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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7706#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1047 fasta sequence
[TATCATAATACGGACAAAACAATTAGTCGACCATGTGAAGGATGTGGATCATTAAATTCCTCTCAATGGTATGCATGGGGTCCATCGAATGCTAACTCTCGTCTATGTACTGATTGTTGGTCTTATTGGAAACGTTATGGTGGTTTGAAAAGTATTGAATCTAAAGAGCGTCCTACTACAACCTTGCGCACTCAGCAACAGTTGAACAGTTCAACAGTTGAAACTAATTCAAAATCTGGTGGTCCTATTAACATTACTGGATCAGTGAATCATCAATTCAAATCTCATTCTATTGGTTTGTCGAGTGGAGTAAGTGATGCTTTGGATGGTGGTGACATTGATATATATACAAATGATCATCATCATAATAATAACACATCTGCTACAAACATGACTGATAATGCTAATAGTAAATTAATTGATGGATCTGGATTCTTCGGTACTTTAGCCGGTACTCCAAGAGGAACACAATGCTTTAGAACTCCGTCCATTATACGTCTAGCACGCATACTTTGTCCAAATCTTGTTCAACCTCTACGTTTAGCTCGACATCCTGGTGGAGTACCAGAAATTTTCTCATCTAAGCAACAAATCCAACATGAAAGCAAATGCGATGAATCTAATCTAACAGGAACGGATAATTTGTCTGAATCCAATATGATGTTGATGTATGCAACACTGAAAGCTGCTGCTCAGCCTATAATATCACGTATACGAGATCCGTCGATTTTATTGACTCGACCACGAAGAACACGACGCTTAAACGATGTGATTGATTTAATGGCTTCACGTAAAGGTATTGTGTTTCAGCCATTAGATCTTTCATCAGCTTTAAAGTTGTCAGTTGCTAATGGTCCTGTCTACGATCGTAAACGTCCTCATTCACCTGTCTTTACTAATGCACCATCGTCGAAAAAATTACATGAAACTGACGATAAAGTAAATAGGAGTAAAAACTCATCAATGTTGACAGAAAATATCACAAGTGAAAAGTGTTTAACTAATGGAAGAAGTACGGCATCTGTTATTACTAGGTCCGATTGGTCT]
[+] EMBL CD160093 [TATCATAATACGGACAAAACAATTAGTCGACCATGTGAAGGATGTGGATCATTAAATTCCTCTCAATGGTATGCATGGGGTCCATCGAATGCTAACTCTCGTCTATGTACTGATTGTTGGTCTTATTGGAAACGTTATGGTGGTTTGAAAAGTATTGAATCTAAAGAGCGTCCTACTACAACCTTGCGCACTCAGCAACAGTTGAACAGTTCAACAGTTGAAACTAATTCAAAATCTGGTGGTCCTATTGACATTACTGGATCAGTGAATCATCAATTCAAATCTCATTCTATTGGTTTGTCGAGTGGAGTAAGTGATGCTTTGGATGGTGGTGACATTGATATATATACAAATGATCATCATCATAATAATAACACATCTGCTACAAACATGACTGATAATGCTAATAGTAAATTAATTGATGGATCTGGATTCTTCGGTACTTTAGCCGGTACTCCAAGAa ]
[+] EMBL CD116977 [ GCTAACTCTCGTCTATGTACTGATTGTTGGTCTTATTGGAAACGTTATGGTGGTTTGAAAAGTATTGAATCTAAAGAGCGTCCTACTACAACCTTGCGCACTCAGCAACAGTTGAACAGTTCAACAGTTGAAACTAATTCAAAATCTGGTGGTCCTATTAACATTACTGGATCAGTGAATCATCAATTCAAATCTCATTCTATTGGTTTGTCGAGTGGA GCTTTGGATGGTGGTGACATTGGTATATATACAAATGATCATCATCATAATAATAACACATCTGCTACAAACATGACTGATAATGCTAATAGTAAATTAATTGATGGATCTGGATTCTTCGGTACTTTAGCCGGTACTCCAAGAGGAACACAATGCTTTAGAACTCCGTCCATTATACGTCTAGCACGCATACTTTGTCCAAATCTTGTTCAACCTCTACGTTTAGCTCGACATCCTGGTGGAGTACCAG ]
[-] EMBL CD116676 [ CTAACTCTCGTCTATGTACTGATTGTTGGTCTTATTGGAAACGTTATGGTGGTTTGAAAAGTATTGAATCTAAAGAGCGTCCTACTACAACCTTGCGCACTCAGCAACAGTTGAACAGTTCAACAGTTGAAACTAATTCAAAATCTGGTGGTCCTATTAACATTACTGGATCAGTGAATCATCAATTCAAATCTCATTCTATTGGTTTGTCGAGTGGAGTAAGTGATGCTTTGGATGGTGGTGACATTGATATATATACAAATGATCATCATCATAATAATAACACATCTGCTACAAACATGACTGATAATGCTAATAGTAAATTAATTGATGGATCTGGATTCTTCGGTACTTTAGCCGGTACTCCAAGAGGAACACAATGCTTTAGAACTCCGTCCATTATGCGTCTAGCACACATACTTTGTCCAAATCTTGTTCAACCTCTACGTTTAGCTCGACATCCTGGTGGAGTACCAGA ]
[-] EMBL CD116672 [ CTAACTCTCGTCTATGTACTGATTGTTGGTCTTATTGGAAACGTTATGGTGGTTTGAAAAGTATTGAATCTAAAGAGCGTCCTACTACAACCTTGCGCACTCAGCAACAGTTGAACAGTTCAACAGTTGAAACTAATTCAAAATCTGGTGGTCCTATTAACATTACTGGATCAGTGAATCATCAATTCAAATCTCATTCTATTGGTTTGTCGAGTGGA GCTTTGGATGGTGGTGACATTGATATATATACAAATGATCATCATCATAATAATAACACATCTGCTACAAACATGACTGATAATGCTAATAGTAAATTAATTGATGGATCTGGATTCTTCGGTACTTTAGCCGGTACTCCAAGAGGAACACAATGCTTTAGAACTCCGTCCATTATACGTCTAGCACGCATACTTTGTCCAAATCTTGTTCAACCTCTACGTTTAGCTCGACATCCTGGTGGAGTACCAGA ]
[+] EMBL CD155654 [ GACTGATAATGCTAATAGTAAATTAATTGATGGATCTGGATTCTTCGGTACTTTAGCCGGTACTCCAAGAGGAACACAATGCTTTAGAACTCCGTCCATTATACGTCTAGCACGCATACTTTGTCCAAATCTTGTTCAACCCCTACGTTTAGCTCGACATCCTGGTGGAGTACCAGAAATTTTCTCATCTAAGCAACAAATCCAACATGAAAGCAAATGCGATGAATCTAATCTAACAGGAACGGATAATTTGTCTGAATCCAATATGATGTTGATGTATGCAACACTGAAAGCTGCTGCTCAGCCTATAATATCACGTATACGAGATCCGTCGATTTTATTGACTCGACCACGAAGAACACGACGCTTAAACGATGTGATTGATTTAATGGCTTCACGTAAAGGTATTGTGTTTCAGCCATTAGATCTTTCATCAGCTTTAAAGTTGTCAGTTGCTAATGGTCCTGTCTACGATCGTAAACGTCCTCATTCACCTGTCTTTACTAATGCACCATCGTCGAAAAAATTACATGAAACTGACGATAAAGTAAATAGGAGTAAAAACTCATCAATGTTGACAGAAAATATCACAAGTGAAAAGTGTTTAACTAATGGAAGAAGTACGGCATCTGTTATTACTAGGTCCGATTGGTCT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||