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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7728#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 914 fasta sequence
[TAGATGAACTAATGATGTAATTGAAACAAATAATGGAACATGATAAATTATACAGTTTGTATACGAAAATAAAACTAGAATTCTAC-GTTAATCA-GTATATATCA-GGGGTAATCATCAT-GATTGAATATTTTAATTAG-TAAGCAGAGATGTTATGGTGGCTATCAATGGAATCCAGGACGCGACTTGTCAGCAGGATGTACCTGTATCGACTCTGGGACGCAGGTACATCCAGTTAATGAGTCACAAATAGGACGAAACGCGTTTCATGTATTCCTTTTATTACTACCATCATCTCTAGTTATAATTCTTGTGACATAAGGTGATATCGAGTCATTCCTCACAGGATGTACATATACTGAAAGAGATTGATCAATTTCAGTCCTAATCATCGATGGGAAAATTCAAACAACCAATACAAAAATGTACTTTAATT-AATGTTTAACAAGGATATAAACTTCTCTTTTTTTCATTTAAGTTTGTTCTTGATTTTGTCATTTGACTTTTCATAGTTTGATCTTTCATTCGGAGATTTAATTTTGAACTTAGAATACTTAGATGACATGAATCTG-TTTTTTTTTTTGAAGATGCTGAAAATATTAAATGTAGAGATTTTTGAATGTTTTAAGTATCAGTGCGAAAATATTGAGCATTCATTCTTCTACCTCTGAATGTGAAATATTGGTGATAAGGTATTAACCAACCGATAGGAGCAGATAATAGTTGCGGGAAATCGCAATTTGACTGAAGTCAGAAATATAAACCACTAACTACCGATCCAGTGATCCACAGGTTAAACTTTCATGACCAAGTCTGAAGTTCCTGCATTCGCTCACTGATGGGTTGTGGATATGAGTTTCTGAGGAGTATTTCATACTGCGACGAAATGGCTGTTTACTGCTTCCTGGTTTATAATA]
[+] EMBL CD084794 [TAGATGAACTAATGATGTAATTGAAACAAATAATGGAACATGATAAATTATACAGTTTGTATACGAAAATAAAACTAGAATTCTAC GTTAATCA GTATATATCA GGGGTAATCATCAT GATTGAATATTTTAATTAG TAAGCAGAGATGTTATGGTGGCTATCAATGGAATCCAGGACGCGACTTGTCAGCAGGATGTACCTGTATCGACTCTGGGACGCAGGTACATCCAGTTAATGAGTCACAAATAGGACGAAACGCGTTTCATGTATTCCTTTTATTACTACCATCATCTCTAGTTATAATTCTTGTGACATAAGGTGATATCGAGTCATTCCTCACAGGATGTACATATACTGAAAGAGATTGATCAATTTCAGTCCTAATCATCGATGGGAAAATTCAAACAACCAATACAAAAATGTACTTTAATTCAATGTTTAACAAGGATATAAACTTCTCTTTTTTTCATTTAAGTTTG ]
[+] EMBL CD084692 [ GATGAACTAATGATGTAATTGAAACAAATAATGGAACATGATAAATTATACAGTTTGTATACGAAAATAAAACTAGAATTCTACNGTTAATCANGTATATATCANGGGGTAATCATCATNGATTGAATATTTTAATTAGNTAAGCAGAGATGTTATGGTGGCTATCAATGGAATCCAGGACGCGACTTGTCAGCAGGATGTACCTGTATCGACTCTGGGACGCAGGTACATCCAGTTAATGAGTCACAAATAGGACGAAACGCGTTTCATGTATTCCTTTTATTACTACCATCATCTCTAGTTATAATTCTTGTGACATAAGGTGATATCGAGTCATTCCTCACAGGATGTACATATACTGAAGGAGATTGATCAATTTCAGTCCTAATCATCGATGGGAAAATTCAAACAACCAATACAAAAATGTACTTTAATT AATGTTTAACAAGGATATAGACTTCTCTTTTTTTCATTTAAGTTTGTTCTTGATTTTGTCATTTGACTTTTCATAGTTTGATCTTTCATTCGGAGATTTAATTTTGAACTTAGAATACTTAGATGACATGAATC ]
[-] EMBL CD084778 [ TTAATT AATGTTTAACAAGGATATAAACTTCTCTTTTTTTCATTTAAGTTTGTTCTTGATTTTGTCATTTGACTTTTCATAGTTTGATCTTTCATTCGGAGATTTAATTTTGAACTTAGAATACTTAGATGACATGAATCTG TTTTTTTTTTTGAAGATGCTGAAAATATTAAATGTAGAGATTTTTGAATGTTTTAAGTATCAGTGCGAAAATATTGAGCATTCATTCTTCTACCTCTGAATGTGAAATATTGGTGATAAGGTATTAACCAACCGATAGGAGCAGATAATAGTTGCGGGAAATCGCAATTTGACTGAAGTCAGAAATATAAACCACTAACTACCGATCCAGTGATCCACAGGTTAAACTTTCATGACCAAGTCTGAAGTTCCTGCATTCGCTCACTGATGGGTTGTGGATATGAGTTTCTGAGGAGTATTTCATACTGCGACGAAATGGCTGTTTACTGCTTCCTGGTTTATAATA]
[-] EMBL CD084734 [ AAGGATATAAACTTCTCTTTTTTTCAATTAAATTTGTTCTTGATTTTGTCATTTGACTTTTCATAGTTTGATCTTTCATTCGGAGATTTAATTTTGAACTTAGAATACTTAGATGACATGAATCTG TTTTTTTTTTTGAAGATGCTGAAAATATTAAATGTAGAGATTTTTGAATGTTTTAAGTATCAGTGCGAAAATATTGAGCATTCATTCTTCTACCTCTGAATGTGAAATATTGGTGATAAGGTATTAACCAACCGATAGGAGCAGATAATAGTTGCGGGAAATCGCAATTTGACTGAAGTCAGAAATATAAACCACTAACTACCGATCCAGTGATCCACAGGTTAAACTTTCATGACCAAGTCTGAAGTTCCTGCATTCGCTCACTGACGGGTTGTGGATATGAGTTTCTGAGGAGTATTTCATACTGCGACGAAATGGCTGTATACTGC TCCTGGTTAATAAgc]
[-] EMBL CD084793 [ CTTCTCTTTTTTTCAATTAAGTTTGTTCTTGAATTTGTCAATTGACTTTTCATAGTTTGATCTTTCATTCGGAGAATTAATTTTGAACTTAGAATACTTAGATGACATGAATCTGTTTTTTTTTTTTGAAGATGCTGAAAATATTAAATGTAGAGATTTTTGAATGTTTTAAGTATCAGTGCGAAAATACTGAGCATTCATTCTTCTACCTCTGAATGTGAAATATTGGTGATAAGGTATTAACCAACCGATAGGAGCAGATAATAGTTGCGGGAAATCGCAATTTGACTGAAGTCAGAAATATAAACCACTAACTACCGATCCAGTGATCCACAGGTTAAACTTTCATGACCAAGTCTGAAGTTCCTGCATTCGCTCACTGATGGGTTGTGGATATGAGTTTCTGAGGAGTATTTCATACTGCAACGAAATGGCTGTTTACTGCTTCCTGGTTTTTAATA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||