Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7704 cluster # 7704       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7704#0 length = 607 sequences # 5  
consensusID : consensus_7704#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 607
fasta sequence 
                              [ACCGATCCCTTACCGTTATGAAGATGATGTTGGGATGCCAGAAGGTGTTGTTTTAGATGAAGTGAAGAATGATTCGAGTGATAACAGCGAGACGTTAGAGCCACCGGTATCTTCTCTCCAGGCATTGTCACCGATCCCTTACCGTTATGAAGATGATGTTGTGATTCCAGAAGTTGTTGCCTCAGATGGAGCAAAACATGCTTCGAGTGGTGGTATGGTGATGTTGAAGCCACCAGTGTCTTCTCTTCAGGCATTGTCACCGATCCCTTACCGTTATGAAGATGATGTTGGGATGCCAGAAGGTGTTGTTTTAGATGAAGTGAAGAATGATTCGAGTGATAACAGCGAGACGTTAGAGCCACCGGTATCTTCTCTCCAGGCATTGTCACCGATCCCTTACCGTTATGAAGATGATGTTGTGATTCCAGAAGTTGTTGCCTCAGATGGAGCAAAACATGCTTCGAGTGGTGGTATGGTGATGTTGAAGCCACCAGTGTCTTCTCTTCAGGCATTGTCACCGATCCCTTACCGTTATGAAGATGATGTTGGGATGCCAGAAGGTGTTGTTTTAGATGAAGTGAAGAATGATTCGAGTGATAACAACGAG]

[+] EMBL CD161627             [ACCGATCCCTTACCGTTATGAAGATGATGTTGGGATGCCAGAAGGTGTTGTTTTAGATGAAGTGAAGAATGATTCGAGTGATAACAGCGAGACGTTAGAGCCACCGGTATCTTCTCTCCAGGCATTGTCACCGATCCCTTACCGTTATGAAGATGATGTTGTGATTCCAGAAGTTGTTGCCTCAGATGGAGCAAAACATGCTTCGAGTGGTGGTATGGTGATGTTGAAGCCACCAGTGTCTTCTCTTCAGGCATTGTCACCGATCCCTTACCGTTATGAAGATGATGTTGGGACGCCAGAATGTGTTGTTTTAGATGAAGTGAAGAATGATTCGAGTGATAACAGCGAGACGTTAGAGCCACCGGTATCTTCTCTCCAGGCATTGTCACCGATCCCTTACCGTTATGAAGATGATGTTGTGATTCCAGAAGTTGTTGCCTCAGATGGAGCAAAACATGCTTCGAGTGGTGGTATGGTGATGTTGAAGCCACCAGTGTCTTCTCTTCAGGCATTGTCACCGATCCCTTACCGTTAT                                                                        ]
[-] EMBL CD161513             [ CCGATCCCTTACCGTTATGAAGATGATGTTGGGATGCCAGAAGGTGTTGTTTTAGATGAAGTGAAGAATGATTCGAGTGATAACAGCGAGACGTTAGAGCCACCGGTATCTTCTCTCCAGGCATTGTCACCGATCCCTTACCGTTATGAAGATGATGTTGTGATTCCAGAAGTTGTTGCCTCAGATGGAGCAAAACATGCTTCGAGTGGTGGTATGGTGATGTTGAAGCCACCAGTGTCTTCTCTTCAGGCATTGTCACCGATCCCTTACCGTTATGAAGATGATGTTGGGATGCCAGAAGGTGTTGTTCTAGATGAAGTGAAGAATGATTCGAGTGATAACAGCGAGACGTTAGAGCCACCGGTATCTTCTCTCCAGGCATTGTCACCGATCCCTTACCGTTATGAAGATGATGTTGTGATTCCAGAAGTTGTTGCCTCAGATGGAGCAAAACATGCTTCGAGTGGTGGTATGGTGATGTTGAAGCCACCAGTGTCTTCTCTTCAGGCATTGTCACCGATCCC                                                                                  ]
[+] EMBL CD116938             [                                                                                                                                    GATCCCTTACCGTTATGAAGATGATGTTGTGATTCCAGAAGTTGTTGCCTCAGATGGAGCAAAACATGCTTCGAGTGGTGGTATGGTGATGTTGAAGCCACCAGTGTCTTCTCTTCAGGCATTGTCACCGATCCCTTACCGTTATGAAGATGATGTTGGGATGCCAGAAGGTGTTGTTTTAGATGAAGTGAAGAATGATTCGAGTGATAACAGCGAGACGTTAGAGCCACCGGTATCTTCTCTCCAGGCATTGTCACCGATCCCTTACCGTTATGAAGATGATGTTGTGATTCCAGAAGTTGTTGCCTCAGATGGAGCAAAACATGCTTCGAGTGGTGGTATGGTGATGTTGAAGCCACCAGTGTCTTCTCTTCAGGCATTGTCACCGATCCCTTACCGTTATGAAGATGATGTTGGGATGCCAGAAGGTGTTGTTTTAGATGAAGTGAAGAATGATTCGAGTGATAACAACGAG]
[+] EMBL CD116714             [                                                                                                                                    GATCCCTTACCGTTATGAAGATGATGTTGTGATTCCAGAAGTTGTTGCCTCAGATGGAGCAAAACATGCTTCGAGTGGTGGTATGGTGATGTTGAAGCCACCAGTGTCTTCTCTTCAGGCATTGTCACCGATCCCTTACCGTTATGAAGATGATGTTGGGATGCCAGAAGGTGTTGTTTTAGATGAAGTGAAGAATGATTCGAGTGATAACAGCGAGACGTTAGAGCCACCGGTATCTTCTCTCCAGGCATTGTCACCGATCCCTTACCGTTATGAAGATGATGTTGTGATTCCAGAAGTTGTTGCCTCAGATGGAGCAAAACATGCTTCGAGTGGTGGTATGGTGATGTTGAAGCCACCAGTGTCTTCTCTTCAGGCATTGTCACCGATCCCTTACCGTTATGAAGATGATGTTGGGATGCCAGAAGGTGTTGTTTTAGATGAAGTGAACAATGATTCc               ]
[-] EMBL CD143234             [                                                                                                                                       CCCTTACCGTTATGAAGATGATGTTGTGATCNCAGAAGTTGTTGCCTCAGATGGAGCAAAACATGCTTCGAGTGGTGGTATGGTGATGTTGAAGCCACCAGTGTCTTCTCTTCAGGCATTGTCACCGATCCCTTCCCGTTATGAAGATGATGTTGGGATGCCAGAAGGTGTTGTTTTAGATGAAGTGAAGAATGATTCGAGTGATAACAGCGAGACGTTAGAGCCTCCGGTATCTTCTCTCCAGGCATTGTCACCGATCCCTTACCGTTATGAAGATGATGTTGTGATTCCAGAAGTTGTTGCCTCAGATGGAGCAAAACATGCTTCGAGTGGTGGTATGGTGATGTTGAAGCCACCAGTGTCTTCTCTTCAGGCATTGTCACCG                                                                                       ]




>consensus_7704#0
ACCGATCCCTTACCGTTATGAAGATGATGTTGGGATGCCAGAAGGTGTTGTTTTAGATGA
AGTGAAGAATGATTCGAGTGATAACAGCGAGACGTTAGAGCCACCGGTATCTTCTCTCCA
GGCATTGTCACCGATCCCTTACCGTTATGAAGATGATGTTGTGATTCCAGAAGTTGTTGC
CTCAGATGGAGCAAAACATGCTTCGAGTGGTGGTATGGTGATGTTGAAGCCACCAGTGTC
TTCTCTTCAGGCATTGTCACCGATCCCTTACCGTTATGAAGATGATGTTGGGATGCCAGA
AGGTGTTGTTTTAGATGAAGTGAAGAATGATTCGAGTGATAACAGCGAGACGTTAGAGCC
ACCGGTATCTTCTCTCCAGGCATTGTCACCGATCCCTTACCGTTATGAAGATGATGTTGT
GATTCCAGAAGTTGTTGCCTCAGATGGAGCAAAACATGCTTCGAGTGGTGGTATGGTGAT
GTTGAAGCCACCAGTGTCTTCTCTTCAGGCATTGTCACCGATCCCTTACCGTTATGAAGA
TGATGTTGGGATGCCAGAAGGTGTTGTTTTAGATGAAGTGAAGAATGATTCGAGTGATAA
CAACGAG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)