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Schistosoma mansoni
cluster # 7730 cluster # 7730       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7730#0 length = 584 sequences # 5  

consensusID : consensus_7730#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 584
fasta sequence
                              [TATTAAGTATTGATGATGAATTAACACCTGGAAATTTTGAGATGACCAATATTTTATTGGGTGAATCTGTATCTAAAATCAATAATAATAATAATAATCATACTAGTGAACAATATTTCAAGAATTCAACGAATCCATCAGCATTTATTCAAATTAAACCAGCTTGTTTTATTGATAATCATTTACGTACAGTTCAAAATAGTCGTAATGTTTATATTAGTAAACATCAAGATTTATTAGACAATAATAATAATGATAATATATCACAATTTGATCTAATTAATTATACATTTCCATCTATATTTTATGCGGATCGATTAAATGATCCTAGNNAAC-ATCAT-ATAATANNTATAATAATAGTCAATTAAAACCTATTGGAATTCGTTTATTAAATGTATCATTTGGTACATCAACTGATGGATTTTATTCTAAATCAAAATTTATTGTTTGGACTGCATCGTTTGGTCTAGGCAATCCGCCTACTGATAATCTATCTTCCTTATTGATTGGATTAATTATATTCTCGATGTTGATCATTGTTAGCTCTGTAGTTTTAGGCATTCTACTTGTAGTTGTTTTACGTC]

[+] EMBL CD139638             [TATTAAGTATTGATGATGAATTAACACCTGGAAATTTTGAGATGACCAATATTTTATTGGGTGAATCTGTATCTAAAATCAATAATAATAATAATAATCATACTAGTGAACAATATTTCAAGAATTCAACGAATCCATCAGCATTTATTCAAATTAAACCAGCTTGTTTTATTGATAATCATTTACGTACAGTTCAAAATAGTCGTAATGTTTATATTAGTAAACATCAAGATTTATTAGACAATAATAATAATGATAATATATCACAATTTGATCTAATTAATTATACATTTCCATCTATATTTTATGCGGATCGATNTAATGATCCTAGNNTAC ATCAT ATAATANNTAT                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD139565             [TATTAAGTATTGATGATGAATTAACACCTGGAAATTTTGAGATGACCAATATTTTATTGGGTGAATCTGTATCTAAAATCAATAATAATAATAATAATCATACTAGTGAACAATATTTCAAGAATTCAACGAATCCATCAGCATTTATTCAAATTAAACCAGCTTGTTTTATTGATAATCATTTACGTACAGTTCAAAATAGTCGTAATGTTTATATTAGTAAACATCAAGATTTATTAGACAATAATAATAATGATAATATATCACAATTTGATCTAATTAATTATACATTTCCATCTATATTTTATGCGGATCGATTAAATGATCCTAGTNAn                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD139847             [TATTAAGTATTGATGATGAATTAACACCTGGAAATTTTGAGATGACCAATATTTTATTGGGTGAATCTGTATCTAAAATCAATAATAATAATAATAATCATACTAGTGAACAATATTTCAAGAATTCAACGAATCCATCAGCATTTATTCAAATTAAACCAGCTTGTTTTATTGATAATCATTTACGTACAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD064546             [              GATGAATTAGCCCCTGCAAATTTTGAGATGACCAATATTTTATTGGGTGAATCTGTATCTAAAATCAATAATAATAATAATAATCATACTAGTGAACAATATTTCAAGAATTCAACGAATCCATCAGCATTTATTCAAATTAAACCAGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD146226             [                                                                                                                                                                      TTTTATTGATAATCATTTACGTACAGTTCAAAATAGTCGTAATGTTTATATTAGTAAACATCAAGATTTATTAGACAATAATAATAATGATAATATATCACAATTTGATCTAATTAATTATACATTTCCATCTATATTTTATGCGGATCGATTAAATGATCCTA ATAACAATCATAATAATAATAATAATAATAGTCAATTAAAACCTATTGGAATTCGTTTATTAAATGTATCATTTGGTACATCAACTGATGGATTTTATTCTAAATCAAAATTTATTGTTTGGACTGCATCGTTTGGTCTAGGCAATCCGCCTACTGATAATCTATCTTCCTTATTGATTGGATTAATTATATTCTCGATGTTGATCATTGTTAGCTCTGTAGTTTTAGGCATTCTACTTGTAGTTGTTTTACGTC]


>consensus_7730#0 TATTAAGTATTGATGATGAATTAACACCTGGAAATTTTGAGATGACCAATATTTTATTGG GTGAATCTGTATCTAAAATCAATAATAATAATAATAATCATACTAGTGAACAATATTTCA AGAATTCAACGAATCCATCAGCATTTATTCAAATTAAACCAGCTTGTTTTATTGATAATC ATTTACGTACAGTTCAAAATAGTCGTAATGTTTATATTAGTAAACATCAAGATTTATTAG ACAATAATAATAATGATAATATATCACAATTTGATCTAATTAATTATACATTTCCATCTA TATTTTATGCGGATCGATTAAATGATCCTAGNNAACATCATATAATANNTATAATAATAG TCAATTAAAACCTATTGGAATTCGTTTATTAAATGTATCATTTGGTACATCAACTGATGG ATTTTATTCTAAATCAAAATTTATTGTTTGGACTGCATCGTTTGGTCTAGGCAATCCGCC TACTGATAATCTATCTTCCTTATTGATTGGATTAATTATATTCTCGATGTTGATCATTGT TAGCTCTGTAGTTTTAGGCATTCTACTTGTAGTTGTTTTACGTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)