Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 7721 cluster # 7721       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7721#0 length = 734 sequences # 5  
consensusID : consensus_7721#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 734
fasta sequence 
                              [CATCTGGAGGACAGGCAGTAAACCCACCCTTAACAAACGTTCCTACTGGGAATGCTAGTTGTATGAATAATGGTGTACAAAACACATCTGGACTCACTTCTCCTACTCATCATCCAGTGAATGGTAATCAACAAAGTCCTGGTGTTAATGGTGGGCATCATGCAATGGGATTAACCGGAACACCTTTATTAGATCCTGGCACATCTCATTGGCCACCTACTGGACAATCAAATAATGTACCTAGTTATATCAATGAAGATGGCGGTACATCACCAAATGAAATAAGATATAAAGTTGACGAATATTTACCTTCCTATTTTGGTCAGCAAACAACAAATCAAACTATTATGCATGCCGGTCTTCTTGGTGCTAATAAAATTGGTTCACCTAATGACGGTATTGTAGATGATGTTGGACCTACTGGTGTCGGAGGCGTTGGTGCTGGTGTTGCTATGCCCACTTCAAACTCTAGTGGTTTACCGTATGGTCCCGGCGGTGCTGTATCCGGTACAAATGCTGGCGGCACACATATT-CGGAATGTAACCGGTTTATATAGTGGTGGTGGTCCAGAAGAAAGTATGGCTCGAGAAATTGATGATAATTTAGGTATGGGAGTTGGCATGGCGACAACAGAATCATCACCTGAAAATGCAGTTGGCGTTGAACAAGATGATGTACAAAGCCAATCATGATGTTGTGGCTGCTTTGGTCAACGGTCGAAAGATCGACGTCTT]

[+] EMBL CD117634             [CATCTGGAGGACAGGCAGTAAACCCACCCTTAACAAACGTTCCTACTGGGAATGCTAGTTGTATGAATAATGGTGTACAAAACACATCTGGACTCACTTCTCCTACTCATCATCCAGTGAATGGTAATCAACAAAGTCCTGGTGTTAATGGTGGGCATCATGCAATGGGATTAACCGGAACACCTTTATTAGATCCTGGCACATCTCATTGGCCACCTACTGGACAATCAAATAATGTACCTAGTTATATCAATGAAGATGGCGGTACATCACCAAATGAAATAAGATATAAAGTTGACGAATATTTACCTTCCTATTTTGGTCAGCAAACAACAAATCAAACTATTATGCATGCCGGTCTTCTTGGTGCTAATAAAATTGGTTCACCTAATGACGGTATTGTAGATGATGTTGGACCTACTGGTGTCGGAGGCGTTGGTGCTGGTGTTGCTATGCCCACTTCAAACTCTAGTGGTTTACCGTATGGTCCCGGCGGTGCTGTATCCGGTACAAATGCTGGCGGCACACATATT CGGAATGTAACCGGTTTATATAGTGGTGGTGGTCCAGAAGAAAG                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD117181             [                                                                                     ATCTGGACTCACTTCTCNTACTCATCATCCAGTGAATGGTAATCAACAAAGTCCTGGTGTTAATGGTGGGCATCATGCAATGGGATTAACCGGAACACCTTTATTAGATCCTGGCACATCTCATTGGCCACCTACTGGACAATCAAATAATGTACCTAGTTATATCAATGAAGATGGCGGTACATCACCAAATGAAATAAGATATANNGTTGNCGAATATTTACCTTCCTATTTTGGTCAGCAAACAACAAATCAAACTATTATGCATGCCGGTCTTCTTGGTGCTAATAAAATTGGTTCACCTAATGACGGTATTGTAGATGATGTTGGACCTACTGGTGTCGGAGGCGTTGGTGCTGGTGTTGCTATGCCCACTTCAAACTCTAGTGGTTTACCGTATGGTCCCGGCGGTGCTGTATCCGGTACAAATGCTGGCGGCACACATATT CGGAATGTAACCGGTTTATATAGTGGTGGTGGTCCAGAAGAAAGTATGGCTCGAGAAATTGATGATAATTTAGGTATGGGAGTTGGCATGGCGACAAC                                                                                                       ]
[+] EMBL CD064436             [                                                                                                                         TGGT ATCAACAAAGTCCTGGTGTTAATGGTGGGCATCATGCAATGGGATTAACCGGAACACCTTTATTAGATCCTGGCACATCTCATTGGCCACCTACTGGACAATCAAATAATGTACCTAGTTATATCAATGAAGATGGCGGTACATCACCAAATGAAATAAGATATAAAGTTGACGAATATTTACCTTCCTATTTTGGTCAGCAAACAACAAATCAAACTATTATGCATGCCGGTCTTCTTGGTGCTAATAAAATTGGTTCACCTAATGACGGTATTGTAGATGATGTTGGACCTACTGGTGTCGGAGGCGTTGGTGCTGGTGTTGCTATGCCCACTTCAAACTCTAGTGGTTTACCGTATGGTCCCGGCGGTGCTGTATCCGGTACAAATGCTGGCGGCACACATATT CGGAATGTAACCGGTTTA                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD197612             [                                                                                                                                                                           TAACCGGAACACCTTTATTAGATCCTGGCACATCTCATTGGCCACCTACTGGACAATCAAATAATGTACCTAGTTATATCAATGAAGATGGCGGTACATCACCAAATGAAATAAGATATAAAGTTGACGAATATTTACCTTCCTATTTTGGTCAGCAAACAACAAATCAAACTATTATGCATGCCGGTCTTCTTGGTGCTAATAAAATTGGTTCACCTAATGACGGTATTGTAGATGATGTTGGACCTACTGGTGTCGGAGGCGTTGGTGCTGGTGTTGCTATGCCCACTTCAAACTCTAGTG                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD114332             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GTACGAATGCTGGCGGCACACATATTGCGGAATGTAACCGGTTTATATAGTGGTGGTGGTCCACAAGAAAGT TGGCTCGAGAAA TGATGATAATTTAGGTATGGGAGTTGGCATGGCGACAACAGAATCATCACCTGAAAATGCAGTTGGCGTTGAACAAGATGATGTACAAAGCCAATCATGATGTTGTGGCTGCTTTGGTCAACGGTCGAAAGATCGACGTCTT]




>consensus_7721#0
CATCTGGAGGACAGGCAGTAAACCCACCCTTAACAAACGTTCCTACTGGGAATGCTAGTT
GTATGAATAATGGTGTACAAAACACATCTGGACTCACTTCTCCTACTCATCATCCAGTGA
ATGGTAATCAACAAAGTCCTGGTGTTAATGGTGGGCATCATGCAATGGGATTAACCGGAA
CACCTTTATTAGATCCTGGCACATCTCATTGGCCACCTACTGGACAATCAAATAATGTAC
CTAGTTATATCAATGAAGATGGCGGTACATCACCAAATGAAATAAGATATAAAGTTGACG
AATATTTACCTTCCTATTTTGGTCAGCAAACAACAAATCAAACTATTATGCATGCCGGTC
TTCTTGGTGCTAATAAAATTGGTTCACCTAATGACGGTATTGTAGATGATGTTGGACCTA
CTGGTGTCGGAGGCGTTGGTGCTGGTGTTGCTATGCCCACTTCAAACTCTAGTGGTTTAC
CGTATGGTCCCGGCGGTGCTGTATCCGGTACAAATGCTGGCGGCACACATATTCGGAATG
TAACCGGTTTATATAGTGGTGGTGGTCCAGAAGAAAGTATGGCTCGAGAAATTGATGATA
ATTTAGGTATGGGAGTTGGCATGGCGACAACAGAATCATCACCTGAAAATGCAGTTGGCG
TTGAACAAGATGATGTACAAAGCCAATCATGATGTTGTGGCTGCTTTGGTCAACGGTCGA
AAGATCGACGTCTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)