These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7706#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1047 fasta sequence [TATCATAATACGGACAAAACAATTAGTCGACCATGTGAAGGATGTGGATCATTAAATTCCTCTCAATGGTATGCATGGGGTCCATCGAATGCTAACTCTCGTCTATGTACTGATTGTTGGTCTTATTGGAAACGTTATGGTGGTTTGAAAAGTATTGAATCTAAAGAGCGTCCTACTACAACCTTGCGCACTCAGCAACAGTTGAACAGTTCAACAGTTGAAACTAATTCAAAATCTGGTGGTCCTATTAACATTACTGGATCAGTGAATCATCAATTCAAATCTCATTCTATTGGTTTGTCGAGTGGAGTAAGTGATGCTTTGGATGGTGGTGACATTGATATATATACAAATGATCATCATCATAATAATAACACATCTGCTACAAACATGACTGATAATGCTAATAGTAAATTAATTGATGGATCTGGATTCTTCGGTACTTTAGCCGGTACTCCAAGAGGAACACAATGCTTTAGAACTCCGTCCATTATACGTCTAGCACGCATACTTTGTCCAAATCTTGTTCAACCTCTACGTTTAGCTCGACATCCTGGTGGAGTACCAGAAATTTTCTCATCTAAGCAACAAATCCAACATGAAAGCAAATGCGATGAATCTAATCTAACAGGAACGGATAATTTGTCTGAATCCAATATGATGTTGATGTATGCAACACTGAAAGCTGCTGCTCAGCCTATAATATCACGTATACGAGATCCGTCGATTTTATTGACTCGACCACGAAGAACACGACGCTTAAACGATGTGATTGATTTAATGGCTTCACGTAAAGGTATTGTGTTTCAGCCATTAGATCTTTCATCAGCTTTAAAGTTGTCAGTTGCTAATGGTCCTGTCTACGATCGTAAACGTCCTCATTCACCTGTCTTTACTAATGCACCATCGTCGAAAAAATTACATGAAACTGACGATAAAGTAAATAGGAGTAAAAACTCATCAATGTTGACAGAAAATATCACAAGTGAAAAGTGTTTAACTAATGGAAGAAGTACGGCATCTGTTATTACTAGGTCCGATTGGTCT] [+] EMBL CD160093 [TATCATAATACGGACAAAACAATTAGTCGACCATGTGAAGGATGTGGATCATTAAATTCCTCTCAATGGTATGCATGGGGTCCATCGAATGCTAACTCTCGTCTATGTACTGATTGTTGGTCTTATTGGAAACGTTATGGTGGTTTGAAAAGTATTGAATCTAAAGAGCGTCCTACTACAACCTTGCGCACTCAGCAACAGTTGAACAGTTCAACAGTTGAAACTAATTCAAAATCTGGTGGTCCTATTGACATTACTGGATCAGTGAATCATCAATTCAAATCTCATTCTATTGGTTTGTCGAGTGGAGTAAGTGATGCTTTGGATGGTGGTGACATTGATATATATACAAATGATCATCATCATAATAATAACACATCTGCTACAAACATGACTGATAATGCTAATAGTAAATTAATTGATGGATCTGGATTCTTCGGTACTTTAGCCGGTACTCCAAGAa ] [+] EMBL CD116977 [ GCTAACTCTCGTCTATGTACTGATTGTTGGTCTTATTGGAAACGTTATGGTGGTTTGAAAAGTATTGAATCTAAAGAGCGTCCTACTACAACCTTGCGCACTCAGCAACAGTTGAACAGTTCAACAGTTGAAACTAATTCAAAATCTGGTGGTCCTATTAACATTACTGGATCAGTGAATCATCAATTCAAATCTCATTCTATTGGTTTGTCGAGTGGA GCTTTGGATGGTGGTGACATTGGTATATATACAAATGATCATCATCATAATAATAACACATCTGCTACAAACATGACTGATAATGCTAATAGTAAATTAATTGATGGATCTGGATTCTTCGGTACTTTAGCCGGTACTCCAAGAGGAACACAATGCTTTAGAACTCCGTCCATTATACGTCTAGCACGCATACTTTGTCCAAATCTTGTTCAACCTCTACGTTTAGCTCGACATCCTGGTGGAGTACCAG ] [-] EMBL CD116676 [ CTAACTCTCGTCTATGTACTGATTGTTGGTCTTATTGGAAACGTTATGGTGGTTTGAAAAGTATTGAATCTAAAGAGCGTCCTACTACAACCTTGCGCACTCAGCAACAGTTGAACAGTTCAACAGTTGAAACTAATTCAAAATCTGGTGGTCCTATTAACATTACTGGATCAGTGAATCATCAATTCAAATCTCATTCTATTGGTTTGTCGAGTGGAGTAAGTGATGCTTTGGATGGTGGTGACATTGATATATATACAAATGATCATCATCATAATAATAACACATCTGCTACAAACATGACTGATAATGCTAATAGTAAATTAATTGATGGATCTGGATTCTTCGGTACTTTAGCCGGTACTCCAAGAGGAACACAATGCTTTAGAACTCCGTCCATTATGCGTCTAGCACACATACTTTGTCCAAATCTTGTTCAACCTCTACGTTTAGCTCGACATCCTGGTGGAGTACCAGA ] [-] EMBL CD116672 [ CTAACTCTCGTCTATGTACTGATTGTTGGTCTTATTGGAAACGTTATGGTGGTTTGAAAAGTATTGAATCTAAAGAGCGTCCTACTACAACCTTGCGCACTCAGCAACAGTTGAACAGTTCAACAGTTGAAACTAATTCAAAATCTGGTGGTCCTATTAACATTACTGGATCAGTGAATCATCAATTCAAATCTCATTCTATTGGTTTGTCGAGTGGA GCTTTGGATGGTGGTGACATTGATATATATACAAATGATCATCATCATAATAATAACACATCTGCTACAAACATGACTGATAATGCTAATAGTAAATTAATTGATGGATCTGGATTCTTCGGTACTTTAGCCGGTACTCCAAGAGGAACACAATGCTTTAGAACTCCGTCCATTATACGTCTAGCACGCATACTTTGTCCAAATCTTGTTCAACCTCTACGTTTAGCTCGACATCCTGGTGGAGTACCAGA ] [+] EMBL CD155654 [ GACTGATAATGCTAATAGTAAATTAATTGATGGATCTGGATTCTTCGGTACTTTAGCCGGTACTCCAAGAGGAACACAATGCTTTAGAACTCCGTCCATTATACGTCTAGCACGCATACTTTGTCCAAATCTTGTTCAACCCCTACGTTTAGCTCGACATCCTGGTGGAGTACCAGAAATTTTCTCATCTAAGCAACAAATCCAACATGAAAGCAAATGCGATGAATCTAATCTAACAGGAACGGATAATTTGTCTGAATCCAATATGATGTTGATGTATGCAACACTGAAAGCTGCTGCTCAGCCTATAATATCACGTATACGAGATCCGTCGATTTTATTGACTCGACCACGAAGAACACGACGCTTAAACGATGTGATTGATTTAATGGCTTCACGTAAAGGTATTGTGTTTCAGCCATTAGATCTTTCATCAGCTTTAAAGTTGTCAGTTGCTAATGGTCCTGTCTACGATCGTAAACGTCCTCATTCACCTGTCTTTACTAATGCACCATCGTCGAAAAAATTACATGAAACTGACGATAAAGTAAATAGGAGTAAAAACTCATCAATGTTGACAGAAAATATCACAAGTGAAAAGTGTTTAACTAATGGAAGAAGTACGGCATCTGTTATTACTAGGTCCGATTGGTCT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||