These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_7730#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 584 fasta sequence [TATTAAGTATTGATGATGAATTAACACCTGGAAATTTTGAGATGACCAATATTTTATTGGGTGAATCTGTATCTAAAATCAATAATAATAATAATAATCATACTAGTGAACAATATTTCAAGAATTCAACGAATCCATCAGCATTTATTCAAATTAAACCAGCTTGTTTTATTGATAATCATTTACGTACAGTTCAAAATAGTCGTAATGTTTATATTAGTAAACATCAAGATTTATTAGACAATAATAATAATGATAATATATCACAATTTGATCTAATTAATTATACATTTCCATCTATATTTTATGCGGATCGATTAAATGATCCTAGNNAAC-ATCAT-ATAATANNTATAATAATAGTCAATTAAAACCTATTGGAATTCGTTTATTAAATGTATCATTTGGTACATCAACTGATGGATTTTATTCTAAATCAAAATTTATTGTTTGGACTGCATCGTTTGGTCTAGGCAATCCGCCTACTGATAATCTATCTTCCTTATTGATTGGATTAATTATATTCTCGATGTTGATCATTGTTAGCTCTGTAGTTTTAGGCATTCTACTTGTAGTTGTTTTACGTC] [+] EMBL CD139638 [TATTAAGTATTGATGATGAATTAACACCTGGAAATTTTGAGATGACCAATATTTTATTGGGTGAATCTGTATCTAAAATCAATAATAATAATAATAATCATACTAGTGAACAATATTTCAAGAATTCAACGAATCCATCAGCATTTATTCAAATTAAACCAGCTTGTTTTATTGATAATCATTTACGTACAGTTCAAAATAGTCGTAATGTTTATATTAGTAAACATCAAGATTTATTAGACAATAATAATAATGATAATATATCACAATTTGATCTAATTAATTATACATTTCCATCTATATTTTATGCGGATCGATNTAATGATCCTAGNNTAC ATCAT ATAATANNTAT ] [+] EMBL CD139565 [TATTAAGTATTGATGATGAATTAACACCTGGAAATTTTGAGATGACCAATATTTTATTGGGTGAATCTGTATCTAAAATCAATAATAATAATAATAATCATACTAGTGAACAATATTTCAAGAATTCAACGAATCCATCAGCATTTATTCAAATTAAACCAGCTTGTTTTATTGATAATCATTTACGTACAGTTCAAAATAGTCGTAATGTTTATATTAGTAAACATCAAGATTTATTAGACAATAATAATAATGATAATATATCACAATTTGATCTAATTAATTATACATTTCCATCTATATTTTATGCGGATCGATTAAATGATCCTAGTNAn ] [+] EMBL CD139847 [TATTAAGTATTGATGATGAATTAACACCTGGAAATTTTGAGATGACCAATATTTTATTGGGTGAATCTGTATCTAAAATCAATAATAATAATAATAATCATACTAGTGAACAATATTTCAAGAATTCAACGAATCCATCAGCATTTATTCAAATTAAACCAGCTTGTTTTATTGATAATCATTTACGTACAG ] [-] EMBL CD064546 [ GATGAATTAGCCCCTGCAAATTTTGAGATGACCAATATTTTATTGGGTGAATCTGTATCTAAAATCAATAATAATAATAATAATCATACTAGTGAACAATATTTCAAGAATTCAACGAATCCATCAGCATTTATTCAAATTAAACCAGCT ] [+] EMBL CD146226 [ TTTTATTGATAATCATTTACGTACAGTTCAAAATAGTCGTAATGTTTATATTAGTAAACATCAAGATTTATTAGACAATAATAATAATGATAATATATCACAATTTGATCTAATTAATTATACATTTCCATCTATATTTTATGCGGATCGATTAAATGATCCTA ATAACAATCATAATAATAATAATAATAATAGTCAATTAAAACCTATTGGAATTCGTTTATTAAATGTATCATTTGGTACATCAACTGATGGATTTTATTCTAAATCAAAATTTATTGTTTGGACTGCATCGTTTGGTCTAGGCAATCCGCCTACTGATAATCTATCTTCCTTATTGATTGGATTAATTATATTCTCGATGTTGATCATTGTTAGCTCTGTAGTTTTAGGCATTCTACTTGTAGTTGTTTTACGTC] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||