGAT
GATGTTGGTCCAATAATAAGTTGTGCTTTAGGTAAACGAAATCTTACATCAGTTATACCA
GTTTGTTGTATAGAATCTTTCCATTTAGGATCAATTAATACATTTAATAGATTGACATCT
TTATCACCTTTTCTTGTAATTTCAGCCTTTGTAATACGTCCTTCAAAAGTTCTATCCGCT
TTTCCTTCAGTATCTTTGATTGGATCAACTGATCCACCAAGATAAACTTTTCCATCAGTC
GATACTAAAGGTGCTCGACCAGCAATTGATCTACTTGCTTGGCTACGATGATCAAGTGTA
ATTGTCAAATTATCTCTATCTCGAATTAGTTGTAAAACTTGTGGTTTTTCTGGAATTAAT
GATGAATTCAAAAATATTTCTTCAGTTACTGTACGTTATGATTTTATGAATCGTTTAC

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_7670#0      TTNTATTTCAAAAGATCGATATAATTCAGAATTCCATGTATCAAATCGTACAATTGAATC 60
consensus_7670#1      ---------------TCCCCAAAANANA-ATTCCNATGTATCAAATCGTACAATTGAATC 44
                                     **   * **   * * * * *************************

consensus_7670#0      ATCAGTACCCATAAATGTAATTGGAACTGGTGTACGTGAAAATTCTGATTCTAATGATGT 120
consensus_7670#1      ATCAGTACCCATAAATGTAATTGGAACTGGTGTACGTGAAAATCCTGATTCTAATGATGT 104
                      ******************************************* ****************

consensus_7670#0      AAAACGTTTATTTGATGATGTTGGTCCAATAATAAGTTGTGCTTTAGGTAAACGAAATCT 180
consensus_7670#1      AAAACGTTTATTTGATGATGTTGGTCCAATAATAAGTTGTGCTTTAGGTAAACGAAATCT 164
                      ************************************************************

consensus_7670#0      TACATCAGTTATACCAGTTTGTTGTATAGAATCTTTCCATTTAGGATCAATTAATACATT 240
consensus_7670#1      TACATCAGTTATACCAGTTTGTTGTATAGAATCTTTCCATTTAGGATCAATTAATACATT 224
                      ************************************************************

consensus_7670#0      TAATAGATTGACATCTTTATCACCTTTTCTTGTAATTTCAGCCTTTGTAATACGTCCTTC 300
consensus_7670#1      TAATAGATTGACATCTTTATCACCTTTTCTTGTAATTTCAGCCTTTGTAATACGTCCTTC 284
                      ************************************************************

consensus_7670#0      AAAAGTTCTATCCACTTTTCCTTCAGTATCTTTGATTGGATCAACTGATCCACCAAGATA 360
consensus_7670#1      AAAAGTTCTATCCGCTTTTCCTTCAGTATCTTTGATTGGATCAACTGATCCACCAAGATA 344
                      ************* **********************************************

consensus_7670#0      AACTTTTCCATCAGTCGATACTAAAGGTGCTCGACCAGCAATTGATCTACTTGCTTGGCT 420
consensus_7670#1      AACTTTTCCATCAGTCGATACTAAAGGTGCTCGACCAGCAATTGATCTACTTGCTTGGCT 404
                      ************************************************************

consensus_7670#0      ACGATGATCAAGTGTAATTGTCAAATTATCTCTATCTCGAATTAGTTGTAAAACTTGTGG 480
consensus_7670#1      ACGATGATCAAGTGTAATTGTCAAATTATCTCTATCTCGAATTAGTTGTAAAACTTGTGG 464
                      ************************************************************

consensus_7670#0      TTTTTCTGGAATTAATGATGAATTCAAAAATATTTCTTCAGTTACTGTACGTTGTGCTTT 540
consensus_7670#1      TTTTTCTGGAATTAATGATGAATTCAAAAATATTTCTTCAGTTACTGTACGTTATGATTT 524
                      ***************************************************** ** ***

consensus_7670#0      ACCAGTTTGATCAGTAATTGCATAAATGTAATAAAGTAATGAGTTCTTTATATAAACATA 600
consensus_7670#1      TATGAATCGTTTAC---------------------------------------------- 538
                            * * * *                                               

consensus_7670#0      ACTTTTTGATTGATCACTTTCACTAAACCATAATAAACCAGATGTAACACCAAATGGTAA 660
consensus_7670#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7670#0      TGTAAAATTAATTGTTAATACTTCTTCTTCAACAGTTCTTTGTAAACGATTCATAAAATC 720
consensus_7670#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7670#0      ATAACGTACAAAACTACCTTCANGAAAATTTACTGATGAAATATATTTAATTGGATTAGT 780
consensus_7670#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7670#0      TGGTATTTGTTCTAATATATTAGTTAAATCTTTTGGTTTACGATTTCTTTTGATATCAGG 840
consensus_7670#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7670#0      TGATTCAATATAAAAATTATTAATTGCAAAATCAATAATTGATTGATTATCAATATTATT 900
consensus_7670#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7670#0      GGATTGTAATTGAATAATATTCCCAAATAATAAACCAATCAATGATTTTAATAAATCAAT 960
consensus_7670#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7670#0      ATTACGGTTAGTAACTATTGATAATCGATCAGATTTATGAAGATCTGATTTTTGTGATGT 1020
consensus_7670#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_7670#0      AATATATTGATTATTATTAT 1040
consensus_7670#1      --------------------