cluster # 7686

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7686 cluster # 7686 Sequences # 5 consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_7686#0 length = 378 sequences # 5

consensusID : consensus_7686#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 378
fasta sequence

                              [AAAAGGTCAAGGACCAAACAAATTCATGTGTACAAGTGTGTACAAGTACAGTGAAAACACTGAGATTCACTAACAATTAAGTTTTAAACAGTATGGAGTAATACTGAAGAATTGTTTCATTCAACTGAGAGAATAAACAACATGAGTTATGATTAAATAAAAAACCGTAAAGTTAATGTCAAGAGAAATAATTCCGAACAAGTGAAATGGAAATTCACAATTCGCAAAAACATGAAAATGATTTACTATTCAGTGGGATTCGTAAGAATTAACTCTTAAATGCAAACAATTGATCCAGTAACACGTTAAACTTAACGAACAATTTGCAAATGAATAAAATTTTCAGAATACAGTAAAACGAACTTGACCTTTTGGAAG]

[+] EMBL CD087376             [AAAAGGTCAAGGACCAAACAAATTCATGTGTACAAGTGTGTACAAGTACAGTGAAAACACTGAGATTCACTAACAATTAAGTTTTAAACAGTATGGAGTAATACTGAAGAATTGTTTCATTCAACTGAGAGAATAAACAACATGAGTTATGATTAAATAAAAAACCGTAAAGTTAATGTCAAGAGAAATAATTCCGAACAAGTGAAATGGAAATTCACAATTCGCAAAAACATGAAAATGATTTACTATTCAGTGGGATTCGTAAGAATTAACTCTTAAATGCAAACAATTGATCCAGTAACACGTTAAACTTAACGAACAATTTGCATATGAATAAAATTTTCAGAATACAGTAAAACGAACTTGACCTTTTGGAAG]
[+] EMBL CD115131             [                    AATTCATGTGTGCAAGTGTGTACAAGTACAGTGAAAACACTGAGATTCACTAACAATTAAGTTTTAAACAGTATGGAGTAATACTGAAGAATTGTTTCATTCAACTGAGAGAATAAACAACATGAGTTATGATTAAATAAAAAACCGTAAAGTTAATGTCAAGAGAAATAATTCCGAACAAGTGAAATGGAAATTCACAATTCGCAAAAACATGAAAATGATTTACTATTCAATGGGATTCGTAAGAATTAACTCTTAAATGCAAACAATTGATCCATTAACACGTTAAACTTAACGAAACATTTGCAAATGAATAAAATTTTTAGAATACc                          ]
[-] EMBL CD115147             [                     ATTCATGTGTGCAAGTGTGTACAAGTACAGTGAAAACACTGAGATTCACTAACAATTAAGTTTTAACNAGTATGGAGTAATACTGAAGAATTGTTTCATTCAACTGAGAGAATAAACAGCATGAGTTATGATTAAATAAAAAACCGTAAAGTTGATGTCAAGAGAAATAATTCCGAACAAGTGAAATGGAAATTCACAATTCGCAAAAACATGAAAATGATTTACTATTCAGTGGGATTCGTAAGAATTAACTCTTAAATGCAAACAATTGATCCAGTAACACGTTAAACTTAACGAACAATTTGCAAATGAATAAAATTTTCAGAATACAG                         ]
[-] EMBL CD115092             [                     ATTCATGTGTACAAGTGTGTACAAGTACAGTGAAAACAGTGAGATTCACTAACAATTAAGTTTTAAACAGTATGGAGTAATACTGAAGAATTGTTTCATTCAACTGAGAGAATAAACAACATGAGTTATGATTAAATAAAAAACCGTAAAGTTAATGTCAAGAGAAATAATTCCGAACAAGTGAAATGGAAATTCACAATTCGCAAAAACATGAAAATGATTTACTATTCAGTGGGATTCGTAAGAATTAACTCTTAAATGCAAACAATTGATCCAGTAACACGTTAAACTTAACGAACAATT                                                      ]
[+] EMBL CD087360             [                                                                                                                                                                                                                                                                                  CTTAAATACAAACAATTGATCCAGTAACACGTTAAACTTAACGAACAATTTGCAAATGAATAAAATTTTCAGAATACAGTAAA                     ]




>consensus_7686#0
AAAAGGTCAAGGACCAAACAAATTCATGTGTACAAGTGTGTACAAGTACAGTGAAAACAC
TGAGATTCACTAACAATTAAGTTTTAAACAGTATGGAGTAATACTGAAGAATTGTTTCAT
TCAACTGAGAGAATAAACAACATGAGTTATGATTAAATAAAAAACCGTAAAGTTAATGTC
AAGAGAAATAATTCCGAACAAGTGAAATGGAAATTCACAATTCGCAAAAACATGAAAATG
ATTTACTATTCAGTGGGATTCGTAAGAATTAACTCTTAAATGCAAACAATTGATCCAGTA
ACACGTTAAACTTAACGAACAATTTGCAAATGAATAAAATTTTCAGAATACAGTAAAACG
AACTTGACCTTTTGGAAG

clustalw multiple alignements is not computed in this case