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Schistosoma mansoni
cluster # 7738 cluster # 7738       Sequences # 5       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_7738#0 length = 1220 sequences # 5  
consensusID : consensus_7738#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 1220
fasta sequence 
                              [ACAGTCAGAGAGAGAATCGAAAGAAAACAAGTTTGGAAGCAAAACGGGTAGGAACTAGTTCTAACCTAAGAAAGGATATCTCATGAATGAACAAATAAACGAACAAAACGACGGTAGAACCAGGAGACAAAGTAATAACAGTAATTAATAATCATAGTAATAATAATAATGTTAAAGATGCCATCTTCAGTTTGTTTCTTTTTTTCATATGAATTAAGAGCATTTACCCATGTATCATCATCGGTTTAATGAAAAGACATATGAAGGACGGATTATAAAGAATGAATTAAAAAAAAGAATGGCATTGTGTATATATATATGCGTGTGTAAGAGGAATCTGGGACCAGAAAAATTAAAAAAAAAAACGATGAGCGAGAGTGCGAAGGAAAAACGTAATGAGAAGAGGAAATGAAAACTAGTTTAAACAGGTTAACCTACTATTCTGTTTTTTTTTCTGTAATCAACAATTTCATTTTTGAAAGAAAAAATGAAGGGAATTAATTAGTACAGACGATGAGAAATTGGTCTATTTTTGCTAAATGCTCTACTGTAAGAATTGAGTAATGCACCTTCAGTCGTACATATGTACGTAGGCATAGATACAAGAAAATATAACTAATTGACAGAAAAAAAAAACAAAACTTGCTTGTAGTATGTGAAAGTATTTACTAGATTAGAGGAGGGTAGAGTAGGGGAAGTCAGGGATTATTTATGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAAAGAGAAAGTAAGCTTCATCAGTACACTTTTTTTCAGTAGTAGTAAACATAGTGTTGCTGCAGAGACACAAACAAAAAGAAGGAAATTTAATATGGAAGATATTCAGTAATGGATCTTTGGGGTGGGGGCGGGAAGAGGGTGCGAGATAGGGATAATGACAATTTTCTCTCTCTTATC-GATCTAATAAAAATGATGAGATTAATATGACTATTGTAACTATCATTACTACCATTATTATTATTACCACCATCACTACTACTACTACTATTACTACTACCGTTTCTTATGGTACCCGATGGACTAGGAGTTAGTTATGTATACAAACTAATCATGATAATAATAAACAACGGTTTATTTAACCTTACAGTTACATATATCAAATTACATCCATTTTATTATCTGCTTTTTATCATCCATTATCTCACACGCATACACATATTCACCCTTATTATCCCTTCTCGGTACCTTGCTATCGCTATGGCGCTT]

[-] EMBL CD201013             [ACAGTCAGAGAGAGAATCGAAAGAAAACAAGTTTGGAAGCAAAACGGGTAGGAACTAGTTCTAACCTAAGAAAGGATATCTCATGAATGAACAAATAAACGAACAAAACGACGGTAGAACCAGGAGACAAAGTAATAACAGTAATTAATAATCATAGTAATAATAATAATGTTAAAGATGCCATCTTCAGTTTGTTTCTTTTTTTCATATGAATTAAGAGCATTTACCCATGTATCATCATCGGTTTAATGAAAAGACATATGAAGGACGGATTATAAAGAATGAATTAAAAAAAAGAATGGCATTGTGTATATATATATGCGTGTGTAAGAGGAATCTATGACCAGAAAAATTAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL AI976845             [                                                                         GGATATCTCATGAATGAACAAATAAACGAACAAAACGACGGTAGAACCAGGAGACAAAGTAATAACAGTAATTAATAATCATAGTAATAATAATAATGTTAAAGATGCCATCTTCAGTTTGTTTCTTTTTTTCATATGAATTAAGAGCATTTACCCATGTATCATCATCGGTTTAATGAAAAGACATATGAAGGACGGATTATAAAGAATGAATTAAAAAAAAGAATGGCATTGTGTATATATATATGCGTGTGTGAGAGGAATCAGGGACCAGAAAAATTAAAAAAAAAAACGATGAGCGAGAGTGCGAAGGAAAAACGTAATGAGAAGAGGAAATGAAAACTAGTTTAAACAGGTTAACCTACTATTCTGTTTTTTTTTCTGTAATCAACAATTTCATTTTTGAAAGAAAAAATGAAGGGAATTAATTAGTACAGACGATGAGAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD064692             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GGGACCAGAAAAATT  AAAAAAAAACGATGAGCGAGAGTGCGAAGGAAAAACGTAATGAGAAGAGGAAATGAAAACTAGTTTAAACAGGTTAACCTACTATTCTGTTTTTTTTTCTGTAATCAACAATTTCATTTTTGAAAGAAAAAATGAAGGGAATTAATTAGTACAGACGATGAGAAATTGGTCTATTTTTGCTAAATGCTCTACTGTAAGAATTGAGTAATGCACCTTCAGTCGTACATATGTACGTAGGCATAGATACAAGAAAATATAACTAATTGACAGAAAAAAAAAACAAAACTTGCTTGTAGTATGTGAAAGTATTTACTAGATTAGAGGAGGGTAGAGTAGGGGAAGTCAGGGATTATTTATGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAAAGAGAAAGTAAGCTTCATCAGTACACTTTTTTTCAGTAGTAGTAAACATAGTGTTGCTGCAGAGACACAAACAAAAAGAAGGAAATTTAATATGGAAGATATTCAGTAATGGATCTTTGGGGTGGGGGCGGGAAGAGGGTGCGAGATAGGGATAATGACAATTTTCTCTCTCTTATCNGA CTAATANAAATGATGAGATTAATATGACTATTGNAACTATCATTACTACCATTATTATTATTACCACCATCACTACTACTACTA                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL BF936162             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AAAGTATTTACTAGATTAGAGGAGGGTAGAGTAGGGGAAGTCAGGGATTATTTATGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAAAGAGAAAGTAAGCTTCATCAGTACACTTTTTTTCAGTAGTAGTAAACATAGTGTTGCTGCAGAGACACAAACAAAAAGAAGGAAATTTAATATGGAAGATATTCAGTAATGGATCTTTGGGGTGGGGGCGGGAAGAGGGTGCGAGATAGGGATAATGACAATTTTCTCTCTCTTATC GATCTAATAAAAATGATGAGATTAATATGACTATTGTAACTATCATTACTACCATTATTATTATTACCACCATCACTACTACTACTACTATTACTACTACCGTTTCTTATGGTACCCGATGGACTAGGAGTTAGTTATGTATACAAACTAATCATGATAATAATAAACAACGGTTTATTTAACCTTACAGTTACATATATCAAATTACATCCATTTTATTATCTGCTTTTTATCATCCATTATCTCACACGCATACACATATTCACCCTTATTATCCCTTCTCGGTACCTTGCTATCGCTATGGCGCTT]
[-] EMBL CD149268             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TCAGTACACTTTTTTTCAGTAGTAGTAAACATAGTGTTGCTGCAGAGACACAAACAAAAAGAAGGAAATTTAATATGGAAGATATTCAGTAATGGATCTTTGGGGTGGGGGCGGGAAGAGGGTGCGAGATAGGGATAATGACAATTTTCTCTCTCTTATC GATCTAATAAAAATGATGAGATTAATATGACTATTGTAACTATCATTACTACCATTATTATTATTACCACCATCACTACTACTACTACTATTACTACTACCGTTTCTTATGGTACCCGATGGACTAGGAGTTAGTTATGTATACAAACTAATCATGATAATAATAAACAACGGTTTATTTAACCTTACAGTTACATATATCAAATTACATCCATTTTATTATCTGCTTTTTAT                                                                            ]




>consensus_7738#0
ACAGTCAGAGAGAGAATCGAAAGAAAACAAGTTTGGAAGCAAAACGGGTAGGAACTAGTT
CTAACCTAAGAAAGGATATCTCATGAATGAACAAATAAACGAACAAAACGACGGTAGAAC
CAGGAGACAAAGTAATAACAGTAATTAATAATCATAGTAATAATAATAATGTTAAAGATG
CCATCTTCAGTTTGTTTCTTTTTTTCATATGAATTAAGAGCATTTACCCATGTATCATCA
TCGGTTTAATGAAAAGACATATGAAGGACGGATTATAAAGAATGAATTAAAAAAAAGAAT
GGCATTGTGTATATATATATGCGTGTGTAAGAGGAATCTGGGACCAGAAAAATTAAAAAA
AAAAACGATGAGCGAGAGTGCGAAGGAAAAACGTAATGAGAAGAGGAAATGAAAACTAGT
TTAAACAGGTTAACCTACTATTCTGTTTTTTTTTCTGTAATCAACAATTTCATTTTTGAA
AGAAAAAATGAAGGGAATTAATTAGTACAGACGATGAGAAATTGGTCTATTTTTGCTAAA
TGCTCTACTGTAAGAATTGAGTAATGCACCTTCAGTCGTACATATGTACGTAGGCATAGA
TACAAGAAAATATAACTAATTGACAGAAAAAAAAAACAAAACTTGCTTGTAGTATGTGAA
AGTATTTACTAGATTAGAGGAGGGTAGAGTAGGGGAAGTCAGGGATTATTTATGTGTGTG
TGTGTGAGAGAGAAAGAGAAAGTAAGCTTCATCAGTACACTTTTTTTCAGTAGTAGTAAA
CATAGTGTTGCTGCAGAGACACAAACAAAAAGAAGGAAATTTAATATGGAAGATATTCAG
TAATGGATCTTTGGGGTGGGGGCGGGAAGAGGGTGCGAGATAGGGATAATGACAATTTTC
TCTCTCTTATCGATCTAATAAAAATGATGAGATTAATATGACTATTGTAACTATCATTAC
TACCATTATTATTATTACCACCATCACTACTACTACTACTATTACTACTACCGTTTCTTA
TGGTACCCGATGGACTAGGAGTTAGTTATGTATACAAACTAATCATGATAATAATAAACA
ACGGTTTATTTAACCTTACAGTTACATATATCAAATTACATCCATTTTATTATCTGCTTT
TTATCATCCATTATCTCACACGCATACACATATTCACCCTTATTATCCCTTCTCGGTACC
TTGCTATCGCTATGGCGCTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)